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B细胞蛋白质抗原表位的研究方法进展 被引量:25
1
作者 吴敬 吴梧桐 《药物生物技术》 CAS CSCD 2000年第4期239-242,共4页
B细胞抗原表位的研究对于免疫识别基础理论和实际应用有积极意义。
关键词 B细胞 抗原表位 化学切割法 酶法 肽探针扫描
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羊口疮病毒F1L蛋白二级结构分析与表位预测 被引量:20
2
作者 王光祥 尚佑军 +3 位作者 吕占禄 张克山 田宏 刘湘涛 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期1185-1190,共6页
目的利用软件预测羊口疮病毒(ORFV)F1L蛋白的二级结构和细胞表位。方法利用SOPMA服务器预测ORFV F1L蛋白的二级结构,以DNAStar软件单参数(二级结构、亲水性、可及性、柔韧性及抗原性)预测结果为基础,通过二级结构预测初步筛选,并以ABCp... 目的利用软件预测羊口疮病毒(ORFV)F1L蛋白的二级结构和细胞表位。方法利用SOPMA服务器预测ORFV F1L蛋白的二级结构,以DNAStar软件单参数(二级结构、亲水性、可及性、柔韧性及抗原性)预测结果为基础,通过二级结构预测初步筛选,并以ABCpred方案作为最终验证,预测羊口疮病毒(ORFV)F1L蛋白的B细胞表位;运用神经网络+量化矩阵法(ANNs+QM法)预测ORFV F1L蛋白的CTL细胞表位;使用MHC-II类分子结合肽在线程序预测ORFV F1L蛋白的Th细胞表位。结果 ORFV F1L蛋白含有α-螺旋34.71%、β-片层18.82%、β-转角5.88%、无规则卷曲40.59%;没有信号肽,可能存在7个B细胞表位,2个CTL表位,3个Th细胞表位。结论该研究结果将为建立ORFV诊断方法、制备单克隆抗体及合成肽疫苗提供理论依据。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 F1L基因 二级结构 细胞表位 预测
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B细胞表位预测方法研究进展 被引量:17
3
作者 梁瑾 王靖飞 《生命科学》 CSCD 北大核心 2009年第2期320-323,共4页
B细胞抗原表位预测方法的研究对基础免疫学的研究及实际应用有着重要的意义。本文归纳了理论预测B细胞表位的常用方法,并对目前预测B细胞表位方法存在的问题进行了分析。
关键词 B细胞 表位 预测
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多表位疫苗的构建策略及其在动物疫苗中的应用 被引量:10
4
作者 张有峰 王红宁 +1 位作者 黄勇 阳泰 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 2008年第2期29-33,共5页
多表位疫苗是基于抗原表位氨基酸序列而制备的一种新型分子疫苗。由于具有安全性好、保护力强和应答类型可以有效调控等优点,多表位疫苗具有较高的研究和应用价值。多表位疫苗因其独特的免疫优势已成为近年来基因工程疫苗研究领域的热... 多表位疫苗是基于抗原表位氨基酸序列而制备的一种新型分子疫苗。由于具有安全性好、保护力强和应答类型可以有效调控等优点,多表位疫苗具有较高的研究和应用价值。多表位疫苗因其独特的免疫优势已成为近年来基因工程疫苗研究领域的热点之一。本文概述了表位的预测筛选、多表位疫苗的设计与优化及其在动物医学领域的应用等方面的进展。 展开更多
关键词 多表位疫苗 抗原表位 T细胞表位 B细胞表位
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O型口蹄疫病毒VP1 T细胞、B细胞表位双拷贝基因与大肠杆菌LTB、STⅠ肠毒素基因融合表达产物的免疫应答 被引量:12
5
作者 庄娟 尤永进 +2 位作者 陈波 饶忠 潘洁 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期557-562,共6页
合成O型口蹄疫病毒VP1蛋白中与细胞免疫(21~40表位肽)及体液免疫(141~160表位肽)相关的基因序列2020VP1,运用基因工程技术构建了含有肠毒素大肠杆菌LTB、STⅠ基因及双拷贝2020VP1的融合表达载体r2020-B-2020-STⅠ,转化宿主菌BL2... 合成O型口蹄疫病毒VP1蛋白中与细胞免疫(21~40表位肽)及体液免疫(141~160表位肽)相关的基因序列2020VP1,运用基因工程技术构建了含有肠毒素大肠杆菌LTB、STⅠ基因及双拷贝2020VP1的融合表达载体r2020-B-2020-STⅠ,转化宿主菌BL21(DE3)RIL后的表达产物经SDS—PAGE分析,结果显示重组融合蛋白的分子量约为45kDa,表达量较高。ELISA实验结果显示,融合蛋白能与霍乱毒素(cholera toxin)CTB抗体特异结合。动物实验表明,融合蛋白能够诱发兔体产生较强的FMDV中和抗体,免疫豚鼠在低浓度FMDV刺激下能够产生特异性T淋巴细胞增殖反应,说明融合蛋白能诱导机体产生FMDV特异性细胞及体液免疫反应;同时,融合蛋白免疫雌鼠能够抵抗大肠杆菌强毒株攻击,免疫兔体能够产生STⅠ中和抗体,且融合蛋白不具STⅠ毒性,证明融合蛋白具有良好的LTB、STⅠ免疫原性。实验结果表明,此融合蛋白具有开发成为口蹄疫及肠毒素腹泻联合疫苗的应用价值。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 VP1 T细胞表位 B细胞表位 肠毒素大肠杆菌 LTB ST 免疫应答
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狂犬病毒MHC限制性CTL与Th表位的预测与鉴定 被引量:13
6
作者 胡晓波 朱乃硕 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期736-740,共5页
目的:预测并筛选鉴定狂犬病毒糖蛋白及核蛋白BALB/c小鼠MHC限制性CTL和Th表位。方法:从NCBI数据库中获取狂犬病毒糖蛋白及核蛋白的完整氨基酸序列,然后运用生物信息学软件BIMAS、SYFPEITHI和RANKPEP对CTL表位及Th表位进行预测并合成相... 目的:预测并筛选鉴定狂犬病毒糖蛋白及核蛋白BALB/c小鼠MHC限制性CTL和Th表位。方法:从NCBI数据库中获取狂犬病毒糖蛋白及核蛋白的完整氨基酸序列,然后运用生物信息学软件BIMAS、SYFPEITHI和RANKPEP对CTL表位及Th表位进行预测并合成相关抗原表位。BALB/c小鼠经狂犬疫苗免疫后,通过淋巴细胞增殖实验对预测的多肽进行初步筛选。初步筛选的多肽再利用ELISPOT和流式细胞法进行进一步筛选,检测指标主要包括细胞因子IFN-γ和IL-4的分泌水平以及多肽对CD3+CD4+/CD3+CD8+T细胞亚群的影响情况。结果:经软件预测获得8条可能的CTL与Th表位,多肽合成后经分析各条多肽纯度大于90%。实验验证后证明2条多肽G367-381及G333-341能够成为细胞表位,其中G367-381作为Th表位,G333-341作为CTL表位。结论:G367-381及G333-341是狂犬病毒的细胞表位,可用于未来狂犬病毒表位疫苗的研究。 展开更多
关键词 狂犬病毒 细胞表位 MHC限制性
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结核分枝杆菌RD12区T细胞表位分布情况预测及分析 被引量:13
7
作者 叶娟 张舒林 刘文第 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期7-12,共6页
目的预测并分析结核分枝杆菌(MTB)RD12区4个抗原的CD4+T和CD8+T细胞表位分布情况。方法在NCBI数据库上查询并获得各个抗原的氨基酸序列,用Blast分析其与MTB复合群及人类蛋白的同源性。利用SYFPEITHI、NETCTL、BIMAS和NetMHC数据库预测... 目的预测并分析结核分枝杆菌(MTB)RD12区4个抗原的CD4+T和CD8+T细胞表位分布情况。方法在NCBI数据库上查询并获得各个抗原的氨基酸序列,用Blast分析其与MTB复合群及人类蛋白的同源性。利用SYFPEITHI、NETCTL、BIMAS和NetMHC数据库预测并分析MTB的RD12区抗原CD8+T细胞表位的分布情况;利用NetMHC数据库预测并分析MTB的RD12区抗原的CD4+T细胞表位的分布情况。然后,综合CD4与CD8表位预测,筛选出优势表位肽段。结果通过预测与分析,初步筛选出MTB的RD12区4个抗原的CD8+T细胞候选表位16个;CD4+T细胞的强结合候选表位234个,弱结合候选表位505个,综合CD4与CD8表位预测并分析,最终筛选出13个优势表位肽段。结论预测出来的T细胞候选表位将为结核病的特异性诊断及新的抗结核多表位疫苗的研究奠定基础。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 RD12区 T细胞 表位分析
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Identification of the epitopes on HCV core protein recognized by HLA-A2 restricted cytotoxic T lymphocytes 被引量:11
8
作者 Hong-Chao Zhou De-Zhong Xu Xue-Ping Wang Jing-Xia Zhang Ying-Huang Yong-Ping Yan Yong Zhu Bo-Quan Jin Department of Epidemiology,the Fourth Military Medical University,Xi’an 710033,Shaanxi Province,ChinaDepartment of Immunology,the Fourth Military Medical University,Xi’an 710033,Shaanxi Province,China 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2001年第4期583-586,共4页
AIM: To identify hepatitis C virus(HCV) core protein epitopes recognized by HLA-A2 restricted cytotoxic T lymphocyte (CTL). METHODS: Utilizing the method of computer prediction followed by a 4h(51)Cr release assay con... AIM: To identify hepatitis C virus(HCV) core protein epitopes recognized by HLA-A2 restricted cytotoxic T lymphocyte (CTL). METHODS: Utilizing the method of computer prediction followed by a 4h(51)Cr release assay confirmation. RESULTS: The results showed that peripheral blood mononuclear cells (PBMC) obtained from two HLA-A2 positive donors who were infected with HCV could lyse autologous target cells labeled with peptide &quot;ALAHGVRAL (core 150-158)&quot;. The rates of specific lysis of the cells from the two donors were 37.5% and 15.8%, respectively. Blocking of the CTL response with anti-CD4 mAb caused no significant decrease of the specific lysis. But blocking of CTL response with anti-CD8 mAb could abolish the lysis. CONCLUSION: The peptide (core 150-158) is the candidate epitope recognized by HLAA2 restricted CTL. 展开更多
关键词 Amino Acid Sequence Antibodies Viral B-LYMPHOCYTES cell Line epitope Mapping HLA-A2 Antigen HEPACIVIRUS Hepatitis C Humans Peptide Fragments Predictive Value of Tests Research Support Non-U.S. Gov't T-Lymphocytes Cytotoxic Viral Core Proteins
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用SP2/0瘤细胞核或DNA免疫同系小鼠诱导抗核抗体的产生 被引量:10
9
作者 沈璐琳 韩晓辉 +1 位作者 郑秀娟 吴厚生 《上海免疫学杂志》 CSCD 北大核心 2001年第4期219-220,共2页
用SP2 / 0瘤细胞核或DNA分别免疫Balb/c小鼠均可获得IgG抗dsDNA、抗组蛋白、抗Sm、抗SS A/SS B等抗核抗体 ,类似于ConA活化的淋巴细胞的DNA免疫 ,而正常Balb/c小鼠的DNA不能诱导出抗核抗体。实验表明肿瘤细胞的DNA类似于活化细胞的DNA... 用SP2 / 0瘤细胞核或DNA分别免疫Balb/c小鼠均可获得IgG抗dsDNA、抗组蛋白、抗Sm、抗SS A/SS B等抗核抗体 ,类似于ConA活化的淋巴细胞的DNA免疫 ,而正常Balb/c小鼠的DNA不能诱导出抗核抗体。实验表明肿瘤细胞的DNA类似于活化细胞的DNA具有免疫原性 。 展开更多
关键词 瘤细胞 DNA 抗核抗体 表位扩展 肿瘤 自身抗体
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Eppin抗原的二级结构分析B细胞表位预测 被引量:8
10
作者 李晋涛 陈正琼 +3 位作者 梁志清 阎萍 何畏 吴玉章 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第24期2254-2257,共4页
目的分析Eppin抗原的二级结构并预测其B细胞表位。方法联合运用多种方法对Eppin的二级结构和表面特性,如亲水性、理化性质、可及性、免疫原性和可塑性等方面进行分析,预测其抗原表位。结果Eppin存在多个潜在的抗原表位位点,可能的蛋白... 目的分析Eppin抗原的二级结构并预测其B细胞表位。方法联合运用多种方法对Eppin的二级结构和表面特性,如亲水性、理化性质、可及性、免疫原性和可塑性等方面进行分析,预测其抗原表位。结果Eppin存在多个潜在的抗原表位位点,可能的蛋白质抗原表位区域:14~23,30~44,48~54,56~68,78~85,97~106,109~116,125~132。体外实验证明,所预测抗原表位区域基本能与免疫抗血清发生抗原特异性反应。结论应用多参数成功预测了Eppin抗原的B细胞表位。 展开更多
关键词 Eppin抗原 B细胞 表位
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The Prediction of B Cell Epitopes for VP73 Protein of African Fever Virus 被引量:9
11
作者 李倩 姚淑霞 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2008年第1期89-93,共5页
[Objective] The B cell epitopes for VP73 protein of African swine fever virus was predicted. [ Method] Based on the analysis of the amino acid sequence and the flexible regions of VP73 protein, the B cell epitopes for... [Objective] The B cell epitopes for VP73 protein of African swine fever virus was predicted. [ Method] Based on the analysis of the amino acid sequence and the flexible regions of VP73 protein, the B cell epitopes for VP73 protein of African swine fever virus were predicted by method of Kyte-Doolittie, Emini and Jameson-Wolf. [Result] The B cell epitopes were located at or adjacent to the N-terminal No. 11 - 18,26 -48,73 -82,136 - 150,159 - 174,181 - 189,191 - 210,247 - 276,279 - 295,313 - 323 and 382 - 392. [Conclusion] The multi-parameters analytic method was adopted to predict the B cell epitopes for VP73 protein of African swine fever virus, which laid solid foundation for further characterizing the protein of VP73 and researching epitope vaccine. 展开更多
关键词 African swine fever virus VP73 protein B cell epitope
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Antigen epitopes of animal coronaviruses:a mini-review
12
作者 Mingjun Su Guanghui Zheng +1 位作者 Xiangwen Xu Houhui Song 《Animal Diseases》 CAS 2024年第1期19-26,共8页
Coronaviruses are widespread in nature and can infect mammals and poultry,making them a public health concern.Globally,prevention and control of emerging and re-emerging animal coronaviruses is a great challenge.The m... Coronaviruses are widespread in nature and can infect mammals and poultry,making them a public health concern.Globally,prevention and control of emerging and re-emerging animal coronaviruses is a great challenge.The mecha-nisms of virus-mediated immune responses have important implications for research on virus prevention and control.The antigenic epitope is a chemical group capable of stimulating the production of antibodies or sensitized lympho-cytes,playing an important role in antiviral immune responses.Thus,it can shed light on the development of diagnos-tic methods and novel vaccines.Here,we have reviewed advances in animal coronavirus antigenic epitope research,aiming to provide a reference for the prevention and control of animal and human coronaviruses. 展开更多
关键词 Animal coronavirus Antigen epitope B-cell epitope T-cell epitope Immune responses Vaccines
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慢性乙型肝炎患者树突状细胞形态、表型和功能的变化 被引量:7
13
作者 刘树人 张雁 +3 位作者 李灼亮 余宙耀 陆汉明 解放军第 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期437-439,共3页
目的观察慢性乙型肝炎病毒hepatitisBvirusHBV感染者树突状细胞dendriticcellsDC形态、表型和功能的改变。方法从13例慢性乙肝患者和11例健康人外周血中分离和培养DC观察DC的形态。用流式细胞仪检测DC的表面标志HLA-DR、CD1a、CD80和CD8... 目的观察慢性乙型肝炎病毒hepatitisBvirusHBV感染者树突状细胞dendriticcellsDC形态、表型和功能的改变。方法从13例慢性乙肝患者和11例健康人外周血中分离和培养DC观察DC的形态。用流式细胞仪检测DC的表面标志HLA-DR、CD1a、CD80和CD86的表达。用3H-TdR掺入法,检测DC诱导混合性淋巴细胞反应mixedleukocytesreactionMLR的能力。结果正常人的DC较慢乙肝患者的DC在形态上更为典型。前者的DC不规则,细胞可表达较多的HLA-DR、CD80和CD86分子P<0.05诱导MLR的能力也较强P<0.05。结论慢乙肝患者外周血DC处于不完全成熟状态,其免疫刺激能力较低。 展开更多
关键词 慢性乙型肝炎 树突状细胞 形态 表型 功能
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MUC1抗原的B细胞表位预测 被引量:6
14
作者 杨清浩 王祥卫 +1 位作者 金燕 张立新 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期406-409,共4页
目的 预测MUC1抗原的B细胞表位。方法 联合运用多种方法对MUC1的二级结构和表面特性,如理化 性质、亲水性、可塑性、溶剂可及性及免疫原性等方面进行分析,预测MUC1的抗原表位。结果 MUC1存在有多个潜在的 抗原表位位点,可能的蛋... 目的 预测MUC1抗原的B细胞表位。方法 联合运用多种方法对MUC1的二级结构和表面特性,如理化 性质、亲水性、可塑性、溶剂可及性及免疫原性等方面进行分析,预测MUC1的抗原表位。结果 MUC1存在有多个潜在的 抗原表位位点,可能的蛋白质抗原表位区域:1 -10,24 -54,65 -77,84 -91,108 -134,140 -156,159 -174,179 -196,199- 210,220- 233, 237- 265,270- 299,316 -337,351 -362,369- 396,411- 420,445 -502。结论 应用多参数预测MUC1抗原的B细胞表位,为进一步 研究MUC1结构和功能、构建MUC1突变体和选择表达新型MUC1分子奠定了基础。 展开更多
关键词 MUC1 表位预测 蛋白质抗原表位 B细胞表位 结构和功能 表面特性 二级结构 理化性质 免疫原性 亲水性 可塑性 可及性 多参数 步研究 突变体
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表达gH/gL抗原的腺病毒载体EBV疫苗免疫BALB/c小鼠后的T细胞表位鉴定
15
作者 石雪洋 郝彦哲 +4 位作者 李晨雨 马琦 王冰丹 冯霞 李淑英 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期500-507,共8页
为了鉴定表达爱泼斯坦-巴尔病毒(Epstein-Barr virus,EBV)gH/gL保护性抗原的腺病毒载体疫苗在BALB/c小鼠中的T细胞表位,本研究使用表达gH/gL蛋白的腺病毒载体EBV疫苗免疫BALB/c小鼠,利用IEDB Analysis Resource软件对序列进行亲和力预测... 为了鉴定表达爱泼斯坦-巴尔病毒(Epstein-Barr virus,EBV)gH/gL保护性抗原的腺病毒载体疫苗在BALB/c小鼠中的T细胞表位,本研究使用表达gH/gL蛋白的腺病毒载体EBV疫苗免疫BALB/c小鼠,利用IEDB Analysis Resource软件对序列进行亲和力预测,设计合成EBV gH基因和gL基因的肽库,并将其混合成肽池,取免疫后的小鼠脾细胞进行IFN-γ ELISPOT检测,通过肽池和单肽两轮筛选检测具有阳性反应的多肽片段,确定优势反应肽。结果显示筛选出gH基因5条特异性优势肽,其中序列为LRGPFSYPSLTSAQS的单肽反应最强;gL基因4条特异性优势肽,其中序列为ASLNSPKNGSNQLVI的单肽反应最强。本研究使用IFN-γ ELISPOT法筛选和确定了9条EBV gH抗原特异性和gL抗原特异性优势T细胞表位,为EBV免疫学与疫苗研究提供了参考。 展开更多
关键词 EBV抗原 T细胞表位 IFN-γELISPOT
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重组表达口蹄疫病毒T细胞表位猪细小病毒病毒样颗粒的制备 被引量:6
16
作者 潘群兴 王永山 +4 位作者 何孔旺 欧阳伟 王晓丽 诸玉梅 夏兴霞 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期844-848,共5页
为增强表位疫苗的免疫原性,本研究将O型口蹄疫病毒(FMDV)VP1中编码T细胞表位肽(aa 21~aa 40)序列连接于猪细小病毒(PPV)VP2的5'端,并插入到杆状病毒供体质粒pFastBac HTA中,构建成重组转座载体pFastBac-FMDV-VP1-PPV-VP2,转化含有... 为增强表位疫苗的免疫原性,本研究将O型口蹄疫病毒(FMDV)VP1中编码T细胞表位肽(aa 21~aa 40)序列连接于猪细小病毒(PPV)VP2的5'端,并插入到杆状病毒供体质粒pFastBac HTA中,构建成重组转座载体pFastBac-FMDV-VP1-PPV-VP2,转化含有穿梭载体Bacmid的E.coli DH10Bac中,经蓝白菌落筛选获得重组杆状病毒表达质粒rBac-FMDV-VP1-PPV-VP2,转染昆虫草地夜蛾(Sf9)细胞,并在Sf9中进行了表达。电镜观察显示,表达的重组蛋白能够自我组装成病毒样颗粒rPPV∶VLP(FMDV)。用间接免疫荧光试验(IFA)、western blot分析表明,表达产物具有与PPV VP2天然蛋白相似的免疫原性。小鼠免疫实验证实,在低浓度FMDV抗原下能够产生特异性T淋巴细胞增殖反应;而且该病毒样颗粒能诱导机体产生抗FMDV特异性细胞免疫反应。 展开更多
关键词 猪细小病毒 病毒样颗粒 O型口蹄疫病毒 T细胞表位
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溶藻弧菌附着定植因子ACFA蛋白的原核表达、抗原性鉴定及生物信息学分析 被引量:6
17
作者 刘祥 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第7期1755-1760,共6页
溶藻弧菌附着定植因子ACFA蛋白具有很好的免疫原性,在疫苗上有应用前景。本试验通过分子克隆获得ACFA蚕白的表达菌株,利用SDS.PAGE切胶纯化与尿素浓度梯度复性获得ACFA蛋白,免疫小鼠制备抗血清,Western-blotting检测发现ACFA蛋白... 溶藻弧菌附着定植因子ACFA蛋白具有很好的免疫原性,在疫苗上有应用前景。本试验通过分子克隆获得ACFA蚕白的表达菌株,利用SDS.PAGE切胶纯化与尿素浓度梯度复性获得ACFA蛋白,免疫小鼠制备抗血清,Western-blotting检测发现ACFA蛋白具有很好的抗原性。利用在线软件预测ACFA蛋白为亲水的分泌型蛋白,存在多个酶切位点;采用TMHMM Serverv.2.0程序预测ACFA无跨膜结构并定位于细胞膜外;SOPMA服务器预测ACFA二级结构中含无规则卷曲32.56%,a-螺旋25,58%,β-转角6.05%,β-片层35.81%。通过SignalP 4.1软件分析显示,ACFA的1—18位氨基酸为信号肽序列。通过Swiss-Model程序预测的三维结构显示,ACFA蛋白没有配体。利用ABCprvd和BepiPred方案,预测ACFA存在4个B细胞表位。运用神经网络与量化矩阵法预测ACFA具有2个CTL表位。使用MHC—II类分子结合肽在线程序预测发现ACFA存在2个n表位。 展开更多
关键词 溶藻弧菌 ACFA蛋白 细胞表位 蛋白结构 预测
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脂多糖结合蛋白的B细胞抗原表位预测及其效应初步分析 被引量:6
18
作者 冯起甲 徐智 +4 位作者 吴国明 胡川闽 徐顺贵 陈维中 郭芮伶 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期292-294,共3页
目的预测人脂多糖结合蛋白(LBP)的B细胞抗原表位。方法采用生物信息软件和互联网服务器,预测LBP的二级结构和分析LBP表面特性(亲水性、可塑性、可及性和抗原性),再计算平均抗原指数(AI),预测LBP的B细胞抗原表位。结果LBP存在多个潜在的... 目的预测人脂多糖结合蛋白(LBP)的B细胞抗原表位。方法采用生物信息软件和互联网服务器,预测LBP的二级结构和分析LBP表面特性(亲水性、可塑性、可及性和抗原性),再计算平均抗原指数(AI),预测LBP的B细胞抗原表位。结果LBP存在多个潜在的抗原表位,247~260序列(FKGEIFHRNHRSPV)的AI(0.0407)明显高于其他片段,370~379序列(LPSSSKEPVF)和303~325序列(ITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFV)的AI分别是0.0336和0.0295。247~260序列是LBP潜在的B细胞优势抗原表位。结论应用多参数预测到LBP的B细胞抗原表位。 展开更多
关键词 LBP抗原 表位 B细胞 生物信息学
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T细胞抗原表位预测的研究方法进展 被引量:6
19
作者 唱凯 李贤龙 +2 位作者 贾延辉 徐泽刚 李晋涛 《生物学杂志》 CAS CSCD 2009年第1期62-64,68,共4页
确定T细胞所识别抗原分子上的短肽序列对T细胞表位进行定位,对于研究特异性免疫应答有着重要意义。综述了近年来实验确定和理论预测T细胞蛋白质抗原表位的常用方法,以及T细胞抗原表位分析的研究方法。
关键词 T细胞 抗原表位 抗原
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粉尘螨1类变应原T和B细胞表位t合基因的构建与表达 被引量:4
20
作者 徐海丰 徐朋飞 +1 位作者 王克霞 李朝品 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 2014年第4期420-424,共5页
目的:构建粉尘螨1类变应原(Derf1)的T和B细胞表位嵌合基因原核表达载体。方法将Derf1包含的5个T细胞表位(T1~T5)和6个B细胞表位(B1~B6),以B1-T1-B2-T2-B3-T3-B4-T4-B5-T5-B6和B1-B2-B3-B4-B5-B6-T1-T2-T3-T4-T5连接方式直接... 目的:构建粉尘螨1类变应原(Derf1)的T和B细胞表位嵌合基因原核表达载体。方法将Derf1包含的5个T细胞表位(T1~T5)和6个B细胞表位(B1~B6),以B1-T1-B2-T2-B3-T3-B4-T4-B5-T5-B6和B1-B2-B3-B4-B5-B6-T1-T2-T3-T4-T5连接方式直接合成表位嵌合基因,并分别命名为Derf1A和Derf1B。构建原核表达重组质粒pET-28a(+)-Derf1A和pET-28a(+)-Derf1B,双酶切及测序验证的阳性克隆转化到E.coliBL21(DE3)后诱导表达。SDS-PAGE分析表达产物后进行纯化,并进行Westernblotting鉴定。ELISA法检测嵌合蛋白对粉尘螨过敏患者血清IgE抗体的结合力。结果双酶切及测序结果表明,成功构建了原核表达重组质粒pET-28a(+)-Derf1A和pET-28a(+)-Derf1B;SDS-PAGE分析表明,Derf1A和Derf1B诱导并纯化成功,Westernblotting结果进一步证实纯化了Derf1A和Derf1B嵌合蛋白。与Derf1相比,Derf1A和Derf1B嵌合蛋白与粉尘螨过敏患者血清IgE抗体的结合能力显著降低(P均<0.05),但Derf1A和Derf1B间差异无统计学意义(P>0.05)。结论成功表达了Derf1的T和B细胞表位嵌合蛋白,为粉尘螨过敏的特异性免疫治疗奠定了基础。 展开更多
关键词 粉尘螨 粉尘螨1类变应原 T细胞表位 B细胞表位 免疫印迹试验
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