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PCR-DGGE法在慢性胃炎病人舌苔菌群结构研究中的应用 被引量:20
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作者 张红琳 田凯旋 +3 位作者 周东蕊 杜彩贺 张仁敏 陆祖宏 《生命科学研究》 CAS CSCD 2011年第2期125-128,共4页
在早间未刷牙和进食的情况下,刮取胃炎病人与正常人舌苔,去除杂质,分离菌体,采用酚/氯仿法抽提细菌基因组DNA,并对其中16S rDNA V3可变区进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和变性梯度凝胶电泳(DGGE)测定.用Bionumerics软件对DGGE分子指纹图... 在早间未刷牙和进食的情况下,刮取胃炎病人与正常人舌苔,去除杂质,分离菌体,采用酚/氯仿法抽提细菌基因组DNA,并对其中16S rDNA V3可变区进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和变性梯度凝胶电泳(DGGE)测定.用Bionumerics软件对DGGE分子指纹图谱进行舌苔菌群结构相似性分析.实验结果表明,采用该方法成功地扩增出16S rDNA V3区片段,为230 bp.DGGE分子指纹图谱结果表明,正常人的舌苔菌群最高相似性为0.74,胃炎病人的舌苔菌群的最高相似性为0.52,正常人的舌苔菌群与胃炎病人的舌苔菌群相似性最高为0.38,即胃炎病人舌苔菌群结构发生了变化. 展开更多
关键词 胃炎 舌苔 16SrDNA 菌群结构
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基于PCR-DGGE的不同年龄段人群舌苔微生物菌群结构分析 被引量:8
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作者 马广强 章常华 +2 位作者 徐洪波 刘洁 万红娇 《江西科学》 2018年第6期923-926,共4页
微生物菌群的不同是影响人体舌苔表型的重要影响因素之一,实验利用PCR-DGGE法和测序法研究不同年龄段人体舌苔微生物菌群结构的差异。方法:分别刮取4个不同年龄段人群的舌苔,提取总DNA,PCR扩增后进行变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析,分析不... 微生物菌群的不同是影响人体舌苔表型的重要影响因素之一,实验利用PCR-DGGE法和测序法研究不同年龄段人体舌苔微生物菌群结构的差异。方法:分别刮取4个不同年龄段人群的舌苔,提取总DNA,PCR扩增后进行变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析,分析不同年龄段人体舌苔微生物菌群结构的异同;并对差异条带进行测序分析,研究不同年龄段人群舌苔微生物群的差异。结果:韦永氏球菌属、普氏菌和链球菌等是各年龄段均有的舌苔菌群,产气荚膜梭菌多为儿童舌苔上携带,Uncultured prevotellaceae是老年舌苔特有菌群,普雷沃氏菌属是青年中年舌苔特有菌群。结论:不同年龄段人体舌苔上的微生物菌群有一定的差异,本实验结果可以为临床上舌苔微生物的理论研究和诊断提供参考。 展开更多
关键词 不同年龄段 舌苔 PCR-DGGE 菌群结构
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蜂花粉微生物污染及菌群结构分析 被引量:1
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作者 唐标 罗怡 +6 位作者 李锐 周秀楠 张玲 钱鸣蓉 戴贤君 夏效东 杨华 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第20期325-331,共7页
为了解蜂花粉的微生物污染情况及菌群结构,在浙江部分地区采集不同来源、类型蜂花粉对细菌和真菌菌落总数进行测定,对其微生物菌群结构进行研究。参考国家标准测定蜂花粉的含水量、细菌和真菌的菌落总数,通过16S rDNA和ITS扩增子测序分... 为了解蜂花粉的微生物污染情况及菌群结构,在浙江部分地区采集不同来源、类型蜂花粉对细菌和真菌菌落总数进行测定,对其微生物菌群结构进行研究。参考国家标准测定蜂花粉的含水量、细菌和真菌的菌落总数,通过16S rDNA和ITS扩增子测序分别对茶花粉和荷花粉的细菌和真菌菌群结构进行分析。结果表明:新鲜蜂花粉含水量较高(>18%),相比较贮运环节的蜂花粉,微生物污染程度低;蜂花粉中可培养的真菌菌落总数相比细菌多,差异显著。荷花粉与茶花粉的细菌菌群中蓝细菌、肠杆菌科细菌及乳杆菌含量丰富,而真菌菌群中Davidiellaceae、曲霉属(Aspergillus)、青霉菌属(Penicillium)和镰孢菌属(Fusarium)占比例较高,且这两种蜂花粉的真菌菌群多样性差异显著。本实验比较新鲜采集与贮运环节花粉的微生物污染情况,比较荷花粉与茶花粉的细菌与真菌菌群,表明蜂花粉真菌菌群多样性高,可预测到丰富的产真菌毒素霉菌,具有食品安全风险。本研究可为蜂花粉的安全评价提供依据。 展开更多
关键词 蜂花粉 细菌 真菌 菌落总数 菌群结构 扩增子测序
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Application of Transcriptomics in the Analysis of Community Structure of Food Fermented with Lactic Acid Bacteria
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作者 Yanrui MA Guangpeng LIU +4 位作者 Yuexun ZHANG Yan ZHAO Fengtao ZHU Miaomiao SUN Ling GAO 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2021年第5期125-130,共6页
Revealing the structural characteristics,succession changes and functional genes of the microbial community in lactic acid bacteria-fermented food has been the focus of scientific research and industrial production fo... Revealing the structural characteristics,succession changes and functional genes of the microbial community in lactic acid bacteria-fermented food has been the focus of scientific research and industrial production for many years.In recent years,high-throughput sequencing technology has become an important tool for the research of lactic acid bacteria-fermented food microorganisms due to its advantages of high efficiency and being relatively cheap.In this paper,starting from the research on the genome,transcriptome and metabonomic levels of high-throughput sequencing technology,we reviewed the progress of transcriptomics in the study on microbial community structure,interaction,and functional gene mining of lactic acid bacteria-fermented food,and analyzed and discussed the main problems and development trends it faces,providing a certain reference for the scientific research and industrial production of fermented food in the future. 展开更多
关键词 TRANSCRIPTOMICS Lactic acid bacteria colony structure
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