目的探讨引起本地区手足口病病原谱构成及其肠道病毒71型（Enterovirus 71,EV71）的分子特征,为手足口病的综合防治提供科学依据。方法采集501例临床表现为手足口病感染者的标本及其相关临床资料,通过real time RT-PCR方法确定肠道病毒...目的探讨引起本地区手足口病病原谱构成及其肠道病毒71型（Enterovirus 71,EV71）的分子特征,为手足口病的综合防治提供科学依据。方法采集501例临床表现为手足口病感染者的标本及其相关临床资料,通过real time RT-PCR方法确定肠道病毒型别,对EV71型分离株进行VP1片段测序,测序结果利用DNAStar软件进行核苷酸、氨基酸序列分析和同源性比较,并用Mega 5.0软件构建系统发生树。结果通过real time RT-PCR特异性检测发现,EV71、Cox A16和其他肠道病毒的阳性率分别为56.69%（284/501）、10.38%（52/501）、13.17%（66/501）。测序结果表明12株EV71分离株之间的VP1基因核苷酸同源性为97.9%-99.6%,氨基酸同源性为99.3%-100%。构建系统发生树表明,12株病毒基因与C基因型代表株与C4基因亚型最为相近,并且可进一步划分为C4a进化枝。说明本研究的12株病毒皆属于EV71病毒C基因型、C4a亚型。结论 EV71和CoxA16是本地区手足口病的主要病原体,因此加强EV71和Cox A16的监测特别是EV71的检测,有助于更好地预防和控制手足口病。EV71型惠州分离株均属于C4基因亚型的C4a进化分支,与2004年以来的中国大陆EV71病毒流行的基因型完全一致。展开更多
文摘目的探讨引起本地区手足口病病原谱构成及其肠道病毒71型（Enterovirus 71,EV71）的分子特征,为手足口病的综合防治提供科学依据。方法采集501例临床表现为手足口病感染者的标本及其相关临床资料,通过real time RT-PCR方法确定肠道病毒型别,对EV71型分离株进行VP1片段测序,测序结果利用DNAStar软件进行核苷酸、氨基酸序列分析和同源性比较,并用Mega 5.0软件构建系统发生树。结果通过real time RT-PCR特异性检测发现,EV71、Cox A16和其他肠道病毒的阳性率分别为56.69%（284/501）、10.38%（52/501）、13.17%（66/501）。测序结果表明12株EV71分离株之间的VP1基因核苷酸同源性为97.9%-99.6%,氨基酸同源性为99.3%-100%。构建系统发生树表明,12株病毒基因与C基因型代表株与C4基因亚型最为相近,并且可进一步划分为C4a进化枝。说明本研究的12株病毒皆属于EV71病毒C基因型、C4a亚型。结论 EV71和CoxA16是本地区手足口病的主要病原体,因此加强EV71和Cox A16的监测特别是EV71的检测,有助于更好地预防和控制手足口病。EV71型惠州分离株均属于C4基因亚型的C4a进化分支,与2004年以来的中国大陆EV71病毒流行的基因型完全一致。
