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插入突变在功能基因组学研究中的应用 被引量:5
1
作者 孟凡立 张卫国 陈庆山 《生物信息学》 2006年第1期38-40,48,共4页
插入突变库的构建是功能基因组学研究的一个重要内容,可为确定基因的功能提供最直接的证据。构建插入突变库的方法有T-DNA插入突变、转座子插入突变和质粒介导的插入突变。本文分别介绍三种方法的原理及其在功能基因组学研究中的应用和... 插入突变库的构建是功能基因组学研究的一个重要内容,可为确定基因的功能提供最直接的证据。构建插入突变库的方法有T-DNA插入突变、转座子插入突变和质粒介导的插入突变。本文分别介绍三种方法的原理及其在功能基因组学研究中的应用和研究进展。 展开更多
关键词 插入突变 插入突变库 功能基因组学
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快速低成本全基因组DNA测序技术 被引量:10
2
作者 陆祖宏 吕华 +1 位作者 肖鹏峰 白云飞 《中国生物医学工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期182-186,190,共6页
人类个体的全基因组序列信息,是最为重要的生物医学信息,是实现未来个体化医疗的基础;实现个体全基因组DNA序列的快速低成本检测,是人类基因组计划完成后又一个重要的技术挑战。对该技术当前的发展现状进行回顾和分析,预计在不长的时间... 人类个体的全基因组序列信息,是最为重要的生物医学信息,是实现未来个体化医疗的基础;实现个体全基因组DNA序列的快速低成本检测,是人类基因组计划完成后又一个重要的技术挑战。对该技术当前的发展现状进行回顾和分析,预计在不长的时间内人类个体全基因组的测序成本能够降低到1万元人民币以下。 展开更多
关键词 全基因组测序 个体化医疗 功能基因组学 快速DNA测序技术
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Present status and development on biological nitrogen fixation research in China 被引量:5
3
作者 SHEN Shihua & JING Yuxiang Key Laboratory of Photosynthesis and Plant-Environment MolecularPhysiology, Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100093, China 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2003年第10期954-960,共7页
This presentation introduces the advances inbiological nitrogen fixation research abroad, in particular,describes the great progress and achievements on itsresearch in China as follows: collection of rhizobial resourc... This presentation introduces the advances inbiological nitrogen fixation research abroad, in particular,describes the great progress and achievements on itsresearch in China as follows: collection of rhizobial resources and establishment of the largest database of Rhizobium inChina, correction and development of Rhizobium taxonomy in international; discovery of a couple of nif genes,identification and unification of linkage among the nif gene operons of Klebsiella pneumoniae, finding of regulative mechanism of positive regulation nif gene and its sensitivity to oxygen, temperature; finding of the activity of nodulation gene nodD3 product in Sinorhizobium meliloti which is notcontrolled by flavonoid produced from its host alfalfa;finding of the association between expression of genes coding the products for carbon utilization and nitrogen metabolism and their regulations; chemical synthesis of nodulationfactor of Sinorhizobium meliloti; constructions of engineered nitrogen fixers and utilization in practice based on theresearch of gene expression and regulation; chemicalsimulation of the structure and function of nitrogenase and bringing forward the model of nitrogenase active center for the first time in international and synthesis of modelcompounds which were paid attention by colleagues abroad. Finally, the development of nitrogen fixation research inChina in future has been put forward, suggesting that the nifgene regulation and its role in providing crops with nitrogen element, signal transduction and molecular interactions between Rhizobium and legume, coupling between carbonand nitrogen metabolisms, nitrogen fixation andphotosynthesis, and functional genomics of nitrogen-fixing nodule symbiosis, etc., would be actively worked on. 展开更多
关键词 现状 发展 生物固氮技术 中国 固氮酶 基因表达 微生物 植物 相互作用 化学模型
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烟草突变体库及其在功能基因组研究中的应用 被引量:2
4
作者 蔡刘体 郑少清 +2 位作者 胡重怡 叶定勇 韩晓红 《中国烟草科学》 CSCD 2008年第6期27-31,共5页
烟草突变体是烟草功能基因组学研究的重要材料。本文综述了烟草突变体在功能基因研究中的作用,构建烟草突变体库的必要性以及烟草突变体库的构建方法,并展望了烟草突变体库在烟草功能基因组学中的应用。
关键词 烟草 突变体 基因 功能基因组
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中药复方活性筛选形式与技术研究进展 被引量:2
5
作者 王忠 刘建勋 +1 位作者 肖诗鹰 王永炎 《世界科学技术-中医药现代化》 2004年第5期51-55,共5页
药物发现是新药研究的重要过程,其中药物活性筛选是决定新药研究成败的关键。本文分析了目前中药复方活性筛选的8种形式,并按历史进程将筛选技术分为传统筛选技术与现代筛选技术,简述了临床前活性药物优化技术、候选药选择技术、分离技... 药物发现是新药研究的重要过程,其中药物活性筛选是决定新药研究成败的关键。本文分析了目前中药复方活性筛选的8种形式,并按历史进程将筛选技术分为传统筛选技术与现代筛选技术,简述了临床前活性药物优化技术、候选药选择技术、分离技术、分子设计、分子水平筛选、生物芯片技术、药物基因组学、药物相互作用分析技术(BIA)、化学和生物信息学结合、中药复方多层区组筛选模式(MBAS模式)等现代筛选技术的特征,并探讨药物发现策略的改变和新技术应用对于中药复方活性筛选研究进程的影响。 展开更多
关键词 中药复方 活性筛选 新药研究 药物发现 药物基因组学 药物相互作用 改变 筛选技术 选择技术 中药物
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植物的功能基因组学研究进展 被引量:43
6
作者 李子银 陈受宜 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期57-60,共4页
基因组研究计划包括以全基因组测序为目标的结构基因组学和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学两方面的内容。目前基因功能鉴定的方法主要有 :基因表达的系统分析(SAGE)、cDNA微阵列、DNA(基因)芯片、蛋白组技术以及基于转座子标签和T_... 基因组研究计划包括以全基因组测序为目标的结构基因组学和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学两方面的内容。目前基因功能鉴定的方法主要有 :基因表达的系统分析(SAGE)、cDNA微阵列、DNA(基因)芯片、蛋白组技术以及基于转座子标签和T_DNA标签的反求遗传学技术等。 展开更多
关键词 功能基因组学 SAGE CDNA微阵列 蛋白组 植物
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水稻突变体与功能基因组学 被引量:53
7
作者 郭龙彪 储成才 钱前 《植物学通报》 CSCD 北大核心 2006年第1期1-13,共13页
突变体是功能基因组学研究的重要材料。本文综述了水稻突变体的创制方法、变异的机制、水稻突变体/基因分类和数量、克隆的水稻重要基因的研究进展,包括1698个水稻突变体/基因的分类和43个克隆的水稻突变体基因,并提出了利用水稻突变体... 突变体是功能基因组学研究的重要材料。本文综述了水稻突变体的创制方法、变异的机制、水稻突变体/基因分类和数量、克隆的水稻重要基因的研究进展,包括1698个水稻突变体/基因的分类和43个克隆的水稻突变体基因,并提出了利用水稻突变体的展望。 展开更多
关键词 水稻 突变体 基因 功能基因组学
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中国水稻遗传学研究进展与分子设计育种 被引量:72
8
作者 郭韬 余泓 +3 位作者 邱杰 李家洋 韩斌 林鸿宣 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2019年第10期1185-1212,共28页
我国是一个农业大国,水稻是保障我国粮食安全和实现农业可持续发展的主粮作物.经过几十年的努力,我国科学家在水稻遗传学和功能基因组学领域取得了瞩目的成就,特别是在水稻复杂农艺性状基因解析方面取得了一系列重要的原创性研究成果,... 我国是一个农业大国,水稻是保障我国粮食安全和实现农业可持续发展的主粮作物.经过几十年的努力,我国科学家在水稻遗传学和功能基因组学领域取得了瞩目的成就,特别是在水稻复杂农艺性状基因解析方面取得了一系列重要的原创性研究成果,开创了以水稻为模式作物研究复杂性状基因调控网络的新领域.随着水稻功能基因组学的发展,我国科学家率先践行了分子设计育种理念,为培育高产、优质、抗逆、营养高效利用的"绿色超级稻"提供了有效的策略,对于确保我国粮食安全具有重要的意义. 展开更多
关键词 水稻 复杂农艺性状 功能基因组 分子设计育种
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功能基因组学的研究内容与方法 被引量:33
9
作者 赵剑华 王秀琴 +1 位作者 刘芝华 吴旻 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2000年第1期6-8,共3页
基因组学的研究已从结构基因组学转向功能基因组学.综述了功能基因组学研究的内容和方法,主要包括应用微点阵、基因表达系列分析(SAGE)、蛋白质组、生物信息学等方法来研究基因组表达概况、基因组多样性。
关键词 人类基因组计划 功能基因组学 生物信息学
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水稻突变群体的构建及功能基因组学 被引量:33
10
作者 江树业 《分子植物育种》 CAS CSCD 2003年第2期137-150,共14页
随着水稻基因组全序列的测定完成 ,功能基因组学已成为重点研究内容。功能基因组学主要研究生物有机体内各基因的生物学功能进而了解所有基因如何协调发挥作用完成一系列的生长发育过程。目前已经发展了多种分析鉴定基因功能的方法 ,其... 随着水稻基因组全序列的测定完成 ,功能基因组学已成为重点研究内容。功能基因组学主要研究生物有机体内各基因的生物学功能进而了解所有基因如何协调发挥作用完成一系列的生长发育过程。目前已经发展了多种分析鉴定基因功能的方法 ,其中最直接最有效的方法是构建饱和的基因突变群体 ,通过突变体分析鉴定基因功能。本文主要阐述了各种构建方法及其优缺点以及在功能基因分离鉴定上的应用。自发突变的频率极低 ,且自发突变基因的分离难度比较大 ,只能作为突变群体构建的辅助方法。利用EMS等化学诱变剂可以在短时间内构建大量点突变群体 ,并可用TILLING进行突变检测 ,但多位点的点突变使突变表型难以鉴定。由快中子等物理诱变也可以在短时间内构建大量缺失突变体 ,且可用Deleteagene系统进行检测 ;但多基因缺失、多位点缺失和内含子缺失等使突变表型的分析可能无法进行。利用T -DNA、转座子和反转录转座子等构建插入突变体已经成为突变库构建的主要方法。T -DNA插入已成功应用于水稻大规模突变体的构建 ,但只限于转基因效率较高的品种 ;T -DNA在基因组中整合的复杂性以及转基因过程中由组织培养等引发的突变等 ,增加了突变体表型和分子分析的难度。Tos17是目前应用最为成功的反转录转座子 ,但多拷贝的插入? 展开更多
关键词 水稻 基因突变群体 功能基因组学 构建方法
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谷子(Setaria italica(L.) P. Beauv.)作为功能基因组研究模式植物的发展现状及趋势 被引量:61
11
作者 贾冠清 刁现民 《生命科学》 CSCD 2017年第3期292-301,共10页
模式植物对遗传学和分子生物学前沿理论探索和实践研究至关重要。玉米、拟南芥和水稻等主要的模式植物,在植物遗传学发展的不同时期发挥了不可替代的作用,但随着研究的深入和细化,迫切需要更多别具特色的物种成为模式植物。谷子(Setaria... 模式植物对遗传学和分子生物学前沿理论探索和实践研究至关重要。玉米、拟南芥和水稻等主要的模式植物,在植物遗传学发展的不同时期发挥了不可替代的作用,但随着研究的深入和细化,迫切需要更多别具特色的物种成为模式植物。谷子(Setaria italia)及其野生种青狗尾草(S.viridis)因具备C_4光合途径和特殊的抗旱耐逆性备受关注,谷子也因其较小的二倍体基因组、自花授粉、高繁殖系数、较小的株高和易于操作的栽培方法,以及生育周期短、易于快速繁殖等特点,非常适合作为分子遗传学研究的模式植物,近年来作为C4和抗旱耐逆研究的模式系统越来越受到国际植物遗传学界的关注。谷子是起源于中国的古老农作物,我国拥有最丰富的遗传资源,并在遗传育种研究上处于领先。现简述我国谷子的研究基础,综述近年来谷子和青狗尾草作为模式作物的研究进展,讨论相关研究存在的问题,并对谷子遗传研究的发展趋势进行展望。 展开更多
关键词 谷子 青狗尾草 模式植物 功能基因组
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虚拟筛选与新药发现 被引量:42
12
作者 李洪林 沈建华 +5 位作者 罗小民 沈旭 朱维良 王希诚 陈凯先 蒋华良 《生命科学》 CSCD 2005年第2期125-131,共7页
虚拟筛选是创新药物研究的新方法和新技术,近年来引起了研究机构和制药公司的高度重视,并且已经成为一种与高通量筛选互补的实用化工具,加入到了创新药物研究的工作流程(pipeline)中。本文介绍国际上虚拟筛选及其在创新药物发现中应用... 虚拟筛选是创新药物研究的新方法和新技术,近年来引起了研究机构和制药公司的高度重视,并且已经成为一种与高通量筛选互补的实用化工具,加入到了创新药物研究的工作流程(pipeline)中。本文介绍国际上虚拟筛选及其在创新药物发现中应用的研究进展,特别介绍了我国这方面研究的状况。 展开更多
关键词 虚拟筛选 分子对接 药物设计 功能基因组
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转录组学在药用植物研究中的应用 被引量:46
13
作者 吴琼 孙超 +4 位作者 陈士林 罗红梅 李滢 孙永珍 牛云云 《世界科学技术-中医药现代化》 2010年第3期457-462,共6页
药用植物转录组学研究已经成为药用植物基因组研究中最活跃的领域之一。以转录组学的产生、发展和研究方法为基础,介绍了药用植物中转录组学的应用现状,重点介绍了转录组学当前采用的技术手段以及在西洋参、丹参、乌拉尔甘草功能基因组... 药用植物转录组学研究已经成为药用植物基因组研究中最活跃的领域之一。以转录组学的产生、发展和研究方法为基础,介绍了药用植物中转录组学的应用现状,重点介绍了转录组学当前采用的技术手段以及在西洋参、丹参、乌拉尔甘草功能基因组学中的研究进展。同时对转录组学在药用植物中的发展前景进行了讨论。 展开更多
关键词 药用植物 转录组学 功能基因组学 454 GS FLX 表达序列标签
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代谢组学研究——功能基因组学研究的重要组成部分 被引量:37
14
作者 邱德有 黄璐琦 《分子植物育种》 CAS CSCD 2004年第2期165-177,共13页
代谢组学 (metabolomics)是上世纪 90年代中期发展起来的一门对某一生物或细胞所有低分子量代谢产物进行定性和定量分析的一门新学科。本文对代谢组和代谢组学的含义、代谢组学与其它组学的区别和关系、代谢组学研究的历史沿革、代谢组... 代谢组学 (metabolomics)是上世纪 90年代中期发展起来的一门对某一生物或细胞所有低分子量代谢产物进行定性和定量分析的一门新学科。本文对代谢组和代谢组学的含义、代谢组学与其它组学的区别和关系、代谢组学研究的历史沿革、代谢组学在功能基因组学研究中的作用、代谢组学的研究现状与应用概况、代谢组学研究的技术等方面内容进行了介绍 ,并对当前代谢组学研究中存在的问题以及今后的发展趋势试作了探讨 ,提出了我国科学工作者利用代谢组学研究技术进行功能基因组学研究的必要性和可能性。 展开更多
关键词 代谢 代谢组 代谢组学 功能基因组学 系统生物学 基因组学 转录组学 蛋白质组学 研究技术 发展趋势
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Senome-wide Association Studies in Maize: Praise and Stargaze 被引量:39
15
作者 Yingjie Xiao Haijun Liu +2 位作者 Liuji Wu Marilyn Warburton Jianbing Yan 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2017年第3期359-374,共16页
Genome-wide association study (GWAS) has become a widely accepted strategy for decoding genotype- phenotype associations in many species thanks to advances in next-generation sequencing (NGS) technol- ogies. Maize... Genome-wide association study (GWAS) has become a widely accepted strategy for decoding genotype- phenotype associations in many species thanks to advances in next-generation sequencing (NGS) technol- ogies. Maize is an ideal crop for GWAS and significant progress has been made in the last decade. This review summarizes current GWAS efforts in maize functional genomics research and discusses future prospects in the omics era. The general goal of GWAS is to link genotypic variations to corresponding dif- ferences in phenotype using the most appropriate statistical model in a given population. The current re- view also presents perspectives for optimizing GWAS design and analysis. GWAS analysis of data from RNA, protein, and metabolite-based omics studies is discussed, along with new models and new popula- tion designs that will identify causes of phenotypic variation that have been hidden to date. The joint and continuous efforts of the whole community will enhance our understanding of maize quantitative traits and boost crop molecular breeding designs. 展开更多
关键词 GWAS OMICS mixed model population design functional genomics Zea mays
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代谢组学在植物代谢研究中的应用 被引量:38
16
作者 淡墨 高先富 +3 位作者 谢国祥 刘忠 赵爱华 贾伟 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第22期2337-2341,共5页
代谢组学作为系统生物学的重要分支,近年来在植物研究领域受到广泛关注,并取得了重要进展。植物代谢组学目前虽然是一个并不成熟的领域,但是在研究模式植物的生理生化过程和基因改造等方面已成为最为有效的手段之一,近年在研究非模式植... 代谢组学作为系统生物学的重要分支,近年来在植物研究领域受到广泛关注,并取得了重要进展。植物代谢组学目前虽然是一个并不成熟的领域,但是在研究模式植物的生理生化过程和基因改造等方面已成为最为有效的手段之一,近年在研究非模式植物方面特别是药用植物方面也取得了突破性进展。作者在总结植物代谢组学的定义和发展的基础上重点阐述了其最新应用,并提出了植物代谢组学可能的发展方向。植物代谢组学为植物研究提供了一个整体全面的分析平台,从宏观角度更加科学地理解植物生理生化过程,进而为人类所用提供了可能。许多植物代谢物是中药的活性成分,其种类和含量随品种、生长环境、采集季节以及炮制方法等因素而变化。因此,中药的质量问题主要就是植物代谢组的问题。由于环境因素、植物有效部位对中药药效(或价值)有一定影响,而代谢组学法可以有效检测这些因素,植物代谢组学为深入研究开发中药资源创造了新的研究平台。 展开更多
关键词 代谢组学 代谢途径 系统生物学 中药 功能基因组学 蛋白质组学 转录组学
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植物反转录转座子及其在功能基因组学中的应用 被引量:29
17
作者 唐益苗 马有志 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 2005年第2期221-225,共5页
高等植物中的反转录转座子是构成植物基因组的重要成分之一。它分病毒家族和非病毒家族两类,病毒家族包括反转录病毒和类似于反转录病毒的非病毒转座子,病毒家族中的反转录转座子可再细分为Ty3 gypsy类和Ty1 copia类;非病毒家族可细分为... 高等植物中的反转录转座子是构成植物基因组的重要成分之一。它分病毒家族和非病毒家族两类,病毒家族包括反转录病毒和类似于反转录病毒的非病毒转座子,病毒家族中的反转录转座子可再细分为Ty3 gypsy类和Ty1 copia类;非病毒家族可细分为LINE类和SINE类。正常情况下大部分反转录转座子不具有活性,某些生物或非生物因素胁迫可激活部分反转录转座子转座。反转录转座子自身编码反转录酶进行转录,以“拷贝-粘贴”的转座模式导致基因组扩增和进化。具有活性的反转录转座子通过插入产生新的突变,可作为一种基因标签技术,应用于功能基因组学研究,并成为研究植物基因功能和表达的重要技术平台。本文综述了近几年来在植物反转录转座子方面的研究进展,主要包括植物反转录转座子的结构、特征、活性及其对基因组的影响和它们在功能基因组学中的应用。 展开更多
关键词 植物 反转录转座子 转座 功能基因组学 基因标签技术 植物基因组 应用 反转录病毒 非生物因素 技术平台
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植物转座子及其在功能基因组学中的应用 被引量:21
18
作者 廖鸣娟 董爱华 +1 位作者 王正栋 朱睦元 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2000年第5期345-348,共4页
转座子作为插入突变原或分子标签被广泛应用于基因的分离和克隆,且因其独特的性质已成为发现新基因和基因功能分析的有效工具。本文综述了植物转座子及其作为基因分离和克隆工具的研究进展,并讨论其在植物基因功能研究方面的应用。
关键词 植物 转座子标签 转座子捕捉 功能基因组学
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真菌降解木质纤维素的功能基因组学研究进展 被引量:37
19
作者 田朝光 马延和 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期1333-1339,共7页
木质纤维素利用的核心问题之一是生物质的降解,即如何将生物质由高聚大分子降解为可发酵的小分子糖,又称为糖化。自然界中向胞外大量分泌降解生物质酶类的微生物主要是真菌,研究真菌木质纤维素降解途径的分子机理对生物质的综合利用意... 木质纤维素利用的核心问题之一是生物质的降解,即如何将生物质由高聚大分子降解为可发酵的小分子糖,又称为糖化。自然界中向胞外大量分泌降解生物质酶类的微生物主要是真菌,研究真菌木质纤维素降解途径的分子机理对生物质的综合利用意义重大,是木质纤维素能否实现全面生物炼制的关键之一。以下将针对真菌降解木质纤维素的研究进展,特别是对利用功能基因组学所取得的进展进行评述。 展开更多
关键词 木质纤维素 真菌 功能基因组
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基因组学发展对中医证实质研究的启示——兼论中医基础理论研究发展的前景 被引量:28
20
作者 李杰芬 《上海中医药杂志》 北大核心 2001年第2期11-13,共3页
结合基因组学研究由结构基因组学过渡到功能基因组学的时代背景 ,探讨基因组学研究发展对中医证实质研究的启示。认为利用基因组学研究提供的新知识和新方法 ,从证相关基因研究入手 ,拓展至诸证的遗传学基础及相关基因编码蛋白的空间结... 结合基因组学研究由结构基因组学过渡到功能基因组学的时代背景 ,探讨基因组学研究发展对中医证实质研究的启示。认为利用基因组学研究提供的新知识和新方法 ,从证相关基因研究入手 ,拓展至诸证的遗传学基础及相关基因编码蛋白的空间结构和生物功能的研究等 ,有可能带动中医基础理论研究发生质的飞跃。 展开更多
关键词 实质研究 基因组学 功能基因组学 中医基础理论
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