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11个地方鸡品种性状间的典型相关分析 被引量:30
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作者 吴信生 徐琪 +5 位作者 肖小珺 张学余 吴圣龙 包文斌 李碧春 陈国宏 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期576-581,共6页
对中国部分地方鸡品种的体尺性状、屠宰性状、产蛋性状和生态性状等4组性状间的17个变量关系进行了典型相关分析。结果表明,体尺性状和屠宰性状间、体尺性状与生态性状间以及屠宰性状与生态性状间的第1个典型相关系数达极显著水平,分别... 对中国部分地方鸡品种的体尺性状、屠宰性状、产蛋性状和生态性状等4组性状间的17个变量关系进行了典型相关分析。结果表明,体尺性状和屠宰性状间、体尺性状与生态性状间以及屠宰性状与生态性状间的第1个典型相关系数达极显著水平,分别占总相关信息的38.17%、42.73%和42.13%,其典型相关系数分别为0.998、0.997和0.998;体尺性状与产蛋性状间和产蛋性状与生态性状间的第1个典型相关系数达显著水平,分别占总相关信息的42.55%和66.79%,其典型相关系数分别为0.965和0.984。研究结果对于鸡的遗传育种具有一定的参考价值。 展开更多
关键词 地方鸡品种 体尺性状 屠宰性状 产蛋性状 生态性状 典型相关
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琅琊鸡FSHR基因-868位点的多态性及对产蛋性能的遗传效应研究
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作者 陈诚 乔西波 +2 位作者 孙亿 康丽 姜运良 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期4560-4568,共9页
旨在探讨琅琊鸡FSHR基因-868位点的多态性和遗传效应。本研究采用PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳对相同饲养管理条件下的、有产蛋性能记录的382只琅琊鸡母鸡FSHR 5′调控区-868位点进行了基因型判定并分析了群体的多态性,分析了该位点与产蛋... 旨在探讨琅琊鸡FSHR基因-868位点的多态性和遗传效应。本研究采用PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳对相同饲养管理条件下的、有产蛋性能记录的382只琅琊鸡母鸡FSHR 5′调控区-868位点进行了基因型判定并分析了群体的多态性,分析了该位点与产蛋性状的关系;采用qRT-PCR和Western Blotting对不同基因型的琅琊鸡个体FSHR的表达量进行了比较。结果表明:琅琊鸡FSHR 5′调控区-868位点存在多态性,I-为优势等位基因,群体偏离哈代-温伯格平衡状态(P<0.05);I+I-基因型个体的47周产蛋数(E47)和换羽后134 d的产蛋数(134D)均显著高于I-I-基因型个体(P<0.05),I+I+和I+I-基因型个体最大连产天数(MCS)显著高于I-I-基因型个体(P<0.01);在等级前卵泡中,I+I+基因型个体的FSHR mRNA水平显著高于I-I-基因型个体(P<0.05);在鸡卵巢中,I+I-基因型个体的FSHR蛋白水平显著高于I-I-基因型个体(P<0.05)。琅琊鸡FSHR基因-868位点存在多态性,FSHR 5′调控区-868位点多态性对琅琊鸡E47和MCS效应显著,亦对换羽后134 d的产蛋量产生显著影响,I+I+基因型个体的FSHR表达量较高。通过基因型选择逐步降低I-的等位基因频率,预期可以提高琅琊鸡的产蛋性能。 展开更多
关键词 琅琊鸡 FSHR -868位点多态性 产蛋性状 表达量
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Associations of Gonadotropin-Releasing Hormone Receptor (GnRHR) and Neuropeptide Y(NPY) Genes’Polymorphisms with Egg-Laying Traits in Wenchang Chicken 被引量:11
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作者 WU Xu LI Hui-fang +7 位作者 YAN Mei-jiao TANG Qing-ping CHEN Kuan-wei WANG Jin-yu GAO Yu- shi TU Yun-jie YU Ya-bo ZHU Wen-qi 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2007年第4期499-504,共6页
Single nucleotide polymorphisms (SNP) of chicken gonadotropin-releasing hormone receptor (GnRHR) and neuropeptide Y (NPY) were selected to identify the genotypes of Wenchang (Chinese indigenous breed) chicken ... Single nucleotide polymorphisms (SNP) of chicken gonadotropin-releasing hormone receptor (GnRHR) and neuropeptide Y (NPY) were selected to identify the genotypes of Wenchang (Chinese indigenous breed) chicken with restricton fragment length polymorphisms. The associations of the SNPs with the total egg production (NE), average days of continual laying (ADCL), and number of double-yolked eggs (DYE) traits were analyzed. The frequency of restriction enzyme A/a alleles in the population was for GnRHR 0.69 (Bpu1102 Ⅰ A) and 0.31 (Bpu1102 Ⅰ a) and for NPY 0.46 (Dra Ⅰ B) and 0.54 (Dra Ⅰ b). Trait data from a total of 120 hens, which were purebred introduced from Hainan Province, China from one generation were recorded. Two significant effects of genes' marker were found: for GnRHR and number of eggs (dominant; t= 2.67, df= 116) and NPY and number of eggs (additive; t= 1.97, df= 116). The current research supports the effects of GnRHR and NPY genes on egg-laying traits of chickens. 展开更多
关键词 CHICKEN gonadotropin-releasing hormone receptor (GnRHR) neuropeptide Y (NPY) egg-laying traits single nucleotide polymorphisms (SNP)
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生长激素基因SNPs与康乐黄鸡产蛋性状的关联分析
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作者 马荆鄂 邱愉菲 +3 位作者 林晓巧 许继国 王樟凤 饶友生 《中国家禽》 北大核心 2024年第9期46-53,共8页
为探索生长激素(Growth hormone,GH)基因部分序列单核苷酸多态性(Single nu⁃cleotide polymorphism,SNP)位点与康乐黄鸡母鸡产蛋性状的相关性,寻找地方鸡种产蛋性状选育的分子标记,试验选取294只康乐黄鸡母鸡为研究材料,测量并记录3个... 为探索生长激素(Growth hormone,GH)基因部分序列单核苷酸多态性(Single nu⁃cleotide polymorphism,SNP)位点与康乐黄鸡母鸡产蛋性状的相关性,寻找地方鸡种产蛋性状选育的分子标记,试验选取294只康乐黄鸡母鸡为研究材料,测量并记录3个产蛋性状指标,包括开产日龄、初产体重和182日龄产蛋数。采用PCR直接测序法筛选GH基因内含子1区域SNPs,利用SAS分析产蛋性状关联的SNPs。结果显示:共发现30个SNP位点,其中共有5个SNP位点与康乐黄鸡母鸡产蛋性状显著关联,其中位于内含子1区域的位点T1270451C与康乐黄鸡母鸡182日龄产蛋数,位点C1271148T与开产日龄、初产体重,位点A1271168G与开产日龄,位点G1271198A与初产体重均显著相关,位于内含子2区域的位点T1270070A与初产体重显著相关。研究表明,GH基因内含子1区域的4个位点T1270451C、C1271148T、A1271168G、G1271198A,内含子2区域T1270070A位点可作为康乐黄鸡产蛋性状选育的候选分子标记。 展开更多
关键词 康乐黄鸡 生长激素基因 SNP 产蛋性状
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茶花鸡PRLR基因多态性与产蛋性状的相关性研究 被引量:5
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作者 孙大卫 柳明正 +7 位作者 杜彦丽 张茹 自先念 何洋 王坤 豆腾飞 贾俊静 葛长荣 《中国家禽》 北大核心 2021年第11期14-19,共6页
为探究茶花鸡PRLR基因多态性与茶花鸡产蛋性状的相关性,挖掘影响茶花鸡产蛋性状的分子遗传标记,研究以300只300日龄的茶花鸡为研究对象,通过测序检测PRLR基因是否存在SNPs位点,并与茶花鸡产蛋性状进行关联分析,再通过实时荧光定量PCR验... 为探究茶花鸡PRLR基因多态性与茶花鸡产蛋性状的相关性,挖掘影响茶花鸡产蛋性状的分子遗传标记,研究以300只300日龄的茶花鸡为研究对象,通过测序检测PRLR基因是否存在SNPs位点,并与茶花鸡产蛋性状进行关联分析,再通过实时荧光定量PCR验证PRLR基因在不同组织中的表达情况。研究结果显示:在茶花鸡PRLR基因中发现两个SNPs位点(C-40T和A+47G),在C-40T的位点中,优势等位基因为T,属于低度多态;关联分析显示该位点与300日龄产蛋数显著相关(P<0.05)。在A+47G位点中,优势等位基因为G,属于中度多态;关联分析显示该位点与开产日龄显著相关(P<0.05)。两个位点均显著偏离哈迪-温伯格平衡(P<0.05)。PRLR在茶花鸡高产组卵巢中的表达显著高于低产组(P<0.05),在高产组卵巢中的表达显著高于垂体(P<0.05)。综上所述,茶花鸡PRLR基因位点C-40T和A+47G可能分别是茶花鸡43周龄产蛋数和开产日龄的分子标记,为茶花鸡产蛋性能的选育提供参考依据。 展开更多
关键词 PRLR基因 茶花鸡 产蛋性状 关联分析
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鸽GnIH基因多态性及其与产蛋性状的关联分析
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作者 张蕊 穆春宇 +4 位作者 汤青萍 卜柱 杨明军 夏爱萍 杨晓明 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1412-1421,共10页
【目的】探究鸽促性腺激素抑制激素(gonadotropin-inhibitory hormone,GnIH)基因多态性,筛选影响母鸽产蛋性状的显著单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,用于高产母鸽的早期选择。【方法】本试验以78对白羽王鸽为... 【目的】探究鸽促性腺激素抑制激素(gonadotropin-inhibitory hormone,GnIH)基因多态性,筛选影响母鸽产蛋性状的显著单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,用于高产母鸽的早期选择。【方法】本试验以78对白羽王鸽为研究对象,根据前期克隆获得的鸽GnIH基因mRNA序列(GenBank登录号:MG589639.1)设计引物,通过PCR扩增和直接测序法检测GnIH基因SNP位点并分型,使用Haploview软件对GnIH基因SNP进行连锁不平衡分析,使用SPSS 22.0软件对GnIH基因多态性与白羽王鸽产蛋性状进行关联分析。【结果】白羽王鸽GnIH基因中共检出7个SNPs,分别位于外显子1(c.59 C>T、c.72 T>A)、外显子2(c.398 G>C)和3′-UTR(c.768 C>T、c.860 G>A、c.909 A>G、c.961 T>C),除c.59 C>T位点偏离Hardy-Weinberg平衡外(P<0.05),其余位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);c.768 C>T与c.961 T>C位点呈完全连锁不平衡状态(D’=1,r 2=1),c.860 G>A与c.768 C>T、c.961 T>C位点呈强连锁状态(D’=1,r 2=0.69),其余位点呈弱连锁状态;c.398 G>C位点突变造成了氨基酸性质和mRNA二级结构的改变,该位点与母鸽年产蛋量和初产体重均呈显著相关(P<0.05)。【结论】GnIH基因外显子2上的SNP位点对母鸽产蛋性状有显著影响,可作为母鸽产蛋性能的候选分子标记。 展开更多
关键词 GnIH基因 单核苷酸多态性(SNP) 产蛋性状 关联分析
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GnIH基因多态性与鹅产蛋和体组成性状的关联分析 被引量:3
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作者 高广亮 张克山 +4 位作者 许国洋 赵献芝 陈主平 周莉 王启贵 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2021年第5期204-210,共7页
为研究促性腺激素抑制激素基因(GnIH)的系列特征,以及其SNP多态性位点对四川白鹅产蛋和体组成等性状的影响,克隆了GnIH基因DNA序列,并与哺乳动物和其他禽类进行生物信息学分析;该基因DNA序列比对到鹅参考基因组序列筛选SNP位点,随后采用... 为研究促性腺激素抑制激素基因(GnIH)的系列特征,以及其SNP多态性位点对四川白鹅产蛋和体组成等性状的影响,克隆了GnIH基因DNA序列,并与哺乳动物和其他禽类进行生物信息学分析;该基因DNA序列比对到鹅参考基因组序列筛选SNP位点,随后采用Sanger方法直接测序PCR产物的方法,检测四川白鹅群体(208个体)中该基因序列,该序列包含3个外显子和2个内含子,CDS区长522 bp,173个氨基酸的前体蛋白GnIH氨基酸序。通过多重比对分析后,统计该基因在四川白鹅群体中SNP位点的基因型及其频率,进而与鹅产蛋和体组成等11个重要经济性状进行关联分析。获得了3735 bp的GnIH基因DNA序列,遗传进化分析显示,四川白鹅GnIH基因与绿头鸭的序列相似度最高(99%);序列比对到鹅参考基因组序列发现该基存在26个SNP位点;SNP位点基因型频率与性状关联分析结果表明:该基因11个SNP位点(g.811T>C、g.1892T>C、g.1320G>A、g.1809G>T、g.2164C>G、g.1708A>G、g.2164C>G、g.1809G>T、g.1892T>C、g.1929C>A和g.2164C>G)与初产蛋质量、体斜长、颈长、胸宽和胫围等性状显著或极显著相关(P<0.05或P<0.01),所有SNP位点而与48周产蛋数、64周产蛋数、出生质量、半潜水长、龙骨长、骨盆宽等无显著相关(P>0.05)。四川白鹅GnIH基因序列与绿头鸭亲缘关系最相近;本研究克隆的3735 bp的DNA序列中存在26个SNP位点,其中11个SNP位点可作为四川白鹅初产蛋质量、体斜长、颈长、胸宽和胫围等经济性状的潜在的分子标记之一。 展开更多
关键词 GnIH基因 SNPS 产蛋性状 体组成性状 分子标记辅助选择
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茶花鸡FSHR基因多态性及其与产蛋性能的相关性研究 被引量:2
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作者 自先念 柳明正 +7 位作者 孙大卫 杜彦丽 何洋 刘永 王坤 豆腾飞 贾俊静 葛长荣 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2022年第1期105-111,共7页
[目的]旨在探索FSHR基因多态性与茶花鸡产蛋性能的相关性,以期挖掘出影响茶花鸡产蛋的分子遗传标记。[方法]以茶花鸡为研究对象,采用测序技术来筛选FSHR基因SNPs位点,并与茶花鸡产蛋性能进行相关性分析,通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技... [目的]旨在探索FSHR基因多态性与茶花鸡产蛋性能的相关性,以期挖掘出影响茶花鸡产蛋的分子遗传标记。[方法]以茶花鸡为研究对象,采用测序技术来筛选FSHR基因SNPs位点,并与茶花鸡产蛋性能进行相关性分析,通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术探究FSHR基因在高、低产组间不同组织中的基因表达情况。[结果]在FSHR基因外显子1中发现了2个SNPs位点(g.34847A→G和g.35000C→T),均属于中度多态;关联分析显示:g.35000C→T位点的TT型个体开产日龄显著高于CT型(P<0.05);CT型个体43周龄产蛋数显著高于CC型和TT型(P<0.05);FSHR基因在高产组卵巢和下丘脑中的表达量显著高于低产组(P<0.05),高产组和低产组中卵巢的表达量都显著高于下丘脑(P<0.05)。[结论]茶花鸡FSHR基因具有一定的多态性和组织表达差异,发现一些影响茶花鸡产蛋性能的潜在分子标记,为地方鸡产蛋性能分子机理及茶花鸡的选育提供了理论基础。 展开更多
关键词 茶花鸡 FSHR基因 产蛋性状 关联分析 表达差异
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鹅产蛋性状全基因组选择信号分析 被引量:1
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作者 唐碧徽 潘璐 +7 位作者 李海英 赵晓钰 吴盈萍 蒋腾 丁雅文 吴利楠 曹妍 梅志勇 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第8期3015-3025,共11页
【目的】利用选择信号分析方法在伊犁鹅和霍尔多巴吉鹅中筛选与产蛋性状相关的候选基因。【方法】选取健康状况良好、饲养管理水平一致的2岁伊犁鹅母鹅和霍尔多巴吉鹅母鹅各24只,采集血液样本,提取基因组DNA,利用全基因组重测序技术进... 【目的】利用选择信号分析方法在伊犁鹅和霍尔多巴吉鹅中筛选与产蛋性状相关的候选基因。【方法】选取健康状况良好、饲养管理水平一致的2岁伊犁鹅母鹅和霍尔多巴吉鹅母鹅各24只,采集血液样本,提取基因组DNA,利用全基因组重测序技术进行选择信号检测分析,筛选出受到选择的候选区域,针对注释基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,进一步筛选出与鹅产蛋性状相关的候选基因。【结果】全基因组重测序的平均测序深度为15.28×,与参考基因组比对率在97.31%以上。通过群体分化指数(Fst)对伊犁鹅和霍尔多巴吉鹅2个群体进行分析,共筛选到1231个候选区域。与核苷酸多样性(Pi)进行联合分析后,伊犁鹅群体共筛选出10个候选区域,得到5个注释基因;霍尔多巴吉鹅群体中共筛选出353个候选区域,得到263个注释基因。GO功能和KEGG通路富集分析发现,初步筛选出6个可能与鹅产蛋性状相关的候选基因(BMP2、BMP6、MIS、ENO1、LIF、EP300),还发现了IL-18基因可能与禽类的免疫有关。【结论】本研究筛选出6个可能与鹅产蛋性状相关的候选基因,为揭示鹅产蛋性状的分子调控机制提供了参考。 展开更多
关键词 伊犁鹅 霍尔多巴吉鹅 选择信号 产蛋性状 候选基因
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