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海水鱼真鲷脂蛋白脂肪酶基因cDNA序列与组织表达 被引量:15
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作者 梁旭方 Hiromi OKU +3 位作者 Hiroshi Y.OGATA 李月琴 白俊杰 罗建仁 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期712-719,共8页
为研究脊椎动物真鲷脂蛋白脂肪酶 (LPL)结构与功能关系以及探讨动脉粥样硬化形成机理 ,通过构建cDNA文库 ,克隆对动脉粥样硬化表现抗性的海水鱼真鲷LPL基因cDNA全序列 .再通过PCR方法扩增基因组DNA ,获取内含子 9及其两侧序列以确定外显... 为研究脊椎动物真鲷脂蛋白脂肪酶 (LPL)结构与功能关系以及探讨动脉粥样硬化形成机理 ,通过构建cDNA文库 ,克隆对动脉粥样硬化表现抗性的海水鱼真鲷LPL基因cDNA全序列 .再通过PCR方法扩增基因组DNA ,获取内含子 9及其两侧序列以确定外显子 10的大小 ,最后通过RT PCR ,以 β肌动蛋白为外参照 ,比较真鲷在食用两种脂肪含量不同饲料和摄食状态不同的处理条件下 ,肝脏和腹腔肠系膜脂肪组织LPLmRNA的相对水平 .从腹腔肠系膜脂肪组织cDNA文库中克隆出LPLcDNA序列 ,其完整的开放阅读框架由 15 36bp组成 ,编码 5 11个氨基酸残基 .与哺乳类不同 ,真鲷LPL基因外显子 10的开始部分是翻译的 .LPL的催化位点、二硫键位点、N 糖基化位点、肝素结合区、脂质结合位点、介导脂蛋白与低密度脂蛋白受体结合位点、二聚体形成位点等主要功能域在真骨鱼类真鲷与其它脊椎动物间基本保守 ,但肝素结合区的碱性氨基酸残基含量较人类减少 ,并在结合脂质底物的疏水环套中出现插入片段 .与哺乳类不同 ,真鲷LPL基因在成体肝脏存在诱导性表达 ,而在其腹腔肠系膜脂肪组织则存在与哺乳类相似的组成性表达 .当真鲷喂食高脂饲料时 ,其饱食状态下肝脏LPLmRNA水平升高 ,但对其腹腔肠系膜脂肪组织LPL表达没有影响 .当真鲷喂食标准商业饲料时 ,? 展开更多
关键词 海水鱼 真鲷 脂蛋白脂肪酶基因 cdna序列 组织表达
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草鱼出血病病毒基因组的cDNA合成、克隆及部分序列分析 被引量:13
2
作者 田静 邹桂平 方勤 《中国病毒学》 CSCD 1999年第1期87-92,共6页
采用差速离心的方法纯化感染草鱼出血病病毒的细胞悬液。提纯的病毒粒子经蛋白酶K处理和酚氯仿抽提,在1%琼脂糖凝胶电泳条件下分离得到11条dsRNA,利用柱离心式胶回收试剂盒纯化各基因片段。纯化的dsRNA溶于90%的... 采用差速离心的方法纯化感染草鱼出血病病毒的细胞悬液。提纯的病毒粒子经蛋白酶K处理和酚氯仿抽提,在1%琼脂糖凝胶电泳条件下分离得到11条dsRNA,利用柱离心式胶回收试剂盒纯化各基因片段。纯化的dsRNA溶于90%的DMSO中,70℃变性15min,然后采用随机引物法反转录合成各基因片段的cDNA,并平头连接于pZErO2.0载体的EcoRV位点,电转化TOP10感受态细胞。重组质粒经酶切、PCR扩增得到大小不等的插入片段,cDNARNA斑点杂交的结果进一步证实其插入为目的基因片段。采用循环PCR测序的方法,对其插入片段进行了序列测定,对其中第11片段的部分序列作了报道。 展开更多
关键词 草鱼出血病 病毒 cdna克隆 序列分析
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金荞麦花青素合酶基因的克隆及其表达与花青素量的相关性研究 被引量:16
3
作者 卜星星 雒晓鹏 +3 位作者 白悦辰 李成磊 陈惠 吴琦 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期985-989,共5页
目的获取金荞麦花青素合成途径关键酶花青素合成酶(anthocyanins synthase,ANS)基因的全长序列,并进行序列分析;对花期金荞麦ANS基因在各组织中表达水平与花青素量的相关性进行分析。方法利用同源克隆技术获得ANS基因cDNA序列;采用半定... 目的获取金荞麦花青素合成途径关键酶花青素合成酶(anthocyanins synthase,ANS)基因的全长序列,并进行序列分析;对花期金荞麦ANS基因在各组织中表达水平与花青素量的相关性进行分析。方法利用同源克隆技术获得ANS基因cDNA序列;采用半定量RT-PCR对ANS表达量进行分析;采用分光光度法测量花青素量。结果金荞麦ANS基因cDNA包含一个1 077 bp的ORF,编码358个氨基酸,命名为FdANS。生物信息学分析表明,该基因编码蛋白与其他植物ANS蛋白氨基酸序列同源率较高。FdANS在花期金荞麦不同组织中的表达量分析表明,其表达量花>叶>茎>根,花青素量为花>叶>茎>根。结论在金荞麦中首次获得ANS基因的cDNA序列,编码蛋白具有ANS同源蛋白的典型特征。FdANS基因在金荞麦根、茎、叶和花中的表达量与花青素量具有相关性。 展开更多
关键词 金荞麦 花青素合酶 基因克隆 cdna序列 花青素
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鳜鱼(Siniperca chuatsi)β-肌动蛋白基因cDNA全序列与5′侧翼区的克隆与分析 被引量:16
4
作者 刘秀霞 梁旭方 +3 位作者 王琳 端金霞 李光照 廖婉琴 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期102-108,共7页
采用RT-PCR及RACE法,分离、克隆鳜鱼β-肌动蛋白基因cDNA全序列,再用基因组步行法(Genome Walker)克隆鳜鱼β-肌动蛋白基因5′调控区。序列分析结果表明,鳜鱼β-肌动蛋白基因全长1897bp,其中5′-UTR长94bp,3′-UTR长675bp,编码区长1128... 采用RT-PCR及RACE法,分离、克隆鳜鱼β-肌动蛋白基因cDNA全序列,再用基因组步行法(Genome Walker)克隆鳜鱼β-肌动蛋白基因5′调控区。序列分析结果表明,鳜鱼β-肌动蛋白基因全长1897bp,其中5′-UTR长94bp,3′-UTR长675bp,编码区长1128bp,编码375个氨基酸。将所得序列与其它动物类群的β-肌动蛋白基因序列进行比较分析显示,鱼类、两栖类、鸟类、哺乳类等不同类群脊椎动物β-肌动蛋白氨基酸序列同源性均在96%以上,说明该基因在生物进化过程中高度保守。通过鳜鱼与其它脊椎动物β-肌动蛋白基因的核苷酸序列构建的进化树显示,脊椎动物β-肌动蛋白聚类成3个分支,鱼类β-肌动蛋白基因形成一个独立的分化群,说明鱼类β-肌动蛋白基因起源于一个共同祖先。克隆得到的鳜鱼β-肌动蛋白基因5'侧翼序列长1399bp,对其进行序列分析,在其起始密码字ATG上游200bp范围内发现含有CAATbox、CC(A/T)6GG(CArGbox)、TATA box对转录调控起重要作用的顺式元件,同时在侧翼区也发现含有GC box、MYOD、YY1、SP1、GATA等多个潜在调控元件。鳜鱼β-肌动蛋白基因5′侧翼序列的克隆成功,为今后转基因鳜鱼的研究工作奠定了基础。 展开更多
关键词 β-肌动蛋白基因 cdna序列 5′调控区 克隆 鳜鱼
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水稻分支酶基因Sbe1和Sbe3 cDNA的克隆及全序列分析 被引量:8
5
作者 陈秀花 刘巧泉 +2 位作者 吴信淦 王宗阳 顾铭洪 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期109-112,共4页
通过改良的 RT- PCR法合成了水稻未成熟种子胚乳 c DNA库 ,并以此为模板 ,用 PCR技术从粳稻品种武运粳 7号中克隆了分别编码淀粉分支酶 SBE 和 SBE 的 2个基因 Sbe1和 Sbe3。序列分析表明 ,克隆 Sbe1和 Sbe3基因的大小分别为 2 4 90 bp... 通过改良的 RT- PCR法合成了水稻未成熟种子胚乳 c DNA库 ,并以此为模板 ,用 PCR技术从粳稻品种武运粳 7号中克隆了分别编码淀粉分支酶 SBE 和 SBE 的 2个基因 Sbe1和 Sbe3。序列分析表明 ,克隆 Sbe1和 Sbe3基因的大小分别为 2 4 90 bp和 2 4 81bp,包含了基因完整的编码序列。 Sbe3基因与已发表基因全序列完全相同 ,同源性达 10 0 % ;Sbe1基因与已发表基因序列有 4个碱基不同 ,同源性为 99.84 % ,推导氨基酸序列的差异为 展开更多
关键词 水稻 淀粉分支酶基因 基因克隆 cdna序列 序列分析
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近江牡蛎Hsc70蛋白基因cDNA片段的克隆及Southern杂交和RT-PCR分析 被引量:12
6
作者 张其中 吴信忠 +1 位作者 高劲松 潘金培 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第5期708-712,共5页
In order to elucidate the molecular mechanisms of the oyster (Crassostrea ariakensis) against adverse stimulating factors, we cloned and sequenced a partial cDNA encoding a 70 kDa heat shock cognate protein (Hsc70) fr... In order to elucidate the molecular mechanisms of the oyster (Crassostrea ariakensis) against adverse stimulating factors, we cloned and sequenced a partial cDNA encoding a 70 kDa heat shock cognate protein (Hsc70) from the oyster. The live oysters were obtained from Chengcun, Yangxi County, Guangdong Province, China. Various tissues, including mantle, gills, adductor muscle, heart and blood cells, were respectively collected from 5 untreated live oysters or treated ones at 36℃ for 1 5 hours, and immediately frozen in liquid nitrogen except for the blood cells which were suspended with Trizol Reagent after centrifugation ( 12 000 r/min for 30 s) and stored at -20℃. Total RNA was isolated using Trizol Reagent according to the manufacture’s instructions. The first strand cDNA was synthesized using reverse transcriptase Superscript Ⅱ according to the manufacture’s instructions. The primers were designed from a conserved region of C. gigas Hsc70 cDNA sequence (GeneBank accession No. AF144646). The polymerase chain reaction (PCR) was performed for 30 cycles with denaturation at 94℃ for 30 s, annealing at 49℃ for 40 s, and elongation at 72℃ for 30 s. The product was cloned to pGEM T easy vector and sequenced. It is 509 base pairs (bp) and possesses 94% identity with the cDNA encoding C. gigas Hsc70 using Blastn. This homology was strongly confirmed by amino acid sequence comparison using the Blastx (99%). The 509 bp fragment was labeled with α 32 pdCTP and a random primer DNA labeling kit and employed as a probe to perform Southern blotting, the result demonstrated that the cDNA came from a partial mRNA transcript of C. ariakensis genomic DNA gene. The polymerase chain reaction (PCR) was carried out to investigate the expression of Hsc70, Using the cDNAs of several tissues, such as gills (heat shocked), mantle, adductor muscle (heat shocked), heart, blood cells (one sample with heat shock for 1 5 hours at 36℃ and another without any stimulus). The PCR results revealed that Hsc70 transcripts could be 展开更多
关键词 近江牡蛎 Hsc70蛋白基因 cdna片段 克隆 SOUTHERN杂交 RT-PCR分析
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猪带绦虫45W基因家族cDNA克隆和序列分析 被引量:7
7
作者 贾万忠 郑亚东 +4 位作者 王佩雅 陈涓 程晓红 景志忠 才学鹏 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期776-780,共5页
根据猪带绦虫45W基因序列设计引物,用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)对六钩蚴总RNA进行cDNA扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳分离、纯化、回收,与载体pGEMT-easyVector连接,转化大肠杆菌JM109,筛选阳性克隆,测序。结果显示,已成功克隆到... 根据猪带绦虫45W基因序列设计引物,用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)对六钩蚴总RNA进行cDNA扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳分离、纯化、回收,与载体pGEMT-easyVector连接,转化大肠杆菌JM109,筛选阳性克隆,测序。结果显示,已成功克隆到重要保护性抗原45W基因B型转录本cDNA,完整开放阅读框(ORF)的大小为459bp。序列同源性分析与比较表明,所获得的9个B型转录本cDNA除TSO45W-4B-1和TSO45W-4B-2与已报道的TSO45W-4B同源外,其余均属于首次报道的45W基因家族新成员。各cDNA克隆之间核苷酸序列的差异性为1.5%~19.8%,氨基酸序列之间的差异性为2.6%~29.7%,后者比前者的差异程度更大。 展开更多
关键词 带绦虫 45W基因家族 cdna克隆 序列分析 囊尾蚴病
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鳜脂蛋白脂酶和肝脂酶基因结构与组织表达 被引量:10
8
作者 姚煜 梁旭方 +2 位作者 李光照 王琳 刘秀霞 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期506-517,共12页
为了研究鳜(Siniperca chuatsi)脂蛋白脂酶(LPL)、肝脂酶(HL)基因结构与功能关系,首先采用RT-PCR及RACE法,克隆得到鳜肝脏LPL与HL基因cDNA全序列。鳜肝脏LPL基因cDNA全长为2089bp,其中开放阅读框(ORF)为1548bp,编码515个氨基酸。鳜HL基... 为了研究鳜(Siniperca chuatsi)脂蛋白脂酶(LPL)、肝脂酶(HL)基因结构与功能关系,首先采用RT-PCR及RACE法,克隆得到鳜肝脏LPL与HL基因cDNA全序列。鳜肝脏LPL基因cDNA全长为2089bp,其中开放阅读框(ORF)为1548bp,编码515个氨基酸。鳜HL基因cDNA全长为1964bp,其中ORF为1494bp,编码497个氨基酸。进化树分析显示,鳜LPL与HL基因与其他脊椎动物的LPL、HL基因各自聚集成簇。对鳜基因组进行PCR获得鳜LPL与HL全基因组DNA序列,与其他脊椎动物基因结构相似,鳜LPL基因由10个外显子和9个内含子组成,全长7392bp;鳜HL基因由9个外显子和8个内含子组成,全长8837bp。应用Genome Walker方法在鳜克隆得到一段长为1071bp的LPL和一段长为2173bp的HL基因5′侧翼区序列,并利用相关软件预测其中具有多个保守的顺式调控元件。组织表达研究显示与易患动脉粥样硬化的人类LPL不同,鳜LPL基因在所有被检测组织中均有表达:在脂肪组织中大量表达,其次是肝脏、脑、肠道、肌肉,在脾中表达量最低;而鳜HL基因的表达则与人类相似,只在肝脏中表达。本研究将为深入探讨机体脂质代谢调节机制以及LPL、HL在防治动脉粥样硬化中的作用奠定良好基础。 展开更多
关键词 脂蛋白脂酶 肝脂酶 cdna序列 基因结构 5'调控区 组织表达
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甘蓝型油菜隐性核不育两用系S45AB中与MS2Bnap基因同源片段的克隆及序列分析 被引量:6
9
作者 李德谋 侯磊 +2 位作者 罗小英 裴炎 杨光伟 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期1-5,共5页
以甘蓝型油菜隐性核不育两用系 S4 5 AB的可育株和不育株为材料 ,提取减数分裂期与单核期的花粉 m RNA,反转录合成 c DNA,并以其为模板扩增花粉特异基因 MS2 Bnap。结果减数分裂期能扩出产物 ,而单核期无任何产物。将减数分裂期的扩增... 以甘蓝型油菜隐性核不育两用系 S4 5 AB的可育株和不育株为材料 ,提取减数分裂期与单核期的花粉 m RNA,反转录合成 c DNA,并以其为模板扩增花粉特异基因 MS2 Bnap。结果减数分裂期能扩出产物 ,而单核期无任何产物。将减数分裂期的扩增产物克隆、测序。同源性分析表明 :在 S4 5 AB上克隆的 MS2 Bnap基因与 Gene Bank公布的拟南芥控制核育性基因 MS2和已报道的甘蓝型油菜的 MS2 Bnap基因的同源性分别为 88%和 99%。可育株 S4 5 B与不育株S4 5 A在 MS2 Bnap基因序列上有 4处碱基存在差异 ,其中 3处为同义突变 ,编码氨基酸未发生变化 :1处为错义突变 ,可育株为 AAA,不育株为 AGA。其三联体密码对应的氨基酸也发生了变化 ,AAA编码赖氨酸 ,AGA编码精氨酸。该变化可能与 S4 5 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 隐性核不育 序列分析 MS2Bnap基因 基因克隆 花粉发育
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猪生长激素cDNA的全序列分析 被引量:9
10
作者 齐顺章 王辛中 +4 位作者 周顺伍 贾锋 王华岩 夏立 李娟 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 1989年第1期35-39,共5页
本文报道了两个猪生长激素cDNA的全序列分析的结果。猪生长激素cDNA是我们由猪垂体mRNA经过反向转录、克隆和筛选后获得的。文中还将这两个序列与Seeburg等(1983)报道的序列以及Vize等(1987)报道的猪基因组生长激素基因的序列进行了比... 本文报道了两个猪生长激素cDNA的全序列分析的结果。猪生长激素cDNA是我们由猪垂体mRNA经过反向转录、克隆和筛选后获得的。文中还将这两个序列与Seeburg等(1983)报道的序列以及Vize等(1987)报道的猪基因组生长激素基因的序列进行了比较和讨论。 展开更多
关键词 猪生长激素 cdna序列
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草鱼过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)基因cDNA序列的克隆及其组成型表达 被引量:9
11
作者 陈亮 梁旭方 +3 位作者 瞿春梅 杜嵇华 刘秀霞 何珊 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期80-87,共8页
过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)是核激素受体超家族成员之一,分α,β,γ3个亚型,PPAR具有多种生物学效能,对其基因进行研究将有助于揭示草食性鱼类对营养物利用规律及其机制.通过简并引物克隆草鱼(C tenopharyngodon idellus)PPA... 过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)是核激素受体超家族成员之一,分α,β,γ3个亚型,PPAR具有多种生物学效能,对其基因进行研究将有助于揭示草食性鱼类对营养物利用规律及其机制.通过简并引物克隆草鱼(C tenopharyngodon idellus)PPAR基因cDNA核心序列,应用3′RACE技术扩增该序列的3′末端序列,并对其进行序列分析,最后用荧光定量PCR方法比较草鱼肝脏、脑、脾脏、肌肉、脂肪和心脏的PPARα、PPARβ和PPARγ基因mRNA相对表达水平.序列分析结果表明,草鱼PPARα、PPARβ和PPARγ基因cDNA核心序列片段大小为631 bp,604 bp和651 bp,分别编码210、201和217个氨基酸,PPARγ经3′RACE后共获得大小为1331 bp的片段,编码337个氨基酸.草鱼与鲤鱼(Cyprinus carpio)、斑马鱼(Danio rerio)、鲈鱼(Lateolabrax japonicus)等鱼类PPAR氨基酸序列同源性很高,为71.4%~96.1%;与人(Homo sapiens)、大鼠(Rattus norvegicus)、小鼠(Mus musculus)、牛(Bos taurus)等哺乳动物PPAR氨基酸序列的同源性也较高,为65.0%~77.6%;与非洲爪蟾(Xenopus laevis)等两栖动物PPAR氨基酸序列的同源性约为67.0%.荧光定量PCR结果表明,草鱼PPARα于肝脏,PPARβ于肝脏、肌肉和心脏,PPARγ于肝脏的表达相对较高.相同物种不同PPAR亚型的同源性较低,而不同物种同型PPAR同源性很高,反映了不同亚型在结构上的差异,这与其在功能上的差异是相一致的. 展开更多
关键词 草鱼 过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR) cdna序列 克隆 组成型表达
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野生革耳菌漆酶cDNA在巴斯德毕赤酵母中的表达 被引量:7
12
作者 张敏 肖亚中 +1 位作者 余聪 龚为民 《中国科学技术大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期757-762,共6页
将分离到的野生革耳菌(Panusrudis)漆酶的cDNA序列克隆到毕赤酵母表达载体pPIC9K上,构建成受强启动子AOX1控制的重组表达载体.重组质粒DNA经BglII线性化后,电击转化毕赤酵母GS115细胞,通过G418筛选和PCR鉴定的重组酵母在甲醇诱导后能分... 将分离到的野生革耳菌(Panusrudis)漆酶的cDNA序列克隆到毕赤酵母表达载体pPIC9K上,构建成受强启动子AOX1控制的重组表达载体.重组质粒DNA经BglII线性化后,电击转化毕赤酵母GS115细胞,通过G418筛选和PCR鉴定的重组酵母在甲醇诱导后能分泌表达活性漆酶.低温培养是该漆酶基因活性表达的必要条件.培养基中添加400μmol/L的CuSO4最有利于漆酶的活性表达. 展开更多
关键词 野生革耳菌 漆酶 cdna序列 毕赤酵母 表达
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鱼腥草1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶1基因克隆与表达分析 被引量:9
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作者 魏麟 伍贤进 +6 位作者 李胜华 刘胜贵 唐玉莲 贺安娜 王丹 宁鹏飞 李昭君 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1607-1612,共6页
目的克隆鱼腥草1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶1(DXS1)基因并分析其表达差异。方法根据已经获得的鱼腥草DXS1转录本序列设计1对引物,采用RT-PCR方法获得DXS1基因cDNA序列并对DXS1蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三维结构预测分析,并预... 目的克隆鱼腥草1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶1(DXS1)基因并分析其表达差异。方法根据已经获得的鱼腥草DXS1转录本序列设计1对引物,采用RT-PCR方法获得DXS1基因cDNA序列并对DXS1蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三维结构预测分析,并预测了该蛋白功能;利用实时荧光定量PCR方法检测了DXS1基因在鱼腥草的地下茎、地上茎、叶、花中的表达情况。结果克隆获得的DXS1基因长为2 172 bp,编码723个氨基酸。生物信息学预测DXS1蛋白不含跨膜区,不含信号肽,具有定位肽。DXS1基因在鱼腥草的花中表达丰度最高,其次是叶片,再次是地下茎,地上茎中表达量最低。结论首次从鱼腥草中克隆了DXS1基因,为进一步阐明该基因在鱼腥草萜类化合物代谢途径中的重要作用奠定基础。 展开更多
关键词 鱼腥草 1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶 RT-PCR cdna序列 克隆
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野桑蚕卵黄原蛋白的鉴定及cDNA序列分析 被引量:6
14
作者 董胜张 刘朝良 +1 位作者 汪泰初 朱保建 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期439-443,共5页
利用SDS_PAGE和Westernblot方法分析鉴定了野桑蚕BombyxmandarinaMoore卵黄原蛋白 ,发现该蛋白由大小两个亚基组成 ,分子量分别为 175kD和 4 2kD。利用昆虫卵黄原蛋白进化上的保守性 ,根据家蚕的卵黄原蛋白cDNA序列设计特异性引物在野... 利用SDS_PAGE和Westernblot方法分析鉴定了野桑蚕BombyxmandarinaMoore卵黄原蛋白 ,发现该蛋白由大小两个亚基组成 ,分子量分别为 175kD和 4 2kD。利用昆虫卵黄原蛋白进化上的保守性 ,根据家蚕的卵黄原蛋白cDNA序列设计特异性引物在野桑蚕的总RNA进行RT_PCR扩增 ,对于 3′和 5′端进行RACE扩增 ,解析获得了野桑蚕卵黄原蛋白cDNA全序列 (GenBank登录号AY30 996 7)。该序列含有 5 75 4个碱基 ,由一个开放阅读框组成 ,编码 1780个氨基酸 ,卵黄原蛋白的氨基酸序列与家蚕的同源性达到 97 6 %。在特定的酶切位点 (RSRR)处 ,即第 36 4~ 36 7个氨基酸位置 ,卵黄原蛋白前体被酶切为大小两个亚基 ,根据氨基酸推算的相对分子质量分别为 16 1 5 71kD和 4 0 794kD ,如果考虑到翻译后的修饰 ,这与SDS_PAGE的结果是吻合的。同源性分析表明 ,昆虫卵黄原蛋白一级结构分化基本上局限在同一目内 。 展开更多
关键词 野桑蚕 卵黄原蛋白 cdna序列 聚类分析 同源性比较
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丹参多酚氧化酶基因的克隆及表达分析 被引量:9
15
作者 时王珂 孙奕玥 +3 位作者 舒志明 张跃进 梁宗锁 郭宏波 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1735-1742,共8页
前期研究发现多酚氧化酶(PPO)能正向调控丹酚酸B合成,该研究运用RACE技术,从丹参毛状根中克隆到多酚氧化酶基因(SmPPO,GenBank登录号为KF712274)全长序列,其cDNA全长1 930bp,开放阅读框为1 770bp,编码589个氨基酸。将SmPPO与管状花目其... 前期研究发现多酚氧化酶(PPO)能正向调控丹酚酸B合成,该研究运用RACE技术,从丹参毛状根中克隆到多酚氧化酶基因(SmPPO,GenBank登录号为KF712274)全长序列,其cDNA全长1 930bp,开放阅读框为1 770bp,编码589个氨基酸。将SmPPO与管状花目其它4个物种进行氨基酸序列比对,在N端类囊体转移结构域中发现都存在2个N-豆蔻酰化位点。在丹参毛状根培养液中加入不同诱导因子,利用实时荧光定量PCR检测,发现该基因在酵母提取物处理中表达量显著上调,但在银离子、抗坏血酸和L-半胱氨酸处理中表达受到明显抑制。运用HPLC技术同步检测毛状根中丹酚酸B含量,显示出与基因表达相同的变化趋势。研究表明,丹参中多酚氧化酶基因(SmPPO)对丹酚酸B的合成具有正向调控作用。 展开更多
关键词 丹参 多酚氧化酶 基因克隆 序列全长 基因表达
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鲢鱼可溶性谷胱甘肽S-转移酶(sGST)基因cDNA全序列与5′调控区的克隆与分析 被引量:5
16
作者 廖婉琴 梁旭方 +2 位作者 王琳 雷腊梅 韩博平 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期470-476,共7页
淡水鱼类可溶性谷胱甘肽S-转移酶(sGST)在微囊藻毒素去毒代谢过程中具有独特的关键作用,因而也称为微囊藻毒素去毒酶.从淡水食毒藻鱼类鲢鱼(Hypophthalmichthysmolitrix)肝脏通过简并引物克隆微囊藻毒素去毒酶基因cDNA核心序列,应用5′R... 淡水鱼类可溶性谷胱甘肽S-转移酶(sGST)在微囊藻毒素去毒代谢过程中具有独特的关键作用,因而也称为微囊藻毒素去毒酶.从淡水食毒藻鱼类鲢鱼(Hypophthalmichthysmolitrix)肝脏通过简并引物克隆微囊藻毒素去毒酶基因cDNA核心序列,应用5′RACE和3′RACE技术分别扩增该序列的5′末端和3′末端序列,最后通过序列拼接获得鲢鱼肝脏微囊藻毒素去毒酶基因cDNA全序列.序列分析结果表明,鲢鱼肝脏微囊藻毒素去毒酶基因cDNA全长920bp,其中5′-UTR长74bp,3′-UTR长174bp,编码区长672bp,编码223个氨基酸.应用基因组步行法,在鲢鱼克隆得到淡水鱼类微囊藻毒素去毒酶基因5′侧翼区878bp序列.与哺乳动物及海水鱼sGST基因不同,鲢鱼微囊藻毒素去毒酶基因的5′侧翼区,发现存在多个脂多糖反应元件(LPSRE),表明来源于毒藻的脂多糖可能对鲢鱼微囊藻毒素去毒酶基因表达有潜在调控作用. 展开更多
关键词 微囊藻毒素去毒酶基因 cdna序列 5'调控区 克隆 鲢鱼
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Construction of a Pea Tendril cDNA Library and Sequence Analysis of a Pea Actin cDNA, PEAcl 被引量:5
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作者 曹晓风 王荣臣 +3 位作者 阎隆飞 鲁治滨 潘乃隧 陈章良 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 1994年第4期332-337,共6页
Actins are ubiquitous to all of the known eukaryotic organisms. Since the firstdiscovery of actins in higher plants by Yen et al. in 1960s, the actin research ofhigher plants has been extensively carried out. It has b... Actins are ubiquitous to all of the known eukaryotic organisms. Since the firstdiscovery of actins in higher plants by Yen et al. in 1960s, the actin research ofhigher plants has been extensively carried out. It has been shown that the actin is animportant part of cytoskeleton, being involved in many important biological processes, 展开更多
关键词 ACTIN genes cdna sequence PEA TENDRILS cdna library.
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牦牛肌红蛋白的cDNA序列测定及其氧化特性的研究 被引量:7
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作者 古松 陈丹 +2 位作者 陈浩 杨志荣 孙群 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期902-906,共5页
通过对牦牛肌红蛋白的含量和cDNA序列的测定及心肌肌红蛋白氧化和脂类氧化相关性的研究,初步探讨了牦牛适应高原低氧环境的机理.牦牛与黄牛的肌红蛋白cDNA序列比较,二者只有2个碱基的差异(89位氨基酸由cac变为cat,91位氨基酸由gcc变为gc... 通过对牦牛肌红蛋白的含量和cDNA序列的测定及心肌肌红蛋白氧化和脂类氧化相关性的研究,初步探讨了牦牛适应高原低氧环境的机理.牦牛与黄牛的肌红蛋白cDNA序列比较,二者只有2个碱基的差异(89位氨基酸由cac变为cat,91位氨基酸由gcc变为gct),但由于氨基酸密码子简并性,两者的氨基酸序列没有差异.牦牛的骨骼肌的肌红蛋白含量为488.3 nmol/g,与黄牛相比没有显著差异,但牦牛心肌的肌红蛋白含量为823.4 nmol/g,比黄牛高61.2%(P<0.05).在4℃贮存下,牦牛心肌中肌红蛋白的氧化速率与黄牛相比没有显著差异,而牦牛骨骼肌中肌红蛋白的氧化速率比黄牛慢25.8%(P<0.05).牦牛骨骼肌中脂类氧化的硫代巴比妥酸反应物质(TBARS)值比黄牛低63.5%(P<0.05).结果表明,牦牛适应高原的低氧环境,不是通过改变其肌红蛋白氨基酸序列从而引起蛋白质结构的变化来实现的,提高肌红蛋白在体内的含量以及减缓肌红蛋白和脂类的氧化速率则可能是牦牛对高原低氧适应的原因之一. 展开更多
关键词 牦牛 肌红蛋白 cdna 肌红蛋白氧化 脂类氧化 低氧
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鱼腥草HMGR基因cDNA克隆、差异表达及蛋白质结构分析 被引量:7
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作者 魏麟 黎晓英 +6 位作者 刘胜贵 王丹 黄豪兰 龙强 蒋玉红 郭文博 伍贤进 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2017年第18期3815-3819,共5页
目的克隆鱼腥草3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)基因并分析其差异表达。方法采用实时荧光定量PCR(RT-PCR)方法获得HMGR基因cDNA序列并对HMGR蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三维结构预测分析,并预测该蛋白功能;利用RT-PCR方法检... 目的克隆鱼腥草3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)基因并分析其差异表达。方法采用实时荧光定量PCR(RT-PCR)方法获得HMGR基因cDNA序列并对HMGR蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三维结构预测分析,并预测该蛋白功能;利用RT-PCR方法检测HMGR基因在鱼腥草的地下茎、地上茎、叶、花中的表达情况。结果克隆获得的HMGR基因cDNA全长为1 626 bp,编码541个氨基酸。生物信息学预测HMGR蛋白含2个跨膜区,不含信号肽。HMGR基因主要在鱼腥草的花中表达,其他器官中表达相对较低,地下茎中表达量最低。结论首次从鱼腥草中克隆了HMGR基因,为进一步阐明该基因在鱼腥草萜类化合物代谢途径中的作用奠定基础。 展开更多
关键词 鱼腥草 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶 萜类 RT-PCR cdna序列
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日本沼虾不同亚型维甲酸类X受体(RXR)cDNA克隆及序列分析 被引量:5
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作者 王文青 朱小玲 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2010年第1期3-10,共8页
采用RT-PCR和RACE末端扩增技术,从日本沼虾(Macrobrachium nipponense)卵巢组织中获得了5种不同构型的RXR基因cDNA序列。结果显示:RXR基因中MnRXRL2含有最长的开放阅读框(open reading frame,ORF),其全长1698 bp,编码337个氨基酸。对比... 采用RT-PCR和RACE末端扩增技术,从日本沼虾(Macrobrachium nipponense)卵巢组织中获得了5种不同构型的RXR基因cDNA序列。结果显示:RXR基因中MnRXRL2含有最长的开放阅读框(open reading frame,ORF),其全长1698 bp,编码337个氨基酸。对比5个不同构型的核苷酸序列,有四个不同的剪接位点,一个发生在5′端A/B区域,产生了3种不同形式的5′端序列;一个在RXR受体结构的D区即铰链区域,使T-盒区长度也有3种形式(VQEERQR/VQVGGIEEERQR/VQVGGIE);两个发生在LBD区,其中一个是在H2-H3螺旋区域,产生了2种不同形式(MnRXRL/MnRXRS),另外一个是在D区产生了中断,缺失了E/F区域(MnRXRM)。将各个序列编码的氨基酸序列与其他物种相比,与甲壳类的同源性较高,表明RXR在进化中较为保守。 展开更多
关键词 日本沼虾(Macrobrachium nipponense) RXR受体 克隆 cdna序列
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