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甘蔗ADP/ATP转运蛋白酶基因克隆及其序列的生物信息学分析 被引量：4
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作者 张积森 黄金存 +2 位作者 叶冰莹 陈由强 陈如凯 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2009年第20期49-53,共5页
甘蔗(Saccharum officinarum L.)是C4光合途径作物,有着特殊的能量代谢系统,研究其能量代谢过程的ADP/ATP转运蛋白酶基因具有重要的意义。采用同源克隆原理结合PCR技术克隆甘蔗AAC转运蛋白酶基因,并应用生物信息学方法,对其进行多序列... 甘蔗(Saccharum officinarum L.)是C4光合途径作物,有着特殊的能量代谢系统,研究其能量代谢过程的ADP/ATP转运蛋白酶基因具有重要的意义。采用同源克隆原理结合PCR技术克隆甘蔗AAC转运蛋白酶基因,并应用生物信息学方法,对其进行多序列比对分析、物理性质分析、三级结构预测、亚细胞定位、跨膜区域预测和疏水性分析。结果表明,克隆获得了甘蔗AAC cDNA序列的全长为1170bp,包括一个可编码387个氨基酸的完整ORF。生物信息学分析显示,AAC家族基因的N端序列相对不保守,C端序列高度保守;其分子量是42.265kD,理论等电点是9.79,预测其为稳定的蛋白;GRAVY值为-0.099;含有6个跨膜区域;其6个跨膜螺旋(TM1-TM6)跨越磷脂双分子层结构,盐桥可能是通过中间的3个连接螺旋α1～α3共同构成的;定位在细胞质的概率为60.9%。获得了甘蔗AAC完整ORF序列,并通过生物信息学预测该基因所编码的蛋白为一个稳定跨膜蛋白,且可能定位在细胞质,为甘蔗AAC基因的深入研究和应用奠定初步基础。 展开更多
关键词 甘蔗 ADP/ATP转运蛋白酶 C_4作物 生物信息学
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