期刊文献+
共找到82篇文章
< 1 2 5 >
每页显示 20 50 100
简并PCR技术及其在基因克隆中的应用 被引量:29
1
作者 王洪振 周晓馥 +2 位作者 宋朝霞 刘文广 曾宪录 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期201-204,共4页
本文简要介绍简并PCR技术,包括什么是简并引物,如何设计简并引物,进行简并PCR的反应条件,应用简并PCR获得全长基因的方法和简并PCR技术的应用范围,并对简并PCR技术的局限性及其新进展进行讨论。在此基础上,简述基因的克隆策略以及简并PC... 本文简要介绍简并PCR技术,包括什么是简并引物,如何设计简并引物,进行简并PCR的反应条件,应用简并PCR获得全长基因的方法和简并PCR技术的应用范围,并对简并PCR技术的局限性及其新进展进行讨论。在此基础上,简述基因的克隆策略以及简并PCR技术在基因克隆中的应用。简并PCR技术是寻找和发现"新"基因或蛋白质家族新成员的一种非常有用的工具。 展开更多
关键词 简并PCR 简并引物 基因克隆
下载PDF
程序化设计的简并引物克隆半滑舌鳎CYP17基因 被引量:21
2
作者 陈彩芳 温海深 +1 位作者 何峰 董双林 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期1213-1218,共6页
采用1种新的简并引物设计方法——CODEHOP法来克隆半滑舌鳎CYP17基因。该法结合NCBI、Blastp、BlockMaker、CODEHOP等生物信息学资源和DNAMAN、Oligo6.0等生物软件,程序性设计半滑舌鳎CYP17基因的CODEHOP引物,从半滑舌鳎卵巢组织中成功... 采用1种新的简并引物设计方法——CODEHOP法来克隆半滑舌鳎CYP17基因。该法结合NCBI、Blastp、BlockMaker、CODEHOP等生物信息学资源和DNAMAN、Oligo6.0等生物软件,程序性设计半滑舌鳎CYP17基因的CODEHOP引物,从半滑舌鳎卵巢组织中成功克隆了CYP17基因,该基因片段与其它物种的CYP17家族具有较高的同源性,经鉴定,该基因属于整个脊椎动物的CYP17基因群,尤其是鱼类亚群。实验结果表明,程序性设计的简并引物较传统简并引物特异性更高,假阳性率少,更有利于实验成功。 展开更多
关键词 半滑舌鳎 简并引物 CYP17
下载PDF
浙江省急性驰缓性麻痹相关肠道病毒鉴定分析 被引量:11
3
作者 葛琼 龚黎明 +3 位作者 严菊英 张严峻 茅海燕 卢亦愚 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期450-452,共3页
目的对浙江省2006-2008年急性弛缓性麻痹病例(AFP)中的非脊灰肠道病毒(NPEV)分离株进行分子生物学分型鉴定。方法采用简并引物和逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR),对31株非脊灰肠道病毒分离株进行目的基因片段扩增,然后测定序列,将测定的结... 目的对浙江省2006-2008年急性弛缓性麻痹病例(AFP)中的非脊灰肠道病毒(NPEV)分离株进行分子生物学分型鉴定。方法采用简并引物和逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR),对31株非脊灰肠道病毒分离株进行目的基因片段扩增,然后测定序列,将测定的结果与GenBank进行BLAST比较分析,运用DNAMAN软件进行同源性分析,并构建基因树。结果31株非脊灰肠道病毒分离株经分子生物学分型,其中人类肠道病毒(HEV)-A组5株,有2个血清型;HEV-B组24株,有13个血清型;HEV-C组2株,有1个血清型。结论浙江省2006-2008年分离到的非脊灰肠道病毒以HEV-B组为主。 展开更多
关键词 非脊灰肠道病毒 分子生物学定型 简并引物
原文传递
用CODEHOP设计简并引物克隆B49乙酸激酶基因片段 被引量:9
4
作者 任南琪 林海龙 +4 位作者 李建政 郑国香 李永丰 于振国 张昆 《哈尔滨工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第8期1225-1229,共5页
利用CODEHOP设计细菌乙酸激酶的简并引物,选用1对引物ACK-J1以高效产氢菌B49基因组DNA进行PCR,得到655bp PCR产物,产物经pMD18-T载体克隆转化至DH5α大肠杆菌中,发现此DNA产物与其他乙酸激酶基因有高度的相似性.所克隆的序列为B49的乙... 利用CODEHOP设计细菌乙酸激酶的简并引物,选用1对引物ACK-J1以高效产氢菌B49基因组DNA进行PCR,得到655bp PCR产物,产物经pMD18-T载体克隆转化至DH5α大肠杆菌中,发现此DNA产物与其他乙酸激酶基因有高度的相似性.所克隆的序列为B49的乙酸激酶基因片段.用CODEHOP程序化设计的简并引物可信性强,阳性率高.该基因的成功克隆将为高效产氢菌B49代谢工程研究和降低其反应器酸化研究提供科学依据. 展开更多
关键词 引物设计 CODEHOP 乙酸激酶基因 简并引物 高效产氢菌
下载PDF
利用CODEHOP和iCODEHOP设计简并引物克隆芒果LAX基因家族片段 被引量:10
5
作者 李运合 孙光明 《热带作物学报》 CSCD 2011年第12期2278-2282,共5页
详细介绍采用CODEHOP和iCODEHOP设计简并引物的方法,并利用这2个程序设计了8对简并引物,从芒果子叶中扩增到8条不同长度的cDNA片段,测序结果表明,这些片段包含4类不同的DNA序列。经过在NCBI上进行blastx分析,这些序列与其它植物的LAX基... 详细介绍采用CODEHOP和iCODEHOP设计简并引物的方法,并利用这2个程序设计了8对简并引物,从芒果子叶中扩增到8条不同长度的cDNA片段,测序结果表明,这些片段包含4类不同的DNA序列。经过在NCBI上进行blastx分析,这些序列与其它植物的LAX基因具有高度同源性,因此推测,芒果中的LAX基因家族其至少包括4条同源基因。研究结果表明CODEHOP和iCODEHOP设计的简并引物可信性强并具有高效性。 展开更多
关键词 芒果 LAX基因 简并引物 iCODEHOP 克隆
下载PDF
盐藻hsp70a cDNA片段的克隆与分析 被引量:9
6
作者 姜国忠 牛向丽 +5 位作者 吕玉民 谢华 王建民 袁保梅 徐培荣 薛乐勋 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期573-576,共4页
根据衣藻、矮牵牛花、Pisumsativum等真核生物hsp70a氨基酸高度保守序列设计两对简并引物,以热休克盐藻cDNA为模板进行巢式PCR扩增,产物经T A克隆转化至JM109大肠杆菌中,经筛选后测序,将测序结果推导成氨基酸序列进行同源性分析,获得了... 根据衣藻、矮牵牛花、Pisumsativum等真核生物hsp70a氨基酸高度保守序列设计两对简并引物,以热休克盐藻cDNA为模板进行巢式PCR扩增,产物经T A克隆转化至JM109大肠杆菌中,经筛选后测序,将测序结果推导成氨基酸序列进行同源性分析,获得了盐藻热休克蛋白70acDNA片段。在盐藻中所获得的cDNA片段,核苷酸长度为372bp,编码126个氨基酸。推导的氨基酸序列与与下列物种的hsp70a比较:衣藻为96%,矮牵牛花为94%,Pisumsativum为86%,番茄为86%,人为85%,果蝇和酵母分别为84%和83%。所克隆的序列为盐藻hsp70acDNA片段。 展开更多
关键词 杜氏盐藻 hsp70a CDNA 简并引物 克隆 序列设计
下载PDF
杜氏盐藻硝酸盐还原酶cDNA片段的克隆与分析 被引量:8
7
作者 谢华 姜国忠 +4 位作者 吕玉民 牛向丽 许培荣 王建民 薛乐勋 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2004年第1期6-8,共3页
目的 :获得杜氏盐藻硝酸盐还原酶cDNA片段。方法 :根据Dunaliellatertiolecta、衣藻、团藻等生物硝酸盐还原酶 (nitratereductase ,NR)高度保守序列EGWWFKP、WNVMGMM设计一对简并引物 ,以含硝酸盐培养基培养的的盐藻cDNA为模板 ,进行PC... 目的 :获得杜氏盐藻硝酸盐还原酶cDNA片段。方法 :根据Dunaliellatertiolecta、衣藻、团藻等生物硝酸盐还原酶 (nitratereductase ,NR)高度保守序列EGWWFKP、WNVMGMM设计一对简并引物 ,以含硝酸盐培养基培养的的盐藻cDNA为模板 ,进行PCR扩增 ,产物克隆至T载体后转化大肠杆菌JM1 0 9,经筛选后测序 ,将测序结果推导成氨基酸序列 ,并与Dunaliellatertiolecta、团藻、衣藻、小球藻等进行同源性分析。结果 :在盐藻中所获得的cDNA片段 ,核苷酸长度为 381bp ,编码 1 2 7个氨基酸。推导的氨基酸序列与下列物种的硝酸盐还原酶进行同源性比较 :Dunaliellatertiolecta为 88.2 %同源 ,团藻为 78% ,衣藻为 6 7% ,小球藻为 5 9%。结论 :所克隆的序列为盐藻硝酸盐还原酶cDNA片段。 展开更多
关键词 杜氏盐藻 硝酸盐还原酶 CDNA 简并引物
下载PDF
CODEHOP在线简并引物设计与杉木4CL基因片段克隆 被引量:7
8
作者 佘朝文 蒋向辉 +2 位作者 许栋 张青桦 赵旺 《湖南林业科技》 2009年第6期26-29,共4页
利用CODEHOP设计4CL酶的简并引物,利用设计的3对简并引物进行RT—PCR,从杉木幼茎中克隆到2个长度分别为502 bp和536 bp的PCR产物,产物经pMD18—T载体克隆转化至DH5α大肠杆菌中,序列通过Blastx检索与Genbank进行同源性比对后,发现2片段... 利用CODEHOP设计4CL酶的简并引物,利用设计的3对简并引物进行RT—PCR,从杉木幼茎中克隆到2个长度分别为502 bp和536 bp的PCR产物,产物经pMD18—T载体克隆转化至DH5α大肠杆菌中,序列通过Blastx检索与Genbank进行同源性比对后,发现2片段都与其它植物的4—CL基因具有较高的氨基酸序列同源性。研究表明,该程序设计的简并引物可信性强,阳性率高。该基因的成功克隆将为研究杉木木质素的合成提供科学依据。 展开更多
关键词 CODEHOP 简并引物 4-CL基因 克隆
下载PDF
盐生杜氏藻cbr基因的克隆 被引量:8
9
作者 郑鸣 白林含 +4 位作者 马梵辛 贺庆华 蒋彦 曹毅 乔代蓉 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期590-593,共4页
首先对其他物种cbr/elip基因的同源序列进行相似性分析,设计一对简并引物,利用TR PCR技术获得一250bp的片段,经克隆测序分析发现其同D.bardwail的cbr基因有67.0%的同源性,然后再以此片段为模板设计引物,通过RACE技术构建盐生杜氏藻cbr... 首先对其他物种cbr/elip基因的同源序列进行相似性分析,设计一对简并引物,利用TR PCR技术获得一250bp的片段,经克隆测序分析发现其同D.bardwail的cbr基因有67.0%的同源性,然后再以此片段为模板设计引物,通过RACE技术构建盐生杜氏藻cbr基因的全长序列. 展开更多
关键词 同源先隆 简并引物 CBR RACE
下载PDF
采用简并引物克隆葎草花粉过敏原全长同源cDNA 被引量:5
10
作者 陶爱林 何韶衡 +2 位作者 张利达 陈章权 李东栋 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期99-103,共5页
目的 :建立一套稳定可靠的方法 ,对过敏原性物种中的过敏原同源基因进行快速克隆。方法 :在分析生物信息数据库中积累的大量过敏原序列同源性的基础上 ,设计简并引物 ,基于高质量草花粉RNA ,逆转录合成cDNA。采用Touch down方式在cDN... 目的 :建立一套稳定可靠的方法 ,对过敏原性物种中的过敏原同源基因进行快速克隆。方法 :在分析生物信息数据库中积累的大量过敏原序列同源性的基础上 ,设计简并引物 ,基于高质量草花粉RNA ,逆转录合成cDNA。采用Touch down方式在cDNA池中进行选择性PCR扩增。同时借助梯度PCR程序 ,对引物扩增的简并性作进一步强化 ,并结合RACE技术获取全长cDNA ,进而对草花粉中的过敏原同源基因进行克隆。结果 :成功地获得 3个全长cDNA克隆。序列分析显示 ,这些基因与已知过敏原的基因序列相似性高达79%~ 85 % ,初步认定其为泛过敏原肌球蛋白抑制蛋白 (pro filin)的同源基因。对比RACE技术获得的相应基因的全长序列发现 ,这些序列在引物结合处与简并引物序列之间存在 4个碱基的差异 ,提示采用Touchdown方式的梯度PCR程序 ,可使引物的简并性得到进一步扩展。结论 :简并引物与Touch down梯度PCR相结合的方法 。 展开更多
关键词 简并引物 梯度PCR 基因克隆 过敏原 同源基因
下载PDF
甘薯抗病基因同源序列的克隆与分析 被引量:6
11
作者 王钰 王荣富 何国浩 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期81-86,共6页
对根据紫花苜蓿(Medicago truncatula)NBS区域的保守序列等设计的16对简并引物进行优化,筛选出6对简并引物,以甘薯的基因组DNA为模板进行PCR扩增,克隆甘薯抗病基因同源序列(RGA)。结果克隆出342个不同的甘薯RGA,这342个甘薯RGA... 对根据紫花苜蓿(Medicago truncatula)NBS区域的保守序列等设计的16对简并引物进行优化,筛选出6对简并引物,以甘薯的基因组DNA为模板进行PCR扩增,克隆甘薯抗病基因同源序列(RGA)。结果克隆出342个不同的甘薯RGA,这342个甘薯RGA和已知的抗病基因历、N、RGCl等具有高度同源性(Evalue〈e×10^-20)。根据抗病基因同源序列的相似性,利用Cluxtalw软件将其分为22个不同的类群。这些甘薯的抗病基因同源序列已提交GenBank(编号:DQ903322至DQ903664)。在342个甘薯RGA中,除7个是TIR外,其余属于DOD—TIR类型。用Blastx和DNAman软件对342个甘薯RGA进行列队比较,发现有9个含有抗线虫病RGC1序列的RGA,它们与RGC1的同源件为50%~100%. 展开更多
关键词 甘薯 简并引物 抗病基因同源序列(RGA) 克隆
下载PDF
基于NBS-LRR类R基因保守结构域克隆瓠瓜抗病基因同源序列 被引量:7
12
作者 赵芹 谢大森 +2 位作者 何晓明 罗少波 彭庆务 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期92-98,共7页
【目的】分离鉴定瓠瓜Lagenaria siceraria抗病种质的抗病基因同源序列(Resistance gene analogs,RGAs),为瓠瓜功能性抗病基因的克隆及分子标记辅助育种奠定基础.【方法】根据已知核苷酸结合位点和富亮氨酸重复(Nucleotide binding s... 【目的】分离鉴定瓠瓜Lagenaria siceraria抗病种质的抗病基因同源序列(Resistance gene analogs,RGAs),为瓠瓜功能性抗病基因的克隆及分子标记辅助育种奠定基础.【方法】根据已知核苷酸结合位点和富亮氨酸重复(Nucleotide binding site and leucine rich repeat,NBS-LRR)类抗病基因保守区设计简并引物,从“大籽瓠”抗性材料基因组DNA中分离抗病基因同源序列,并利用生物信息学软件进行长度变异、保守结构域、同源比对与系统进化分析.【结果和结论】基于同源克隆策略,获得23条瓠瓜NBS抗病同源序列,命名为HNB1~HNB23,GenBank登录号为KJ908192~KJ908214.序列分析及同源比对结果表明,这些RGAs长度变异在242~261nt之间,18条序列具有连续开放阅读框(Open reading frame,ORF),推导氨基酸序列具有P-loop、Kinase-2a典型NBS类R基因保守结构域;核苷酸序列相似性为41.5% ~98.8%,氨基酸序列相似性为21.5% ~100.0%;利用NCBIBlast同源搜索发现,与其他植物尤其是冬瓜、黄瓜、葫芦及丝瓜的已知R基因具有40% ~100%相似性;氨基酸序列聚类分析将其分为5个组;同源进化分析表明,23条瓠瓜RGAs均为non-TIR-NBS-LRR类R基因,与推导氨基酸序列多重比较结果一致. 展开更多
关键词 瓠瓜 NBS-LRR类 抗病基因同源序列 简并引物 序列分析
下载PDF
北方梭囊孔菌漆酶基因DNA片段的克隆与序列分析 被引量:3
13
作者 宋小双 赵敏 +2 位作者 刘桂丰 王玉成 杨谦 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期59-64,共6页
根据报道的10几种真菌漆酶氨基酸序列的保守区域设计了一对简并引物,以北方梭囊孔菌总DNA为模板,通过PCR扩增到一个1201bp的基因片段.将片段序列在NCBI的BLAST软件上进行同源性搜寻,显示99个序列,全部为漆酶基因及其类似基因,因而认为... 根据报道的10几种真菌漆酶氨基酸序列的保守区域设计了一对简并引物,以北方梭囊孔菌总DNA为模板,通过PCR扩增到一个1201bp的基因片段.将片段序列在NCBI的BLAST软件上进行同源性搜寻,显示99个序列,全部为漆酶基因及其类似基因,因而认为克隆到的片段就是北方梭囊孔菌漆酶基因片段.经过与同源性最高的粗毛革孔菌(laccaselcc1)同一区段编码区序列进行ClustalW比较,其中有6个间隔区,确定为内含子区.去除内含子后,推导的氨基酸序列为286个残基.经与其他几种真菌漆酶的氨基酸序列进行ClustalW比对,同源性均在51%以上. 展开更多
关键词 北方梭囊孔菌 漆酶 简并引物 基因克隆
下载PDF
乌江流域某水库浮游藻类群落结构及多样性分析 被引量:6
14
作者 岳一鸿 傅志伟 +3 位作者 陈学萍 杨明 王宝利 汪福顺 《上海大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期97-105,共9页
浮游藻类在河流生态系统中发挥着重要的生态功能.为探明乌江流域不同梯级水库中浮游藻类的种群结构特征,采集了乌江流域某水库水深分别为0,10和45 m的水样过滤膜分层样本,利用两对浮游藻类通用简并引物对水样进行23S rRNA基因扩增、扩... 浮游藻类在河流生态系统中发挥着重要的生态功能.为探明乌江流域不同梯级水库中浮游藻类的种群结构特征,采集了乌江流域某水库水深分别为0,10和45 m的水样过滤膜分层样本,利用两对浮游藻类通用简并引物对水样进行23S rRNA基因扩增、扩增片段建库和高通量测序分析.通过对两对引物获得的浮游藻类种群覆盖度比较,选择出了相对高效的分子标记,获得了不同水深水体中浮游藻类群落结构组成的初步信息,为进一步深入研究乌江流域不同梯级水库中浮游藻类物种多样性提供了一种新手段. 展开更多
关键词 乌江流域 浮游藻类 简并引物 高通量测序
下载PDF
基于兼并引物的PCR扩增特定基因的效果比较 被引量:5
15
作者 李志强 何德 李翠新 《湖北民族学院学报(自然科学版)》 CAS 2015年第2期170-173,共4页
根据NCBI上的DNA拓扑异构酶Ⅱ基因序列设计兼并引物,采用常规PCR、降落PCR、巢式PCR三种方法扩增糙皮侧耳和阿魏侧耳的拓扑异构酶Ⅱ部分基因序列,比较三种方法扩增效果的特异性、灵敏度.结果表明,巢式PCR的灵敏度和特异性都优于常规PCR... 根据NCBI上的DNA拓扑异构酶Ⅱ基因序列设计兼并引物,采用常规PCR、降落PCR、巢式PCR三种方法扩增糙皮侧耳和阿魏侧耳的拓扑异构酶Ⅱ部分基因序列,比较三种方法扩增效果的特异性、灵敏度.结果表明,巢式PCR的灵敏度和特异性都优于常规PCR和降落PCR,并且巢式PCR的灵敏度是常规PCR灵敏度的100倍以上,更加适合兼并引物扩增.这对利用兼并引物获取特异基因具有指导意义. 展开更多
关键词 兼并引物 常规PCR 降落PCR 巢式PCR
下载PDF
香石竹斑驳病毒属简并引物RT-PCR检测方法的建立 被引量:1
16
作者 廖富荣 陈红运 +5 位作者 沈建国 方志鹏 黄蓬英 陈青 林玲玲 洪钧 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期2288-2301,共14页
【目的】使用简并引物RT-PCR方法并结合序列测定与分析,为甲型香石竹斑驳病毒属(Alphacarmovirus)、乙型香石竹斑驳病毒属(Betacarmovirus)和丙型香石竹斑驳病毒属(Gammacarmovirus)病毒建立一种快速、灵敏、广谱的检测鉴定方法。【方... 【目的】使用简并引物RT-PCR方法并结合序列测定与分析,为甲型香石竹斑驳病毒属(Alphacarmovirus)、乙型香石竹斑驳病毒属(Betacarmovirus)和丙型香石竹斑驳病毒属(Gammacarmovirus)病毒建立一种快速、灵敏、广谱的检测鉴定方法。【方法】通过基因组序列的多重比对分析,在依赖于RNA的RNA聚合酶(RdRp)基因的保守区域设计1对简并引物Carmo-F2/Carmo-R2,在引物5′端分别加入非互补的富含AT序列(AATAAATCATAA)形成引物Carmo-F2a/Carmo-R2a,测试简并引物RT-PCR方法的广谱性、特异性和灵敏度,并对PCR产物进行测序、序列分析和系统发育分析。利用该方法对来自厦门的扶桑(Hibiscusrosa-sinensis)样品进行病毒检测。【结果】利用Carmo-F2/Carmo-R2和Carmo-F2a/Carmo-R2a两对引物建立的RT-PCR方法,扩增甲型、乙型和丙型香石竹斑驳病毒属病毒的部分RdRp基因,扩增片段分别约为500和550 bp。该方法成功用于检测甲型香石竹斑驳病毒属的香彩雀花碎色病毒(angelonia flower break virus,AnFBV)、小花矮牵牛斑驳病毒(calibrachoa mottle virus,CbMV)、香石竹斑驳病毒(carnation mottle virus,CarMV)、天竺葵花碎色病毒(pelargonium flower break virus,PFBV),乙型香石竹斑驳病毒属的木槿褪绿环斑病毒(hibiscus chlorotic ringspot virus,HCRSV),丙型香石竹斑驳病毒属的甜瓜坏死斑点病毒(melon necrotic spot virus,MNSV),显示出良好的广谱性。特异性检测表明,简并引物Carmo-F2/Carmo-R2和Carmo-F2a/Carmo-R2a在玉米褪绿斑驳病毒(maize chlorotic mottle virus,MCMV;Machlomovirus)、天竺葵线纹病毒(pelargonium line pattern virus,PLPV;Pelarspovirus)、香石竹环斑病毒(carnation ringspot virus,CRSV;Dianthovirus),健康的西瓜、甜瓜、南瓜、大豆、豌豆植物未扩增到预期大小的条带。灵敏度检测表明,简并引物Carmo-F2/Carmo-R2最低可检测到10-2稀释液,简并引物Carmo-F2a/Carmo-R2a可检测到10-3稀释液,在5′端加入非互补的富 展开更多
关键词 甲型香石竹斑驳病毒属 乙型香石竹斑驳病毒属 丙型香石竹斑驳病毒属 简并引物 RT-PCR 扶桑 木槿褪绿环斑病毒
下载PDF
杜氏盐藻psaB基因cDNA的克隆与序列分析 被引量:4
17
作者 刘红涛 臧卫东 +4 位作者 鲁照明 王宁 侯桂琴 李慎柯 薛乐勋 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期642-645,共4页
根据真核生物莱茵衣藻(Chlamydomonasreinhardtii)、Chlamydomonasmoewusii、Chlorellavulgaris以及Mesostigmaviride的psaB基因的氨基酸高度保守序列,设计一对简并引物,利用TRIzol试剂提取杜氏盐藻(Dunaliellasalina)细胞的总RNA,通过R... 根据真核生物莱茵衣藻(Chlamydomonasreinhardtii)、Chlamydomonasmoewusii、Chlorellavulgaris以及Mesostigmaviride的psaB基因的氨基酸高度保守序列,设计一对简并引物,利用TRIzol试剂提取杜氏盐藻(Dunaliellasalina)细胞的总RNA,通过RT-PCR,得到的一段长为1·8kb左右的cDNA片段。PCR产物经T-A克隆并测序分析以及测序结果推导成氨基酸序列进行同源性比较,表明所克隆的1815bp序列为杜氏盐藻psaBcDNA片段,GenBank收录号为AY820754。根据已经得到的psaB序列推导成氨基酸序列与一些已知物种的psaB基因相比较,同源性分别为Chlamydomonasreinhardtii92%,Chlamydomonasmoewusii91%,Chlorellavulgaris86%,Mesostigmaviride85%,Physcomitrellapatenssubsp.Patens85%,Nephroselmisolivacea84%。据此可推断本实验中所克隆的序列为杜氏盐藻psaBcDNA序列。 展开更多
关键词 杜氏盐藻 A2亚基 psaB CDNA 简并引物
下载PDF
油菜野芥细胞质雄性不育恢复基因候选片段的克隆 被引量:4
18
作者 郝建轶 李云昌 +3 位作者 胡琼 梅德圣 李英德 徐育松 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期433-437,共5页
根据植物细胞质雄性不育恢复基因编码的PPR(pentatricopeptide repeat)蛋白的特点,结合拟南芥PPR基因簇相似序列,扩增油菜野芥细胞质雄性不育(Nsa CMS)基因组DNA,筛选出一对简并引物,在Nsa不育系育性恢复后的可育材料和野芥亲本中可以... 根据植物细胞质雄性不育恢复基因编码的PPR(pentatricopeptide repeat)蛋白的特点,结合拟南芥PPR基因簇相似序列,扩增油菜野芥细胞质雄性不育(Nsa CMS)基因组DNA,筛选出一对简并引物,在Nsa不育系育性恢复后的可育材料和野芥亲本中可以同时扩增出符合预期的片段。片段长度为309bp,与萝卜CMS恢复基因核苷酸序列的一致性为69%,与拟南芥1号染色体臂上PPR基因簇核苷酸序列的一致性大于70%,与含波里马(Pol)CMS恢复基因的白菜型油菜相关序列一致性达85%。该片段编码的氨基酸序列含有两个相邻排列的PPR基序,可作为Nsa CMS育性恢复基因的候选片段。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 野芥细胞质雄性不育 恢复基因 PPR蛋白 简并引物 基因克隆
下载PDF
杜氏盐藻光系统Ⅰ反应中心psaB基因cDNA克隆及系统进化分析 被引量:3
19
作者 鲁照明 刘红涛 +2 位作者 臧卫东 李杰 薛乐勋 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期717-720,共4页
关键词 杜氏盐藻 A2亚基 psaB cDNA 简并引物
下载PDF
PCR法扩增盐藻叶绿体atpA基因 被引量:3
20
作者 侯桂琴 王宁 +4 位作者 谢华 姜国忠 柴玉荣 王天云 薛乐勋 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2004年第1期12-15,共4页
目的 :克隆杜氏盐藻叶绿体atpA基因片段。方法 :把GenBank中近 1 0种藻类的atpA全基因的氨基酸序列进行比较 ,设计简并引物 ,利用PCR方法从盐藻叶绿体DNA中扩增atpA基因片段 ,然后胶回收所扩片段并与T -vector相连 ,转化大肠杆菌JM1 0 9... 目的 :克隆杜氏盐藻叶绿体atpA基因片段。方法 :把GenBank中近 1 0种藻类的atpA全基因的氨基酸序列进行比较 ,设计简并引物 ,利用PCR方法从盐藻叶绿体DNA中扩增atpA基因片段 ,然后胶回收所扩片段并与T -vector相连 ,转化大肠杆菌JM1 0 9,挑阳性克隆鉴定 ,并测序 ,再将序列与所选藻类有关序列比较同源性。结果 :从盐藻叶绿体基因组中扩增出约 4 0 0bp的片段。测序结果显示此片段长 4 0 5bp ,推导的氨基酸序列与莱茵衣藻的同源性为 92 % ,普通小球藻为 88% ,原始绿藻为 87% ,卵形肾藻为 86 % ,Cyanidioschyzonmerolae为 85 %。结论 展开更多
关键词 杜氏盐藻 叶绿体 ATPA 简并引物
下载PDF
上一页 1 2 5 下一页 到第
使用帮助 返回顶部