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秦巴山区漆树nrDNAITS和cpDNA序列分子进化特点的分析
被引量:
5
1
作者
柏国清
李为民
+2 位作者
陈昊
黎斌
李思锋
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期579-586,共8页
应用PCR产物直接测序法分析漆树种群nrDNA(核糖体DNA)ITS序列和cpDNA序列(matK、rbcL、psb AtrnH)的碱基差异,初步研究两套植物基因组的变异速率。结果表明:nrDNA ITS序列共有518 bp,有变异位点15处,变异位点百分率为2.9%,(G+C)含量为61...
应用PCR产物直接测序法分析漆树种群nrDNA(核糖体DNA)ITS序列和cpDNA序列(matK、rbcL、psb AtrnH)的碱基差异,初步研究两套植物基因组的变异速率。结果表明:nrDNA ITS序列共有518 bp,有变异位点15处,变异位点百分率为2.9%,(G+C)含量为61.8%。cpDNA序列合并后长度1 907 bp,有变异位点20处,变异位点百分率为1.05%,(G+C)含量为36.1%。通过对ITS序列核糖型(Ribotype)和叶绿体序列单倍型(Haploype)进行分析发现,秦巴山区漆树区域性分布明显,不同区域拥有自己独特的单倍型,漆树居群历史近期没有扩张。nrDNA ITS序列较叶绿体序列进化较快,变异速率较快。nrDNA ITS序列及叶绿体matK、psbA-trnH适合漆树的亲缘地理学研究。
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关键词
漆树
ITS序列
叶绿体DNA序列
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职称材料
题名
秦巴山区漆树nrDNAITS和cpDNA序列分子进化特点的分析
被引量:
5
1
作者
柏国清
李为民
陈昊
黎斌
李思锋
机构
陕西省植物研究所陕西省植物资源保护与利用工程技术研究中心
出处
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期579-586,共8页
基金
国家科技支撑计划项目(漆树特色种质挖掘与创新利用[2013BAD01B06-7])~~
文摘
应用PCR产物直接测序法分析漆树种群nrDNA(核糖体DNA)ITS序列和cpDNA序列(matK、rbcL、psb AtrnH)的碱基差异,初步研究两套植物基因组的变异速率。结果表明:nrDNA ITS序列共有518 bp,有变异位点15处,变异位点百分率为2.9%,(G+C)含量为61.8%。cpDNA序列合并后长度1 907 bp,有变异位点20处,变异位点百分率为1.05%,(G+C)含量为36.1%。通过对ITS序列核糖型(Ribotype)和叶绿体序列单倍型(Haploype)进行分析发现,秦巴山区漆树区域性分布明显,不同区域拥有自己独特的单倍型,漆树居群历史近期没有扩张。nrDNA ITS序列较叶绿体序列进化较快,变异速率较快。nrDNA ITS序列及叶绿体matK、psbA-trnH适合漆树的亲缘地理学研究。
关键词
漆树
ITS序列
叶绿体DNA序列
Keywords
Toxicodendron
vernlcifluum
ITS
sequence
cpdna
sequenct
分类号
S794.2 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
秦巴山区漆树nrDNAITS和cpDNA序列分子进化特点的分析
柏国清
李为民
陈昊
黎斌
李思锋
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2017
5
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