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柑橘大实蝇内参基因的评估
被引量:
11
1
作者
王佳
赵静
刘映红
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第12期1375-1380,共6页
【目的】柑橘大实蝇Bactrocera minax(Enderlein)是一种危害严重的柑橘害虫。本研究旨在筛选柑橘大实蝇在特定条件下体内稳定表达的内参基因,以确保使用实时荧光定量PCR分析目标基因表达的可靠性。【方法】选择10种候选内参基因用于...
【目的】柑橘大实蝇Bactrocera minax(Enderlein)是一种危害严重的柑橘害虫。本研究旨在筛选柑橘大实蝇在特定条件下体内稳定表达的内参基因,以确保使用实时荧光定量PCR分析目标基因表达的可靠性。【方法】选择10种候选内参基因用于进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR),利用5种软件对柑橘大实蝇在不同虫态下(低龄幼虫、3龄幼虫、1日龄蛹、80日龄蛹、160日龄蛹、雄成虫、雌成虫)以及成虫不同部位(成虫头、胸、腹、整体)中候选内参基因的Ct值进行分析,明确其表达的稳定性。【结果】在柑橘大实蝇不同虫态和成虫不同部位,10种候选内参基因的Ct值都处于15~30之间,各基因Ct值的不同表明各基因的表达量存在差异。综合分析各种软件对内参基因稳定性的排名,结合ge Norm软件对最佳内参基因数量的分析结果,推荐在不同虫态下采用UBQ,GAPDH和GST作为内参基因,在不同成虫部位中采用TUB,GAPDH和GST作为内参基因。【结论】为了获取可信的目标基因表达分析结果,建议根据不同条件选择使用不同的内参基因组合。本研究结果有利于进一步研究柑橘大实蝇在特定条件下的目标基因表达。
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关键词
柑橘大实蝇
内参基因
表达稳定性
基因表达分析
实时荧光定量PCR
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职称材料
绿豆象实时荧光定量PCR内参基因的筛选
2
作者
张敏
李子鹏
+2 位作者
赵欣然
张仙红
郑海霞
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2024年第1期174-183,共10页
绿豆象Callosobruchus chinensis是一种世界性分布的害虫,对绿豆、豇豆等豆科作物的产量与品质造成严重影响。本研究旨在筛选出适合分析绿豆象不同发育阶段以及成虫不同组织中稳定表达的内参基因,根据绿豆象转录组测序以及相关参考文献...
绿豆象Callosobruchus chinensis是一种世界性分布的害虫,对绿豆、豇豆等豆科作物的产量与品质造成严重影响。本研究旨在筛选出适合分析绿豆象不同发育阶段以及成虫不同组织中稳定表达的内参基因,根据绿豆象转录组测序以及相关参考文献报道,筛选出8个候选内参基因(β-Actin、β-Tubulin、α-Tubulin、AK、GAPDH、RPL40、Hsc70、eEF1-α),采用qRT-PCR技术分析在绿豆象不同发育阶段(幼虫、蛹、雌雄成虫)以及成虫不同组织中的(触角、头、腹、足、翅)各候选基因的表达量;利用GeNorm、NormFinder、BestKeeper和在线网站RefFinder并结合△Ct值评估8个候选内参基因的稳定性。结果显示,在绿豆象不同发育阶段以及成虫不同组织中,各候选内参基因Ct值和跨度均不同,表明各候选内参基因表达量存在差异。不同算法综合比较内参基因稳定性以及GeNorm软件最佳内参基因数目的分析显示,在绿豆象虫不同发育阶段中推荐采用β-Act、β-Tub作为内参基因,而在绿豆象成虫不同组织中推荐采用β-Tub、α-Tub作为内参基因,这有利于在绿豆象的基因表达研究中取得更为可靠、准确的数据。
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关键词
绿豆象
实时荧光定量PCR
内参基因
不同发育阶段
组织
基因稳定表达
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职称材料
甘蔗内标基因PCR检测技术研究
被引量:
2
3
作者
肖乃衍
林冰
+8 位作者
刘迪
陈平华
许跃语
施桂姣
王恒波
郭晋隆
高三基
许莉萍
陈如凯
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2017年第3期500-507,共8页
克隆鉴定甘蔗内源低拷贝基因鲜有研究,影响转基因甘蔗精确鉴定。根据其他作物已有的内标基因和内源低拷贝基因,按照内标基因的物种特异性和通用性原则,用12个有代表性甘蔗栽培品种对11个候选基因进行筛选与鉴定,获得了甘蔗特有的内源低...
克隆鉴定甘蔗内源低拷贝基因鲜有研究,影响转基因甘蔗精确鉴定。根据其他作物已有的内标基因和内源低拷贝基因,按照内标基因的物种特异性和通用性原则,用12个有代表性甘蔗栽培品种对11个候选基因进行筛选与鉴定,获得了甘蔗特有的内源低拷贝基因,并以该基因建立了甘蔗内标基因PCR检测技术体系,为转基因甘蔗的精确检测和转基因标准的制定奠定了基础。
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关键词
甘蔗
内标基因
鉴定
PCR检测技术
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职称材料
题名
柑橘大实蝇内参基因的评估
被引量:
11
1
作者
王佳
赵静
刘映红
机构
西南大学植物保护学院昆虫研究所
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第12期1375-1380,共6页
基金
中国博士后科学基金(2014M552307)
中央高校基本科研业务费专项资金(XDJK2013C149)
文摘
【目的】柑橘大实蝇Bactrocera minax(Enderlein)是一种危害严重的柑橘害虫。本研究旨在筛选柑橘大实蝇在特定条件下体内稳定表达的内参基因,以确保使用实时荧光定量PCR分析目标基因表达的可靠性。【方法】选择10种候选内参基因用于进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR),利用5种软件对柑橘大实蝇在不同虫态下(低龄幼虫、3龄幼虫、1日龄蛹、80日龄蛹、160日龄蛹、雄成虫、雌成虫)以及成虫不同部位(成虫头、胸、腹、整体)中候选内参基因的Ct值进行分析,明确其表达的稳定性。【结果】在柑橘大实蝇不同虫态和成虫不同部位,10种候选内参基因的Ct值都处于15~30之间,各基因Ct值的不同表明各基因的表达量存在差异。综合分析各种软件对内参基因稳定性的排名,结合ge Norm软件对最佳内参基因数量的分析结果,推荐在不同虫态下采用UBQ,GAPDH和GST作为内参基因,在不同成虫部位中采用TUB,GAPDH和GST作为内参基因。【结论】为了获取可信的目标基因表达分析结果,建议根据不同条件选择使用不同的内参基因组合。本研究结果有利于进一步研究柑橘大实蝇在特定条件下的目标基因表达。
关键词
柑橘大实蝇
内参基因
表达稳定性
基因表达分析
实时荧光定量PCR
Keywords
Bactrocera
minax
endogenous
reference
genes
expression
stability
gene
expression
analysis
quantitative
real-time
PCR(qRT-PCR)
分类号
Q966 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
绿豆象实时荧光定量PCR内参基因的筛选
2
作者
张敏
李子鹏
赵欣然
张仙红
郑海霞
机构
山西农业大学植物保护学院
出处
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2024年第1期174-183,共10页
基金
国家现代农业产业技术体系(CARS-08-G10)
国家重点研发计划子课题(2021YFD1600603-01)
+1 种基金
山西省现代农业产业技术体系建设(杂粮)(2022-03)
山西省自然科学基金(20210302124166)。
文摘
绿豆象Callosobruchus chinensis是一种世界性分布的害虫,对绿豆、豇豆等豆科作物的产量与品质造成严重影响。本研究旨在筛选出适合分析绿豆象不同发育阶段以及成虫不同组织中稳定表达的内参基因,根据绿豆象转录组测序以及相关参考文献报道,筛选出8个候选内参基因(β-Actin、β-Tubulin、α-Tubulin、AK、GAPDH、RPL40、Hsc70、eEF1-α),采用qRT-PCR技术分析在绿豆象不同发育阶段(幼虫、蛹、雌雄成虫)以及成虫不同组织中的(触角、头、腹、足、翅)各候选基因的表达量;利用GeNorm、NormFinder、BestKeeper和在线网站RefFinder并结合△Ct值评估8个候选内参基因的稳定性。结果显示,在绿豆象不同发育阶段以及成虫不同组织中,各候选内参基因Ct值和跨度均不同,表明各候选内参基因表达量存在差异。不同算法综合比较内参基因稳定性以及GeNorm软件最佳内参基因数目的分析显示,在绿豆象虫不同发育阶段中推荐采用β-Act、β-Tub作为内参基因,而在绿豆象成虫不同组织中推荐采用β-Tub、α-Tub作为内参基因,这有利于在绿豆象的基因表达研究中取得更为可靠、准确的数据。
关键词
绿豆象
实时荧光定量PCR
内参基因
不同发育阶段
组织
基因稳定表达
Keywords
Callosobruchus
chinensis
qRT-PCR
endogenous
reference
genes
developmental
stage
tissue
gene
expression
stability
分类号
Q968.1 [生物学—昆虫学]
S433 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
甘蔗内标基因PCR检测技术研究
被引量:
2
3
作者
肖乃衍
林冰
刘迪
陈平华
许跃语
施桂姣
王恒波
郭晋隆
高三基
许莉萍
陈如凯
机构
福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心
农业部甘蔗及制品质量监督检验测试中心转基因检测室
农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室
出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2017年第3期500-507,共8页
基金
福建省自然科学基金(No.2014J01092)
国家自然科学基金项目(No.31070330)
+1 种基金
科技发展基金项目(No.KF2015080
KF2015118)
文摘
克隆鉴定甘蔗内源低拷贝基因鲜有研究,影响转基因甘蔗精确鉴定。根据其他作物已有的内标基因和内源低拷贝基因,按照内标基因的物种特异性和通用性原则,用12个有代表性甘蔗栽培品种对11个候选基因进行筛选与鉴定,获得了甘蔗特有的内源低拷贝基因,并以该基因建立了甘蔗内标基因PCR检测技术体系,为转基因甘蔗的精确检测和转基因标准的制定奠定了基础。
关键词
甘蔗
内标基因
鉴定
PCR检测技术
Keywords
sugarcane
endogenous
reference
genes
determination
PCR
detection
technology
分类号
S566.103 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
柑橘大实蝇内参基因的评估
王佳
赵静
刘映红
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
11
下载PDF
职称材料
2
绿豆象实时荧光定量PCR内参基因的筛选
张敏
李子鹏
赵欣然
张仙红
郑海霞
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
3
甘蔗内标基因PCR检测技术研究
肖乃衍
林冰
刘迪
陈平华
许跃语
施桂姣
王恒波
郭晋隆
高三基
许莉萍
陈如凯
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2017
2
下载PDF
职称材料
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