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蔬菜保护地木霉菌rDNA-ITS序列和UP-PCR遗传多样性分析 被引量：14
1
作者 贺字典 高增贵 +2 位作者 高玉峰 赵柏霞 张小飞 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期459-465,共7页
采用传统形态学分类和ITS序列比对的方法,研究蔬菜保护地土壤中木霉菌种群分布和遗传多样性。木霉菌分离培养结果显示,共获得397株木霉菌,鉴定出11个种,分别为:长枝木霉Trichoderma longibrachiatum、深绿木霉T.atroviride、哈茨木霉T.h... 采用传统形态学分类和ITS序列比对的方法,研究蔬菜保护地土壤中木霉菌种群分布和遗传多样性。木霉菌分离培养结果显示,共获得397株木霉菌,鉴定出11个种,分别为:长枝木霉Trichoderma longibrachiatum、深绿木霉T.atroviride、哈茨木霉T.harzianum、粘绿木霉T.viren、微孢木霉T.minutisporum、拟康木霉T.pseudokoningii、黄绿木霉T.aureoviride、非钩木霉T.inhamatum、棘孢木霉T.asperellum、长孢木霉T.longipile和螺旋木霉T.helicum。经ITS序列建立系统发育树后,将木霉菌分为5个组。用5条通用引物经UP-PCR扩增后,扩增出46条谱带,其中多态性条带43条,占总条带数的93.5%。遗传多样性分析表明,当相似系数为0.80时,可将24个菌株划分为9个组。UP-PCR与ITS序列相比,更能体现木霉菌种间和种内的亲缘关系及遗传差异性,可以作为木霉菌分类的辅助方法。 展开更多
关键词 木霉菌 ITS 通用引物pcr 遗传多样性
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应用UP-PCR进行玉米丝黑穗病菌遗传多样性研究 被引量：10
2
作者 张小飞 高增贵 +2 位作者 庄敬华 赵辉 赵柏霞 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期95-98,共4页
本研究探讨了UP-PCR技术在玉米丝黑穗病菌遗传多样性分析中的利用可行性。在13个通用引物中，筛选出9个扩增多态性好且稳定的通用引物，共扩增出113条DNA条带，大小分布于250~2000bp之间，其中多态性条带为95条，为总条带数的84．07％... 本研究探讨了UP-PCR技术在玉米丝黑穗病菌遗传多样性分析中的利用可行性。在13个通用引物中，筛选出9个扩增多态性好且稳定的通用引物，共扩增出113条DNA条带，大小分布于250~2000bp之间，其中多态性条带为95条，为总条带数的84．07％。遗传距离为0．76处时，所有丝黑穗病菌菌株被聚为6个组。利用UP-PCR技术，可以充分展现玉米丝黑穗病菌菌株间的亲缘关系及差异性，可用于玉米丝黑穗病菌遗传多样性研究，为有效地开展玉米丝黑穗病菌的遗传进化甚至探讨病菌致病性的生理分化提供了一个新的技术方法。 展开更多
关键词 玉米丝黑穗病菌 UP-pcr 遗传多样性
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瓜类保护地土壤镰孢菌种群及UP-PCR多样性分析 被引量：9
3
作者 赵柏霞 高增贵 +2 位作者 庄敬华 张小飞 赵辉 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期857-862,共6页
对采自辽宁省部分地区瓜类保护地的36份土壤样品进行镰孢菌(Fusarium)分离培养,共获得112株镰孢菌,采用传统形态学分类和现代分子生物学方法,确定属于11个种.对其中25株镰孢菌及3株对照镰孢菌进行了通用引物PCR(UP-PCR)多样性分析.结果... 对采自辽宁省部分地区瓜类保护地的36份土壤样品进行镰孢菌(Fusarium)分离培养,共获得112株镰孢菌,采用传统形态学分类和现代分子生物学方法,确定属于11个种.对其中25株镰孢菌及3株对照镰孢菌进行了通用引物PCR(UP-PCR)多样性分析.结果表明:6条引物扩增出73条带,其中多态性条带66条,占总条带数的90.4%.对供试菌株进行UP-PCR聚类图谱分析,当相似系数为0.736时,可将其划分为8个类群,其中14株尖孢镰孢菌聚为一类.UP-PCR分析体现了镰孢菌菌株间的亲缘关系及差异性,可以作为镰孢菌分类的辅助方法. 展开更多
关键词 镰孢菌 形态学鉴定 UP-pcr 遗传多样性
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隐匿柄锈菌(小麦叶锈病菌)UP-PCR遗传多样性分析 被引量：7
4
作者 张林亚 孟庆芳 +3 位作者 康健 杨文香 闫红飞 刘大群 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期215-226,共12页
小麦叶锈病是世界麦区普遍发生的病害。以2008年采集于河北省的29个隐匿柄锈菌(小麦叶锈病菌)单孢子堆分离菌系为试验材料,利用39个小麦抗叶锈近等(单)基因系和7个UP-PCR(Universally Primed PCR)引物对其进行毒性多态性和分子多态性分... 小麦叶锈病是世界麦区普遍发生的病害。以2008年采集于河北省的29个隐匿柄锈菌(小麦叶锈病菌)单孢子堆分离菌系为试验材料,利用39个小麦抗叶锈近等(单)基因系和7个UP-PCR(Universally Primed PCR)引物对其进行毒性多态性和分子多态性分析。7个UP-PCR引物共检测出48条条带,其中多态性条带41条,多态性百分率为85.42%,表明UP-PCR在隐匿柄锈菌中扩增多态性较高;经聚类分析,遗传相似系数为0.69–0.90,在相似系数0.72处,29个叶锈菌株聚为6组,体现了隐匿柄锈菌菌株间的亲缘关系和差异性,表明UP-PCR技术可用于小麦叶锈病菌群体遗传多样性研究。在物种水平上,隐匿柄锈菌观察等位基因数(Na)为1.85,有效等位基因数(Ne)为1.29,Nei’s基因多样性指数(H)为0.19,Shannon信息指数(I)为0.31,多态位点百分率(P)为85.42%,表明隐匿柄锈菌遗传多样性丰富,其中沧州的群体遗传多样性水平最高,群体内多样性大于群体间多样性。聚类分析表明沧州和石家庄的病菌群体亲缘关系最近,邢台与石家庄的群体亲缘关系最远。隐匿柄锈菌UP-PCR多态性与毒性多态性间无明显相关性,且两者均与地理来源无相关性。 展开更多
关键词 隐匿柄锈菌 小麦叶锈病 通用引物 毒性鉴定 遗传结构
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蔬菜保护地土壤木霉菌的UP-PCR多样性 被引量：1
5
作者 贺字典 高增贵 高玉峰 《河北科技师范学院学报》 CAS 2010年第3期70-74,共5页
为明确蔬菜保护地土壤中木霉菌的遗传多样性,采用通用引物PCR对蔬菜保护地部分土壤样品中分离到的木霉菌进行了多样性分析,并用UPMGA法对供试菌株的扩增片段数据进行图谱聚类分析。从13条通用引物中筛选出5条引物,分别为3-2,AS4,AS15 in... 为明确蔬菜保护地土壤中木霉菌的遗传多样性,采用通用引物PCR对蔬菜保护地部分土壤样品中分离到的木霉菌进行了多样性分析,并用UPMGA法对供试菌株的扩增片段数据进行图谱聚类分析。从13条通用引物中筛选出5条引物,分别为3-2,AS4,AS15 inv,AS19和L45;扩增出46条谱带,其中多态性条带43条,占总条带数的93.5%。当相似系数为0.74时,可将24个菌株划分为9个组,分别为A1,A2,B1,B2,B3,B4,B5,C1和C2。 展开更多
关键词 木霉菌(Trichoderma) UP-pcr 遗传多样性
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