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黄牛FSHR基因的生物信息学分析 被引量:18
1
作者 王明亮 陈鹏 +3 位作者 郝明超 高旭东 刘犇 余四九 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期7-13,共7页
利用生物基因组学数据库,对黄牛FSHR基因进行生物信息学分析,以预测FSHR基因编码产物的理化性质、结构与功能,同时构建FSHR同源系统进化树.结果表明:FSHR基因编码产物为疏水性跨膜蛋白,具有明显的信号肽,其切割位点位于17~18位的氨基... 利用生物基因组学数据库,对黄牛FSHR基因进行生物信息学分析,以预测FSHR基因编码产物的理化性质、结构与功能,同时构建FSHR同源系统进化树.结果表明:FSHR基因编码产物为疏水性跨膜蛋白,具有明显的信号肽,其切割位点位于17~18位的氨基酸之间,二级结构主要以α-螺旋与无规则卷曲为主,并主要在质膜中发挥生物学作用,跨膜区域分为跨膜域、胞外域和胞内域3个部分.序列分析表明,FSHR编码产物可能具有离子通道、运载体、受体、信号转导和阳离子通道等功能,在离子跨膜与信号传递过程中发挥重要作用,并对黄牛的激素调节有影响.FSHR基因编码产物系统进化树表明,黄牛FSHR与水牛、成都麻羊、绵羊等物种FSHR遗传距离较近,具有高度同源性. 展开更多
关键词 fshr基因 黄牛 生物信息学 繁殖性状
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文昌鸡FSHR基因多态性及其对繁殖性状的遗传效应 被引量:6
2
作者 李亨 薛素美 +2 位作者 刘宏祥 李慧芳 丁家桐 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2011年第9期58-64,共7页
【目的】寻找与文昌鸡繁殖性能相关的遗传标记。【方法】以促卵泡素受体(FSHR)基因作为影响鸡繁殖性状的候选基因,采用PCR-SSCP技术结合测序分析,对FSHR基因所有外显子及部分内含子区域进行单核苷酸多态性(SNPs)检测,收集文昌鸡繁殖性... 【目的】寻找与文昌鸡繁殖性能相关的遗传标记。【方法】以促卵泡素受体(FSHR)基因作为影响鸡繁殖性状的候选基因,采用PCR-SSCP技术结合测序分析,对FSHR基因所有外显子及部分内含子区域进行单核苷酸多态性(SNPs)检测,收集文昌鸡繁殖性能指标,分析FSHR基因多态性与繁殖性状的关系。【结果】共发现4个区域存在SNPs位点,分别为:区域4中exon 4编码区43bp处的T→C突变,但没有导致翻译后氨基酸序列的改变;区域2中exon 2编码区5′端-49bp处的C→T突变;区域6中exon 6编码区3′端+12bp处的A→G突变;区域9中exon 8编码区3′端+38bp处的G→T突变。对以上4个区域不同基因型与繁殖性状的相关性分析表明,文昌鸡FSHR基因第4外显子呈现的3种基因型(CC/CD/DD)多态性,与文昌鸡300日龄产蛋数及平均联产天数显著相关(P<0.05)),而且CD杂合基因型的300日龄产蛋数及平均联产天数显著高于其他基因型(P<0.05)。【结论】FSHR基因可作为影响文昌鸡产蛋数的候选基因。 展开更多
关键词 文昌鸡 促卵泡素受体(fshr)基因 单核苷酸多态性 遗传效应
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德国牧羊犬FSHR基因第1外显子SNP T89C与产仔数关系研究 被引量:1
3
作者 刘成武 杨敏 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第9期66-68,230,共4页
为了研究FSHR基因与产仔数的关系,试验以警用德国牧羊犬种母犬基因组为模板,应用PCR技术克隆FSHR基因第1外显子,测序检测单核苷酸多态性(SNP)T89C位点,并进一步分析基因型对产仔数的影响。结果表明:FSHR基因第1外显子SNP T89C CC基因型... 为了研究FSHR基因与产仔数的关系,试验以警用德国牧羊犬种母犬基因组为模板,应用PCR技术克隆FSHR基因第1外显子,测序检测单核苷酸多态性(SNP)T89C位点,并进一步分析基因型对产仔数的影响。结果表明:FSHR基因第1外显子SNP T89C CC基因型个体产仔数显著少于TT基因型个体产仔数(P<0.05),说明SNP T89C位点与德国牧羊犬产仔数存在相关性。 展开更多
关键词 德国牧羊犬 fshr基因 第1外显子 单核苷酸多态性(SNP) 产仔数
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德国牧羊犬FSHR基因第1外显子的克隆与序列分析
4
作者 刘成武 杨敏 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第8期72-74,共3页
为了研究德国牧羊犬卵泡刺激素受体(FSHR)基因多态性,试验以警用德国牧羊犬的基因组为模板,根据GenBank报道的拳师犬FSHR基因第1外显子序列设计引物,应用PCR技术,克隆和测定FSHR基因第1外显子序列,并进行BLAST比对分析。结果表明:30只... 为了研究德国牧羊犬卵泡刺激素受体(FSHR)基因多态性,试验以警用德国牧羊犬的基因组为模板,根据GenBank报道的拳师犬FSHR基因第1外显子序列设计引物,应用PCR技术,克隆和测定FSHR基因第1外显子序列,并进行BLAST比对分析。结果表明:30只受试犬基因遗传同源性高达100%,6只受试犬基因遗传同源性达99.6%,存在1处有义突变(SNP T89C)。 展开更多
关键词 德国牧羊犬 卵泡刺激素受体(fshr)基因 第1外显子 克隆 序列分析
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牛FSHR基因第10外显子单核苷酸多态性及其与双胎性状的关系 被引量:32
5
作者 雷雪芹 陈宏 +3 位作者 袁志发 徐廷生 雷初朝 孙维斌 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期34-37,共4页
以秦川牛和荷斯坦奶牛的双胎母牛和单胎母牛为实验材料 ,以牛的FSHR基因的第 10个外显子作为标记牛双胎性状的候选基因 ,用SNP法进行了多态检测 .结果发现 ,在秦川牛的双胎母牛中突变率 6 0 % (6 10 ) ,而在单胎母牛中突变率为 2 0 % (... 以秦川牛和荷斯坦奶牛的双胎母牛和单胎母牛为实验材料 ,以牛的FSHR基因的第 10个外显子作为标记牛双胎性状的候选基因 ,用SNP法进行了多态检测 .结果发现 ,在秦川牛的双胎母牛中突变率 6 0 % (6 10 ) ,而在单胎母牛中突变率为 2 0 % (2 10 ) ;在荷斯坦奶牛中 ,双胎母牛突变率为31 2 5 % (5 16 ) ,单胎母牛突变率为 6 6 7% (1 15 ) ;由此可见双胎牛和单胎牛二者之间FSHR基因的第 10个外显子的突变率差异明显 .这表明 ,选择FSHR基因的第 10个外显子有可能作为双胎性状的候选基因 .序列分析发现 ,在FSHR基因的第 15 0 6位碱基发生了突变 (T→C) ,但氨基酸没有发生变化 . 展开更多
关键词 fshr基因 第10外显子 单核苷酸多态性 双胎性状
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文昌鸡促卵泡素受体(FSHR)基因外显子区域SNPs分析 被引量:12
6
作者 李亨 陈宽维 +3 位作者 李慧芳 徐文娟 肖晓珺 朱文奇 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2009年第7期83-87,共5页
寻找与鸡繁殖性能相关的遗传标记,为高繁殖力的标记辅助选择提供科学依据。本研究以促卵泡素受体(FSHR)基因作为影响鸡繁殖性状的候选基因,采用PCR-SSCP技术结合测序对FSHR基因部分包括所有外显子区域进行单核苷酸多态性检测和分析。结... 寻找与鸡繁殖性能相关的遗传标记,为高繁殖力的标记辅助选择提供科学依据。本研究以促卵泡素受体(FSHR)基因作为影响鸡繁殖性状的候选基因,采用PCR-SSCP技术结合测序对FSHR基因部分包括所有外显子区域进行单核苷酸多态性检测和分析。结果发现,在区域2、区域4、区域6、区域9共4个区域存在SNPs位点。exon4编码区43bp处T→C突变,但没有导致翻译后氨基酸序列的改变,在exon2中编码区5′端—49bp处的C→T突变;exon6编码区3′端+12bp处的A→G突变;exon8编码区3′端+38bp处的G→T突变。促卵泡素受体(FSHR)是促卵泡素(FSH)的特异性受体,这些位点的单核苷酸多态性为下一步研究探讨FSHR基因对文昌鸡繁殖性能的遗传效应奠定了基础。 展开更多
关键词 文昌鸡 促卵泡素受体(fshr)基因 单核苷酸多态性
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半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)促性腺激素受体在雄性生殖周期中的表达 被引量:4
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作者 陈晓燕 温海深 +7 位作者 何峰 李吉方 陈彩芳 张葭人 金国雄 史宝 史丹 杨艳平 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期201-206,共6页
采用RT-PCR方法,研究了促性腺激素受体(FSHR和LHR)基因在雄性半滑舌鳎繁殖周期中的季节表达规律。结果表明,FSHR mRNA在雄鱼精巢、脑和脾中及LHR mRNA在雄鱼的精巢和脾中均呈季节规律性变化。3月份样品中,FSHR mRNA在精巢表达量最低,12... 采用RT-PCR方法,研究了促性腺激素受体(FSHR和LHR)基因在雄性半滑舌鳎繁殖周期中的季节表达规律。结果表明,FSHR mRNA在雄鱼精巢、脑和脾中及LHR mRNA在雄鱼的精巢和脾中均呈季节规律性变化。3月份样品中,FSHR mRNA在精巢表达量最低,12月份,表达量最高;FSHR mRNA在脑中表达模式与精巢相反,3月份表达量最高,12月份达到最低值;FSHR mRNA在脾中表达模式和精巢相同。在6月份精巢样品中,LHR mRNA表达量最低,12月表达量最高;在脾中,LHRmRNA在3月份表达量最低,12月份表达量最高。在精巢中,FSHR mRNA和LHR mRNA都是在排精时表达量达到最大值,说明这两种受体在雄性半滑舌鳎排精时发挥重要作用。 展开更多
关键词 半滑舌鳎 fshr LHR 基因表达 精巢
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半滑舌鳎促滤泡激素受体基因克隆及其在雌鱼生殖周期中的表达 被引量:3
8
作者 陈晓燕 温海深 +7 位作者 何峰 李吉方 陈彩芳 张葭人 金国雄 史宝 史丹 杨艳平 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期1309-1318,共10页
通过简并引物扩增及RACE技术,首次克隆了半滑舌鳎促滤泡激素受体(FSHR)基因cDNA全长序列。该基因全长3105bp,编码704个氨基酸,含有典型的跨膜螺旋结构区域(TMhelix),属于糖蛋白激素受体(GHR)家族。该基因编码区共有19个Ser,4个Thr和5个... 通过简并引物扩增及RACE技术,首次克隆了半滑舌鳎促滤泡激素受体(FSHR)基因cDNA全长序列。该基因全长3105bp,编码704个氨基酸,含有典型的跨膜螺旋结构区域(TMhelix),属于糖蛋白激素受体(GHR)家族。该基因编码区共有19个Ser,4个Thr和5个Tyr磷酸化位点;3个潜在的N基端糖基化位点,分别是62NISS,226NGIK和356NSTS;441T为潜在的PKC位点。基酸序列比对结果表明,半滑舌鳎FSHR含有GpHR家族的特殊信号序列,如82CCAF,481ERW,594FTD和667NPFLY,含有10个LRRs(LRR1-10)。组织表达分析表明,FSHR表达广泛,除在性腺中大量表达外,其他非性腺组织也有表达,尤其以脾、肾、头肾表达最较高。采用125Ⅰ标记放射免疫分析法(RIA)测定雌鱼血清中E2含量的季节变化,发现4月时E2含量最低,10月时含量最高。卵巢中FSHR mRNA在10月表达量最高,1月最低。 展开更多
关键词 半滑舌鳎 促滤泡激素受体 基因克隆 MRNA表达 雌二醇
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北极狐FSHR基因多态性与产仔数关联分析
9
作者 黄贺 田亚光 +1 位作者 郑鹏 李和平 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第6期11-15,共5页
为了研究北极狐FSHR基因的多态性与北极狐产仔数的相关性,试验采用PCR-SSCP技术检测北极狐FSHR基因多态性,用最小二乘法分析其多态性对北极狐产仔数影响的遗传效应。结果表明:FSHR基因在北极狐中存在多态性,A等位基因为优势等位基因。... 为了研究北极狐FSHR基因的多态性与北极狐产仔数的相关性,试验采用PCR-SSCP技术检测北极狐FSHR基因多态性,用最小二乘法分析其多态性对北极狐产仔数影响的遗传效应。结果表明:FSHR基因在北极狐中存在多态性,A等位基因为优势等位基因。对于初产母狐,BB基因型母狐的总产仔数(TNB)和产活仔数(NBA)比AA基因型母狐分别多1.08头和1.58头(P<0.05);对于经产母狐,BB基因型母狐的TNB和NBA比AA基因型母狐分别多1.72头和1.03头(P<0.05)。在北极狐群中,北极狐FSHR基因处于Hardy-Weinberg平衡状态。说明北极狐FSHR基因B等位基因对北极狐产仔数性状有显著影响。 展开更多
关键词 fshr基因 多态性 繁殖性能 北极狐 SSCP
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黄颡鱼促卵泡激素受体基因的克隆及其在雌鱼生殖周期中的表达
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作者 刘淼 温海深 +1 位作者 何峰 李吉方 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期1376-1385,共10页
为研究黄颡鱼促卵泡激素受体(FSHR)基因的克隆以及该基因在卵巢发育周期中的表达情况,实验首先采用SmartTMRace技术,获得了黄颡鱼促卵泡激素受体基因cDNA全长序列,该基因全长2 340 bp,编码661aa,具有G蛋白偶联受体超家族(G protein-coup... 为研究黄颡鱼促卵泡激素受体(FSHR)基因的克隆以及该基因在卵巢发育周期中的表达情况,实验首先采用SmartTMRace技术,获得了黄颡鱼促卵泡激素受体基因cDNA全长序列,该基因全长2 340 bp,编码661aa,具有G蛋白偶联受体超家族(G protein-coupled receptor,GPCR)的7个跨膜螺旋区(transmembrane domain)。经分析发现,得到的FSHR基因序列具有9个富含亮氨酸的重复性序列(LRRs);5个潜在的N-端糖基化位点;蛋白激酶C(proteinkinase C,PKC)磷酸化位点(403Y)位于第一个包外环,C-末端(C-terminal domain)G蛋白偶联区域,存在3个蛋白激酶C磷酸化位点(634S,643S,632T)。这些区域可能与FSHR的功能有密切关系。RT-PCR发现,FSHR基因在卵巢和脑中大量表达,在其他组织中均存在少量或微量的表达;在繁殖周期中,卵巢FSHR基因表达从Ⅲ期~Ⅳ期处于较高水平,在Ⅵ期时下降。研究推测,卵巢中FSHR基因参与黄颡鱼卵母细胞成熟及卵黄蛋白的积累过程。 展开更多
关键词 黄颡鱼 促卵泡激素受体 基因克隆 半定量mRNA表达
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