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人巨细胞病毒临床低传代病毒株UL97基因的克隆与分析
被引量:
2
1
作者
王波
李月琴
+4 位作者
田传军
张纯青
苏运贞
何华坤
周天鸿
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第5期694-699,共6页
分离人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代GZ02病毒株,并根据GenBank提供的实验室标 准病毒株HCMV AD169磷酸转移酶基因UL97 DNA序列及有关文献设计引物,从HCMY GZ02病毒 株基因组DNA中通过PER扩增UL97基因,并克隆至pGEM3Z质粒载体.重组质粒...
分离人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代GZ02病毒株,并根据GenBank提供的实验室标 准病毒株HCMV AD169磷酸转移酶基因UL97 DNA序列及有关文献设计引物,从HCMY GZ02病毒 株基因组DNA中通过PER扩增UL97基因,并克隆至pGEM3Z质粒载体.重组质粒经测序鉴定,发 现HCMV GZ02病毒株UL97基因序列保守区域与HCMV AD169 UL97长度完全一致,但发生G205A、 G761A、T823C、T1173C、T1282C、T1334C、T2106C等7个位点的碱基突变,涉及到编码氨基酸E69K, S275P,CA28R和F445S位点发生改变.
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关键词
人巨细胞病毒
野生型
UL97基因
突变
克隆
序列分析
下载PDF
职称材料
广州地区人巨细胞病毒临床低传代病毒株UL142基因的序列特征分析
2
作者
郭梦杰
胡兢晶
+4 位作者
王波
苏海浩
伍苑宾
蔡丽君
谭琪琪
《中华妇幼临床医学杂志(电子版)》
CAS
2016年第6期720-725,共6页
目的 探讨广州地区人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代病毒株UL142基因的序列特征。方法 选取2014年3月至2015年12月在广州医科大学附属广东省妇儿医院儿科就诊的10例HCMV症状性感染患儿的尿液标本为研究对象。将从HCMV症状性感染患儿尿液...
目的 探讨广州地区人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代病毒株UL142基因的序列特征。方法 选取2014年3月至2015年12月在广州医科大学附属广东省妇儿医院儿科就诊的10例HCMV症状性感染患儿的尿液标本为研究对象。将从HCMV症状性感染患儿尿液标本中分离出的病毒株进行多重PCR鉴定,对UL142基因全序列克隆到pMD18-T载体上扩增并将产物进行测序,将测序结果提交GenBank并与GenBank收录的其他10株HCMV病毒株的UL142基因进行比对分析。结果 从广州地区HCMV症状性感染患儿尿液中成功分离2株HCMV临床病毒株,分别命名为HCMV D2和D3;克隆测序后由GenBank收录,收录号分别为DQ180384和DQ180370。各HCMV病毒株的UL142基因同源性比对分析发现:UL142基因序列较保守,有69处碱基发生变异,且均为点突变,无插入及缺失突变;编码蛋白的氨基酸残基为306个,序列也较保守,其中28处点突变导致编码氨基酸的改变,其余点突变均未导致编码氨基酸改变。不同HCMV病毒株中UL142基因所编码的氨基酸变异率为0.9%-6.5%。各HCMV病毒株UL142基因编码蛋白的二级结构的氨基酸数目不同,但所有HCMV病毒株UL142基因编码蛋白的等电点均在6.48-8.27。结论 广州地区HCMV临床低传代病毒株ULl42基因序列及其编码产物的氨基酸序列均较为保守,但仍存在一定的多态性,这提示UL142基因在HCMV感染与致病机制的研究中可能具有重要作用。
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关键词
巨细胞病毒
临床低传代病毒株
UL142
序列分析
原文传递
题名
人巨细胞病毒临床低传代病毒株UL97基因的克隆与分析
被引量:
2
1
作者
王波
李月琴
田传军
张纯青
苏运贞
何华坤
周天鸿
机构
暨南大学生物工程学系
广州医学院第一附属医院
出处
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第5期694-699,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(30370776)广东省医学科学基金资助项目(A2004272)广州市属高校科技计划资助项目(2004-1045)广州医学院科研基金资助项目(03-K-15).
文摘
分离人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代GZ02病毒株,并根据GenBank提供的实验室标 准病毒株HCMV AD169磷酸转移酶基因UL97 DNA序列及有关文献设计引物,从HCMY GZ02病毒 株基因组DNA中通过PER扩增UL97基因,并克隆至pGEM3Z质粒载体.重组质粒经测序鉴定,发 现HCMV GZ02病毒株UL97基因序列保守区域与HCMV AD169 UL97长度完全一致,但发生G205A、 G761A、T823C、T1173C、T1282C、T1334C、T2106C等7个位点的碱基突变,涉及到编码氨基酸E69K, S275P,CA28R和F445S位点发生改变.
关键词
人巨细胞病毒
野生型
UL97基因
突变
克隆
序列分析
Keywords
human
cytomegalovims
clinical
low
passage
UL97
mutation
clone:
sequence
analysis
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
广州地区人巨细胞病毒临床低传代病毒株UL142基因的序列特征分析
2
作者
郭梦杰
胡兢晶
王波
苏海浩
伍苑宾
蔡丽君
谭琪琪
机构
广州医科大学附属广东省妇儿医院儿科
出处
《中华妇幼临床医学杂志(电子版)》
CAS
2016年第6期720-725,共6页
基金
广东省自然科学基金项目(9151008901000085)
广东省自然科学基金项目(2015A030313726)
广东省医学科研基金项目(A2015133)~~
文摘
目的 探讨广州地区人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代病毒株UL142基因的序列特征。方法 选取2014年3月至2015年12月在广州医科大学附属广东省妇儿医院儿科就诊的10例HCMV症状性感染患儿的尿液标本为研究对象。将从HCMV症状性感染患儿尿液标本中分离出的病毒株进行多重PCR鉴定,对UL142基因全序列克隆到pMD18-T载体上扩增并将产物进行测序,将测序结果提交GenBank并与GenBank收录的其他10株HCMV病毒株的UL142基因进行比对分析。结果 从广州地区HCMV症状性感染患儿尿液中成功分离2株HCMV临床病毒株,分别命名为HCMV D2和D3;克隆测序后由GenBank收录,收录号分别为DQ180384和DQ180370。各HCMV病毒株的UL142基因同源性比对分析发现:UL142基因序列较保守,有69处碱基发生变异,且均为点突变,无插入及缺失突变;编码蛋白的氨基酸残基为306个,序列也较保守,其中28处点突变导致编码氨基酸的改变,其余点突变均未导致编码氨基酸改变。不同HCMV病毒株中UL142基因所编码的氨基酸变异率为0.9%-6.5%。各HCMV病毒株UL142基因编码蛋白的二级结构的氨基酸数目不同,但所有HCMV病毒株UL142基因编码蛋白的等电点均在6.48-8.27。结论 广州地区HCMV临床低传代病毒株ULl42基因序列及其编码产物的氨基酸序列均较为保守,但仍存在一定的多态性,这提示UL142基因在HCMV感染与致病机制的研究中可能具有重要作用。
关键词
巨细胞病毒
临床低传代病毒株
UL142
序列分析
Keywords
Cytomegalovirus
clinical
low
passage
virus
strain
UL142
Sequence
analysis
分类号
R725.1 [医药卫生—儿科]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人巨细胞病毒临床低传代病毒株UL97基因的克隆与分析
王波
李月琴
田传军
张纯青
苏运贞
何华坤
周天鸿
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2005
2
下载PDF
职称材料
2
广州地区人巨细胞病毒临床低传代病毒株UL142基因的序列特征分析
郭梦杰
胡兢晶
王波
苏海浩
伍苑宾
蔡丽君
谭琪琪
《中华妇幼临床医学杂志(电子版)》
CAS
2016
0
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