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The Role of PIN Auxin Efflux Carriers in Polar Auxin Transport and Accumulation and Their Effect on Shaping Maize Development 被引量:11
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作者 Cristian Forestan Serena Varotto 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2012年第4期787-798,共12页
In plants, proper seed development and the continuing post-embryonic organogenesis both require that dif- ferent cell types are correctly differentiated in response to internal and external stimuli. Among internal sti... In plants, proper seed development and the continuing post-embryonic organogenesis both require that dif- ferent cell types are correctly differentiated in response to internal and external stimuli. Among internal stimuli, plant hormones and particularly auxin and its polar transport (PAT) have been shown to regulate a multitude of plant phys- iological processes during vegetative and reproductive development. Although our current auxin knowledge is almost based on the results from researches on the eudicot Arabidopsis thaliana, during the last few years, many studies tried to transfer this knowledge from model to crop species, maize in particular. Applications of auxin transport inhibitors, mutant characterization, and molecular and cell biology approaches, facilitated by the sequencing of the maize genome, allowed the identification of genes involved in auxin metabolism, signaling, and particularly in polar auxin transport. PIN auxin efflux carriers have been shown to play an essential role in regulating PAT during both seed and post-embryonic development in maize. In this review, we provide a summary of the recent findings on PIN-mediated polar auxin transport during maize development. Similarities and differences between maize and Arabidopsis are analyzed and discussed, also considering that their different plant architecture depends on the differentiation of structures whose development is con- trolled by auxins. 展开更多
关键词 auxin PIN-formed auxin efflux carrier PAT Polar auxin Transport kernel development MERISTEM organ-ogenesis Zea mays.
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狗蔷薇生长素输出载体蛋白基因PIN1和PIN2的分离与表达分析 被引量:7
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作者 刘凤栾 寇亚平 +3 位作者 陈晓丽 高彬 王玲 赵梁军 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期925-934,共10页
植物体内生长素输出载体PIN蛋白基因的表达变化间接反映了生长素的运输与积累状态。为分析生长素在狗蔷薇(Rosa canina)类原球茎发生初期的作用,以狗蔷薇叶片愈伤形成的不定根为材料,分离了生长素输出载体蛋白基因PIN1和PIN2的cDNA,分... 植物体内生长素输出载体PIN蛋白基因的表达变化间接反映了生长素的运输与积累状态。为分析生长素在狗蔷薇(Rosa canina)类原球茎发生初期的作用,以狗蔷薇叶片愈伤形成的不定根为材料,分离了生长素输出载体蛋白基因PIN1和PIN2的cDNA,分别命名为RcPIN1(GenBank登录号KF543362)和RcPIN2(GenBank登录号KF543363)。RcPIN1全长2 266 bp,编码621个氨基酸;RcPIN2全长2 248 bp,编码643个氨基酸,两者推导蛋白结构差异微小,在N端和C端均有5个跨膜区域,中间1个亲水区。Blast比对发现两个基因与多种植物PIN基因具有高度同源性(>70%)。半定量RT-PCR分析表明,RcPIN1在根、茎中表达量高于叶和花,RcPIN2在根中表达水平高于茎、叶和花;在狗蔷薇类原球茎发生初期,TDZ诱导培养下愈伤—不定根RcPIN1和RcPIN2表达上调,而TDZ+TIBA抑制培养下两基因表达不活跃,且类原球茎形成率降低。试验结果表明生长素的极性运输与积累参与了调控狗蔷薇类原球茎的初期形态建成。 展开更多
关键词 狗蔷薇 PIN 生长素 生长素输出载体 类原球茎
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茶树生长素外运载体基因CsPIN3的克隆与表达分析 被引量:5
3
作者 王博 曹红利 +6 位作者 黄玉婷 胡玉荣 钱文俊 郝心愿 王璐 杨亚军 王新超 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期58-69,共12页
从实验室前期茶树冷驯化转录组测序结果中筛选拼接得到1条与其他植物PIN蛋白高度相似的EST序列,采用反转录PCR结合RACE技术从茶树中克隆到生长素外运载体基因PIN3的全长cDNA序列,命名为CsPIN3(Gen Bank登录号为KP896474)。CsPIN3全长265... 从实验室前期茶树冷驯化转录组测序结果中筛选拼接得到1条与其他植物PIN蛋白高度相似的EST序列,采用反转录PCR结合RACE技术从茶树中克隆到生长素外运载体基因PIN3的全长cDNA序列,命名为CsPIN3(Gen Bank登录号为KP896474)。CsPIN3全长2654 bp,包含1926 bp的完整开放阅读框(ORF),编码641个氨基酸。生物信息学分析显示,CsPIN3编码的蛋白质分子量为70.15 kD,理论等电点为8.42,是一种非分泌性蛋白;亚细胞定位显示,CsPIN3主要分布于质膜上,在内质网中有少量分布,是典型的膜蛋白;氨基酸序列分析表明,CsPIN3编码蛋白由两端的疏水区和中间的亲水区构成。疏水区内有多个跨膜螺旋,其中N端疏水区有5个跨膜螺旋,C端有4个,与水稻的PIN蛋白结构相似。亲水区存在2个可变结构域,还存在着糖基化位点和磷酸化位点以及调控PIN蛋白内吞作用的NPNXY保守内在构型(inner motif,IM),如PIN蛋白特有的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(PID/PINOID)磷酸化活性位点TPRXS(N/S)结构域;相似性及系统进化分析表明,该基因编码的氨基酸序列具有较高的保守性,与杨树、葡萄、柑橘、烟草、番茄、马铃薯、芝麻等植物的PIN序列相似性在80%以上,与茄科植物的亲缘关系最近。在拟南芥PIN蛋白中,At PIN3与茶树CsPIN3的亲缘关系较近。组织表达特异性分析表明CsPIN3在茶树根、茎、叶、花中均有表达,在花中的表达量较高,在茎、叶中的表达量略高于根部。实时定量PCR分析显示,CsPIN3在龙井43茶树越冬芽萌发阶段的表达量高于休眠阶段(休眠初期到膨大期之间),在茶芽萌动过程中表达上调的速度明显。推测该基因可能与茶树越冬芽休眠的维持和解除相关。 展开更多
关键词 茶树 休眠 生长素外运载体基因 表达分析
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菠萝生长素极性运输载体基因AcPINs和AcAUXs的分离与表达分析 被引量:4
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作者 李运合 孙光明 +2 位作者 张红娜 刘胜辉 吴青松 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1916-1928,共13页
乙烯已经被广泛应用于菠萝人工催花,但其分子机制不是很清楚。以菠萝(Ananas comosus L.‘Perola’)茎尖为材料,采用RT-PCR结合RACE方法得到3个生长素极性运输输出载体基因(AcPIN1、AcPIN2和AcPIN3)和2个生长素极性运输输入载体基因(AcA... 乙烯已经被广泛应用于菠萝人工催花,但其分子机制不是很清楚。以菠萝(Ananas comosus L.‘Perola’)茎尖为材料,采用RT-PCR结合RACE方法得到3个生长素极性运输输出载体基因(AcPIN1、AcPIN2和AcPIN3)和2个生长素极性运输输入载体基因(AcAUX1和AcAUX2)的c DNA及基因组DNA全长。AcPIN1、AcPIN2、AcPIN3、AcAUX1和AcAUX2的cDNA全长分别为2 690、2 388、2 057、2 156和1 580 bp,其开放读码框长度分别为1 854、1 917、1 530、1 479和1 392 bp,分别编码617、638、509、492和463个氨基酸;其基因组DNA全长分别为3 602、3 208、4 204、5 457和2 436 bp,从起始密码子到终止密码子的长度分别为3 244、2 780、3 947、5 264和2 321 bp。氨基酸序列多重比对及系统发育树结果显示AcPINs和AcAUXs分别属于植物PINs和AUX/LAXs家族。荧光定量PCR结果表明,菠萝茎尖经200和1 200 mg·L^(-1)乙烯利诱导处理后,AcPINs的表达上调较多,其中AcPIN2在处理后的早期(1~2 d)和后期(28~37 d)显著上调,另外两个PIN家族基因AcPIN1和AcPIN3在处理后的大部分时间都明显提高。AcAUX1的上调表达量相对较少,且相对表达量显著提高也主要集中在处理初期(1 d)和后期(28~37 d),而AcAUX2的上调表达则只在处理后的前期(1、2、9 d)。研究结果表明,乙烯利诱导菠萝成花过程中,存在着生长素极性运输,且生长素极性输出在此过程中的作用可能更重要。 展开更多
关键词 菠萝 开花 生长素输出载体 生长素输入载体 生长素极性运输
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A Pin gene families encoding components of auxin efflux carriers in Brassica juncea
5
作者 WEIMINNI XIAOYACHEN 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 2002年第3期247-255,共9页
Based on the sequence information of Arabidopsis PIN1, two cDNAs encoding PIN homologues from Brassica juncea, Bjpin2 and Bjpin3, were isolated through cDNA library screening. Bjpin2 and Bjpin3 encoded proteins contai... Based on the sequence information of Arabidopsis PIN1, two cDNAs encoding PIN homologues from Brassica juncea, Bjpin2 and Bjpin3, were isolated through cDNA library screening. Bjpin2 and Bjpin3 encoded proteins containing 640 and 635 amino acid residues, respectively, which shared 97.5% identities with each other and were highly homologous to Arabidopsis PIN1, PIN2 and other putative PIN proteins. BJPIN2 and BjPIN3 had similar structures as AtPIN proteins. Northern blot analysis indicated that Bjpin2 was expressed in stem, leaf and floral tissues, while Bjpin3 was expressed predominantly in stem and hypocotyls. Two promoter fragments of pin genes, Bjpin-X and Bjpin-Z, were isolated by 'genome walking' technique using primers at 5'-end of pin cDNA. Promoter-gus fusion studies revealed the GUS activities driven by Bjpin-X were at internal side of xylem and petal; while those driven by Bjpin-Z were detected at leaf vein, epidermal cell and cortex of stem, vascular tissues and anther. Results of the pin genes with different expression patterns in B. juncea suggested the presence of a gene family. 展开更多
关键词 Brassica juncea polar auxin transport auxin efflux carrier promoter.
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A Pin gene families encoding components of auxin efflux carriers in Brassica juncea 被引量:1
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作者 WEI MIN NI XIAO YA CHEN ZHI HONG XU HONG WEI XUE 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 2002年第4期247-255,共9页
Based on the sequence information of Arabidopsis PIN1, two cDNAs encoding PIN homologues fromBrassica juncea, Bjpin2 and Bjpin3, were isolated through cDNA library screening. Bjpin2 and Bjpin3encoded proteins containi... Based on the sequence information of Arabidopsis PIN1, two cDNAs encoding PIN homologues fromBrassica juncea, Bjpin2 and Bjpin3, were isolated through cDNA library screening. Bjpin2 and Bjpin3encoded proteins containing 640 and 635 amino acid residues, respectively, which shared 97.5% identities witheach other and were highly homologous to Arabidopsis PIN1, PIN2 and other putative PIN proteins. BjPIN2and BjPIN3 had similar structures as AtPIN proteins. Northern blot analysis indicated that Bjpin2 wasexpressed in stem, leaf and floral tissues, while Bjpin3 was expressed predominantly in stem and hypocotyls.Two promoter fragments of pin genes, Bjpin-X and Bjpin-Z, were isolated by 'genome walking' techniqueusing primers at 5'-end of pin cDNA. Promoter-gus fusion studies revealed the GUS activities driven byBjpin-X were at internal side of xylem and petal; while those driven by Bjpin-Z were detected at leaf vein,epidermal cell and cortex of stem, vascular tissues and anther. Results of the pin genes with differentexpression patterns in B. juncea suggested the presence of a gene family. 展开更多
关键词 BRASSICA juncea polar auxin transport auxin efflux carrier promoter.
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生长素输出载体蛋白PIN1在作物根和胚中的亚细胞定位
7
作者 武丽霞 韩丽 +2 位作者 赵宜婷 周璇 杜云龙 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期1219-1225,共7页
生长素输出载体在植物发育中起非常重要的作用。然而,生长素输出载体蛋白PIN1在农作物水稻、小麦、玉米和大豆的根和胚中的亚细胞定位尚不清楚。该研究首先分析了OsPIN1b和它的同源物的氨基酸序列特征,发现小麦(TaPIN1)、玉米(ZmPIN1b)... 生长素输出载体在植物发育中起非常重要的作用。然而,生长素输出载体蛋白PIN1在农作物水稻、小麦、玉米和大豆的根和胚中的亚细胞定位尚不清楚。该研究首先分析了OsPIN1b和它的同源物的氨基酸序列特征,发现小麦(TaPIN1)、玉米(ZmPIN1b)和大豆(GmPIN1b)中的PIN1序列与水稻的OsPIN1b序列分别具有61.5%、62.5%、61.9%的相似性。然后根据水稻‘日本晴’(‘Nipponbare’)的OsPIN1b的氨基酸序列,人工合成OsPIN1b多肽并注射健康的新西兰白兔获得了抗兔的OsPIN1b多克隆抗体,在通过免疫印迹方法检测抗兔的OsPIN1b多克隆抗体的有效性后,发现可以利用该抗体有效检测到水稻叶片及根中OsPIN1b的表达。为检测OsPIN1及其同源物在不同作物胚根和胚中子叶细胞的定位,利用制备的抗兔的OsPIN1b多克隆抗体并通过免疫组化实验,发现水稻的OsPIN1b、小麦的TaPIN1和玉米的ZmPIN1b非极性定位在早期的胚根和胚中子叶表皮细胞的细胞质膜上,大豆中的GmPIN1b非极性定位在胚根表皮细胞的质膜上,而在胚的子叶细胞中是胞质定位。为进一步检测水稻中OsPIN1b的亚细胞定位,对水稻根分生区表皮细胞用蛋白质转运抑制剂BFA(Brefeldin A)及抗兔的OsPIN1b多克隆抗体处理后,进行免疫组化实验,结果发现水稻中的OsPIN1b可以通过胞吞转运途径从水稻根表皮细胞膜进入细胞质中。该研究利用抗兔的OsPIN1b多克隆抗体有效检测了OsPIN1b及其同源物在水稻、小麦、玉米和大豆的胚根表皮细胞及胚中子叶表皮细胞的亚细胞定位,这将有助于进一步揭示生长素输出载体OsPIN1b及其同源物通过调控生长素极性运输而参与作物发育的作用机制。 展开更多
关键词 生长素输出载体 PIN1 水稻 小麦 玉米 大豆
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应用CRISPR/Cas9技术研究水稻OsPIN10a基因功能
8
作者 张艳雯 杨晓祎 +4 位作者 王慧慧 侯典云 张红晓 张卓妍 胥华伟 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1715-1723,共9页
生长素输出载体蛋白(PIN-FORMED,PIN)是控制生长素极性运输的关键蛋白。OsPIN10a是单子叶植物特异的生长素输出载体蛋白,但其生物学功能报道甚少。本研究在OsPIN10a基因的第1个外显子上设计编辑位点,构建了OsPIN10a的CRISPR/Cas9基因编... 生长素输出载体蛋白(PIN-FORMED,PIN)是控制生长素极性运输的关键蛋白。OsPIN10a是单子叶植物特异的生长素输出载体蛋白,但其生物学功能报道甚少。本研究在OsPIN10a基因的第1个外显子上设计编辑位点,构建了OsPIN10a的CRISPR/Cas9基因编辑载体。通过遗传转化水稻粳稻品种‘日本晴’获得19株转基因植株。测序分析表明14个转基因株系中有7种不同的突变类型,总突变率为73.68%。进一步鉴定获得4种不同类型的纯合突变体。序列比对分析表明,这4种类型的突变均造成移码突变和蛋白翻译提前终止,其中2种突变蛋白的长度为7和9个氨基酸,将其命名为ospin10a-1和ospin10a-2;2种突变蛋白的长度为235和232个氨基酸,命名为ospin10a-3和ospin10a-4。跨膜螺旋结构域分析表明这四种突变体中OsPIN10a蛋白的跨膜结构全部消失。幼苗期表型分析表明,ospin10a-1和ospin10a-2突变体植株地上部的生长和不定根的发育都受到显著影响。ospin10a-1和ospin10a-2突变体根的向重性受到显著抑制,说明OsPIN10a参与调控水稻根的向重性。 展开更多
关键词 生长素输出载体 OsPIN10a 水稻 CRISPR/Cas9 向重性反应
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百脉根PIN基因家族的鉴定与分析 被引量:2
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作者 吕赟 丘日光 +2 位作者 杨仕梅 吴佳海 宋莉 《河南农业科学》 北大核心 2019年第8期39-48,共10页
生长素输出载体蛋白PIN-formed(PIN)是一类调控植物生长素极性运输的重要载体元件,与植物生长发育密切相关。利用生物信息学方法对百脉根(Lotuscorniculatus)PIN基因家族成员(LjPIN)进行筛选、鉴定,并对其结构特征、系统进化、编码蛋白... 生长素输出载体蛋白PIN-formed(PIN)是一类调控植物生长素极性运输的重要载体元件,与植物生长发育密切相关。利用生物信息学方法对百脉根(Lotuscorniculatus)PIN基因家族成员(LjPIN)进行筛选、鉴定,并对其结构特征、系统进化、编码蛋白质性质、顺式作用元件组成和表达特性等进行研究,为其功能鉴定及利用奠定基础。结果表明,百脉根基因组中含有27个LjPIN成员,主要分布在1-5号染色体上;27个LjPIN基因含8个可变剪切位点,编码35个蛋白质;除了LjPIN4、LjPIN13、LjPIN23基因外,其他LjPIN基因均含有内含子,内含子数和外显子数均为1~10个;LjPIN与拟南芥AtPIN、大豆GmPIN在进化关系上较接近,与水稻OsPIN较远;LjPIN蛋白大多为碱性的两性稳定蛋白质,一般含有5种保守基序,基序数量2~9个;LjPIN基因除了含有顺式作用基本元件CAAT-box和TATA-box外,还含有光响应、激素响应及生长发育相关的调控元件;11个LjPIN基因在根、茎、叶、花和不同形成时期种子中呈时空差异表达。 展开更多
关键词 百脉根 生长素输出载体蛋白 PIN基因家族 生物信息学分析
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