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高通量测序技术在遗传性耳聋研究中的应用及研究进展 被引量:20
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作者 王翠翠 袁慧军 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期208-219,共12页
耳聋是一种常见的严重出生缺陷,阐明遗传性耳聋的致病机理不仅能够在临床上辅助诊断,为遗传咨询及耳聋预防提供依据,而且能促进人们更深入地了解耳聋的致病机制,开发新的治疗方法。随着基因组研究技术不断创新,以全基因组测序、全外显... 耳聋是一种常见的严重出生缺陷,阐明遗传性耳聋的致病机理不仅能够在临床上辅助诊断,为遗传咨询及耳聋预防提供依据,而且能促进人们更深入地了解耳聋的致病机制,开发新的治疗方法。随着基因组研究技术不断创新,以全基因组测序、全外显子组测序、目标区域测序为代表的高通量测序技术在遗传性耳聋研究中已得到广泛应用。本文总结了近5年全外显子组测序和目标区域测序在遗传性耳聋致病基因研究及临床分子诊断中应用及研究进展,希望能够有助于我国临床耳聋基因诊断技术的发展及诊断水平的提升。 展开更多
关键词 遗传性耳聋 致病基因 全外显子组测序 目标区域测序
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脐血干细胞移植治疗白介素10受体A基因突变导致的极早发型炎症性肠病1例病例报告并文献复习 被引量:16
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作者 彭凯玥 钱晓文 +6 位作者 吴冰冰 黄志恒 芦军萍 翟晓文 王慧君 郑翠芳 黄瑛 《中国循证儿科杂志》 CSCD 北大核心 2016年第3期171-176,共6页
目的通过IL-10RA基因突变导致的炎症性肠病(IBD)病例,进一步深化认识极早发型IBD(VEO-IBD)的特点。方法报告1例VEO-IBD临床诊断(症状、体征和肠镜),全外显子组测序(WES)明确病因,脐血干细胞移植精准治疗的过程。结果患儿,女,44 d,足月,... 目的通过IL-10RA基因突变导致的炎症性肠病(IBD)病例,进一步深化认识极早发型IBD(VEO-IBD)的特点。方法报告1例VEO-IBD临床诊断(症状、体征和肠镜),全外显子组测序(WES)明确病因,脐血干细胞移植精准治疗的过程。结果患儿,女,44 d,足月,生后8 d始腹泻呈进行性加重(多至每天10~20次),持续间断发热,重度营养不良。患儿姐姐1月龄反复发热、腹泻和鹅口疮,5月龄时疑尿道瘘不治死亡。入复旦大学附属儿科医院4 d外阴皮肤红肿,渐形成肛瘘,体重2.6 kg。肠镜示直肠黏膜增生性病变,乙状结肠、降结肠可见纵行溃疡和鹅卵石样增生。予抗感染、沙利度胺6 mg·d^(-1)和美沙拉秦150 mg·d^(-1)控制肠道炎症反应,肠道内外营养支持等对症治疗。行WES明确为IL-10RA基因缺陷,获得同性别无关供者HLA基因位点8/10的脐血行干细胞移植。移植后12周嵌合体率95.7%,Sanger测序及蛋白功能验证IL-10RA基因突变点被修复,IL-10信号通路轴功能恢复正常。患儿大便逐渐成型,体重5.2 kg,结肠镜显示肠黏膜愈合,仅见少量增生和疤痕,移植后10个月大便钙卫蛋白72μg·g^(-1)。结论脐血干细胞移植作为治疗IL-10RA基因突变导致的VEO-IBD方法,值得积累更多的病例。 展开更多
关键词 炎症性肠病 极早发型 全外显子测序 白介素10受体A基因 脐血 干细胞移植
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全外显子组测序技术在产前诊断中应用的专家共识 被引量:15
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作者 全外显子组测序技术在产前诊断中的应用协作组 娄桂予 +3 位作者 侯巧芳 杨科 郭梁洁 廖世秀 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2022年第5期457-463,共7页
大规模的前瞻性研究表明,在染色体核型和染色体拷贝数分析均未见异常的胎儿中,产前全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)可将结构异常胎儿的诊断率提高8.5%~10%。产前WES目前已经在国内外逐步开展,但由于胎儿表型评估的局限性、... 大规模的前瞻性研究表明,在染色体核型和染色体拷贝数分析均未见异常的胎儿中,产前全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)可将结构异常胎儿的诊断率提高8.5%~10%。产前WES目前已经在国内外逐步开展,但由于胎儿表型评估的局限性、产前诊断的预测性质以及伦理学问题等,如何合理、规范地应用产前WES,最大限度地发挥其临床效用,成为亟待明确的问题。鉴于此,我们参考国内外最新的指南、专家共识和已发表的文献,讨论形成了本共识,对产前WES的适用群体、检测前咨询、取样及实验室检测、产前WES报告、检测后咨询、妊娠结局随访、产前WES复杂病例多学科会诊、产前WES样本与资料信息的保存等提出了建议。 展开更多
关键词 全外显子组测序 胎儿结构畸形 产前诊断 专家共识
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全外显子组测序发现中国Joubert综合征家系C5orf42基因的新突变 被引量:12
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作者 罗敏娜 曹宗富 +5 位作者 陈军 王珂 管纯一 高华方 李玉堂 马旭 《生殖医学杂志》 CAS 2017年第5期464-469,共6页
目的探究一个中国Joubert综合征家系的致病基因及位点。方法对该Joubert综合征家系的先证者进行全外显子组测序,按照ACMG解读规则筛选致病性变异位点,利用聚合酶链式反应(PCR)和Sanger测序进行验证,并在其他家庭成员及192例健康对照者... 目的探究一个中国Joubert综合征家系的致病基因及位点。方法对该Joubert综合征家系的先证者进行全外显子组测序,按照ACMG解读规则筛选致病性变异位点,利用聚合酶链式反应(PCR)和Sanger测序进行验证,并在其他家庭成员及192例健康对照者中进行测序验证。结果在先证者的5号染色体的C5orf42基因上存在2个杂合突变位点,分别为c.3676C>T,p.R1226X以及c.8310_8311insT,p.L2770fsX5,这两个位点在家系中符合遗传共分离规律。结论全外显子组测序结合Sanger测序发现C5orf42基因的c.3676C>T,p.R1226X以及c.8310_8311insT,p.L2770fsX5位点为引起该Joubert综合征家系临床病变的突变位点。 展开更多
关键词 JOUBERT综合征 C5orf42 全外显子组测序 小脑蚓部发育不全
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中国人群21种遗传代谢病的孕前携带者筛查研究 被引量:12
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作者 徐西林 何文斌 +5 位作者 王莹 龚斐 卢光琇 林戈 谭跃球 杜娟 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2022年第3期269-275,共7页
目的探讨中国育龄人群中21种遗传代谢病的携带率,为遗传咨询和生育指导提供依据,同时为新生儿遗传代谢病筛查病种的选择提供一定的参考。方法采集897位无关健康个体(包括143对夫妇)的外周血,提取DNA。应用全外显子组测序技术对该897位... 目的探讨中国育龄人群中21种遗传代谢病的携带率,为遗传咨询和生育指导提供依据,同时为新生儿遗传代谢病筛查病种的选择提供一定的参考。方法采集897位无关健康个体(包括143对夫妇)的外周血,提取DNA。应用全外显子组测序技术对该897位个体的54个基因(21种遗传代谢病的致病基因)进行检测,筛选在数据库记载的致病性/疑似致病性变异和未记载的功能丧失型变异。结果897位个体中检出数据库记载的54个致病基因中致病性/疑似致病性变异和未记载的功能丧失型变异共140个,总频次为183次,人均携带0.20个。一对夫妇同时携带SLC25A13基因致病性变异,通过胚胎植入前遗传学诊断生育一健康婴儿。检出的变异涉及40个基因,变异数频次较多的5个基因分别是ATP7B、SLC25A13、PAH、CBS和MMACHC。根据Hardy-Weinberg定律,人群中该21种遗传代谢病发病率约为1/1100,发病率较高的5种单基因病是瓜氨酸血症、甲基丙二酸血症、肝豆状核变性、糖原累积病和苯丙酮尿症。结论本研究初步明确了21种遗传代谢性疾病在中国育龄人群中的携带率及发病率,为新生儿遗传代谢病筛查病种的选择提供了参考。孕前遗传病携带者筛查是主动的一级预防措施,是阻断患儿出生的有效方法。 展开更多
关键词 全外显子组测序 孕前携带者筛查 遗传代谢性疾病 基因变异
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原发性免疫缺陷病分子诊断及新发原发性免疫缺陷病 被引量:8
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作者 毛华伟 《中国实用儿科杂志》 CSCD 北大核心 2017年第7期491-496,共6页
原发性免疫缺陷病(PID)是免疫系统1个或多个要素缺陷所致的一类罕见病,大多数PID为单基因遗传病。由于遗传的多效性与异质性,明确的分子诊断对PID精准诊治非常重要。Sanger测序和下一代测序(NGS)是PID分子诊断的主要工具。前者是检测单... 原发性免疫缺陷病(PID)是免疫系统1个或多个要素缺陷所致的一类罕见病,大多数PID为单基因遗传病。由于遗传的多效性与异质性,明确的分子诊断对PID精准诊治非常重要。Sanger测序和下一代测序(NGS)是PID分子诊断的主要工具。前者是检测单个基因以及验证NGS结果的金标准。NGS越来越多地应用于临床,但对生物信息分析的要求较高。二者各有优势与不足,需合理结合、扬长避短,才能发挥最优作用。PID分子诊断的4步法策略值得借鉴。另外,对NGS的临床应用和PID分子诊断发展的一些建议也值得学习。 展开更多
关键词 原发性免疫缺陷病 分子诊断 Sanger测序 下一代测序 全外显子组测序 全基因组测序
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基因组时代产前诊断面临的机遇和挑战 被引量:9
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作者 王艳 许争峰 《中国实用妇科与产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期797-799,共3页
自20世纪70年代开始,染色体核型分析技术作为诊断胎儿染色体异常的金标准已使用多年,但该技术存在分辨率较低(5~10Mb)、培养周期长、检测通量低及有培养失败风险等局限性。随后,靶向诊断技术(FISH、QF-PCR、MLPA)的出现,大大缩短了检测... 自20世纪70年代开始,染色体核型分析技术作为诊断胎儿染色体异常的金标准已使用多年,但该技术存在分辨率较低(5~10Mb)、培养周期长、检测通量低及有培养失败风险等局限性。随后,靶向诊断技术(FISH、QF-PCR、MLPA)的出现,大大缩短了检测时间,与染色体核型技术联合应用,可早期诊断常见的胎儿染色体异常。此外,Sanger测序作为基因变异检测的金标准,可用于明确致病的单基因疾病的产前诊断。然而,以上技术均无法实现在全基因组范围内进行快速、高分辨率地诊断胎儿致病性变异。 展开更多
关键词 产前诊断 染色体微阵列分析 全外显子组测序 全基因组测序 遗传咨询
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对传统产前诊断阴性的先天性发育异常胎儿家系应用全外显子测序技术的分析 被引量:9
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作者 符芳 黎璐珊 +17 位作者 杜坤 李茹 喻秋霞 王丹 雷婷缨 邓琼 聂志强 张雯雯 杨昕 韩瑾 甄理 潘敏 张丽娜 黎福成 张永玲 景象一 李东至 廖灿 《中华妇产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期458-466,共9页
目的评估全外显子测序技术(WES)在产前临床应用于传统产前诊断阴性的异常胎儿的价值。方法对2014年1月至2019年12月在广州市妇女儿童医疗中心行侵入性产前诊断[包括G显带染色体核型分析和(或)染色体微阵列分析(CMA)检测],结果为阴性的1... 目的评估全外显子测序技术(WES)在产前临床应用于传统产前诊断阴性的异常胎儿的价值。方法对2014年1月至2019年12月在广州市妇女儿童医疗中心行侵入性产前诊断[包括G显带染色体核型分析和(或)染色体微阵列分析(CMA)检测],结果为阴性的1152例先天性发育异常(包括先天性结构畸形及超声软指标异常)胎儿进行核心家系WES检测。根据WES检测的时间节点与妊娠终止的关系,分为回顾组(妊娠已终止)及前瞻组(妊娠未终止)。根据胎儿畸形的具体发生部位区分各器官畸形亚组,并根据家族史情况分亚组。随访所有入选胎儿的临床预后,并统计WES检测结果对妊娠决策及临床干预的影响。根据随访结果,对初次WES检测未获得阳性诊断但孕晚期或出生后有新增表型胎儿的数据进行重分析。结果接受WES检测的1152个家系中有5例检出非胎儿生物学父母而被剔除,其余1147例中共152例胎儿获得阳性诊断(13.3%,152/1147),包括回顾组74例(16.1%,74/460),前瞻组78例(11.4%,78/687)。对未获得阳性诊断但孕晚期或出生后出现新增表型的胎儿进行WES检测数据的重分析,阳性诊断率为4.9%(8/163)。共34例(21.3%,34/160)受检者的妊娠结局及临床干预直接受对应的WES阳性诊断影响。在诊断性变异为4级的68例活产儿中,29例(42.7%,29/68)通过快速回顾WES结果获得了适当的医学干预。结论WES对染色体核型分析和(或)CMA阴性的异常胎儿可额外提高13.3%的检出率。产前WES可指导妊娠决策及早期临床干预。重视妊娠晚期及胎儿出生后的专科随访并进行WES数据重分析是提高检出率的有效策略。 展开更多
关键词 全外显子组测序 先天畸形 产前诊断 系谱 结果可重复性
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CCDC39基因突变致原发性纤毛运动障碍1例及其遗传咨询和产前诊断 被引量:9
9
作者 祁媛媛 洪达 +4 位作者 王慧君 张晓波 王立波 金婷婷 钱莉玲 《中国循证儿科杂志》 CSCD 北大核心 2016年第6期445-449,共5页
目的探讨对原发性纤毛运动障碍(PCD)患儿进行基因检测对指导优生优育的意义。方法对1例临床诊断Kartagener综合征并随访4年的患儿进行家系全外显子组测序(WES),经高通量测序数据分析及临床诊断流程确定致病基因突变,根据基因诊断结果行... 目的探讨对原发性纤毛运动障碍(PCD)患儿进行基因检测对指导优生优育的意义。方法对1例临床诊断Kartagener综合征并随访4年的患儿进行家系全外显子组测序(WES),经高通量测序数据分析及临床诊断流程确定致病基因突变,根据基因诊断结果行针对性遗传咨询后对患儿母亲第2胎行羊水穿刺,分离羊水脱落细胞,提取基因组DNA并PCR扩增羊水脱落细胞相应基因突变所在外显子,行直接Sanger测序。结果临床随访发现患儿肺功能较诊断时明显下降,胸部CT支气管扩张较前加重。WES患儿中检测到CCDC39基因c.1819A>A/T,p.K607X无义突变和c.2447_2448het_del CA,p.T816Kfs*3移码突变,2个突变均为未报道的新突变,均经功能预测工具Mutation Taster预测为致病突变,分析父母突变来源确定为复合杂合突变。同时结合患儿支气管黏膜活检电镜特征性的纤毛结构异常,认定该复合杂合突变为患儿的致病突变。患儿母亲第2胎羊水细胞CCDC39基因2个突变位点所在外显子的Sanger测序结果显示,胎儿携带母亲来源的移码突变,无父亲的无义突变,为单杂合突变携带者。结论采用WES检测有助于明确PCD患儿的遗传病因,在此基础上对患儿家庭行遗传咨询和产前基因诊断,可以指导优生优育。 展开更多
关键词 原发性纤毛运动障碍 全外显子组测序 遗传咨询 产前诊断
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Histologic features and genomic alterations of primary colorectal adenocarcinoma predict growth patterns of liver metastasis 被引量:7
10
作者 Jing-Bo Wu Ali Lopez Sarmiento +4 位作者 Pierre-Olivier Fiset Anthula Lazaris Peter Metrakos Stephanie Petrillo Zu-Hua Gao 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2019年第26期3408-3425,共18页
BACKGROUND Different histological growth patterns(HGPs)of colorectal carcinoma(CRC)liver metastasis are associated with patients’prognosis and response to antiangiogenic therapy.However,the relationship between HGPs ... BACKGROUND Different histological growth patterns(HGPs)of colorectal carcinoma(CRC)liver metastasis are associated with patients’prognosis and response to antiangiogenic therapy.However,the relationship between HGPs of liver metastasis and clinicopathological and genomic characteristics of primary cancer has not been well established.AIM To assess whether certain clinicopathological and genomic features of primary CRC could predict the HGPs of liver metastasis.METHODS A total of 29 patients with paired resections of both primary CRC and liver metastasis were divided into two groups:A(15 cases with desmoplastic liver metastasis)and B(14 cases with replacement liver metastasis).Clinical information was obtained from patients’charts.Mismatch repair proteins,BRAFV600E,and PD-L1 were evaluated by immunohistochemistry.Five cases were selected randomly from each group for whole exome sequencing(WES)analysis.RESULTS In the primary tumor,expanding growth pattern,low tumor budding score(TBS),and Crohn’s disease-like response(CDR)were associated with desmoplastic liver metastasis and better overall survival,whereas infiltrating growth pattern alone of primary carcinoma could predict the replacement liver metastasis and worse overall survival(P<0.05).On WES analysis,primary carcinoma with desmoplastic liver metastasis showed mutations in APC(4/5);TP53(3/5);KRAS,PIK3CA,and FAT4(2/5);BRCA-1,BRCA2,BRAF,and DNAH5(1/5),whereas primary carcinoma with replacement liver metastasis showed mutations in APC and TP53(3/5);KRAS,FAT4,DNH5,SMAD,ERBB2,ERBB3,LRP1,and SDK1(1/5).CONCLUSION The HGPs,TBS,and CDR of primary CRC as well as the presence of specific genetic mutations such as those in PIK3CA could be used to predict the HGPs of liver metastasis,response to therapy,and patients’prognosis. 展开更多
关键词 COLORECTAL carcinoma Liver metastasis HISTOLOGIC growth pattern CLINICOPATHOLOGICAL characteristics whole exome sequencing
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全外显子测序技术在癫痫患儿致病基因检测中应用价值 被引量:8
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作者 张冰 杨科 +5 位作者 张玉薇 肖海 张倩 娄桂予 祁娜 廖世秀 《中华实用诊断与治疗杂志》 2021年第4期412-415,共4页
目的应用全外显子测序技术对2例癫痫患儿进行基因检测以明确诊断,探讨全外显子测序技术对癫痫的基因诊断价值。方法分别提取2例癫痫患儿(患儿1、2)及其父母的外周血DNA,采用全外显子测序技术对其进行基因检测,采用Sanger测序法对2例患... 目的应用全外显子测序技术对2例癫痫患儿进行基因检测以明确诊断,探讨全外显子测序技术对癫痫的基因诊断价值。方法分别提取2例癫痫患儿(患儿1、2)及其父母的外周血DNA,采用全外显子测序技术对其进行基因检测,采用Sanger测序法对2例患儿及其父母的可疑致病基因变异进行验证。明确病因后,分别抽取2例孕妇(患儿母亲)的羊水,提取胎儿DNA,采用Sanger测序法进一步对胎儿进行产前诊断。结果患儿1 SCN2A基因存在c.4399C>G错义杂合变异,其父母该位点均为野生型,胎儿该位点也为野生型,其父母选择继续妊娠;患儿2 TBC1D24基因存在c.76G>T和c.1595C>G复合杂合变异,分别遗传自其父母,胎儿为c.76G>T杂合变异携带者,其父母选择继续妊娠。结论 TBC1D24基因c.76G>T和c.1595C>G复合杂合变异、SCN2A基因c.4399C>G杂合变异可能是癫痫患儿的致病原因,全外显子测序技术可快速、准确地对癫痫进行基因诊断。 展开更多
关键词 癫痫 TBC1D24基因 SCN2A基因 全外显子测序技术
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全外显子组测序技术用于妊娠早中期严重肢体短小胎儿的病因分析 被引量:8
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作者 张鑫悦 游艳琴 +5 位作者 周红辉 汪淑娟 谢潇潇 张蔓丽 汪龙霞 卢彦平 《中华妇产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期221-225,共5页
目的使用全外显子组测序(WES)为妊娠早、中期严重肢体短小胎儿查找致病原因。方法收集2016年9月至2018年6月解放军总医院收治的妊娠早、中期严重肢体短小胎儿共13例。13例孕妇知情同意后均引产,其中6例同时取羊水行染色体核型分析;引产... 目的使用全外显子组测序(WES)为妊娠早、中期严重肢体短小胎儿查找致病原因。方法收集2016年9月至2018年6月解放军总医院收治的妊娠早、中期严重肢体短小胎儿共13例。13例孕妇知情同意后均引产,其中6例同时取羊水行染色体核型分析;引产后取胎儿组织提取基因组DNA,行全基因组拷贝数变异(CNV)检测和WES,并对WES检测到的可疑致病位点行Sanger测序验证。结果行染色体核型分析的6例胎儿染色体核型均未见异常;13例胎儿CNV检测均未见变异。13例胎儿的WES结果示,10例胎儿发现致病或可能致病的调控骨骼系统发育的关键基因突变,包括COL2A1、FGFR3、COL1A1、COL1A2、DYNC2LI1、TRIP11基因等;余3例未发现疾病相关性较高的基因变异。WES对妊娠早、中期严重肢体短小胎儿的诊断率为10/13。结论妊娠早、中期胎儿严重肢体短小多为单基因遗传病,使用WES的诊断率高,可为大部分患儿查明致病原因。 展开更多
关键词 骨疾病 发育性 妊娠初期 妊娠中期 全外显子组测序 DNA拷贝数变异
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Unexpected metastasis of intraductal papillary neoplasm of the bile duct without an invasive component to the brain and lungs:A case report 被引量:6
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作者 Nguyen Hai Nam Kojiro Taura +7 位作者 Masashi Kanai Keita Fukuyama Norimitsu Uza Hirona Maeda Yojiro Yutaka Toyofumi F Chen-Yoshikawa Manabu Muto Shinji Uemoto 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2020年第3期366-374,共9页
BACKGROUND Despite an expanding number of studies on intraductal papillary neoplasm of the bile duct(IPNB),distant metastasis remains unexplained especially in cases of carcinoma in situ.In the present study,we report... BACKGROUND Despite an expanding number of studies on intraductal papillary neoplasm of the bile duct(IPNB),distant metastasis remains unexplained especially in cases of carcinoma in situ.In the present study,we report a rare and interesting case of IPNB without invasive components that later metastasized to lungs and brain.CASE SUMMARY A 69-year-old male was referred to our hospital due to suspected cholangiocarcinoma.Laboratory tests on admission reported a mild elevation of alkaline phosphatase,γ-glutamyl transpeptidase,and total bilirubin in serum.Endoscopic retrograde cholangiography revealed a filling defect in the common bile duct(CBD)extending to the left hepatic duct.Peroral cholangioscopy delineated a tumor in the CBD that had a papillary pattern.Multidetector computed tomography and magnetic resonance cholangiopancreatography detected partial blockage ot interlude in the CBD leading to cholestasis without evidence of metastasis.Therefore,a diagnosis of IPNB cT1N0M0 was established.Left hepatectomy with bile duct reconstruction was performed.Pathological examination confirmed an intraepithelial neoplasia pattern without an invasive component and an R0 resection achievement.The patient was monitored carefully by regular examinations.However,at 32 mo after the operation,a 26 mm tumor in the lungs and a 12 mm lesion in the brain were detected following a suspicious elevated CA 19-9 level.Video-assisted thoracoscopic surgery of left upper lobectomy and stereotactic radiotherapy are indicated.In addition to histopathological results,a genomic profiling analysis using whole exome sequencing subsequently confirmed lung metastasis originating from bile duct cancer.CONCLUSION This case highlights the important role of genomic profiling analysis using whole exome sequencing in identifying the origin of metastasis in patients with IPNB. 展开更多
关键词 Intraductal papillary neoplasm of the bile duct Distant metastasis Invasive component whole exome sequencing CA 19-9 Case report
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CREBBP基因突变所致Rubinstein-Taybi综合征1例 被引量:7
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作者 罗敏娜 曹宗富 +5 位作者 王琳 张艳萍 魏莹 高华方 陈剑虹 马旭 《生殖医学杂志》 CAS 2017年第6期552-556,共5页
目的分析1例Rubinstein-Taybi综合征的临床及遗传学特点。方法对惠州第一妇幼保健院疑似Rubinstein-Taybi综合征病例进行临床分析,同时提取先证者DNA进行全外显子组测序,筛选致病突变位点,用Sanger测序对突变位点进行验证。结果在患儿... 目的分析1例Rubinstein-Taybi综合征的临床及遗传学特点。方法对惠州第一妇幼保健院疑似Rubinstein-Taybi综合征病例进行临床分析,同时提取先证者DNA进行全外显子组测序,筛选致病突变位点,用Sanger测序对突变位点进行验证。结果在患儿的16号染色体CREBBP基因上存在1个杂合突变位点c.5790delC,这个位点的缺失造成了蛋白质翻译的提前终止。该位点在其父母中均未发生突变,为de novo突变。结论全外显子组测序结合Sanger测序发现CREBBP基因的c.5790delC位点为引起该Rubinstein-Taybi综合征的突变位点。 展开更多
关键词 Rubinstein-Taybi综合征 CREBBP基因 全外显子组测序 发育迟缓 宽拇指(趾)
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全外显子组测序在危重症新生儿单基因遗传病中的临床应用 被引量:7
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作者 齐志业 段江 +4 位作者 贺湘英 钟庆华 张彩营 谢云波 梁琨 《中国当代儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期640-643,共4页
目的探讨全外显子组测序(WES)检测技术在危重症新生儿单基因遗传病中的临床应用价值及意义.方法选取2016年6月至2018年12月收治的怀疑有遗传性疾病或临床诊断不明确的危重症新生儿为研究对象,采集患儿及父母全血标本进行WES检测.对检测... 目的探讨全外显子组测序(WES)检测技术在危重症新生儿单基因遗传病中的临床应用价值及意义.方法选取2016年6月至2018年12月收治的怀疑有遗传性疾病或临床诊断不明确的危重症新生儿为研究对象,采集患儿及父母全血标本进行WES检测.对检测出的基因变异进行分类,寻找与临床表现相关的变异,并进行Sanger测序验证.结果共纳入新生儿45例,男22例,女23例,中位发病日龄为2.0 d.经分子诊断确诊单基因遗传病患儿12例,诊断阳性率为27%,中位确诊日龄为31.5 d,其中与部分临床表型相关、但经对患儿临床表型再次进行补充与分析后诊断为单基因遗传病者占42%(5/12).确诊单基因遗传病的患儿经临床治疗后好转率为67%(8/12).结论 WES检测技术是寻找危重症新生儿单基因遗传病基因变异的有力工具,并可在临床决策中起到关键作用,但数据结果的解读还需要临床医生结合患儿的表型与WES检测结果综合分析. 展开更多
关键词 单基因遗传病 全外显子组测序 新生儿
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高通量测序技术在智力障碍/全面发育迟缓中的临床应用 被引量:6
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作者 孙昱 傅启华 余永国 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期84-88,共5页
智力障碍是一组常见的神经发育障碍性疾病,基因型和表型的异质性都很高,对其的明确诊断越来越依赖全基因组范围内的分子诊断。基于高通量测序(NGS)的panel测序,全外显组测序甚至全基因组测序在智障的分子诊断上都有很好的应用,推荐家系... 智力障碍是一组常见的神经发育障碍性疾病,基因型和表型的异质性都很高,对其的明确诊断越来越依赖全基因组范围内的分子诊断。基于高通量测序(NGS)的panel测序,全外显组测序甚至全基因组测序在智障的分子诊断上都有很好的应用,推荐家系全外显组测序,特别是家系全外作为首选检测方法。针对智障的的NGS数据分析以及重分析对诊断有临床意义,可以可靠检测出基因组内的小尺度突变及拷贝数变异。因此有可能会成为下一个推荐的智障分子诊断技术。 展开更多
关键词 智力障碍 高通量测序 全外显组测序 突变
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全外显子测序产前诊断Walker-Warburg综合征 被引量:6
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作者 乔凤昌 胡平 +5 位作者 林颖 王艳 李航 季修庆 罗春玉 许争峰 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2018年第5期321-323,共3页
目的利用全外显子测序技术对患有脑积水和先天性心脏病的胎儿进行产前诊断,并指导再次妊娠。方法提取胎儿羊水细胞DNA以及父母外周血DNA,采用外显子测序技术进行检测,经过建库、杂交捕获、测序等过程,将得到的数据经过比对、软件分析、... 目的利用全外显子测序技术对患有脑积水和先天性心脏病的胎儿进行产前诊断,并指导再次妊娠。方法提取胎儿羊水细胞DNA以及父母外周血DNA,采用外显子测序技术进行检测,经过建库、杂交捕获、测序等过程,将得到的数据经过比对、软件分析、查找数据库及文献等,根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG,2015)原则寻找胎儿的致病基因,并利用Sanger测序对致病位点进行验证。结果全外显子测序技术检测结果发现患儿POMT1基因发生复合杂合突变,分别遗传自母亲的经典剪切位点突变c.605+1G>A(IVS7)和遗传自父亲的移码突变c.1367_c.1368(exon 15)ins GA,p.L456Lfs*80;Sanger测序验证结果与外显子捕获测序结果一致。胎儿为Walker-Warburg综合征患者。胎儿父母最终决定终止妊娠。结论利用全外显子测序技术可快速可靠地诊断Walker-Warburg综合征患者,在临床决策及产前咨询中发挥重要作用。 展开更多
关键词 全外显子测序技术 POMT1 Walker-Warburg综合征 基因突变 产前诊断
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SCN8A基因变异致癫痫5例患儿的临床特征及遗传学分析 被引量:2
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作者 张新 邱世彦 +3 位作者 杨莉 李玉芬 徐那 余西西 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2024年第2期174-180,共7页
目的探讨5例SCN8A基因变异所致癫痫患儿的临床及遗传学特点。方法收集2015年8月至2022年8月在临沂市人民医院拟诊为遗传性癫痫患儿的临床资料,对其进行家系全外显子组测序,对候选变异进行Sanger测序家系验证。结果共筛选出5例(4男1女)携... 目的探讨5例SCN8A基因变异所致癫痫患儿的临床及遗传学特点。方法收集2015年8月至2022年8月在临沂市人民医院拟诊为遗传性癫痫患儿的临床资料,对其进行家系全外显子组测序,对候选变异进行Sanger测序家系验证。结果共筛选出5例(4男1女)携带SCN8A变异的患儿。患儿1具有良性家族性婴儿癫痫,携带遗传自父亲(具有相似表型)的c.4840A>G变异,为已报道致病性变异。患儿2~4为中间型癫痫。患儿2携带c.3967G>A新发变异,根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)相关指南评级为致病性变异(PS1+PS2+PM1+PM2Supporting+PP3),患儿3携带c.415A>T变异,患儿4携带c.4697C>T新发变异,均评级为可能致病性变异(PS2+PM1+PM2Supporting+PP3)。患儿5具有早期婴儿癫痫性脑病,之后转变为类Lennox-Gastaut综合征,携带c.5615G>A新发变异,为已报道致病性变异。5例患儿的首次发病年龄为2~14个月,均存在局灶性发作和全面强直阵挛发作,患儿1、2、3、5具有丛集性发作的特点,患儿1~4单药或双药治疗后发作得到控制,生长发育正常,患儿5属于药物难治性癫痫,且存在严重的发育落后。结论上述5例癫痫患儿均存在成簇发作、良性癫痫成年期偶尔发作、中间型癫痫停药易复发的新特点,SCN8A基因变异考虑为其致病原因。 展开更多
关键词 SCN8A基因 癫痫 全外显子组测序 基因变异
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骨骼发育不良的分子遗传学研究进展 被引量:6
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作者 林嘉琛 陈伟圣 +1 位作者 吴志宏 吴南 《国际药学研究杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期178-185,189,共9页
骨骼发育不良(SD)是一组以全身骨骼生长发育障碍为特征的遗传性骨骼系统疾病,其临床表型具有多样性和复杂性。分子诊断技术可帮助临床医师明确疾病的类型、病因和转归。全外显子组测序(WES)目前作为基因组学中被广泛应用的技术,在SD的... 骨骼发育不良(SD)是一组以全身骨骼生长发育障碍为特征的遗传性骨骼系统疾病,其临床表型具有多样性和复杂性。分子诊断技术可帮助临床医师明确疾病的类型、病因和转归。全外显子组测序(WES)目前作为基因组学中被广泛应用的技术,在SD的致病突变和发病机制研究中取得了显著成果。本文就近3年来应用WES在SD领域的分子遗传学研究进展进行综述。 展开更多
关键词 遗传性骨骼疾病 致病突变 全外显子组测序 骨骼发育不良 分子诊断
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全外显子组测序技术及其在遗传性耳聋研究中的应用 被引量:6
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作者 姜海鸥 全庆丽 +1 位作者 胡祥上 王义旺 《中华耳科学杂志》 CSCD 北大核心 2015年第1期179-182,共4页
近年来,全外显子组测序技术迅猛发展,为遗传疾病的基因研究带来了新的机遇,受到遗传学多个领域的重视与应用,其在遗传性耳聋的应用也日益受到关注。该技术先应用靶向富集技术捕获基因组的外显子区域,再通过高通量测序获得编码区序列遗... 近年来,全外显子组测序技术迅猛发展,为遗传疾病的基因研究带来了新的机遇,受到遗传学多个领域的重视与应用,其在遗传性耳聋的应用也日益受到关注。该技术先应用靶向富集技术捕获基因组的外显子区域,再通过高通量测序获得编码区序列遗传信息。本文主要介绍全外显子组测序的技术路线及在遗传性耳聋中的应用与研究成果。 展开更多
关键词 外显子组测序 遗传性耳聋 致病基因
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