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分子生物学技术及其在环境样品微生物分析中的应用
被引量:
5
1
作者
张瑛
阮晓红
《河海大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第3期241-245,共5页
综述了荧光原位杂交(FISH)、多聚酶链式反应(PCR)、DNA克隆及DNA测序等分子生物学技术,并将这些分子生物学技术应用到淡水水体底泥厌氧氨氧化菌(anammox菌)和好氧氨氧化菌的原位检测中,从底泥样品中鉴别出这两种细菌,其中好氧氨氧化菌...
综述了荧光原位杂交(FISH)、多聚酶链式反应(PCR)、DNA克隆及DNA测序等分子生物学技术,并将这些分子生物学技术应用到淡水水体底泥厌氧氨氧化菌(anammox菌)和好氧氨氧化菌的原位检测中,从底泥样品中鉴别出这两种细菌,其中好氧氨氧化菌属于亚硝酸单胞菌属,厌氧氨氧化菌属于anammox菌的Brocadia分支,为进一步研究淡水环境中氮的微生物循环过程提供了一定的依据.
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关键词
分子生物学
FISH
PCR
DNA克隆
DNA测序
anammox
菌
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职称材料
厌氧氨氧化反应器载体生物膜细菌多样性的研究
被引量:
5
2
作者
王银华
马悦欣
+2 位作者
刘长发
朱学惠
朱莹
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期500-506,共7页
采用细菌16S rRNA通用引物1055F/1392R-GC获得的PCR产物进行变性梯度凝胶电泳(DGGE),分析了两个厌氧氨氧化反应器在不同运行时间其载体生物膜上的细菌多样性。结果表明,两个反应器在不同运行时间其细菌种群多样性有一定差异。DGGE优势...
采用细菌16S rRNA通用引物1055F/1392R-GC获得的PCR产物进行变性梯度凝胶电泳(DGGE),分析了两个厌氧氨氧化反应器在不同运行时间其载体生物膜上的细菌多样性。结果表明,两个反应器在不同运行时间其细菌种群多样性有一定差异。DGGE优势条带序列系统发育分析结果表明,反应器载体生物膜上的细菌类群主要是陶厄氏菌属Thauera、鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas,外硫红螺旋菌科Ectothiorho-dospiraceae、酸杆菌门Chloroflexi、绿弯菌门Acidobacteria及不可培养细菌。当反应器运行208 d时,水体中氨氮和亚硝态氮的去除率维持较高水平,两者去除率之比为1.1,表明反应器内发生了厌氧氨氧化反应。针对厌氧氨氧化细菌16S rRNA基因引物Pla46F/Amx368R-GC获得的PCR产物,采用DGGE技术对载体生物膜上的厌氧氨氧化细菌进行了检测。DGGE优势条带序列分析结果表明,在反应器中富集得到的厌氧氨氧化细菌分别与Planctomycete KSU-1、Candidatus Jettenia asiatica的相似性均为96%,可以认为它们是反应器内起厌氧氨氧化作用的主要细菌。
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关键词
厌氧氨氧化反应器
生物膜
PCR—DGGE
细菌多样性
厌氧氨氧化细菌
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职称材料
题名
分子生物学技术及其在环境样品微生物分析中的应用
被引量:
5
1
作者
张瑛
阮晓红
机构
河海大学水文水资源与水利工程科学国家重点实验室
教育部浅水湖泊综合治理与资源开发重点实验室
出处
《河海大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第3期241-245,共5页
基金
国家"十五"重大科技专项基金资助项目(2003AA601070)
江苏省环境保护厅科技计划资助项目(2002010)
文摘
综述了荧光原位杂交(FISH)、多聚酶链式反应(PCR)、DNA克隆及DNA测序等分子生物学技术,并将这些分子生物学技术应用到淡水水体底泥厌氧氨氧化菌(anammox菌)和好氧氨氧化菌的原位检测中,从底泥样品中鉴别出这两种细菌,其中好氧氨氧化菌属于亚硝酸单胞菌属,厌氧氨氧化菌属于anammox菌的Brocadia分支,为进一步研究淡水环境中氮的微生物循环过程提供了一定的依据.
关键词
分子生物学
FISH
PCR
DNA克隆
DNA测序
anammox
菌
Keywords
molecular
biology
Fluorescent
in
situ
Hybridization
(FISH)
Polymerase
Chain
Reaction
(PCR)
DNA
cloning
DNA
sequencing
anammox
bacterium
分类号
Q938.1 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
厌氧氨氧化反应器载体生物膜细菌多样性的研究
被引量:
5
2
作者
王银华
马悦欣
刘长发
朱学惠
朱莹
机构
大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室
大连海洋大学海洋科技与环境学院
出处
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期500-506,共7页
基金
国家"863"计划项目(2007AA10Z410)
文摘
采用细菌16S rRNA通用引物1055F/1392R-GC获得的PCR产物进行变性梯度凝胶电泳(DGGE),分析了两个厌氧氨氧化反应器在不同运行时间其载体生物膜上的细菌多样性。结果表明,两个反应器在不同运行时间其细菌种群多样性有一定差异。DGGE优势条带序列系统发育分析结果表明,反应器载体生物膜上的细菌类群主要是陶厄氏菌属Thauera、鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas,外硫红螺旋菌科Ectothiorho-dospiraceae、酸杆菌门Chloroflexi、绿弯菌门Acidobacteria及不可培养细菌。当反应器运行208 d时,水体中氨氮和亚硝态氮的去除率维持较高水平,两者去除率之比为1.1,表明反应器内发生了厌氧氨氧化反应。针对厌氧氨氧化细菌16S rRNA基因引物Pla46F/Amx368R-GC获得的PCR产物,采用DGGE技术对载体生物膜上的厌氧氨氧化细菌进行了检测。DGGE优势条带序列分析结果表明,在反应器中富集得到的厌氧氨氧化细菌分别与Planctomycete KSU-1、Candidatus Jettenia asiatica的相似性均为96%,可以认为它们是反应器内起厌氧氨氧化作用的主要细菌。
关键词
厌氧氨氧化反应器
生物膜
PCR—DGGE
细菌多样性
厌氧氨氧化细菌
Keywords
anaerobic
ammonium
oxidation
reactor
biofilm
PCR-DGGE
anaerobic
ammonium
oxidation
bacterium
anammox
bacterium
分类号
X172 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
分子生物学技术及其在环境样品微生物分析中的应用
张瑛
阮晓红
《河海大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2005
5
下载PDF
职称材料
2
厌氧氨氧化反应器载体生物膜细菌多样性的研究
王银华
马悦欣
刘长发
朱学惠
朱莹
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
5
下载PDF
职称材料
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