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纽荷尔脐橙CRTISO基因片段的克隆与分析 被引量：3
1
作者 陶能国 张继红 《吉林农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期28-30,共3页
利用RT-PCR技术，从纽荷尔脐橙（Citrus sinensis Osbeck）果实cDNA中分离出类胡萝卜素异构酶（Carotenoid isomerase，CRTISO）基因片段。该片断长446bp，编码148个氨基酸。用BLASF比较其氨基酸同源性发现，该片段氨基酸残基与伏令夏橙... 利用RT-PCR技术，从纽荷尔脐橙（Citrus sinensis Osbeck）果实cDNA中分离出类胡萝卜素异构酶（Carotenoid isomerase，CRTISO）基因片段。该片断长446bp，编码148个氨基酸。用BLASF比较其氨基酸同源性发现，该片段氨基酸残基与伏令夏橙（C．sinensis Osbeck）、番茄（Lycopersicon esculentum Miller）和拟南芥（Arabidopsis thaliana）CRTISO的同源性分别为99％、85％和83％，与里斯本柠檬（C．limon Burm．F．）和温州蜜柑（C．unshiu Marc．）完全一致。半定量RT-PCR分析表明，CRTISO基因在8～11月份纽荷尔果实中均有表达，10月份的表达量最大。 展开更多
关键词 纽荷尔脐橙 RT—PCR 类胡萝卜素异构酶 基因
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绿色杜氏藻类胡萝卜素异构酶(CRTISO)的基因生物信息学与转录差异研究 被引量：1
2
作者 周丽亚 龚一富 +1 位作者 朱帅旗 王何瑜 《生物学杂志》 CAS CSCD 2016年第6期15-19,共5页
类胡萝卜素异构酶(Carotenoid isomerase,CRTISO)是类胡萝卜素生物合成途径中催化番茄红素由顺式结构向反式结构转变的关键异构酶。利用转录组测序获得绿色杜氏藻crtiso c DNA全长序列,进行生物信息学分析,并研究乙酰水杨酸(ASA)、花生... 类胡萝卜素异构酶(Carotenoid isomerase,CRTISO)是类胡萝卜素生物合成途径中催化番茄红素由顺式结构向反式结构转变的关键异构酶。利用转录组测序获得绿色杜氏藻crtiso c DNA全长序列,进行生物信息学分析,并研究乙酰水杨酸(ASA)、花生四烯酸(AA)处理绿色杜氏藻后该基因转录差异与类胡萝卜素含量变化情况。生物信息学结果表明:绿色杜氏藻crtiso c DNA全长1176 bp,开放阅读框(ORF)长度为795 bp,编码264个氨基酸。该蛋白质的理论相对分子质量为29 522.6,理论等电点(PI)为5.86,该蛋白为稳定蛋白与亲水性蛋白,无信号肽和跨膜区域,定位于细胞质基质。氨基酸序列同源性比对结果表明其与小球藻的类胡萝卜素异构酶同源性最高,达到78%。RT-q PCR结果表明,AA、ASA诱导后,该基因表达量均呈现先升高后降低的趋势,且当AA、ASA质量浓度分别为62.5 mg/L、50 mg/L时表达量最高。类胡萝卜素含量大致呈现逐渐升高的趋势。当AA、ASA质量浓度分别为312.5 mg/L、100 mg/L时,类胡萝卜素含量达到最高。即该基因与类胡萝卜素含量呈一定相关性。 展开更多
关键词 绿色杜氏藻 crtiso 生物信息学分析 类胡萝卜素
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烟草类胡萝卜素异构酶基因的电子克隆及生物信息学分析 被引量：1
3
作者 钟晓武 付强 +5 位作者 邹颉 郭玉双 林世峰 赵杰宏 王轶 任学良 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2013年第11期5-9,共5页
为从烟草中克隆烟草类胡萝卜素合成途径中的关键类胡萝卜素异构酶基因,运用电子克隆的方法,以番茄CRTISO基因为探针,分离编码CRTISO基因的cDNA序列,并对其进行序列分析。结果表明:该基因编码区为1 716bp,编码571个氨基酸残基。烟草CRTIS... 为从烟草中克隆烟草类胡萝卜素合成途径中的关键类胡萝卜素异构酶基因,运用电子克隆的方法,以番茄CRTISO基因为探针,分离编码CRTISO基因的cDNA序列,并对其进行序列分析。结果表明:该基因编码区为1 716bp,编码571个氨基酸残基。烟草CRTISO蛋白为亲水性稳定蛋白,相对分子量为61.65kDa,理论等电点为8.48,蛋白质二级结构中的主要构成元件是α-螺旋和无规则卷曲。NtCRTISO蛋白含有16个丝氨酸激酶磷酸化位点,5个苏氨酸激酶磷酸化位点,3个酪氨酸激酶磷酸化位点,定位在线粒体内膜的概率为0.721。系统进化树分析表明,烟草CRTISO与其他高等植物类胡萝卜素异构酶亲缘关系比较近。 展开更多
关键词 烟草 类胡萝卜素异构酶 电子克隆 生物信息学
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桂花类胡萝卜素异构酶基因的克隆及表达分析 被引量：3
4
作者 张超 刘玉成 +2 位作者 王艺光 付建新 赵宏波 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期89-96,共8页
利用已构建的桂花‘堰虹桂’花瓣转录组数据库中Unigene序列信息,结合RT-PCR技术对1个桂花类胡萝卜素异构酶基因(Of CRTISO)的最大阅读框进行扩增,并测序验证。生物信息学分析表明Of CRTISO基因含有长为1 842 bp的开放读码框,编码613个... 利用已构建的桂花‘堰虹桂’花瓣转录组数据库中Unigene序列信息,结合RT-PCR技术对1个桂花类胡萝卜素异构酶基因(Of CRTISO)的最大阅读框进行扩增,并测序验证。生物信息学分析表明Of CRTISO基因含有长为1 842 bp的开放读码框,编码613个氨基酸残基。桂花Of CRTISO与已知胡麻科和茄科植物的CRTISO序列相似性最高,系统进化树分析发现Of CRTISO与芝麻CRTISO(XP_011077785)亲缘关系最近,聚为同一小支。表达分析发现,Of CRTISO基因在桂花‘堰虹桂’花蕾前期花序中的表达量极低,花蕾后期其表达量逐渐增加,初开期达到高峰,而盛开期时,其表达量显著下降。对桂花不同花色品种花瓣中Of CRTISO基因的表达分析表明,桂花初开期Of CRTISO基因的表达量可能影响盛开期各品种花瓣中类胡萝卜素的积累。 展开更多
关键词 桂花 花色 类胡萝卜素 类胡萝卜素异构酶基因
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