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蒺藜状苜蓿中MtERF-6基因的克隆及序列分析 被引量：5
1
作者 连瑞丽 李宇伟 赵德刚 《草业科学》 CAS CSCD 2006年第9期82-87,共6页
乙烯反应元件结合蛋白属于植物特有的一个转录因子家族,这个家族保守的DNA结合域称为ERF结构域。根据对蒺藜状苜蓿Medicago truncatula测序的数据库进行分析,设计合成引物,通过RT-PCR扩增得到了乙烯反应元件结合蛋白基因(MtERF-6),并测... 乙烯反应元件结合蛋白属于植物特有的一个转录因子家族,这个家族保守的DNA结合域称为ERF结构域。根据对蒺藜状苜蓿Medicago truncatula测序的数据库进行分析,设计合成引物,通过RT-PCR扩增得到了乙烯反应元件结合蛋白基因(MtERF-6),并测定了其核苷酸全序列。该基因完整的读码框包括654 bp,编码218个氨基酸。用此片段的氨基酸序列通过GenBankBLAST分析表明,该基因属于EREBP(Ethylene responsive element binding proteins)家族,其核苷酸与已报道的ERF4[Gossypium hirsu-tum]、ATERF-9[Arabidopsis thaliana]、NtERF3[Nicotiana tabacum]、NsERF3[Nicotiana sylvestris]、CaEREBP-C1[Capsicum annuum]的相似性分别为45%、47%、41%、40%和42%,是新的基因。MtERF-6的核酸序列在GenBank发表,登录号为DQ344024。 展开更多
关键词 蒺藜状苜蓿 乙烯反应元件结合蛋白 MtERF-6基因
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玉米乙烯应答元件结合蛋白基因启动子克隆与功能验证 被引量：6
2
作者 刘鑫 邹郁陶 +2 位作者 牟巍 李晚忱 付凤玲 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期629-637,共9页
为了给玉米转基因研究提供更多的非生物逆境诱导启动子,寻找只在逆境胁迫条件下适当驱动外源抗逆基因的表达,在生物信息学分析的基础上,克隆与水稻DREB1B转录因子基因同源的玉米乙烯应答元件结合蛋白基因sb CBF6的启动子psb CBF6,在非... 为了给玉米转基因研究提供更多的非生物逆境诱导启动子,寻找只在逆境胁迫条件下适当驱动外源抗逆基因的表达,在生物信息学分析的基础上,克隆与水稻DREB1B转录因子基因同源的玉米乙烯应答元件结合蛋白基因sb CBF6的启动子psb CBF6,在非生物逆境应答元件分析和实时定量PCR验证其非生物逆境胁迫响应特性后,用以构建驱动报告基因GUS的表达载体,并使用基因枪法转化玉米愈伤组织,通过愈伤组织的GUS荧光值与荧光素酶发光值的比值,评价psb CBF6启动子在非生物逆境胁迫及激素诱导条件下的驱动活性。结果表明,sb CBF6基因在各种非生物逆境胁迫下差异表达。psb CBF6启动子长1 479 bp,存在多种与非生物逆境胁迫应答相关的调控元件,可在非生物胁迫条件下驱动外源抗逆基因在转基因植物中诱导表达。试验结果为研究抗逆转基因玉米提了供参考。 展开更多
关键词 非生物逆境 乙烯应答元件结合蛋白 启动子 玉米
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丹参功能基因组学研究Ⅳ——丹参乙烯应答因子(ERF)基因的分析 被引量：5
3
作者 胥彬 黄璐琦 +2 位作者 崔光红 毛莹 张辉 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第20期2564-2566,共3页
目的:获得丹参乙烯应答因子结合蛋白基因序列,并进行生物信息学分析和初步的表达特性研究。方法:利用cDNA芯片技术,从不同时期毛状根中获得目的基因。利用BLAST进行序列比对,ORF finder寻找开放读码框,Prosite分析蛋白质的基本结构域。... 目的:获得丹参乙烯应答因子结合蛋白基因序列,并进行生物信息学分析和初步的表达特性研究。方法:利用cDNA芯片技术,从不同时期毛状根中获得目的基因。利用BLAST进行序列比对,ORF finder寻找开放读码框,Prosite分析蛋白质的基本结构域。用半定量RT-PCR检测其在丹参组培苗根、茎、叶中的表达情况。结果:得到1个乙烯应答因子结合蛋白基因全长序列,全长952bp,具有1个699bp的开放读码框和87bp的5′非编码区、166bp的3′非编码区,推测的氨基酸序列中含有1个高度保守的AP2/ERFDNA结合域,GenBank EF667000,命名为SmERF。半定量RT-PCR表明,SmERF基因在丹参组培苗根、茎、叶中均有转录水平的表达,根中表达量高于茎和叶中的。结论:首次得到丹参乙烯应答因子结合蛋白基因,为其功能研究提供了基础。 展开更多
关键词 丹参 乙烯应答因子结合蛋白 序列
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超级杂交稻乙烯反应元件结合蛋白cDNA的生物信息学分析与克隆
4
作者 晏瑾 肖浪涛 《生物技术通讯》 CAS 2008年第1期47-50,共4页
目的:从超级杂交稻中克隆乙烯反应元件结合蛋白(EREBP)的cDNA。方法:利用模式植物拟南芥中编码乙烯反应元件结合蛋白的cDNA,对现有的水稻基因组数据库进行搜索,获得一条高同源的未知序列。对这条未知序列的核酸序列和蛋白质序列及其结... 目的:从超级杂交稻中克隆乙烯反应元件结合蛋白(EREBP)的cDNA。方法:利用模式植物拟南芥中编码乙烯反应元件结合蛋白的cDNA,对现有的水稻基因组数据库进行搜索,获得一条高同源的未知序列。对这条未知序列的核酸序列和蛋白质序列及其结构、性质、功能等进行生物信息学分析后,以超级杂交稻为材料,用未知序列设计一对简并引物,用RT-PCR技术扩增后进行T-A克隆。结果:生物信息学分析结果表明,这个未知序列应为水稻中编码EREBP的cDNA;克隆后经测序获得一条915 bp的cDNA,BLAST表明这条cDNA序列与未知序列的部分核酸序列的同源性达到了99%;提交NCBI的GenBank后被接受,登录号为EF507537。结论:以生物信息学分析为基础,结合RT-PCR和T-A克隆技术,成功地从超级杂交稻中克隆了EREBP cDNA。 展开更多
关键词 超级杂交稻 生物信息学 乙烯反应元件结合蛋白 基因克隆
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