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植物bZIP转录因子的研究进展 被引量:39
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作者 杨颖 高世庆 +4 位作者 唐益苗 冶晓芳 王永波 刘美英 赵昌平 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期730-737,共8页
碱性亮氨酸拉链(Basic leucine zipper,bZIP)转录因子是真核生物转录因子中分布最广泛、最保守的一类蛋白。目前,在拟南芥基因组、豆科植物基因组、水稻基因组中发现大量的bZIP转录因子。本文围绕植物bZIP转录因子的最新研究进展,按照... 碱性亮氨酸拉链(Basic leucine zipper,bZIP)转录因子是真核生物转录因子中分布最广泛、最保守的一类蛋白。目前,在拟南芥基因组、豆科植物基因组、水稻基因组中发现大量的bZIP转录因子。本文围绕植物bZIP转录因子的最新研究进展,按照其不同亚家族的结构和功能进行了综述。根据植物bZIP转录因子结构的差异,可以将其划分为10个亚族:A、B、C、D、E、F、G、HI、、S亚族。这些不同家族的bZIP转录因子成员广泛参与种子贮藏基因的表达、植物的生长发育、光信号转导、病害防御、生物和非生物胁迫应答以及ABA的敏感性等各种信号的反应。 展开更多
关键词 植物 bzip转录因子 种类 结构特点 功能
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The Arabidopsis bZIP1 Transcription Factor Is Involved in Sugar Signaling, Protein Networking, and DNA Binding 被引量:13
2
作者 Shin Gene Kang John Price +2 位作者 Pei-Chi Lin Jong Chan Hong Jyan-Chyun Jang 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2010年第2期361-373,共13页
Sugar signaling is a mechanism that plants use to integrate various internal and external cues to achieve nutrient homeostasis, mediate developmental programs, and articulate stress responses. Many bZlP transcription ... Sugar signaling is a mechanism that plants use to integrate various internal and external cues to achieve nutrient homeostasis, mediate developmental programs, and articulate stress responses. Many bZlP transcription factors are known to be involved in nutrient and/or stress signaling. An Arabidopsis Sl-group bZlP gene, AtbZIP1, was identified as a sugar-sensitive gene in a previous gene expression profiling study (Plant Cell. 16, 2128-2150). In this report, we show that the expression of AtbZIP1 is repressed by sugars in a fast, sensitive, and reversible way. The sugar repression of Atb- ZIP1 is affected by a conserved sugar signaling component, hexokinase. Besides being a sugar-regulated gene, AtbZIP1 can mediate sugar signaling and affect gene expression, plant growth, and development. When carbon nutrients are limited, gain or loss of function of AtbZlP1 causes changes in the rates of early seedling establishment. Results of phenotypic analyses indicate that AtbZlP1 acts as a negative regulator of early seedling growth. Using gain- and loss-of-function plants in a microarray analysis, two sets of putative AtbZIP1-regulated genes have been identified. Among them, sugar-responsive genes are highly over-represented, implicating a role of AtbZlP1 in sugar-mediated gene expression. Using yeast two-hybrid (Y-2-H) screens and bimolecular fluorescence complementation (BiFC) analyses, we are able to recapitulate extensive C/S1 AtbZlP protein interacting network in living cells. Finally, we show that AtbZIP1 can bind ACGT-based motifs in vitro and that the binding characteristics appear to be affected by the heterodimerization between AtbZlP1 and the C-group AtbZIPs, including AtbZlP10 and AtbZlP63. 展开更多
关键词 bzip transcription factors sugar response protein dimerization microarray analysis BIFC EMSA ACGT motif.
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植物bZIP转录因子家族的研究进展 被引量:13
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作者 王金英 丁峰 +6 位作者 潘介春 张树伟 杨亚涵 黄幸 范志毅 李琳 王颖 《热带农业科学》 2019年第6期39-45,共7页
植物bZIP转录因子是一类蛋白,在真核生物中广泛分布并且相对保守,其碱性区域高度保守,约包含20个氨基酸残基。根据bZIP结构的不同,可将其划分为10个亚族。不同亚族的转录因子行使不同的功能,主要包括表达植物种子贮藏基因、调控植物生... 植物bZIP转录因子是一类蛋白,在真核生物中广泛分布并且相对保守,其碱性区域高度保守,约包含20个氨基酸残基。根据bZIP结构的不同,可将其划分为10个亚族。不同亚族的转录因子行使不同的功能,主要包括表达植物种子贮藏基因、调控植物生长发育过程、进行光信号转导、预防病害、胁迫应答和ABA敏感性等各种信号的反应。本文主要介绍bZIP转录因子的分类、结构特征、功能多样性及其在不同植物中的分布及数量、参与的植物发育过程、次生代谢调控、生物与非生物胁迫应答及以非生物信号转导方面的研究进展,以期为进一步研究和利用bZIP转录因子提供参考。 展开更多
关键词 bzip 转录因子 胁迫应答 信号传导 植物发育
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柑橘响应溃疡病菌转录因子CsBZIP40的克隆及功能分析 被引量:11
4
作者 贾瑞瑞 周鹏飞 +8 位作者 白晓晶 陈善春 许兰珍 彭爱红 雷天刚 姚利晓 陈敏 何永睿 李强 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第13期2488-2497,共10页
【目的】分析柑橘BZIP转录因子家族并克隆柑橘溃疡病菌相关的转录因子Cs BZIP40,对其进行亚细胞定位并研究外源激素及机械损伤对该基因的诱导表达,确定其诱导表达模式,分析其与溃疡病菌侵染的关系。【方法】基于全基因组公共数据库,对柑... 【目的】分析柑橘BZIP转录因子家族并克隆柑橘溃疡病菌相关的转录因子Cs BZIP40,对其进行亚细胞定位并研究外源激素及机械损伤对该基因的诱导表达,确定其诱导表达模式,分析其与溃疡病菌侵染的关系。【方法】基于全基因组公共数据库,对柑橘BZIP转录因子进行综合专业注释以获得柑橘中BZIP家族的所有成员信息,并根据染色体定位对其进行命名;利用MEME分析其结构域;利用MEGA 6.0分析柑橘BZIP与拟南芥BZIP的系统发育关系,并根据系统发育关系对该基因家族进行分类,确定本研究关注的Cs BZIP40所属的类型;结合染色体定位和系统发育树确定该家族的基因复制情况;利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)方法验证感染溃疡病菌前后由柑橘转录组筛选出的Cs BZIP40表达模式;分析Cs BZIP40、启动子元件(plant CARE)和核定位信号(c NLSmapper),构建GFP融合载体,用洋葱表皮进行亚细胞定位分析,来对预测的核定位信息进行验证;利用q RT-PCR技术分析水杨酸(SA)、茉莉酸甲酯(Me JA)、乙烯利(ET)以及机械损伤(wounding)对该基因的诱导表达模式,揭示该转录因子与激素代谢途径的关系。【结果】从柑橘(甜橙)全基因组数据库中共注释到47个BZIP,这些BZIP基因位于9号染色体之外的所有染色体上,其中3号染色体基因密度最大为4.5×10-7个/Mb,2号染色体上的BZIP基因密度最小,仅占所有BZIP基因的2%;柑橘BZIP基因家族含有较少的基因复制事件,所以相对其他已测序物种其BZIP家族较小;Cs BZIP40基因全长5 756 bp,开放阅读框1 530 bp,编码509个氨基酸;经BZIP家族染色体定位、结构域和系统发育分析结果显示Cs BZIP40基因序列特异性较好,且Cs BZIP40与拟南芥中AT1g08320属于同源基因,属于柑橘10个亚家族中参与病菌防御的D亚类;上游启动子元件含多个与植物逆境或激素应答相关的顺式作用元件,例如Box-W1、HSE、ERE等;此基因含有核定 展开更多
关键词 柑橘溃疡病 bzip 转录因子 亚细胞定位
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CAAT区/增强子结合蛋白(C/EBP)的结构与功能 被引量:3
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作者 杨根焰 张永莲 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1999年第1期26-30,共5页
C/EBPs是一组耐热的转录调控因子.其作用范围广泛,既参与正常的生理代谢过程,又与多种疾病的发生和发展相关;其作用方式多样,对转录的调控既有正效应又有负作用.C/EBPs的这种功能多样性是与其结构的特征性相联系的,... C/EBPs是一组耐热的转录调控因子.其作用范围广泛,既参与正常的生理代谢过程,又与多种疾病的发生和发展相关;其作用方式多样,对转录的调控既有正效应又有负作用.C/EBPs的这种功能多样性是与其结构的特征性相联系的,它们属于bZIP蛋白家族.自身或与其他异构体形成蕴含着不同调控信息的同源或异源二聚体,并且能与多种蛋白质因子协同作用,决定C/EBPs发挥作用的方式和细胞特异性. 展开更多
关键词 C/EBPs 转录调控因子 bzip蛋白
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紫花苜蓿bZIP基因家族的鉴定、 进化及表达分析 被引量:6
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作者 齐晓 张正社 +2 位作者 闵学阳 孙启忠 刘文献 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期1635-1648,共14页
碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子是真核生物转录因子中分布最广泛、最保守的一类蛋白。目前在许多植物中已发现大量的bZIP转录因子,这些bZIP转录因子成员广泛参与种子贮藏基因的表达、植物的生长发育、光信号传导、病害防御、生物和非生... 碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子是真核生物转录因子中分布最广泛、最保守的一类蛋白。目前在许多植物中已发现大量的bZIP转录因子,这些bZIP转录因子成员广泛参与种子贮藏基因的表达、植物的生长发育、光信号传导、病害防御、生物和非生物胁迫应答以及ABA的敏感性等各种信号的反应。本研究首次从紫花苜蓿(Medicago sativa)全转录组水平鉴定出bZIP转录因子家族共包含138个基因,根据bZIP蛋白序列进行系统进化分析可以将其分为10类;对MsbZIP基因的系统进化分析表明该基因家族在分类上有很高的保守性。该转录因子家族的基因密码子偏好性分析表明,MsbZIP基因密码子偏好使用A/T碱基。此外,MsbZIP基因GO功能注释分析结果显示,138个MsbZIP基因最终分为23个GO分类,总体包括分子功能和生物学过程两类。相关性分析结果表明,共有372对基因表达相关性极显著(P<0.01)。本研究可为紫花苜蓿bZIP转录因子功能特性、进化历程和生物功能的深入研究奠定基础。 展开更多
关键词 bzip转录因子 紫花苜蓿 系统进化分析 密码子偏好性
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西洋参bZIP基因家族全基因组鉴定和表达分析
7
作者 郭纯 宋桂梅 +2 位作者 闫艳 邸鹏 王英平 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期167-178,共12页
【目的】碱性亮氨酸拉链转录因子(the basic leucine zipper,bZIP)是植物中最大的转录因子家族之一,参与植物生长发育及激素调控等多个进程,对西洋参bZIP基因家族进行鉴定并对其结构及表达模式进行分析,为深入研究西洋参bZIP基因家族功... 【目的】碱性亮氨酸拉链转录因子(the basic leucine zipper,bZIP)是植物中最大的转录因子家族之一,参与植物生长发育及激素调控等多个进程,对西洋参bZIP基因家族进行鉴定并对其结构及表达模式进行分析,为深入研究西洋参bZIP基因家族功能提供理论依据。【方法】利用生物信息学对西洋参bZIP基因进行理化性质、系统发育关系、基因结构、保守基序、顺式作用元件、染色体定位、进化选择压力分析、以及组织特异性表达分析,同时利用外源激素ABA处理西洋参后进行转录组数据分析及荧光定量验证。【结果】西洋参中共鉴定出121个bZIPs基因;根据系统发育树,这些基因被分为12个亚组;基因结构和保守基序分析表明,同一亚组的蛋白具有相似的保守基序和结构域,保守基序1在西洋参bZIP蛋白质中分布最广,保守性最强;顺式作用元件分析表明,bZIP上游启动子元件存在激素响应元件、防御和应激反应元件,其中ABA激素响应元件占比最大;染色体定位分析显示bZIP基因不均匀的分布在24条染色体上;进行进化选择压力分析,发现纯化选择在西洋参bZIP基因家族进化过程中起着重要作用;组织特异性表达分析,PqbZIPs基因在花和根中的表达量相对较高;转录组数据发现bZIP转录因子积极响应ABA激素处理,随后进行荧光定量实验验证,发现基因表达变化趋势基本一致。【结论】PqbZIP基因家族成员具有组织特异性表达模式且多数成员响应ABA激素处理。 展开更多
关键词 bzip 转录因子 西洋参 ABA 转录组
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甘蓝型油菜低温诱导下的bZIP转录因子挖掘及聚类分析 被引量:4
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作者 杜春芳 刘春晴 +5 位作者 咸拴狮 范建春 胡恺宁 李萌 涂金星 傅廷栋 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期153-161,共9页
植物响应低温胁迫的过程是一个复杂的网络过程,涉及众多转录因子的调控。本文通过对低温胁迫下的甘蓝型油菜转录组数据进行生物信息学分析,获得108个序列编码bZIP转录因子。经过序列比对、染色体定位和聚类分析,发现这些转录因子定位在1... 植物响应低温胁迫的过程是一个复杂的网络过程,涉及众多转录因子的调控。本文通过对低温胁迫下的甘蓝型油菜转录组数据进行生物信息学分析,获得108个序列编码bZIP转录因子。经过序列比对、染色体定位和聚类分析,发现这些转录因子定位在19条染色体上,在抗寒过程中表现动态变化;同时发现这些转录因子在A亚族、C亚族、I亚族、G亚族、S亚族中聚集最多,B亚族和D亚族中很少聚集;取4个在所有胁迫阶段皆表现差异的基因进行定量分析,发现其调控变化与测序分析的变化趋势相同,不仅证明了测序数据的可靠性,而且证明甘蓝型油菜bZIP转录因子对低温胁迫的响应是一个动态的调控过程。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 低温 bzip转录因子 挖掘 聚类分析
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2个慈竹bZIP基因的克隆、生物信息学分析及其诱导表达 被引量:4
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作者 龚道勇 胡尚连 +2 位作者 曹颖 卢学琴 张庆波 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期268-277,共10页
从慈竹笋转录组数据库中筛选并克隆出2个bZIP基因(BebZIP2和BebZIP6)进行生物信息学分析。分析结果表明,它们编码序列长度分别为504和720 bp,编码167个和239个氨基酸,BebZIP2和BebZIP6属于bZIP相关蛋白,与水稻OsbZIP52/RISBZ5蛋白聚在... 从慈竹笋转录组数据库中筛选并克隆出2个bZIP基因(BebZIP2和BebZIP6)进行生物信息学分析。分析结果表明,它们编码序列长度分别为504和720 bp,编码167个和239个氨基酸,BebZIP2和BebZIP6属于bZIP相关蛋白,与水稻OsbZIP52/RISBZ5蛋白聚在一枝。组织表达分析表明,这2个慈竹BebZIP基因在慈竹笋、茎、展开叶和未展开叶等部位均有表达,属于组成型表达,同一基因在不同组织中的表达量差异较大,表达量的大小为未展开叶>展开叶>茎>笋。对慈竹幼苗进行ABA、NaCl和PEG6000非生物胁迫处理,结果表明,BebZIP2和BebZIP6对盐、干旱和ABA胁迫均具有不同程度的响应。 展开更多
关键词 慈竹 bzip转录因子 生物信息学分析 组织表达分析 非生物胁迫
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响应ABA胁迫的甘草bZIP转录因子的系统筛选与分析 被引量:3
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作者 武立伟 徐志超 +5 位作者 王清 聂丽萍 崔英贤 王瑀 宋经元 姚辉 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期818-830,共13页
甘草为我国最常用的大宗药材之一,主要分布在干旱、半干旱区域,有着重要的经济和生态价值。bZIP转录因子在植物生物或非生物胁迫响应、生长发育、次生代谢产物合成等方面具有重要的调控作用。本研究利用Illumina高通量测序技术对不同浓... 甘草为我国最常用的大宗药材之一,主要分布在干旱、半干旱区域,有着重要的经济和生态价值。bZIP转录因子在植物生物或非生物胁迫响应、生长发育、次生代谢产物合成等方面具有重要的调控作用。本研究利用Illumina高通量测序技术对不同浓度脱落酸(ABA)处理的甘草转录组进行测序,并基于已发表的甘草全基因组数据,以拟南芥基因组中发现的bZIP序列为参照,鉴定了甘草中的bZIP转录因子。之后筛选ABA依赖bZIP转录因子基因作为候选基因,对其编码蛋白理化性质、结构以及外源ABA胁迫下基因的表达模式进行分析。共鉴定到69个甘草bZIP转录因子家族基因,命名为GubZIP1-69,并根据它们与拟南芥bZIP的同源相似性分为A~I以及S这10个亚家族。通过计算69个GubZIPs基因在不同外源ABA胁迫下的相对表达量,筛选出可能参与ABA信号通路的调控基因,即GubZIP1、GubZIP5、GubZIP8、GubZIP30、GubZIP33和GubZIP56。外源ABA胁迫下候选GubZIPs基因的表达模式分析结果显示,与0 mg·L^(-1)浓度ABA处理下相比, 25 mg·L^(-1)的ABA没有引起基因的表达模式发生变化,而在50 mg·L^(-1)浓度ABA处理下的表达模式发生了明显的变化,说明这些基因的表达响应50 mg·L^(-1)浓度的ABA,即基因相对表达量均在处理后3 h下降, 6 h之后逐渐上升,除了GubZIP8, 12 h后基因相对表达量较0 h均显著上升。本研究为进一步开展甘草bZIP转录因子功能研究,阐明其调控机制奠定了基础,为今后利用分子育种方法培育优质甘草品种提供了科学依据。 展开更多
关键词 甘草 bzip转录因子 ABA胁迫 结构分析 表达分析
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植物bZIP转录因子在非生物胁迫中的作用 被引量:4
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作者 冉静 邹杰 +1 位作者 刘爱玲 陈信波 《湖南农业科学》 2012年第4期11-13,共3页
非生物胁迫因子如干旱、高温、低温和盐碱等严重影响着植物的生长发育,碱性亮氨酸拉链(bZIP)类转录因子与非生物逆境胁迫响应有密切关联。综述了植物bZIP类转录因子在应答非生物逆境胁迫中的作用及研究进展。
关键词 bzip 转录因子 非生物胁迫
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萱草海水胁迫相关bZIP转录因子密码子偏向性分析 被引量:2
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作者 王玥宁 张世杰 +3 位作者 张志国 倪迪安 秦巧平 刘翔 《应用技术学报》 2022年第2期167-175,共9页
bZIP转录因子是普遍存在于动、植物及微生物中的一类蛋白,广泛参与胁迫响应、生长发育调节及能量代谢等多种生理过程。首次通过CodonW和Emboss对萱草海水胁迫相关bZIP基因家族的密码子构成特性及密码子使用模式进行分析,预测HfbZIP基因... bZIP转录因子是普遍存在于动、植物及微生物中的一类蛋白,广泛参与胁迫响应、生长发育调节及能量代谢等多种生理过程。首次通过CodonW和Emboss对萱草海水胁迫相关bZIP基因家族的密码子构成特性及密码子使用模式进行分析,预测HfbZIP基因可能使用的最优密码子,为发掘萱草bZIP基因家族成员的潜在功能提供理论基础。结果表明,HfbZIP基因家族密码子平均GC含量为48.52%,GC3值为48.12%,略微偏向使用A/T结尾;ENC值所在范围为37.40~61.00,平均值为51.50,CAI值取值范围为0.14~0.21,均值为0.19,表明该家族密码子使用偏向性较弱且整体的表达水平不高;中性绘图分析,ENC-plot曲线分析及PR2-plot图表明HfbZIP家族基因密码子偏好性形成受碱基组成,突变与自然选择压力等多因素共同影响;根据RSCU分析筛选出7个最优密码子,可为萱草bZIP功能基因研究和序列设计中密码子优化和宿主选择提供理论支持。 展开更多
关键词 萱草 bzip转录因子 密码子偏向性 最优密码子
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bZIP转录因子在植物激素介导的抗病抗逆途径中的作用 被引量:3
13
作者 李冬月 原文霞 +4 位作者 郑超 王栩鸣 周洁 严成其 陈剑平 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第1期168-175,共8页
植物体内有一套复杂精细且交叉调控的激素信号网络,在植物应对不良环境胁迫的过程中起着至关重要的作用。bZIP转录因子作为基因表达的关键调控因子,在植物抗病抗逆相关基因的表达中行使着重要的功能。文章首先介绍了bZIP转录因子的结构... 植物体内有一套复杂精细且交叉调控的激素信号网络,在植物应对不良环境胁迫的过程中起着至关重要的作用。bZIP转录因子作为基因表达的关键调控因子,在植物抗病抗逆相关基因的表达中行使着重要的功能。文章首先介绍了bZIP转录因子的结构和功能,阐述了其在几种主要的激素抗性调控途径中的作用机理,之后对各种激素信号通路之间的交叉调控途径及其关键调控节点蛋白进行了概括,以期阐明植物激素介导的抗性调控网络,并为新的抗性相关基因的挖掘和利用提供理论依据。 展开更多
关键词 bzip转录因子 植物激素 抗病 抗逆 信号调控
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非生物胁迫下转录因子增强植物抗性的研究进展 被引量:2
14
作者 张双喜 季新梅 +5 位作者 李红霞 樊明 刘旺清 裘敏 方亮 魏亦勤 《宁夏农林科技》 2014年第12期11-13,48,共4页
转录因子通过调控下游基因的表达来缓冲各种环境压力反应。其中AP2/EREBPL参与植物的细胞周期、生长发育、生物胁迫和非生物胁迫相关的基因的表达调控;MYB参与植物的细胞周期、细胞死亡、新陈代谢等响应;b ZIP基因参与植物种子贮藏相关... 转录因子通过调控下游基因的表达来缓冲各种环境压力反应。其中AP2/EREBPL参与植物的细胞周期、生长发育、生物胁迫和非生物胁迫相关的基因的表达调控;MYB参与植物的细胞周期、细胞死亡、新陈代谢等响应;b ZIP基因参与植物种子贮藏相关的基因表达,控制光和发育的发生和器官形态建成等;NAC基因参与了植物激素信号传导和生长素通路。这些转录因子通过调控一系列基因的表达增强植物忍耐逆境胁迫能力。 展开更多
关键词 转录因子 AP2 MYB bzip NAC 忍耐性
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Transcriptional regulation of secretory capacity by bZip transcription factors 被引量:1
15
作者 Rebecca M. FOX Deborah J. ANDREW 《Frontiers in Biology》 CAS CSCD 2015年第1期28-51,共24页
Cells of specialized secretory organs expand their secretory pathways to accommodate the increased protein load necessary for their function. The endoplasmic reticulum (ER), the Golgi apparatus and the secretory ves... Cells of specialized secretory organs expand their secretory pathways to accommodate the increased protein load necessary for their function. The endoplasmic reticulum (ER), the Golgi apparatus and the secretory vesicles, expand not only the membrane components but also the protein machinery required for increased protein production and transport. Increased protein load causes an ER stress response akin to the Unfolded Protein Response (UPR). Recent work has implicated several bZip transcription factors in the regulation of protein components of the early secretory pathway necessary to alleviate this stress. Here, we highlight eight bZip transcription factors in regulating secretory pathway component genes. These include components of the three canonical branches of the UPR-ATF4, XBP1, and ATF6, as well as the five members of the Creb3 family of transcription factors. We review findings from both invertebrate and vertebrate model systems suggesting that all of these proteins increase secretory capacity in response to increased protein load. Finally, we propose that the Creb3 family of factors may have a dual role in secretory cell differentiation by also regulating the pathways necessary for cell cycle exit during terminal differentiation. 展开更多
关键词 bzip transcription factors endoplasmic reticulum GOLGI SECRETION secretory capacity secretory vesicles
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大豆胞囊线虫病抗性相关bZIP转录因子的生物信息学分析 被引量:1
16
作者 姜海鹏 田力峥 +2 位作者 卜凡珊 赵雪 韩英鹏 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期703-711,共9页
为分析大豆bZIP转录因子在大豆胞囊线虫病3号生理小种胁迫下的应答机制,促进大豆响应大豆胞囊线虫病3号生理小种胁迫机制的研究,本研究采用胞囊线虫病3号生理小种对抗线虫大豆品种东农L^-10进行胁迫,对转录组测序数据中与抗性相关的bZI... 为分析大豆bZIP转录因子在大豆胞囊线虫病3号生理小种胁迫下的应答机制,促进大豆响应大豆胞囊线虫病3号生理小种胁迫机制的研究,本研究采用胞囊线虫病3号生理小种对抗线虫大豆品种东农L^-10进行胁迫,对转录组测序数据中与抗性相关的bZIP转录因子进行在线生物信息学预测和分析。结果共获得18个与大豆胞囊线虫病3号生理小种相关的差异表达bZIP转录因子,不同bZIP转录因子之间的理化性质存在较大差异,大多数上调表达的bZIP转录因子为碱性等电点,而大多数下调表达的bZIP转录因子为酸性等电点;18个bZIP蛋白中含有多个丝氨酸(S)、苏氨酸(T)和酪氨酸(Y)磷酸化位点,其中丝氨酸(S)位点最多;亚细胞定位显示2个bZIP转录因子定位于叶绿体,其余均定位于细胞核,与转录因子调控下游基因的表达特性相一致;18个bZIP蛋白的系统进化树分为2大类群,其中上调表达的bZIP转录因子和下调表达的bZIP转录因子亲缘关系较远;bZIP基因家族的成员都含有数量不等的motif结构,且不同bZIP基因之间保守结构域的氨基酸存在变异;蛋白二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主要构成元件;根据结构相似性,18个bZIP蛋白三级结构分为4类,不同bZIP转录因子三级结构的相似性暗示了功能上存在相似。 展开更多
关键词 大豆胞囊线虫病 3号生理小种 转录组测序 bzip转录因子 生物信息学
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生物类黄酮 花青素合成与转录因子的关系 被引量:1
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作者 李瑾瑜 《广东蚕业》 2019年第12期41-42,共2页
植物中的次生代谢途径同样也发挥着很重要的作用,其中一种次生代谢物质——花青素苷,与植物花叶呈色有直接关系,同时这些途径还影响着非生物胁迫等一系列外界刺激,可以一定程度上帮助植物抵抗逆境应对外界刺激。转录因子在植物次生代谢... 植物中的次生代谢途径同样也发挥着很重要的作用,其中一种次生代谢物质——花青素苷,与植物花叶呈色有直接关系,同时这些途径还影响着非生物胁迫等一系列外界刺激,可以一定程度上帮助植物抵抗逆境应对外界刺激。转录因子在植物次生代谢物的合成中发挥重要的调节作用,与花青素苷生物合成相关的转录因子主要有MYB、bHLH、WD40、bZIP等,文章介绍了其中的几种转录因子的结构以及他们在花青素合成途径中是怎样发挥作用的。 展开更多
关键词 类黄酮 转录因子 MYB BHLH bzip
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谷子SibZIP8超量表达载体的构建
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作者 成亮 刘盼 +1 位作者 邢恒荣 张莉 《山西农业科学》 2018年第8期1235-1238,共4页
为了研究SibZIP8介导谷子抗旱的分子机制,试验根据SibZIP8 cDNA序列设计引物,以晋谷21的cDNA为模板,通过PCR扩增SibZIP8基因的全长cDNA。将所得的cDNA序列与表达载体p CAMBIA1302连接。通过对阳性克隆进行测序筛选,确定pCAMBIA1302-SibZ... 为了研究SibZIP8介导谷子抗旱的分子机制,试验根据SibZIP8 cDNA序列设计引物,以晋谷21的cDNA为模板,通过PCR扩增SibZIP8基因的全长cDNA。将所得的cDNA序列与表达载体p CAMBIA1302连接。通过对阳性克隆进行测序筛选,确定pCAMBIA1302-SibZIP8超量表达载体构建成功。该超量表达载体可用于SibZIP8基因功能的研究。 展开更多
关键词 谷子 bzip转录因子 超量表达载体 基因功能
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碱性亮氨酸拉链转录因子的翻译后修饰在植物响应非生物胁迫中的作用
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作者 李影 赵伟迪 +4 位作者 杨敬华 李佳奇 韩松洋 任月坤 郭长虹 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期53-62,共10页
非生物胁迫是植物生长发育过程中必须要应对的不利环境因素。在进化过程中,植物获得了多种响应或抵抗逆境的能力,其中转录因子在调控非生物胁迫耐受性方面起到了重要作用。碱性亮氨酸拉链转录因子(basic leucine zipper transcription f... 非生物胁迫是植物生长发育过程中必须要应对的不利环境因素。在进化过程中,植物获得了多种响应或抵抗逆境的能力,其中转录因子在调控非生物胁迫耐受性方面起到了重要作用。碱性亮氨酸拉链转录因子(basic leucine zipper transcription factors,bZIP)是转录因子中较大的基因家族之一。不同的翻译后修饰(post-translational modifications,PTMs)可以控制bZIP转录因子的稳定性和活性,响应各种细胞内或细胞外胁迫。本文介绍了bZIP转录因子的结构特征与分类,重点综述了bZIP转录因子磷酸化、泛素化和小泛素相关修饰物(small ubiquitin-like modifier,SUMO)化等翻译后修饰在植物响应非生物胁迫中的作用,并对未来的研究方向进行了展望,为通过调控bZIP转录因子的翻译后修饰培育优良抗逆作物品种提供研究参考。 展开更多
关键词 非生物胁迫 碱性亮氨酸拉链转录因子(bzip) 磷酸化 泛素化 小泛素相关修饰物(SUMO)
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拟南芥bzip19-2/bzip23-1/bzip24-2三突变体植株获取及其PCR鉴定 被引量:2
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作者 曹家升 任永兵 +2 位作者 孟云 曹树青 阳立波 《合肥工业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2019年第1期125-129,共5页
近年来植物所受非生物胁迫的影响日益严峻,是造成农业减产的主要因素之一。bZIP类转录因子参与多种生物学功能并起着重要调控作用,尤其是对植物生长发育以及逆境胁迫应答的调控。因此文章以拟南芥bZIP19、bZIP23、bZIP24基因的突变体为... 近年来植物所受非生物胁迫的影响日益严峻,是造成农业减产的主要因素之一。bZIP类转录因子参与多种生物学功能并起着重要调控作用,尤其是对植物生长发育以及逆境胁迫应答的调控。因此文章以拟南芥bZIP19、bZIP23、bZIP24基因的突变体为实验材料,通过遗传杂交技术构建bzip19-2/bzip23-1/bzip24-2三突变体,结合聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)鉴定技术,最终获得纯合三突变体实验材料,为研究bZIP类转录因子的功能及其间相互作用奠定了基础。 展开更多
关键词 拟南芥 bzip转录因子 杂交 聚合酶链式反应(PCR) 三突变体
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