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乳酸菌胞外多糖的结构、生物合成及其应用 被引量:15
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作者 丹彤 王俊国 张和平 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第7期335-339,共5页
胞外多糖(EPS)是微生物在生长代谢过程中分泌到细胞壁外常渗于培养基的一类糖类化合物。这些高分子糖类聚合物因具有独特的流变学特性和分子结构,可作为增稠剂、乳化剂和稳定剂等在食品和非食品工业中发挥重要作用。一些乳酸菌胞外多糖... 胞外多糖(EPS)是微生物在生长代谢过程中分泌到细胞壁外常渗于培养基的一类糖类化合物。这些高分子糖类聚合物因具有独特的流变学特性和分子结构,可作为增稠剂、乳化剂和稳定剂等在食品和非食品工业中发挥重要作用。一些乳酸菌胞外多糖还具有促进免疫、降低胆固醇和抗肿瘤等特性。本文综述了乳酸菌胞外多糖的化学结构、生物合成机制及其在食品中的应用。 展开更多
关键词 乳酸菌 胞外多糖 EPS基因簇 生物合成 遗传调控
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动物双歧杆菌RH胞外多糖基因簇的克隆及分析 被引量:7
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作者 刘丽莎 范熠 +1 位作者 旭日花 李平兰 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第15期136-142,共7页
利用16S rRNA结合tuf基因将一株分离自广西巴马长寿老人源的产胞外多糖菌株RH鉴定为动物双歧杆菌乳亚种(Bifidobacterium animalis subsp.lactis RH),根据GenBank中已报道动物双歧杆菌乳亚种产糖相关基因设计引物,经PCR扩增获得双歧杆... 利用16S rRNA结合tuf基因将一株分离自广西巴马长寿老人源的产胞外多糖菌株RH鉴定为动物双歧杆菌乳亚种(Bifidobacterium animalis subsp.lactis RH),根据GenBank中已报道动物双歧杆菌乳亚种产糖相关基因设计引物,经PCR扩增获得双歧杆菌RH的12个胞外多糖(EPS)生物合成相关基因。对各阅读框功能预测分析表明这些基因主要参与EPS合成过程多糖聚合、糖基转移、糖链长度控制以及多糖转运和输出,为解析双歧杆菌RH胞外多糖生物合成途径和调控机制提供理论基础。 展开更多
关键词 胞外多糖 双歧杆菌 基因簇
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乳杆菌胞外多糖合成基因簇及构效关系 被引量:1
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作者 石金铭 陈秋羽 +2 位作者 刘昭曦 刘双江 陈敏 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期3482-3499,共18页
肠道菌群稳态对维护人体的健康具有至关重要的作用。作为肠道天然微生物群“守卫兵”,益生菌参与改善体内微生态平衡。乳杆菌(Lactobacillus)是一种肠道益生菌的代表,其合成的胞外多糖(exopolysaccharide,EPS)既可通过增益肠道内其他益... 肠道菌群稳态对维护人体的健康具有至关重要的作用。作为肠道天然微生物群“守卫兵”,益生菌参与改善体内微生态平衡。乳杆菌(Lactobacillus)是一种肠道益生菌的代表,其合成的胞外多糖(exopolysaccharide,EPS)既可通过增益肠道内其他益生菌的生长来优化肠道微生态,还具有抗肿瘤、抗氧化、降胆固醇、降血压和增强机体免疫力等益生功能。本文对近年来乳杆菌胞外多糖的遗传、生物学活性、构效关系等方面的研究进展,进行综述和展望。 展开更多
关键词 乳杆菌 胞外多糖 基因簇 多糖结构 构效关系
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植物乳杆菌C88胞外多糖生物合成基因的克隆及序列比对 被引量:5
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作者 赵玉娟 李盛钰 +5 位作者 张莉 牛春华 张雪 李达 张贵斌 杨贞耐 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期331-337,共7页
乳酸菌胞外多糖能显著改善发酵乳制品及食品的流变学和质构特性。为进一步了解乳酸菌胞外多糖的生物合成途径及调控机制,本研究对参与植物乳杆菌C88胞外多糖生物合成基因簇的部分序列进行了克隆和鉴定。根据GenBank中已报道植物乳杆菌... 乳酸菌胞外多糖能显著改善发酵乳制品及食品的流变学和质构特性。为进一步了解乳酸菌胞外多糖的生物合成途径及调控机制,本研究对参与植物乳杆菌C88胞外多糖生物合成基因簇的部分序列进行了克隆和鉴定。根据GenBank中已报道植物乳杆菌基因序列的保守区域设计特异性引物,扩增出植物乳杆菌C88生物合成蛋白基因(cps4A)序列,并通过染色体步移方法克隆了植物乳杆菌C88参与胞外多糖合成基因簇的部分序列(4.9kb)。利用生物信息学方法预测基因簇中6个阅读框的结构和功能,结果表明该序列与已报道的乳酸杆菌胞外多糖生物合成基因具有高度的同源性(>96%);对各阅读框功能预测分析发现,这6个基因主要编码参与胞外多糖合成中的多糖合成蛋白、糖链长度检测蛋白、UDP-葡萄糖-4-异构酶和糖基转移酶。本研究将为利用基因工程方法调控多糖的合成和产量提供理论依据。 展开更多
关键词 植物糖乳杆菌 胞外多糖 基因簇 生物合成
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鼠李糖乳杆菌JAAS8胞外多糖聚合和转运相关基因的克隆及生物信息学分析 被引量:4
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作者 赵玉娟 李盛钰 +3 位作者 牛春华 张雪 曾宪鹏 杨贞耐 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期447-452,共6页
本研究根据GenBank中多株鼠李糖乳杆菌(Lactobacillus rhamnosus)磷蛋白磷酸酶(phosphorotein phosphatase,wzb)和多糖共聚酶(polysaccharide co-polymerase,wzd)基因的保守序列信息设计特异性引物,以鼠李糖乳杆菌JAAS8基因组DNA为模板,... 本研究根据GenBank中多株鼠李糖乳杆菌(Lactobacillus rhamnosus)磷蛋白磷酸酶(phosphorotein phosphatase,wzb)和多糖共聚酶(polysaccharide co-polymerase,wzd)基因的保守序列信息设计特异性引物,以鼠李糖乳杆菌JAAS8基因组DNA为模板,经PCR扩增获得JAAS8磷蛋白磷酸酶和多糖共聚酶基因的部分序列,利用染色体步移方法(chromosome walking)结合PCR技术获得了参与胞外多糖生物合成的酪氨酸蛋白激酶(tyrosine-protein kinase,wze)、转录调节子(transcriptional regulator,wzr),多糖重复单元转运子(polysaccharide transporter,wzx)和多糖重复单元聚合酶(repeat unit polymerase,wzy)序列,片段长度约8.5kb。生物信息学比对和分析表明,除多糖重复单元聚合酶基因外,其它5个基因预测氨基酸序列与GenBank已报道的乳酸菌胞外多糖生物合成基因簇高度同源,尤其是磷蛋白磷酸酶与鼠李糖乳杆菌HN001的同源性高达99%。对各阅读框功能预测分析表明这6个基因序列主要参与胞外多糖合成过程中多糖聚合、糖链长度检测、多糖转运和输出,为进一步了解乳杆菌胞外多糖生物合成途径和调控机制奠定了基础。 展开更多
关键词 鼠李糖乳杆菌 胞外多糖 基因簇 生物合成
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乳酸乳球菌乳酸亚种IMAU11823全基因组测序及胞外多糖基因簇分析 被引量:4
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作者 李敏 李伟程 +4 位作者 刘亚华 尤利军 马腾 赵洁 孙志宏 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第4期256-266,共11页
目的:乳酸乳球菌乳酸亚种IMAU11823是从内蒙古锡林郭勒盟自然发酵乳制品嚼口中分离得到的1株具有优良发酵特性且高产胞外多糖的乳酸菌。为探究其产胞外多糖的作用机制,对其进行全基因组测序并解析基因组序列信息。方法:使用PacBio SMRT... 目的:乳酸乳球菌乳酸亚种IMAU11823是从内蒙古锡林郭勒盟自然发酵乳制品嚼口中分离得到的1株具有优良发酵特性且高产胞外多糖的乳酸菌。为探究其产胞外多糖的作用机制,对其进行全基因组测序并解析基因组序列信息。方法:使用PacBio SMRT三代测序技术对该菌株进行全基因组测序,采用生物信息学方法对其进行序列组装、基因预测和功能注释,并深入挖掘可能参与胞外多糖生物合成相关的基因信息。结果:乳酸乳球菌乳酸亚种IMAU11823包含1条染色体DNA(基因组大小为2 458 520 bp,GC含量为35.2%)和3个环状质粒(pIMAU11823A、pIMAU11823B、pIMAU11823C,基因组大小和GC含量分别为127 965,24 554,7 734 bp和35.7%,39.5%,32.7%),同时发现该菌株基因组内具有乳糖、纤维二糖、蔗糖、果糖、甘露糖、半乳糖转运系统和7种糖核苷酸合成相关基因以及1个胞外多糖合成基因簇epsRXCDBEF(GTF1)H(GTF2)JKM。结论:本研究揭示了乳酸乳球菌乳酸亚种IMAU11823的基因组特征,并预测了其胞外多糖的合成机制,为研究其产生的胞外多糖结构特征提供了理论依据,同时为该菌株在工业生产中的应用奠定理论基础。 展开更多
关键词 乳酸乳球菌乳酸亚种 全基因组测序 胞外多糖 基因簇
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嗜热链球菌KLDSSM胞外多糖生物合成途径的分析 被引量:3
7
作者 丁秀云 蒙月月 +1 位作者 李柏良 霍贵成 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期151-156,共6页
为了从遗传水平上探究嗜热链球菌KLDS SM合成胞外多糖(EPS)的能力,本研究从糖被转运进入胞内、糖核苷酸合成及EPS基因簇三方面所涉及的基因进行了相关分析。结果发现,该菌能够转运葡萄糖、乳糖、蔗糖、海藻糖及甘露糖5种糖,具有代谢葡... 为了从遗传水平上探究嗜热链球菌KLDS SM合成胞外多糖(EPS)的能力,本研究从糖被转运进入胞内、糖核苷酸合成及EPS基因簇三方面所涉及的基因进行了相关分析。结果发现,该菌能够转运葡萄糖、乳糖、蔗糖、海藻糖及甘露糖5种糖,具有代谢葡萄糖、乳糖、果糖、蔗糖、海藻糖与甘露糖形成糖酵解中间代谢产物的酶类,拥有合成EPS前体物质UDP-葡萄糖、UDP-半乳糖、UDP-N-乙酰基葡糖胺、UDP-呋喃半乳糖与d TDP-鼠李糖的潜力。同时序列比对分析发现该菌具有一个与高产EPS的菌株ASCC 1275一致性极高的EPS基因簇,且EPS初步产量测定约为331 mg/m L,表明该菌是一株高产EPS潜力菌株,具有较大的应用潜能。 展开更多
关键词 嗜热链球菌KLDS SM 糖转运系统 糖核苷酸 EPS基因簇 生物信息分析
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Streptococcus thermophilus IMAU20551胞外多糖基因簇及其表达分析
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作者 乔少婷 代安娜尔 +3 位作者 解敏 孙思霖 聂佳莹 丹彤 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第22期136-144,共9页
以1株产胞外多糖(exopolysaccharide,EPS)的嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus)IMAU20551为研究对象,提取其DNA后采用Illumina HiSeq技术对DNA进行二代基因组重测序,并利用SOAPdenovo软件对其进行组装,通过与RAST、直系同源集、基... 以1株产胞外多糖(exopolysaccharide,EPS)的嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus)IMAU20551为研究对象,提取其DNA后采用Illumina HiSeq技术对DNA进行二代基因组重测序,并利用SOAPdenovo软件对其进行组装,通过与RAST、直系同源集、基因本体论、京都基因与基因组百科全书等数据库进行比对,注释基因组中功能基因。发现S.thermophilus IMAU20551基因组全长1725107 bp,共注释出1884个功能基因,其中包含一个长度为19376 bp的完整eps基因簇,该基因簇中与EPS合成相关的基因共有18个,主要包括epsA、epsB、epsC、epsD、epsE、eps1F、eps2F、epsJ、wzx、epsP和epsX等,这些基因分别对EPS的合成、组装以及转运输出进行调控。另一方面,利用实时聚合酶链式反应对S.thermophilus IMAU20551 eps基因簇表达进行验证,发现所有基因均可表达,且除个别糖基转移酶基因外,其他被测基因均在6 h达到最大表达量。本研究介绍了S.thermophilus IMAU20551的基因组特征、eps基因簇及其表达能力,为今后深入研究S.thermophilus EPS基因簇及其表征结构的互作关系奠定基础。 展开更多
关键词 胞外多糖 嗜热链球菌 eps基因簇 基因组信息 实时聚合酶链式反应
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鼠李糖乳杆菌JAAS8胞外多糖生物合成基因的克隆及生物信息学分析
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作者 李盛钰 赵玉娟 +4 位作者 张雪 戴大海 曾宪鹏 张贵斌 杨贞耐 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第17期292-296,共5页
根据已知乳杆菌胞外多糖生物合成基因的同源性,利用其保守区设计引物,扩增出鼠李糖乳杆菌JAAS8磷蛋白磷酸酶基因(wzb)序列,并通过染色体步移法克隆了鼠李糖乳杆菌JAAS8参与胞外多糖生物合成基因簇全部序列(19.7kb),利用生物信息学方法... 根据已知乳杆菌胞外多糖生物合成基因的同源性,利用其保守区设计引物,扩增出鼠李糖乳杆菌JAAS8磷蛋白磷酸酶基因(wzb)序列,并通过染色体步移法克隆了鼠李糖乳杆菌JAAS8参与胞外多糖生物合成基因簇全部序列(19.7kb),利用生物信息学方法预测了基因簇16个阅读框的结构和功能。结果表明,该序列与已报道的乳杆菌胞外多糖生物合成基因具有高度同源性。welF、welG、welH、welI、welJ和welE为合成寡糖重复单元的糖基转移酶基因。rmlA、rmlB和rmlC基因与dTDP-L-鼠李糖前体的生物合成密切相关。wzd、wze、wzy、wzx、wzr和wzb基因预测蛋白主要参与胞外多糖合成过程中多糖链长检测、聚合和输出。 展开更多
关键词 鼠李糖乳杆菌 胞外多糖 基因簇 生物合成
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微生物胞外多糖生物合成研究进展 被引量:14
10
作者 王玲燕 李元 《药物生物技术》 CAS CSCD 2002年第6期369-373,共5页
微生物胞多外糖 (EPSs)在食品和医药等方面具有很大的应用价值 ,近年来 ,有关EPSs生物合成研究 ,以及参与EPSs生物合成的基因蔟的不断发现 。
关键词 研究进展 微生物胞外多糖 生物合成 基因簇
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长双歧杆菌A17胞外多糖合成基因簇的分析
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作者 张文丽 王英 +2 位作者 石莹 呼鑫荣 旭日花 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期9-15,共7页
为探究长双歧杆菌A17胞外多糖(exopolysaccharides,EPS)生物合成途径,作者依托全基因组测序,利用eggNOG-mapper、KEGG、GO数据注释和局部序列比对等方法对EPS合成相关的基因进行注释与同源性分析。根据同源性分析得到一个长度约为20 kb... 为探究长双歧杆菌A17胞外多糖(exopolysaccharides,EPS)生物合成途径,作者依托全基因组测序,利用eggNOG-mapper、KEGG、GO数据注释和局部序列比对等方法对EPS合成相关的基因进行注释与同源性分析。根据同源性分析得到一个长度约为20 kb由19个基因组成的A17 eps基因簇,预测到EPS前体糖核苷酸合成途径,同时发现该途径中的关键基因pgm并进行了异源表达。eps基因簇负责eps单体重复单元合成以及输出相关的EPS合成过程,在EPS前体糖核苷酸合成途径中双歧杆菌A17利用葡萄糖、乳糖形成UDP-Gal、UDP-Glc两种前体糖核苷酸。其中,pgm编码1→6葡萄糖磷酸变位酶,该酶的产量和活性与EPS合成有关。 展开更多
关键词 双歧杆菌 胞外多糖 基因簇 异源表达
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