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应用实时荧光定量PCR定量检测溃疡性结肠炎肠道大肠埃希菌、乳酸杆菌及双歧杆菌属的变化 被引量:20
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作者 宋美茹 姚萍 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2012年第3期239-243,共5页
目的应用实时荧光定量PCR(RT-PCR)法对溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)患者粪便中大肠埃希菌、乳酸杆菌及双歧杆菌属的数量进行定量检测分析。方法根据细菌的16S rDNA基因序列设计大肠埃希菌、乳酸杆菌及双歧杆菌属的种属特异性引... 目的应用实时荧光定量PCR(RT-PCR)法对溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)患者粪便中大肠埃希菌、乳酸杆菌及双歧杆菌属的数量进行定量检测分析。方法根据细菌的16S rDNA基因序列设计大肠埃希菌、乳酸杆菌及双歧杆菌属的种属特异性引物。收集溃疡性结肠炎患者及正常对照者新鲜粪便标本各35例,从待测粪便标本中提取细菌基因组DNA,进行实时荧光定量PCR反应,定量分析不同细菌的数量。结果正常对照组与病例组粪便中细菌数量分别为大肠埃希菌(4.62±1.10;5.27±1.02)、乳酸杆菌属(4.99±0.75;4.65±0.95)、双歧杆菌属(5.07±0.95;4.93±0.99),病例组大肠埃希菌数量明显增多(t=2.540,P=0.013),而乳酸杆菌及双歧杆菌属数量与正常组比较差异无统计学意义(t1=0.488,P1=0.530;t2=-0.533,P2=0.596)。结论溃疡性结肠炎患者粪便中大肠埃希菌的数量较正常对照明显增多,而乳酸杆菌及双歧杆菌属的数量无明显变化,提示大肠埃希菌与溃疡性结肠炎的发病或复发有关系,而乳酸及双歧杆菌属与此病的关系有待进一步研究。 展开更多
关键词 溃疡性结肠炎 大肠埃希菌 乳酸杆菌及双歧杆菌属 实时荧光定量PCR
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河北省禽病原性大肠杆菌的血清型鉴定 被引量:11
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作者 高轩 李潭清 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第1期56-59,共4页
从河北省的保定、石家庄等8个市(地)所属的78个发病鸡群中的183只病、死鸡的内脏、器官中分离出127株大肠杆菌,并对其进行了生化试验、致病性试验及血清学鉴定。127个分离株中,除32株未能定型外,共鉴定出95个分离株的O血清型,占... 从河北省的保定、石家庄等8个市(地)所属的78个发病鸡群中的183只病、死鸡的内脏、器官中分离出127株大肠杆菌,并对其进行了生化试验、致病性试验及血清学鉴定。127个分离株中,除32株未能定型外,共鉴定出95个分离株的O血清型,占分离菌株的74.8%,这些定型菌株覆盖了24个血清型,但以O78(2.32%),O2(13.68%),O111(9.47%),O1(8.42%)和O15(6.32%)等5个血清型的检出率为高,共61株,占定型菌株的64.21%,且前3种血清型在种类上仅占总量的12.5%,却拥有47个分离株,占定型菌株的49.47%,调查结果表明:O78,O2和O111等血清型为河北省禽病原性大肠杆菌的优势血清型。另外,血清型鉴定检出率较低的还有34个分离株,占定型菌株的35.8%。 展开更多
关键词 大肠杆菌 血清型 禽病
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乌鲁木齐市售畜禽肉源大肠杆菌的耐药性分析 被引量:10
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作者 唐雪林 佟盼盼 +5 位作者 张萌萌 张凌 马晓玉 马蕊 谢金鑫 苏战强 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2021年第10期15-23,共9页
【目的】调查新疆乌鲁木齐市售畜禽肉中大肠杆菌的耐药性及其所携带的耐药基因情况,为肉类食品的耐药性监测及防控提供依据。【方法】从乌鲁木齐市7区19家超市采集畜禽肉样品353份,其中鸡肉90份、猪肉90份、牛肉84份、羊肉89份,对采集... 【目的】调查新疆乌鲁木齐市售畜禽肉中大肠杆菌的耐药性及其所携带的耐药基因情况,为肉类食品的耐药性监测及防控提供依据。【方法】从乌鲁木齐市7区19家超市采集畜禽肉样品353份,其中鸡肉90份、猪肉90份、牛肉84份、羊肉89份,对采集的肉类样品进行大肠杆菌的分离与鉴定。用麦康凯琼脂培养基和科玛嘉尿道菌群定位显色培养基对菌株进行初步筛选分离,用特异性16S rDNA法鉴定大肠杆菌。通过PCR对分离菌株进行系统发育分群,采用K-B纸片琼脂扩散法测定分离菌株的耐药表型,PCR扩增法获得相应的耐药基因并测序。【结果】从乌鲁木齐市353份市售畜禽肉样中分离鉴定得到大肠杆菌252株。系统发育分群结果显示,分离的252株大肠杆菌菌株以A群(79.4%)为主,其次是B1群(12.3%)。耐药表型测定结果表明,大肠杆菌对四环素(49.6%)、氨苄西林(41.6%)、复方新诺明(30.9%)和氯霉素(26.6%)的耐药率较高;而对阿米卡星(1.9%)、多粘菌素B(0.8%)和氨苄西林-舒巴坦(0.4%)的耐药率较低。耐药基因tetA、bla TEM、cml1、aadA1、aac、sul1和bla CTX-M的检出率分别为90.4%,32.1%,31.3%,27.4%,14.5%,12.8%和9.2%,未检出tetE、tetG和bla SHV基因。【结论】乌鲁木齐市售畜禽肉存在严重的大肠杆菌污染问题,畜禽肉作为多重耐药菌的“储存库”,在细菌耐药性的播散中发挥重要作用,应加以重视。 展开更多
关键词 畜禽肉 大肠杆菌 耐药性 系统进化分群 乌鲁木齐
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四川地区猪源致病性大肠埃希菌分子分群、生物被膜形成能力及耐药性研究 被引量:9
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作者 彭珂楠 周雪珂 +8 位作者 殷鑫欢 李飞 蔡瑶 曾喻兵 江朝源 张儒博 杨泽晓 徐志文 朱玲 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第10期1599-1607,共9页
为了解四川地区猪源致病性大肠埃希菌分子流行特点及流行趋势,本研究在2016—2018年,从四川省各个地区无菌采集患病猪肝脏、脾脏、肺脏、肠道等组织样品208份。通过细菌分离鉴定方法筛选出87株大肠埃希菌,通过小鼠攻毒试验确定其中22株... 为了解四川地区猪源致病性大肠埃希菌分子流行特点及流行趋势,本研究在2016—2018年,从四川省各个地区无菌采集患病猪肝脏、脾脏、肺脏、肠道等组织样品208份。通过细菌分离鉴定方法筛选出87株大肠埃希菌,通过小鼠攻毒试验确定其中22株为致病性大肠埃希菌,并对其进行分子分群、生物被膜形成能力检测、耐药性试验、耐药基因及HPI毒力基因检测。结果显示,22株致病性大肠埃希菌多分布于A群(59.09%),且生物被膜形成阳性率为72.73%,其中强成膜能力菌株占40.91%。大肠埃希菌对19种抗生素药物均有不同程度的耐药性,其中对恩诺沙星、复方新诺明、氨苄西林、阿莫西林、红霉素、四环素等9种药物的耐药率较高,为81.82%~100%;对庆大霉素、左氧氟沙星、诺氟沙星、头孢曲松等4种药物的耐药率为63.64%~72.73%;对其他药物的耐药率为4.55%~54.55%,均呈现多重耐药。22株致病性大肠埃希菌检出的耐药基因包括β-内酰胺类TEM(36.36%)、SHV(9.09%)、OXA(9.09%),磺胺类sulⅠ(63.64%)、sulⅡ(95.45%),氨基糖苷类acc(3)-Ⅱ(68.18%)、aph(3′)-Ⅱ(50.00%),氯霉素类cmlA(45.45%)、floR(81.82%),四环素类tetA(81.82%)、tetB(86.36%),喹诺酮类qurB(40.91%)共12个基因型,检测出HPI毒力基因irp1(40.91%)、irp2(13.64%)、fyuA(13.64%)3种。研究结果表明,四川省猪源致病性大肠埃希菌多分布于A群,生物被膜形成阳性率较高,存在严重的多重耐药性,四环素类、氯霉素类、氨基糖苷类及磺胺类耐药基因的携带率较高,且存在多重耐药基因与毒力基因共存情况。研究结果可为四川地区猪病的预防和治疗提供参考依据。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 耐药基因 HPI毒力岛基因 系统进化分群
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携带bla_(CTX-M)禽大肠杆菌的多重耐药特征和体外致病性研究 被引量:1
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作者 崔俊岭 梁玉蕾 +6 位作者 刘新新 楚浩然 陈秋如 董焱斌 贺丹丹 吴华 苑丽 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期435-443,共9页
【目的】探究携带bla_(CTX-M)禽大肠杆菌的分子流行特点。【方法】检测76株携带bla_(CTX-M)禽大肠杆菌的多重耐药谱、系统进化分群及毒力基因,并分析毒力基因与耐药特点、系统进化分群之间的关联性。【结果】药敏结果显示,携带bla_(CTX... 【目的】探究携带bla_(CTX-M)禽大肠杆菌的分子流行特点。【方法】检测76株携带bla_(CTX-M)禽大肠杆菌的多重耐药谱、系统进化分群及毒力基因,并分析毒力基因与耐药特点、系统进化分群之间的关联性。【结果】药敏结果显示,携带bla_(CTX-M)禽大肠杆菌对氟苯尼考的耐药率最高,达85.53%(65/76);其次是恩诺沙星,为48.68%(37/76);最常见的多重耐药谱为氟苯尼考+恩诺沙星+乙酰甲喹,达10.53%(8/76)。系统进化分群结果显示,主要的亚群为C群和B1群;其中,C群检出率最高,达53.95%(41/76);其次是B1群,为30.26%(23/76);E群、A群、D群和F群的检出率分别为9.21%(7/76)、2.63%(2/76)、2.63%(2/76)和1.32%(1/76);未检测出B2群和分支I群。毒力基因检测结果显示,76株携带bla_(CTX-M)禽大肠杆菌均检出了至少4种毒力因子,且有11株菌同时携带至少11种毒力基因;其中,有13株菌同时检出禽致病性大肠杆菌(avian pathogenic Escherichia coli,APEC)的5个标志性毒力基因(iroN、iutA、hly、OmpT和iss),检出率为17.11%;有11株菌检出ColV质粒的标志基因(cva/cvi、iroN、iucD/iutA、etsAC、OmpT/hlyF和sitA),检出率为14.47%;有28株菌检出耶尔森菌强毒力岛(high pathogenitility island,HPI)的标志基因irp-2和fyuA,检出率为36.82%。【结论】携带bla_(CTX-M)禽大肠杆菌多为多重耐药菌,且多重耐药菌株携带ColV毒力质粒可能性更高;携带bla_(CTX-M)禽大肠杆菌的多重耐药与致病性有关联,即携带bla_(CTX-M)禽大肠杆菌具有多重耐药的同时,具有致病的可能性更高。 展开更多
关键词 禽大肠杆菌 多重耐药 系统进化分群 毒力基因 ColV质粒
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鸡源大肠杆菌毒力基因检测及分子流行特征 被引量:7
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作者 张立伟 石玉祥 +11 位作者 张永英 李欣泽 郝贺 朱原 周双 王芝超 杜瞳彤 阿合玛尔列·海依拉提 时欣欣 韩旺 仝星 朱阵 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期2498-2510,共13页
【目的】本试验旨在阐明鸡源大肠杆菌致病性及分子流行特性,为探索大肠杆菌流行途径制定合理的防控策略提供新思路。【方法】2018–2019年在河北省采集病死鸡肝脏样品,通过选择培养基筛选、生化鉴定、血清凝集试验对分离菌株进行系统鉴... 【目的】本试验旨在阐明鸡源大肠杆菌致病性及分子流行特性,为探索大肠杆菌流行途径制定合理的防控策略提供新思路。【方法】2018–2019年在河北省采集病死鸡肝脏样品,通过选择培养基筛选、生化鉴定、血清凝集试验对分离菌株进行系统鉴定,应用PCR方法检测分离株中毒力基因流行情况。参考系统发育群分类方法对大肠杆菌进行分群分析,并参照McMLST网站数据库提供的7对管家基因序列进行多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)分析。【结果】结果显示,56株分离株符合大肠杆菌生化特征,分为8个生化表型,B4(30.36%)、B5(25%)和B2(23.21%)为主要生化表型。56株分离株大肠杆菌血清凝集试验均呈阳性,分为11种血清型,O78(26.79%)、O2(23.21%)、O157(17.86%)和O1(14.29%)为主要流行血清型。56株大肠杆菌共检测出15种肠外大肠杆菌毒力基因,未检出papC、ibeA和ibeB基因。黏附相关基因fimC和抗血清存活因子相关基因ompA携带率为100%。aatA、yijP、irp2、mat、iss,检出率分别为98.21%、98.21%、98.21%、96.43%、92.86%。同时,大肠杆菌与铁转运相关基因iroN、fyuA、iucD、irp2检出率均在80%以上。56株大肠杆菌中有20株属于肠出血型大肠杆菌(enterohemorrhagic E.coli,EHEC),其次是肠聚集型大肠杆菌(enteroaggregative E.coli,EAEC)(n=4)、肠产毒素型大肠杆菌(Enterotoxigenic E.coli,ETEC)(n=2)。这些菌株D群分离株较多,其次是B2群。通过MLST分型分析,共分为22个ST型,其中ST88(n=7)、ST85(n=6)、ST243(n=6)型为主要流行型。【结论】结果显示大肠杆菌血清型多样,毒力因子种类繁多,致病性大肠杆菌同时携带多种毒力基因,表明动物源大肠杆菌具有较强的毒力基础。 展开更多
关键词 大肠杆菌 毒力基因 MLST 系统发育群
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新疆地区腹泻仔猪源大肠杆菌的分群、血清型鉴定及耐药性分析 被引量:3
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作者 佟盼盼 黄顺敏 +6 位作者 王芋丹 施旭辉 陈文霞 宋鑫龙 张毅 苏战强 谢金鑫 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期414-420,共7页
旨在了解新疆地区腹泻仔猪源大肠杆菌的系统进化分群、血清型及耐药性。本研究对154份腹泻仔猪粪便样品进行大肠杆菌的分离鉴定,采用多重PCR方法对分离株进行系统进化分群和O血清型鉴定,通过K-B纸片法对其进行药物敏感性检测并通过PCR... 旨在了解新疆地区腹泻仔猪源大肠杆菌的系统进化分群、血清型及耐药性。本研究对154份腹泻仔猪粪便样品进行大肠杆菌的分离鉴定,采用多重PCR方法对分离株进行系统进化分群和O血清型鉴定,通过K-B纸片法对其进行药物敏感性检测并通过PCR方法进行耐药基因检测。结果显示:共分离到154株大肠杆菌,包括ETEC(n=24)、STEC(n=21)、EPEC(n=1)、EPEC/STEC(n=2)、ETEC/STEC(n=1)和ETEC/EPEC(n=1),其他104株。系统进化分群显示,多数菌株属于B1(37%)和A群(31%)。定型菌株44株,分别属于10种血清型,以O154、O12、O8、O141和O175为主要流行血清型。151株(98%)为多重耐药菌,对复方新诺明、四环素、氨苄西林、链霉素和氯霉素的耐药率为81%~100%,对阿莫西林/克拉维酸、头孢噻肟、庆大霉素、头孢曲松、环丙沙星和阿米卡星的耐药率为31%~66%,对左氧氟沙星、多黏菌素B、头孢他啶、头孢吡肟、氨苄西林-舒巴坦、哌拉西林-他唑巴坦和亚胺培南的耐药率为1%~19%。耐药基因tetA(88%)、tetG(60%)和cmlA(45%)的携带率较高,而blaCTX-M-1G、aadA1、sul1、aac和blaCTX-M-9G均低于30%,未检测出blaCTX-M-2G、blaTEM、blaSHV和tetE。研究结果表明,新疆腹泻仔猪源大肠杆菌类型复杂,多重耐药形势严峻,耐药基因多样化,且检测出人医临床重要的抗生素耐药表型,应加强对猪场大肠杆菌的耐药性监测。 展开更多
关键词 腹泻仔猪 大肠杆菌 系统进化分群 血清型 耐药性
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广州市某马术俱乐部马源大肠杆菌的分离鉴定、毒力基因检测及耐药性分析 被引量:2
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作者 刘鏊 马丁允 +5 位作者 陀海欣 李静 王超男 孙铭飞 林栩慧 齐萌 《畜牧与饲料科学》 2023年第3期109-115,共7页
[目的]分离鉴定广州市某马术俱乐部赛马粪便中的大肠杆菌,检测其毒力基因,并进行耐药性分析。[方法]收集广州市某马术俱乐部20份成年赛马粪便样本,通过细菌培养、革兰染色镜检和细菌16S rDNA序列PCR法分离鉴定大肠杆菌,并对分离菌株进... [目的]分离鉴定广州市某马术俱乐部赛马粪便中的大肠杆菌,检测其毒力基因,并进行耐药性分析。[方法]收集广州市某马术俱乐部20份成年赛马粪便样本,通过细菌培养、革兰染色镜检和细菌16S rDNA序列PCR法分离鉴定大肠杆菌,并对分离菌株进行大肠杆菌系统发育群鉴定;采用PCR法检测10种毒力基因和11种耐药基因,应用K-B纸片法开展药物敏感性试验。[结果]经形态学观察和PCR检测,鉴定出13株大肠杆菌,分离率为65.00%(13/20);系统进化分群分别属于A群(23.07%,3/13)、B1群(61.54%,8/13)和D群(15.38%,2/13);共检出5种毒力基因,分别为fimC(61.54%,8/13)、fyuA(7.69%,1/13)、irp2(7.69%,1/13)、stx1(15.38%,2/13)和stx2(7.69%,1/13);共检出9种耐药基因,分别为parC(100%,13/13)、gyrA(100%,13/13)、gyrB(92.31%,12/13)、sul2(76.92%,10/13)、cmlA(30.77%,4/13)、aadA(23.07%,3/13)、tet(B)(15.38%,2/13)、blaTEM(7.69%,1/13)和blaCTX(7.69%,1/13);13株大肠杆菌分离株对头孢西丁、庆大霉素、环丙沙星敏感,对四环素的耐药率为38.46%,对头孢噻呋、阿米卡星、氨苄西林的耐药率均为30.77%,对氯霉素、甲氧苄啶/磺胺异噁唑和亚胺培南也呈现出不同程度的耐药性。[结论]广州市某马术俱乐部赛马源大肠杆菌种群具有多样性,携带多种毒力基因和耐药基因,呈现多重耐药性,提示临床上应加强马大肠杆菌病的防治。 展开更多
关键词 大肠杆菌 系统进化群 毒力基因 耐药基因
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Prevalence and Resistance Profile of Muenchen Cefotaximase (CTX-M) Group 1 Extended Spectrum Beta-Lactamase (ESBL)-Producing Uropathogenic Escherichia coli Strains in Dakar, Senegal
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作者 Abdoulaye Seck Babacar Ndiaye +6 位作者 Abdou Diop Malick Ndao Cheikh Fall Assane Dieng Thierno Abdoulaye Diallo Chantal Mahou Philippe Dubrous 《Open Journal of Medical Microbiology》 2023年第2期137-145,共9页
Background: Extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) producing bacteria are a real public health problem, particularly in Africa. Among these ESBLs, there are the Muenchen Cefotaximase (CTX-M) described all over the wo... Background: Extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) producing bacteria are a real public health problem, particularly in Africa. Among these ESBLs, there are the Muenchen Cefotaximase (CTX-M) described all over the world of which the most frequent is the CTX-M of group 1 particularly the CTX-M-15 variant. The objective of this study was to determine the prevalence of CTX-M group 1 ESBL-producing Escherichia coli strains and to test their antibiotics susceptibility profile. Methodology: A retrospective cross-sectional descriptive study was conducted to detect ESBL-secreting Escherichia coli strains by the synergy test. Identification of CTX-M type ESBL from group 1 was performed using the NG-Test CTX-M rapid diagnostic test (NG-Biotech®). Antibiotic susceptibility profile was determined using CA-SFM/EUCAST guidelines 2019. Data entry and statistical analysis were performed with Excel version 2010 and SPSS 20.0 respectively. Results: Eighty-two ESBL-producing Escherichia coli strains were tested. A group 1 CTX-M ESBL was detected in 75.6% of the strains (n = 62). These strains were highly resistant to cefotaxim (100%), aztreonam (100%), ceftazidim (85.4%) and cefepim (66.1%). They were also resistant to quinolones, gentamycin and sulfadoxine-trimethoprim combination. However, these strains showed sensitivity to ertapenem (100%), cefoxitin (69.3%), tigecyclin (66%), and amikacin (66.1%). The combination of piperacillin and tazobactam was active on 30.6% of the strains against 6.4% for the combination of amoxicillin and clavulanic acid. Conclusion: The CTX-M type ESBL of group 1 was present in the majority of ESBL-producing Escherichia colis trains. Despite the production of this enzyme conferring resistance to most beta-lactam antibiotics, some antibiotics remain active to treat infections caused by these germs. 展开更多
关键词 escherichia coli ESBL CTX-M group PREVALENCE Antibiotic Resistance
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黑龙江奶牛肠外致病大肠埃希菌种系分类群研究 被引量:4
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作者 佟春玉 曹宏伟 +2 位作者 朱战波 刘振华 崔玉东 《黑龙江八一农垦大学学报》 2013年第4期32-35,共4页
研究黑龙江省奶牛主要肠外致病(奶牛乳房炎、子宫内膜炎)大肠埃希菌的种系分类群。用PCR扩增具有种系分类群标记的chuA、yjaA基因和TSPE4.C2 DNA片段的方法,对黑龙江省84株来源于奶牛乳房炎和41株来源于奶牛子宫内膜炎的大肠埃希菌进行... 研究黑龙江省奶牛主要肠外致病(奶牛乳房炎、子宫内膜炎)大肠埃希菌的种系分类群。用PCR扩增具有种系分类群标记的chuA、yjaA基因和TSPE4.C2 DNA片段的方法,对黑龙江省84株来源于奶牛乳房炎和41株来源于奶牛子宫内膜炎的大肠埃希菌进行种系进化群分类。奶牛乳房炎所检测菌株中A进化种系群占11.90%。B1种系进化群占88.10%。奶牛子宫内膜炎所检测菌株中A种系进化群占14.63%,B1种系进化亚群占85.37%。未检测到属于B2和D群的肠外强毒力株。大肠杆菌分离株接种小鼠剖检可见明显病变。通过遗传进化分析,引起黑龙江奶牛肠外致病大肠埃希菌主要属于B1种系进化群,为奶牛乳房炎和子宫内膜炎疫苗的研制提供理论依据。 展开更多
关键词 奶牛乳房炎 子宫内膜炎 大肠埃希菌 种系分类群
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甘肃省及周边地区奶牛乳腺炎致病大肠杆菌的分离鉴定及其种系分群的研究 被引量:3
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作者 张连梅 赵兴绪 +7 位作者 张勇 张海容 胡俊杰 武小虎 徐燕霞 胡少辉 周长卿 阚威 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期339-344,共6页
运用生化鉴定及大肠杆菌基因保守序列对引起奶牛乳腺炎的大肠杆菌进行分离鉴定,通过ERIC-PCR、RAPD以及大肠杆菌种类进化群判定标准对其进行种系分群,应用SPSS 17.0软件对ERIC-PCR及RAPD扩增图谱进行聚类分析,探讨不同地区分离的大肠杆... 运用生化鉴定及大肠杆菌基因保守序列对引起奶牛乳腺炎的大肠杆菌进行分离鉴定,通过ERIC-PCR、RAPD以及大肠杆菌种类进化群判定标准对其进行种系分群,应用SPSS 17.0软件对ERIC-PCR及RAPD扩增图谱进行聚类分析,探讨不同地区分离的大肠杆菌之间的基因相似性。结果显示,共分离出大肠杆菌13株,根据种系进化群判定标准,该地区A群占61.54%,D群占44.4%,B2群占7.69%。聚类分析显示,ERIC-PCR体系将13株大肠杆菌分为3个聚类群,Ⅰ型7株(占53.85%),Ⅱ型4株(占30.77%),Ⅲ型2株(占15.38%),其中青海省民和县80%的菌株属于Ⅰ型,甘肃省永登县、临洮县及青海省民和县71.43%的菌株属于Ⅱ型和Ⅲ型。RAPD体系将13株大肠杆菌分为2个聚类群,Ⅰ型7株(占53.85%),Ⅱ型6株(占46.15%),其中宁夏区吴忠市的菌株属于Ⅰ型,甘肃省永登县、临洮县及青海省民和县的菌株属于Ⅱ型。基因相似性研究结果显示,以甘肃省兰州市为中心,位于东北方向的宁夏区吴忠市与西南方向的其他3个地区分离菌株的基因相似性存在一定的差异。 展开更多
关键词 奶牛乳腺炎 大肠杆菌 种系分类群
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污水处理中大肠杆菌群数及其参数研究 被引量:2
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作者 顾建新 《武汉理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第12期108-110,114,共4页
依据污水处理厂的进水、曝气池、厌氧池、好氧池以及二沉池5个处理单元中水体的大肠杆菌群数以及常规水质参数(COD、SS、pH、温度)检测数据,分析了大肠杆菌群数与水体理化参数间的关系,得出以下结论:大肠杆菌生长的最适温度为25~40 ℃... 依据污水处理厂的进水、曝气池、厌氧池、好氧池以及二沉池5个处理单元中水体的大肠杆菌群数以及常规水质参数(COD、SS、pH、温度)检测数据,分析了大肠杆菌群数与水体理化参数间的关系,得出以下结论:大肠杆菌生长的最适温度为25~40 ℃;有利于大肠杆菌生长的pH值在6.5~7.5之间,而最佳生长的pH值为7.2;COD值较高和SS含量高的水体中大肠杆菌群数也较多. 展开更多
关键词 污水 大肠杆菌群 水质参数 关系
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Genotyping of E. coli Isolated from Urinary Tract Infection Patients Containing B-Lactamase Resistance Gene CTX-M Group 1 in Sanandaj Medical Health Centers
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作者 Arezoo Omati Kambiz Davari Borhan Shokrolahi 《American Journal of Molecular Biology》 2016年第4期159-169,共12页
CTX-M-producing bacteria are known as a resistant source against oxyimino-cephalosporin such as cefotaxime and ceftazidime;although laboratory diagnosis of this gene has not been properly defined. The aims of this stu... CTX-M-producing bacteria are known as a resistant source against oxyimino-cephalosporin such as cefotaxime and ceftazidime;although laboratory diagnosis of this gene has not been properly defined. The aims of this study are determining the rates of prevalence of CTX-M and CTX-M group 1 in the Escherichia coli (E. coli) obtained from urinary tract infections (UTI), and also determining their genetic relationship in the city of Sanandaj. In current study, 180 E. coli strains isolated from urinary tract infections were used. Sensitivity to common antibiotics was studied by the disc diffusion method. Phenotypic detection of isolated ESBL-producing starins was done by the combination disc test. CTX-M and CTX-M1 genes were detected using the PCR method and finally, the possible clonal relationship between isolates was determined using the REP-PCR method. 89 samples were ESBL-positive. The PCR assay used for detecting the CTX-M gene, showed that 48 samples out of 180 samples (26.66%) contained that gene;also among these 48 samples, 23 (12.77%) had CTX-M group 1. Based on the REP-PCR assay, 48 genotypes among 48 samples were CTX-M-positive. Results from the REP-PCR assay indicated that the clonal propagation theory of one epidemic strain of Escherichia coli is not apply, i.e. all CTX-M-producing species are not originated from one single strain and the gene is spread between different isolates. Therefore, hospitals and their employees must be more hygiene and, proper disposal of hospital waste can help to prevent the spread of different resistances. 展开更多
关键词 escherichia coli Urinary Tract Infection ESBL CTX-M CTX-M group 1 REP-PCR
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一起仔猪大肠杆菌与猪A群轮状病毒混合感染的诊断 被引量:1
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作者 梁乔 赵凤菊 +4 位作者 赵晓彤 曹东 顾贵波 杨本勇 李井春 《黑龙江畜牧兽医(下半月)》 北大核心 2017年第6期109-110,113,294,共4页
为了解抚顺市某猪场仔猪腹泻疫情的病因,对发病猪进行了病理剖检,并采取病料进行了细菌分离鉴定、药敏试验、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪A群轮状病毒(PRV-A)三种病毒性腹泻病原的三重实时荧光RT-PCR检测。结... 为了解抚顺市某猪场仔猪腹泻疫情的病因,对发病猪进行了病理剖检,并采取病料进行了细菌分离鉴定、药敏试验、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪A群轮状病毒(PRV-A)三种病毒性腹泻病原的三重实时荧光RT-PCR检测。结果表明:细菌分离鉴定所分离到的菌株培养特性及生化反应特性与大肠杆菌基本一致,经血清学鉴定所分离菌株菌体抗原血清型为O8;所分离菌株存在多重耐药现象,对四环素类、氯霉素类、磺胺类、喹诺酮类、氨基糖苷类、青霉素类药物均耐药;该猪场存在PRV-A感染。 展开更多
关键词 仔猪 细菌分离鉴定 RT-PCR检测 大肠杆菌 A群轮状病毒 耐药性检测
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多黏菌素耐药基因mcr-1阳性大肠埃希菌分子流行病学及耐药基因特征
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作者 侯轩 张微 +2 位作者 邓明惠 王辉 辜依海 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1616-1621,共6页
目的了解住院患者分离的mcr-1基因阳性大肠埃希菌分子流行病学特征以及耐药基因毒力基因携带状况,为临床诊治以及院感防控提供依据。方法回顾性分析2008年11月-2018年12月西安交通大学附属三二〇一医院各类临床标本中分离的大肠埃希菌1... 目的了解住院患者分离的mcr-1基因阳性大肠埃希菌分子流行病学特征以及耐药基因毒力基因携带状况,为临床诊治以及院感防控提供依据。方法回顾性分析2008年11月-2018年12月西安交通大学附属三二〇一医院各类临床标本中分离的大肠埃希菌1018株,聚合酶链反应(PCR)法检测多黏菌素耐药基因mcr-1;微量肉汤稀释法以及琼脂稀释法检测多黏菌素及其他抗菌药物对mcr-1阳性菌株的最低抑菌浓度(MIC);多重PCR对mcr-1阳性菌株进行系统发育群分类,并通过全基因组序列构建系统进化树、分析其多位点序列分型(MLST)、毒力基因以及耐药基因。结果1018株大肠埃希菌中,共检出mcr-1基因11株,检出率为1.08%;mcr-1基因阳性大肠埃希菌系统发育群分别属于A、B1和D群,系统进化树显示mcr-1阳性菌株分别属于7个不同进化枝,MLST显示mcr-1阳性菌株分别属于6种不同ST型;耐药基因以及毒力基因显示,mcr-1阳性菌株呈现出多重耐药性,均携带超广谱β-内酰胺酶,同时含有编码保护因子(iss、traT等)、黏附(lpfA、papA/papC以及yfcV),铁摄取系统(sitA、chuA、fyuA、irp2、iucC、iutA以及iroN)、毒素、侵袭等多种毒力基因。结论mcr-1基因在医院内大肠埃希菌中呈现低流行率,并介导低水平的多黏菌素耐药;mcr-1阳性大肠埃希菌呈现多药耐药性并携带多种毒力基因,且存在医院内交叉感染。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 多黏菌素 mcr-1基因 系统发育群 毒力基因 耐药基因
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ASB及UTI患者尿液中分离的大肠埃希菌系统分群、毒力基因及耐药性分析 被引量:1
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作者 邓聪 区静怡 +1 位作者 朱雪莲 彭亮 《检验医学与临床》 CAS 2018年第19期2862-2865,共4页
目的对无症状菌尿(ASB)及症状性尿路感染(UTI)患者尿液中分离的大肠埃希菌进行系统分群、毒力基因及耐药性检测。方法收集该院2014年5月至2016年3月从尿路感染患者尿液中分离的大肠埃希菌共145株,其中ASB组65株,UTI组80株。利用多重聚... 目的对无症状菌尿(ASB)及症状性尿路感染(UTI)患者尿液中分离的大肠埃希菌进行系统分群、毒力基因及耐药性检测。方法收集该院2014年5月至2016年3月从尿路感染患者尿液中分离的大肠埃希菌共145株,其中ASB组65株,UTI组80株。利用多重聚合酶链反应(PCR)对其进行系统分群及10种毒力基因表达检测;采用纸片扩散(K-B)法对其进行耐药性检测。结果ASB组中,A、B1、B2、D群分别占10.77%、38.47%、43.07%、7.69%。UTI组中,A、B1、B2、D群分别占12.50%、10.00%、62.50%、15.00%,两组系统分群结果差异有统计学意义(P<0.05)。ASB组黏附相关基因afa和sfa的表达率高于UTI组(P<0.05)。UTI组细胞毒性相关基因细胞毒性坏死因子1(cnf1)和溶血素(hlyA),铁摄取相关基因fyuA和iutA的表达率高于ASB组(P<0.05)。ASB组和UTI组对18种抗菌药物的耐药率及产超广谱β-内酰胺酶菌株阳性率差异无统计学意义(P>0.05)。结论 ASB和UTI不同的系统分群特征,可能与其表现出不同的致病能力有关。ASB菌株毒力较UTI低,降低了其急性致病能力,但具有更高表达率的黏附相关基因,这可能有助于细菌实现持续定植。尿路感染大肠埃希菌的高耐药率必须引起临床重视。 展开更多
关键词 无症状菌尿 症状性尿路感染 大肠埃希菌 系统分群 毒力基因
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大肠菌群快速检测方法探讨 被引量:1
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作者 焦勇霞 《山西化工》 2016年第1期51-53,共3页
大肠菌群是检测食品、药物卫生安全质量的重要指标。传统的大肠菌群检测方法是物理化学方法,但这种方式的检测成本较高,且准确性较低,不适宜于大范围的检测工作。介绍了新的检测方法包括免疫学方法、分子生物学方法和酶学方法等,并对这... 大肠菌群是检测食品、药物卫生安全质量的重要指标。传统的大肠菌群检测方法是物理化学方法,但这种方式的检测成本较高,且准确性较低,不适宜于大范围的检测工作。介绍了新的检测方法包括免疫学方法、分子生物学方法和酶学方法等,并对这些方法进行了对比,以期找到一种成本低、准确性高、操作性强的检测方法。 展开更多
关键词 大肠菌群 快速检测 免疫学方法 分子生物学方法 酶学方法
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血流感染大肠埃希菌的耐药及系统发生分型研究 被引量:1
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作者 郭玲 陈刚 +4 位作者 叶丽艳 程倩 赵强 杨继勇 罗燕萍 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第23期5728-5730,共3页
目的研究引起血流感染大肠埃希菌的耐药谱及系统发生分型,为临床治疗提供指导依据。方法收集2007-2010年医院血流感染大肠埃希菌的非重复菌株,进行临床分布统计、耐药谱测定,并用多重PCR方法对菌株进行系统发生分型检测。结果 271株大... 目的研究引起血流感染大肠埃希菌的耐药谱及系统发生分型,为临床治疗提供指导依据。方法收集2007-2010年医院血流感染大肠埃希菌的非重复菌株,进行临床分布统计、耐药谱测定,并用多重PCR方法对菌株进行系统发生分型检测。结果 271株大肠埃希菌对头孢他啶、头孢噻肟、头孢西丁的敏感率分别为64.9%、36.2%、68.3%;检出产ESBLs菌164株占60.5%,非产ESBLs菌107株占39.5%;系统发生分型以D群和B2群为主,分别占41.0%、32.5%,A群和B1群比例较少,分别占17.0%、9.5%。结论血流感染大肠埃希菌4年的耐药谱未发生明显变化,对碳青霉烯类抗菌药物,阿米卡星敏感率较高,系统发生分型以B2和D群为主。 展开更多
关键词 血流感染 大肠埃希菌 耐药性 系统发生分型
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辽宁省部分地区鸡源大肠杆菌种系分类群及分子多态性分析
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作者 冯方周 郭宏艳 +2 位作者 卢赫 张晓冬 李冰 《现代畜牧兽医》 2014年第8期37-42,共6页
为了解鸡源大肠杆菌不同种系的发育群及其分子上的多态性,本试验应用种系分类群鉴定与随机扩增多态性(RAPD)的方法对采自辽宁省4个市的26株鸡大肠杆菌进行了不同种系发育群的鉴定以及分型研究,种系分类群方法将26株大肠杆菌分为4种发育... 为了解鸡源大肠杆菌不同种系的发育群及其分子上的多态性,本试验应用种系分类群鉴定与随机扩增多态性(RAPD)的方法对采自辽宁省4个市的26株鸡大肠杆菌进行了不同种系发育群的鉴定以及分型研究,种系分类群方法将26株大肠杆菌分为4种发育群,其中,A群13株、B1群3株、B2群8株、D群2株。在RAPD中从6条随机引物中筛选出2条能在26株大肠杆菌中具有较好多态性扩增的随机引物,共扩增出7条DNA片段,菌株HLD6、G2、G5、HLD3、HLD4、G7和G11遗传关系密切,菌株G22与其他25株大肠杆菌遗传关系较远。 展开更多
关键词 大肠杆菌 种系分类群 多态性分析
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禽致病性大肠杆菌血清型、进化分群及毒力基因的分子流行病学调查 被引量:22
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作者 王瑶 张耀东 +10 位作者 易正飞 信素华 陶程琳 李妍 李涛 祁晶晶 田明星 丁铲 于圣青 张焕容 王少辉 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期1159-1166,共8页
为了解禽致病性大肠杆菌(APEC)的分子流行特点,从华东等地区分离鉴定210株APEC菌株,然后检测其血清型、系统进化分群及毒力基因,并分析毒力因子与血清型、系统进化分群之间的关联性。血清型检测结果显示,O78、O1、O2为流行血清型。通过... 为了解禽致病性大肠杆菌(APEC)的分子流行特点,从华东等地区分离鉴定210株APEC菌株,然后检测其血清型、系统进化分群及毒力基因,并分析毒力因子与血清型、系统进化分群之间的关联性。血清型检测结果显示,O78、O1、O2为流行血清型。通过系统进化分群分析发现A、B1、B2及D群比例分别为21.90%、20.00%、31.90%、21.90%。毒力基因检测结果显示,fimC、mat及ibeB基因检出率为90%以上,papC、neuC、vat、ibeA检出率低于22%,且所有分离株至少含有4个毒力基因。关联分析发现,毒力基因irp2、ibeA、neuC、vat及ETT2在特定血清型中的分布较高,而papC、tsh、irp2、neuC、vat及ibeA在B2进化分群较高。结果表明,华东等地区APEC携带多种毒力基因,毒力基因分布与特定血清型及系统进化分群具有关联性,为了解当地的APEC优势流行菌株及防控提供了参考。 展开更多
关键词 禽致病性大肠杆菌 血清型 系统进化分群 毒力基因
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