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鸭脂联素基因单核苷酸多态性检测及群体遗传分析
被引量：
15
1
作者
董飚
龚道清
+4 位作者
孟和
郁建锋
赵旭庭
段修军
顾志良
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第8期995-1000,共6页
以昆山麻鸭、樱桃谷鸭、高邮鸭、荆江麻鸭、金定鸭,山麻鸭、龙白鸭和白羽番鸭8个鸭品种为实验材料,根据鸭脂联素基因开放阅读框序列设计5对引物,用PCR-SSCP方法进行单核苷酸多态性分析,并对不同品种群体进行群体遗传学分析。结果发现引...
以昆山麻鸭、樱桃谷鸭、高邮鸭、荆江麻鸭、金定鸭,山麻鸭、龙白鸭和白羽番鸭8个鸭品种为实验材料,根据鸭脂联素基因开放阅读框序列设计5对引物,用PCR-SSCP方法进行单核苷酸多态性分析,并对不同品种群体进行群体遗传学分析。结果发现引物4扩增片段上共存有7个单碱基突变,第430、457、523处的G-A、A-G、T-C单碱基突变导致第144、153、175个氨基酸分别由丙氨酸(A)变为苏氨酸(T)、异亮氨酸(I)变为缬氨酸(V)、酪氨酸(Y)变为组氨酸(H);而C507T,T540C,C576T和C597T4个单碱基突变为沉默突变。鸭群中表现出AA、AB、AC、BB、BC、CC、DD、DE8种基因型。8种基因型在8个鸭品种间分布存在极显著的差异(P<0.01)。除金定鸭外,其他品种均处于Hardy-Weinberg平衡状态。群体遗传分析表明金定鸭的纯合度最高,高邮鸭最低,其他各群体的纯合度较相近;金定鸭为低度多态,高邮鸭为高度多态,其他品种为中度多态。表明鸭脂联素基因不同品种中具有丰富的单核苷酸多态性,可以进一步作为候选基因来分析其与脂肪性状的相关性。
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关键词
鸭
脂联素基因
单核苷酸多态性
遗传分析
脂肪性状
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职称材料
鸡OBR基因第20外显子多态性与脂肪性状的相关研究
被引量：
3
2
作者
李慧锋
李俊英
+3 位作者
曲鲁江
姜润深
张龙超
杨宁
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第5期422-425,共4页
对鸡OBR基因的单链构象多态性进行检测,在第20 外显子发现了一个新的单核苷酸多态位点。克隆测序了2种纯合子片段,在第20外显子编码区的860位碱基确认了一个由T变为C的突变,编码的氨基酸由缬氨酸突变为丙氨酸。在一个地方鸡杂交群体中...
对鸡OBR基因的单链构象多态性进行检测,在第20 外显子发现了一个新的单核苷酸多态位点。克隆测序了2种纯合子片段,在第20外显子编码区的860位碱基确认了一个由T变为C的突变,编码的氨基酸由缬氨酸突变为丙氨酸。在一个地方鸡杂交群体中检验这一多态位点与脂肪性状的相关,建立固定效应模型进行最小二乘分析,对脂肪性状的不同基因型效应进行差异显著性检验。结果表明:试验群体中AA、AB、BB基因型频率分别为0.641、0.292和0.067。不同基因型对各组杂交肉鸡腹脂率、皮下脂肪厚、肌间脂宽和肌内脂肪含量的效应均不显著(P>0.05),说明这一外显子片段上的变异位点并不是导致脂肪性状产生差异的原因。此结果为进一步研究鸡OBR基因多态性及其功能提供参考,并为丰富基因图谱的标记提供理论依据。
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关键词
OBR基因
脂肪性状
外显子
相关研究
单核苷酸多态位点
单链构象多态性
最小二乘分析
固定效应模型
肌内脂肪含量
显著性检验
基因型效应
基因型频率
基因多态性
克隆测序
杂交群体
皮下脂肪
基因图谱
纯合子
编码区
丙氨酸
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职称材料
题名
鸭脂联素基因单核苷酸多态性检测及群体遗传分析
被引量：
15
1
作者
董飚
龚道清
孟和
郁建锋
赵旭庭
段修军
顾志良
机构
常熟理工学院生物系
扬州大学动物科学与技术学院
上海交通大学农业与生物学院
江苏畜牧兽医职业技术学院
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第8期995-1000,共6页
基金
江苏省自然科学基金(编号:BK2005026)
江苏省高校自然科学研究计划项目(编号:03KJB230004)资助~~
文摘
以昆山麻鸭、樱桃谷鸭、高邮鸭、荆江麻鸭、金定鸭,山麻鸭、龙白鸭和白羽番鸭8个鸭品种为实验材料,根据鸭脂联素基因开放阅读框序列设计5对引物,用PCR-SSCP方法进行单核苷酸多态性分析,并对不同品种群体进行群体遗传学分析。结果发现引物4扩增片段上共存有7个单碱基突变,第430、457、523处的G-A、A-G、T-C单碱基突变导致第144、153、175个氨基酸分别由丙氨酸(A)变为苏氨酸(T)、异亮氨酸(I)变为缬氨酸(V)、酪氨酸(Y)变为组氨酸(H);而C507T,T540C,C576T和C597T4个单碱基突变为沉默突变。鸭群中表现出AA、AB、AC、BB、BC、CC、DD、DE8种基因型。8种基因型在8个鸭品种间分布存在极显著的差异(P<0.01)。除金定鸭外,其他品种均处于Hardy-Weinberg平衡状态。群体遗传分析表明金定鸭的纯合度最高,高邮鸭最低,其他各群体的纯合度较相近;金定鸭为低度多态,高邮鸭为高度多态,其他品种为中度多态。表明鸭脂联素基因不同品种中具有丰富的单核苷酸多态性,可以进一步作为候选基因来分析其与脂肪性状的相关性。
关键词
鸭
脂联素基因
单核苷酸多态性
遗传分析
脂肪性状
Keywords
duck
adiponectin
gene
SNPs
genetic
analyses
fattiness
trait
分类号
S834 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
鸡OBR基因第20外显子多态性与脂肪性状的相关研究
被引量：
3
2
作者
李慧锋
李俊英
曲鲁江
姜润深
张龙超
杨宁
机构
中国农业大学动物科技学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第5期422-425,共4页
基金
国家杰出青年科学基金项目(30225032)
科技部"863"计划项目(2002AA242021)
文摘
对鸡OBR基因的单链构象多态性进行检测,在第20 外显子发现了一个新的单核苷酸多态位点。克隆测序了2种纯合子片段,在第20外显子编码区的860位碱基确认了一个由T变为C的突变,编码的氨基酸由缬氨酸突变为丙氨酸。在一个地方鸡杂交群体中检验这一多态位点与脂肪性状的相关,建立固定效应模型进行最小二乘分析,对脂肪性状的不同基因型效应进行差异显著性检验。结果表明:试验群体中AA、AB、BB基因型频率分别为0.641、0.292和0.067。不同基因型对各组杂交肉鸡腹脂率、皮下脂肪厚、肌间脂宽和肌内脂肪含量的效应均不显著(P>0.05),说明这一外显子片段上的变异位点并不是导致脂肪性状产生差异的原因。此结果为进一步研究鸡OBR基因多态性及其功能提供参考,并为丰富基因图谱的标记提供理论依据。
关键词
OBR基因
脂肪性状
外显子
相关研究
单核苷酸多态位点
单链构象多态性
最小二乘分析
固定效应模型
肌内脂肪含量
显著性检验
基因型效应
基因型频率
基因多态性
克隆测序
杂交群体
皮下脂肪
基因图谱
纯合子
编码区
丙氨酸
Keywords
chicken
obese
receptor
single
nucleotide
polymorphism
fattiness
trait
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
Q343 [农业科学—畜牧兽医]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鸭脂联素基因单核苷酸多态性检测及群体遗传分析
董飚
龚道清
孟和
郁建锋
赵旭庭
段修军
顾志良
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2007
15
下载PDF
职称材料
2
鸡OBR基因第20外显子多态性与脂肪性状的相关研究
李慧锋
李俊英
曲鲁江
姜润深
张龙超
杨宁
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005
3
下载PDF
职称材料
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