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江苏省稻曲病菌的群体遗传结构
被引量：
14
1
作者
李燕
刘永锋
+2 位作者
张荣胜
俞咪娜
陈志谊
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2012年第2期296-301,共6页
为了分析来源于江苏省徐州市、苏州市、南京市、盐城市和南通市的48个稻区稻曲病菌[Ustilaginoideavirens(Cook.)Tak.]的群体遗传多样性,通过Rep-PCR技术,用3对特异性引物BOX、REP和ERIC对48个菌株基因组DNA进行了PCR扩增,以彼此间的带...
为了分析来源于江苏省徐州市、苏州市、南京市、盐城市和南通市的48个稻区稻曲病菌[Ustilaginoideavirens(Cook.)Tak.]的群体遗传多样性,通过Rep-PCR技术,用3对特异性引物BOX、REP和ERIC对48个菌株基因组DNA进行了PCR扩增,以彼此间的带位相似率达90%为界,BOX扩增的谱型被分为4簇,REP的谱型被分为4簇,ERIC的谱型被分为5簇。48个稻曲病菌株接种于感病品种两优培九上,被划分为3个致病力类型,其中弱致病性类型占50%,为优势致病性类型。由于参试菌株遗传多样性值最大(0.55),簇群分类与地理位置显著相关,所以BOX引物较其他两种引物更适合进行稻曲病菌的群体遗传多样性分析。群体遗传多样性值BOX为0.55,REP为0.44,ERIC为0.42,说明江苏省这5个地区稻曲病菌群体的遗传分化不明显,遗传多样性稳定。江苏省5大稻区48个稻曲病菌的BOX、REP、ERIC簇群分类与地理位置、致病性类型均无显著的相关性。
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关键词
REP-PCR
稻曲病菌
遗传多样性
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职称材料
基于EST-SSR标记的茅苍术种质资源遗传多样性分析
被引量：
5
2
作者
韩凤
刘春雷
+4 位作者
罗川
刘杰
胡开治
肖忠
林茂祥
《中国野生植物资源》
CSCD
2019年第4期30-34,共5页
采用EST-SSR标记,对5种不同叶型47份茅苍术进行遗传多样性分析。从30对引物中筛选出5对EST-SSR引物用于PCR扩增,共扩增出36条多态性条带,遗传多态性PIC值变化范围为0.6760~0.7877,平均为0.7539;供试样品遗传距离为0~0.9123,表明茅苍术...
采用EST-SSR标记,对5种不同叶型47份茅苍术进行遗传多样性分析。从30对引物中筛选出5对EST-SSR引物用于PCR扩增,共扩增出36条多态性条带,遗传多态性PIC值变化范围为0.6760~0.7877,平均为0.7539;供试样品遗传距离为0~0.9123,表明茅苍术具有丰富的遗传多样性。采用UPGMA法进行聚类分析,当遗传相似系数为0.70时,可将供试样品分为5大类。聚类结果显示叶片形态特征和分子表达并不一致,即茅苍术的叶形性状与遗传背景不具有明显的相关性。
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关键词
茅苍术
不同叶形
EST-SSR
分子标记
遗传多样性
聚类分析
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职称材料
题名
江苏省稻曲病菌的群体遗传结构
被引量：
14
1
作者
李燕
刘永锋
张荣胜
俞咪娜
陈志谊
机构
江苏省农业科学院植物保护研究所
南京农业大学植物保护学院
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2012年第2期296-301,共6页
基金
公益性(农业)行业科研专项(200903039-2)
文摘
为了分析来源于江苏省徐州市、苏州市、南京市、盐城市和南通市的48个稻区稻曲病菌[Ustilaginoideavirens(Cook.)Tak.]的群体遗传多样性,通过Rep-PCR技术,用3对特异性引物BOX、REP和ERIC对48个菌株基因组DNA进行了PCR扩增,以彼此间的带位相似率达90%为界,BOX扩增的谱型被分为4簇,REP的谱型被分为4簇,ERIC的谱型被分为5簇。48个稻曲病菌株接种于感病品种两优培九上,被划分为3个致病力类型,其中弱致病性类型占50%,为优势致病性类型。由于参试菌株遗传多样性值最大(0.55),簇群分类与地理位置显著相关,所以BOX引物较其他两种引物更适合进行稻曲病菌的群体遗传多样性分析。群体遗传多样性值BOX为0.55,REP为0.44,ERIC为0.42,说明江苏省这5个地区稻曲病菌群体的遗传分化不明显,遗传多样性稳定。江苏省5大稻区48个稻曲病菌的BOX、REP、ERIC簇群分类与地理位置、致病性类型均无显著的相关性。
关键词
REP-PCR
稻曲病菌
遗传多样性
Keywords
Rep-PCR
Ustilaginoidea
virens
enetic
diversity
分类号
S435.111.46 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
下载PDF
职称材料
题名
基于EST-SSR标记的茅苍术种质资源遗传多样性分析
被引量：
5
2
作者
韩凤
刘春雷
罗川
刘杰
胡开治
肖忠
林茂祥
机构
重庆市药物种植研究所
重庆市中药良种选育与评价工程技术中心
出处
《中国野生植物资源》
CSCD
2019年第4期30-34,共5页
基金
国家科技部重点研发计划项目(2017YFC1700704A)
重庆市科委民生创新专项项目(cstc2016shmszx130050,cstc2017shms-kjfp120003)
+1 种基金
重庆市科委基本科研业务费项目(cstc2017jxjl-jbky120017)
重庆市卫计委中医药科技项目(zy201602105)
文摘
采用EST-SSR标记,对5种不同叶型47份茅苍术进行遗传多样性分析。从30对引物中筛选出5对EST-SSR引物用于PCR扩增,共扩增出36条多态性条带,遗传多态性PIC值变化范围为0.6760~0.7877,平均为0.7539;供试样品遗传距离为0~0.9123,表明茅苍术具有丰富的遗传多样性。采用UPGMA法进行聚类分析,当遗传相似系数为0.70时,可将供试样品分为5大类。聚类结果显示叶片形态特征和分子表达并不一致,即茅苍术的叶形性状与遗传背景不具有明显的相关性。
关键词
茅苍术
不同叶形
EST-SSR
分子标记
遗传多样性
聚类分析
Keywords
Atractylodeslancea(Thunb.)DC.
Different
leaf
types
EST-SSR
Molecular
marker
enetic
diversity
Cluster
analysis
分类号
S567.239 [农业科学—中草药栽培]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
江苏省稻曲病菌的群体遗传结构
李燕
刘永锋
张荣胜
俞咪娜
陈志谊
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2012
14
下载PDF
职称材料
2
基于EST-SSR标记的茅苍术种质资源遗传多样性分析
韩凤
刘春雷
罗川
刘杰
胡开治
肖忠
林茂祥
《中国野生植物资源》
CSCD
2019
5
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
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