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可可泛素结合酶基因家族的生物信息学初步分析 被引量:5
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作者 赵秋芳 董晨 +2 位作者 决登伟 陈宏良 贾利强 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2016年第9期1732-1740,共9页
泛素结合酶(E2s)促进底物泛素化或者与E3s链接,是靶蛋白泛素化的关键酶,在泛素-蛋白酶体途径中起重要作用。利用可可(Theobroma cacao L.)全基因组测序数据,共鉴定出45个E2s基因家族成员,包括39个UBC和6个UEV基因。通过生物信息学方... 泛素结合酶(E2s)促进底物泛素化或者与E3s链接,是靶蛋白泛素化的关键酶,在泛素-蛋白酶体途径中起重要作用。利用可可(Theobroma cacao L.)全基因组测序数据,共鉴定出45个E2s基因家族成员,包括39个UBC和6个UEV基因。通过生物信息学方法,对可可E2s家族的基本理化性质、基因结构、二级结构预测、亚细胞定位、进化关系等方面进行初步分析。结果表明:可可E2s基因CDS长度在441(Tc UEV3)~3 651 bp(Tc UBC7)之间,对应的编码蛋白氨基酸数目在146(Tc UEV3)~1 216 aa(Tc UBC7)之间,编码蛋白分子量在16.39~134.71 ku之间。E2s基因外显子在1~11之间,多数基因外显子数目在5~7之间。E2s基因在10条染色体上均有分布,1号染色体为7个,数量最多;6号染色体2个基因,数量最少。可可E2s蛋白大多为不稳定蛋白,且均为亲水性蛋白,其二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主要构成元件。大多数可可E2s蛋白定位在细胞核,少数定位在内质网或者细胞质。进化树分析表明:可可E2s蛋白被分为20个亚家族,包括16个UBC亚家族和4个UEV亚家族,第Ⅵ亚家族E2s数目最多为9个;E2s家族蛋白在物种进化过程中具有高度保守性。 展开更多
关键词 可可 泛素结合酶(e2s) 基因家族 生物信息学
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玉米泛素结合酶基因家族的生物信息学及表达分析 被引量:5
2
作者 陈曙 赵秋芳 +1 位作者 陈宏良 贾利强 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期1476-1483,共8页
【目的】利用生物信息学分析玉米泛素结合酶(E2)基因家族的理化性质和功能,并研究低磷处理下泛素E2基因在玉米幼苗不同组织部位的表达情况,为深入研究泛素E2基因响应低磷胁迫的分子机制提供理论参考。【方法】以MEGA 6.0邻接法(NJ)构建... 【目的】利用生物信息学分析玉米泛素结合酶(E2)基因家族的理化性质和功能,并研究低磷处理下泛素E2基因在玉米幼苗不同组织部位的表达情况,为深入研究泛素E2基因响应低磷胁迫的分子机制提供理论参考。【方法】以MEGA 6.0邻接法(NJ)构建拟南芥、水稻和玉米E2基因家族成员的系统发育进化树,利用生物信息学方法对75个玉米E2基因进行序列分析及理化性质预测。对玉米幼苗进行低磷处理,分别在0、1、6和24 h时采集其根部和叶片样品,并分别通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测其E2亚家族XVIII成员基因即ZmUBC17、ZmUBC18、ZmUBC48、ZmUBC57和ZmUBC58在玉米幼苗不同组织中的表达情况。【结果】拟南芥、水稻和玉米的E2基因可划分为18个亚家族,各亚家族间基因功能和进化关系较相近,但含有的E2基因数量差异明显,以亚家族VI的成员最多,亚家族X、XII和XV的成员数最少,均为3个,各亚家族中均分别含拟南芥、水稻和玉米E2基因各1个。玉米E2基因的编码区序列(CDS)长度为402~2616 bp,编码133~871个氨基酸,外显子数目数量存在明显差异,以4~6个居多,最少为1个,最多为12个。86.8%的玉米E2蛋白为不稳定蛋白。玉米E2亚家族XVIII成员中,ZmUBC18、ZmUBC48、ZmUBC57和ZmUBC58蛋白UBC结构域序列具有高度相似性,但与ZmUBC17存在明显差异,且这4个基因在玉米根和叶中均有表达,基因表达模式相似,整体上在低磷处理6 h时的表达量最高;低磷处理下ZmUBC17基因在根中不同时间点的表达量变幅较小,但在叶0~24 h时的表达量呈逐渐升高的变化趋势,尤其是24 h时表达量达最高,表明ZmUBC17基因的响应部位是叶片。【结论】玉米泛素E2蛋白可能参与调控对磷元素的吸收,尤其是ZmUBC17基因具有组织表达特异性,在叶片中大量表达,推测ZmUBC17基因通过调控玉米对磷元素吸收和转运间接影响光合作用效率。 展开更多
关键词 玉米 泛素结合酶(e2) 生物信息学 系统发育进化树 基因表达
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植物蛋白的体外泛素化检测方法 被引量:2
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作者 赵庆臻 刘利静 +1 位作者 谢旗 于菲菲 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期764-772,共9页
泛素激活酶(E1)、泛素耦联酶(E2)和泛素连接酶(E3)是蛋白质泛素化修饰的关键酶。在真核基因组上有大量基因编码这些泛素化相关的酶类或蛋白。检测这些泛素化修饰酶及其底物蛋白的生化特性和特异性是分析其生物学功能的重要内容。该文提... 泛素激活酶(E1)、泛素耦联酶(E2)和泛素连接酶(E3)是蛋白质泛素化修饰的关键酶。在真核基因组上有大量基因编码这些泛素化相关的酶类或蛋白。检测这些泛素化修饰酶及其底物蛋白的生化特性和特异性是分析其生物学功能的重要内容。该文提供了一种简便快速检测体外泛素化反应的方法,不仅可通过检测对DTT敏感的硫酯键的形成来判断E2的活性、检测E3的体外泛素化活性,而且可以检测E2-E3和E3-底物的特异性。所用蛋白主要来源于拟南芥(Arabidopsisthaliana),包括分属于绝大多数E2亚家族的成员,可用于不同RING类型E3的活性检测。该方法不仅可以采用多种E2进行E3活性分析,而且可以分析不同组合的E2-RINGE3、RINGE3-底物的泛素化活性等,亦可应用于真核生物蛋白质尤其是植物蛋白的体外泛素化活性分析。 展开更多
关键词 体外泛素化 泛素耦联酶(e2) 泛素连接酶(e3)
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角毛壳菌泛素结合酶基因的克隆和特性分析 被引量:1
4
作者 张海燕 贺洁 尚富德 《河南大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2014年第1期74-78,共5页
利用BlastX将角毛壳菌(Chaetomium cupreum)几丁质诱导的菌丝体cDNA文库中的ESTs序列与NCBI的Nr(Non-redundant)数据库进行相似性搜索,获得泛素结合酶(ubiquitin conjugating enzyme,E2)基因的ESTs.以此结果设计引物进行RT-PCR,克隆该... 利用BlastX将角毛壳菌(Chaetomium cupreum)几丁质诱导的菌丝体cDNA文库中的ESTs序列与NCBI的Nr(Non-redundant)数据库进行相似性搜索,获得泛素结合酶(ubiquitin conjugating enzyme,E2)基因的ESTs.以此结果设计引物进行RT-PCR,克隆该基因的cDNA序列(CcE2).该序列长600bp,开放阅读框444bp,编码147个氨基酸组成的多肽,蛋白分子量为16.6ku,是亲水性蛋白.BlastP分析表明该基因进化相当保守,与其他真菌的E2具有高度的相似性;三维结构分析显示CcE2仅包含一个功能结构域,在结构域的中央是决定CcE2活性的半胱氨酸残基活性位点. 展开更多
关键词 泛素结合酶(e2) 角毛壳菌 克隆 生物信息学分析
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条斑紫菜泛素结合酶基因的cDNA序列克隆与分析 被引量:10
5
作者 易乐飞 刘楚吾 +1 位作者 王萍 周向红 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期719-726,共8页
泛素蛋白酶体系统(ubiquitin-proteasomes system,UPS)是真核生物重要的翻译后修饰系统,参与了许多重要的生理反应,同时也参与了蛋白质的质量控制和细胞的稳态维持,因此研究条斑紫菜UPS有助于阐明条斑紫菜在逆境胁迫下通过UPS降解异常... 泛素蛋白酶体系统(ubiquitin-proteasomes system,UPS)是真核生物重要的翻译后修饰系统,参与了许多重要的生理反应,同时也参与了蛋白质的质量控制和细胞的稳态维持,因此研究条斑紫菜UPS有助于阐明条斑紫菜在逆境胁迫下通过UPS降解异常蛋白和调节蛋白的生物学活性。泛素结合酶(ubiquitin-conjugating enzyme,E2)是UPS的重要组成部分。根据电子克隆结果指导RT-PCR实验,成功克隆了条斑紫菜泛素结合酶基因(PyE2)的cDNA序列(GenBank accession:FJ232910)。该cDNA序列含有长444 nt的完整ORF,编码蛋白(PyE2)的分子量16.6 ku,长147 AA。PyE2与其它物种的E2具有高度的一致性和相似性,反映出E2在进化上相当保守。PyE2含有E2活性位点的保守序列及半胱氨酸残基,其三维结构与人的I类E2高度一致。PyE2不含C端和N端延伸结构,所以在条斑紫菜E2家族中属于I类E2。 展开更多
关键词 条斑紫菜 泛素结合酶 克隆 生物信息学
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泛素结合酶E2C通过特异性结合β-微管蛋白参与调控肝细胞癌进展 被引量:7
6
作者 刘梦 朱怡卿 +3 位作者 黄金凤 肖邦 陈美婷 王芳 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期14-20,共7页
目的筛选泛素结合酶E2C(UBE2C)的底物蛋白,并探讨其在肝细胞癌进展中的作用。方法构建带有Halotag标签的UBE2C过表达质粒,将UBE2C与Halotag在人高转移肝癌细胞系HCCLM3中融合表达,通过Halolink树脂沉淀UBE2C结合的底物蛋白,并联合SDS-P... 目的筛选泛素结合酶E2C(UBE2C)的底物蛋白,并探讨其在肝细胞癌进展中的作用。方法构建带有Halotag标签的UBE2C过表达质粒,将UBE2C与Halotag在人高转移肝癌细胞系HCCLM3中融合表达,通过Halolink树脂沉淀UBE2C结合的底物蛋白,并联合SDS-PAGE和质谱对底物蛋白进行鉴定。在人肝癌细胞系Huh-7中过表达UBE2C,通过qRT-PCR、蛋白质印迹分析和细胞免疫荧光实验检测UBE2C过表达对其底物蛋白表达的影响,利用细胞核质分离结合蛋白质印迹分析及TOP flash/FOP flash荧光素酶报告基因实验检测UBE2C过表达对Wnt信号通路的影响,并进一步通过qRT-PCR和蛋白质印迹分析验证UBE2C过表达对Wnt信号通路下游基因表达的影响。结果Halotag共沉淀产物经SDS-PAGE和银染后所获得差异条带的质谱鉴定结果显示,β-微管蛋白是UBE2C结合的底物蛋白。与对照组相比,过表达UBE2C降低了Huh-7细胞中β-微管蛋白在蛋白水平的表达(P<0.01),但对其在mRNA水平的表达没有影响(P>0.05)。同时,过表达UBE2C促进了β-联蛋白入核(P<0.05),提高了TOP flash/FOP flash荧光素酶活性(P<0.01),增强了Wnt信号通路下游基因JNK、细胞周期蛋白D1和基质金属蛋白酶7的表达(P均<0.05)。结论UBE2C通过特异性结合β-微管蛋白降低肝癌细胞中β-微管蛋白水平,从而提高Wnt信号通路活性,促进其下游基因表达,进而参与调控肝细胞癌的进展。 展开更多
关键词 肝细胞癌 泛素结合酶e2C Β-微管蛋白 WNT信号通路
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泛素/26S蛋白酶体途径在水稻中的生物学功能研究进展 被引量:4
7
作者 徐丹丹 孙帆 +3 位作者 王银晓 石英尧 王文生 傅彬英 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期25-33,共9页
生物体内的蛋白质降解方式有两种,一种不需要能量,一种需要能量。而泛素/26S蛋白酶体途径便是目前已知的依赖ATP、高效、有高度选择性的蛋白降解途径。它介导了真核生物中80%~85%的蛋白质降解,几乎参与到植物生长发育的各个环节,是植物... 生物体内的蛋白质降解方式有两种,一种不需要能量,一种需要能量。而泛素/26S蛋白酶体途径便是目前已知的依赖ATP、高效、有高度选择性的蛋白降解途径。它介导了真核生物中80%~85%的蛋白质降解,几乎参与到植物生长发育的各个环节,是植物体内蛋白高效专一降解最重要、最精细的调控机制之一。概述了泛素蛋白酶体途径,重点阐述了泛素结合酶E2和泛素连接酶E3的蛋白结构及其在水稻生长发育、激素信号传导、生物和非生物胁迫响应中的生物学功能及机制,并对进一步研究进行了展望,将有助于揭示泛素/26S蛋白酶体途径在水稻生长发育中的精细调控过程,并为水稻抗逆育种提供了指导和借鉴。 展开更多
关键词 泛素蛋白酶体途径 水稻 泛素结合酶e2 泛素连接酶e3 生物学功能
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UBE2T基因表达对鼻咽癌细胞增殖、迁移及侵袭能力的影响 被引量:5
8
作者 郑志刚 华清泉 陈锋 《实用癌症杂志》 2019年第10期1579-1582,共4页
目的探讨泛素结合酶E2T(UBE2T)基因表达对鼻咽癌细胞增殖、迁移及侵袭能力的影响。方法选取鼻咽癌细胞系5-8F细胞,随机分为对照组、空白转染组和si-UBE2T组,其中空白转染组细胞转染空白载体,si-UBE2T组细胞转染UBE2T特异性siRNA载体,采... 目的探讨泛素结合酶E2T(UBE2T)基因表达对鼻咽癌细胞增殖、迁移及侵袭能力的影响。方法选取鼻咽癌细胞系5-8F细胞,随机分为对照组、空白转染组和si-UBE2T组,其中空白转染组细胞转染空白载体,si-UBE2T组细胞转染UBE2T特异性siRNA载体,采用MTT法检测各组细胞增殖情况,采用Transwell迁移侵袭试验检测各组细胞迁移和侵袭,Western blotting法检测各组细胞UBE2T蛋白表达。结果 si-UBE2T组UBE2T蛋白相对表达量为(0. 354±0. 051),明显低于对照组和空白转染组(P <0. 05);si-UBE2T组培养第1 d、3 d和6 d吸光度值均低于对照组和空白转染组(P <0. 05);对照组和空白转染组培养第1d、3d和6d吸光度值比较差异无统计学意义(P> 0. 05);si-UBE2T组细胞迁移率和穿膜细胞数分别为(0. 322±0. 040)%和(85. 12±12. 06)个,明显低于对照组和空白转染组(P <0. 05);对照组和空白转染组UBE2T蛋白相对表达量、细胞迁移率和穿膜细胞数比较差异无统计学意义(P> 0. 05)。结论 UBE2T基因表达可促进鼻咽癌5-8F细胞增殖、侵袭及转移,有望成为鼻咽癌分支靶向治疗的靶标。 展开更多
关键词 泛素结合酶e2T 鼻咽癌 5-8F细胞 增殖 迁移 侵袭
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泛素结合酶UBE2T基因在肝癌细胞迁移和侵袭中的作用及其临床意义 被引量:5
9
作者 刘腾飞 刘小琴 +6 位作者 葛超 宋镇 陈静 田华 陈陶阳 崔英 李红 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期408-418,共11页
目的:探讨泛素结合酶E2 T(ubiquitin conjugating enzyme E2 T,UBE2T)在肝细胞癌组织中的表达及其临床意义,并研究UBE2T基因表达在肝癌细胞迁移和侵袭过程中的作用。方法:采用实时荧光定量PCR法检测54对肝细胞癌及相应癌旁肝组织中UBE2T... 目的:探讨泛素结合酶E2 T(ubiquitin conjugating enzyme E2 T,UBE2T)在肝细胞癌组织中的表达及其临床意义,并研究UBE2T基因表达在肝癌细胞迁移和侵袭过程中的作用。方法:采用实时荧光定量PCR法检测54对肝细胞癌及相应癌旁肝组织中UBE2T mRNA的表达水平。应用免疫组织化学法检测233例肝细胞癌组织中UBE2T蛋白的表达水平,并分析UBE2T表达与患者临床病理参数之间的关系。构建含有UBE2T基因序列的pWPXL重组慢病毒载体(pWPXLUBE2T)并将其转染肝癌Hep3B和SMMC-7721细胞系,另一方面将靶向UBE2T基因的shRNA慢病毒载体(GV248-shUBE2T-1和GV248-shUBE2T-2)及阴性对照慢病毒载体(GV248-NC)转染肝癌MHCC-LM3和SK-Hep1细胞系,采用实时荧光定量PCR和蛋白质印迹法验证UBE2T基因过表达和干扰效率,然后采用Transwell小室法分别检测UBE2T基因过表达和干扰表达对肝癌细胞迁移和侵袭的影响。结果:54对肝细胞癌组织中UBE2T mRNA表达水平明显高于相应癌旁肝组织(P<0.000 1)。在233例肝细胞癌组织中,UBE2T高表达与肝细胞癌的肝内转移有关(P=0.004)。与对照组相比,过表达UBE2T基因能够明显促进肝癌细胞Hep3B和SMMC-7721的迁移与侵袭(P值均<0.01)。与阴性对照组相比,干扰UBE2T基因表达能够明显抑制肝癌细胞MHCCLM3和SK-Hep1的迁移与侵袭(P值均<0.05)。结论:肝细胞癌中UBE2T高表达与肿瘤肝内转移有关,而过表达UBE2T基因可以促进肝癌细胞的迁移和侵袭。 展开更多
关键词 肝细胞 肿瘤转移 基因表达调控 泛素连接酶e2T
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普通油茶泛素结合酶UBE2-J2的cDNA序列及蛋白质结构分析 被引量:5
10
作者 林萍 姚小华 +3 位作者 曹永庆 龙伟 王开良 滕建华 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2013年第6期744-751,共8页
泛素结合酶(E2)是泛素/26S蛋白酶体途径中3个关键酶之一,在靶蛋白识别、与泛素连接酶(E3)互作等蛋白的泛素依赖性水解和N-末端规则依赖性水解途径的关键环节中起重要作用。采用Solexa测序技术获得了1条普通油茶E2的全长cDNA序列,命名为U... 泛素结合酶(E2)是泛素/26S蛋白酶体途径中3个关键酶之一,在靶蛋白识别、与泛素连接酶(E3)互作等蛋白的泛素依赖性水解和N-末端规则依赖性水解途径的关键环节中起重要作用。采用Solexa测序技术获得了1条普通油茶E2的全长cDNA序列,命名为UBE2-J2,该基因编码239AA,与其它物种的E2具有较高的一致性和相似性;同源建模的结果表明:普通油茶UBE2-J2蛋白具有泛素结合酶催化位点(UBCc),第8 122位氨基酸碱基为其泛素结合酶基因家族的保守区域,第75 122位氨基酸残基区域中有17个可与泛素形成硫酯键中间产物的残基,其中,87位的半胱氨酸残基是该酶活性中心位点,另有5个残基是与E3酶相互作用的位点。UBE2-J2具有C端延伸结构,故普通油茶UBE2-J2蛋白属于II类E2基因家族成员。 展开更多
关键词 普通油茶 泛素结合酶 Solexa测序 生物信息学
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泛素偶联酶E2C在原发性肝癌中的表达及与临床病理参数和预后的关系 被引量:5
11
作者 董文亮 刘洪涛 +2 位作者 初侃 侯铁伟 肖遥 《疑难病杂志》 CAS 2020年第10期994-998,共5页
目的分析泛素偶联酶E2C(UBE2C)在原发性肝癌中的表达及与临床病理参数和预后的关系。方法选取2014年1月—2016年12月北部战区总医院普外科手术治疗原发性肝癌患者109例作为研究对象,留取其癌组织和癌旁组织。采用免疫组化法测定原发性... 目的分析泛素偶联酶E2C(UBE2C)在原发性肝癌中的表达及与临床病理参数和预后的关系。方法选取2014年1月—2016年12月北部战区总医院普外科手术治疗原发性肝癌患者109例作为研究对象,留取其癌组织和癌旁组织。采用免疫组化法测定原发性肝癌组织和癌旁组织中UBE2C表达水平,分析其与原发性肝癌临床病理参数及患者预后的关系。结果原发性肝癌组织中UBE2C阳性表达率高于癌旁组织(92.16%vs.64.22%,χ^2/P=26.067/0.000)。UBE2C在原发性肝癌组织中的表达水平与患者的性别、年龄、肿瘤大小、浸润深度、淋巴结转移、分化程度无相关性(P>0.05),与TNM分期、淋巴血管间隙浸润、复发呈正相关(r/P=0.506/0.000、0.517/0.000、0.493/0.002)。术后随访,UBE2C高表达原发性肝癌患者中位生存时间为23.32个月,短于UBE2C低表达患者的33.32个月(χ^2/P=9.129/0.003)。COX多因素分析表明,有淋巴血管间隙浸润、复发、UBE2C高表达是影响原发性肝癌患者不良预后的独立危险因素[OR(95%CI)=2.880(1.348~6.153)、2.975(1.091~8.115)、3.475(1.942~6.219)]。结论UBE2C在原发性肝癌组织中阳性表达率显著升高,与患者TNM分期、淋巴血管间隙浸润、复发相关,可能成为评价原发性肝癌患者预后的临床指标。 展开更多
关键词 泛素偶联酶e2C 肝癌 原发性 预后 危险因素
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Ubiquitination in Abscisic Acid-Related Pathway 被引量:3
12
作者 Yi-Yue Zhang Qi Xie 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2007年第1期87-93,共7页
Ubiquitination is emerging as a tight regulatory mechanism that is necessary for all aspects of development and survival of all eukaryotes. Recent genomic and genetic analysis in Arabidopsis suggests that ubiquitinati... Ubiquitination is emerging as a tight regulatory mechanism that is necessary for all aspects of development and survival of all eukaryotes. Recent genomic and genetic analysis in Arabidopsis suggests that ubiquitination may also play important roles in plant response to the phytohormone abscisic acid (ABA). Many components of the ubiquitination pathway, such as ubiquitin-conjugating enzyme E2, ubiquitin ligase E3 and components of the proteasome, have been identified or predicted to be essential in ABA biosynthesis, catabolism and signaling. In addition, the ubiquitination-related pathway, sumoylation, is also involved in ABA signaling. We summarize in this report recent developments to elucidate their roles in the ABA-related pathway. 展开更多
关键词 ABA e3 ligase PROTeOLYSIS SUMO ubiquitinATION ubiquitin-conjugating enzyme e2
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UBE2C和UBE2T与胰腺癌患者预后及免疫细胞浸润的关系 被引量:3
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作者 于运亮 李婷 +2 位作者 王莉莉 丛培英 封建凯 《山东医药》 CAS 2021年第28期13-18,共6页
目的探讨泛素结合酶E2C(UBE2C)和E2T(UBE2T)与胰腺癌患者预后及免疫细胞浸润的关系。方法检索Oncomine、GEPIA2.0、EMBL-EBI数据库分析两基因在胰腺癌中的表达情况,利用GEPIA、Kaplan-Meierplotter数据库探索两基因的表达与胰腺癌患者... 目的探讨泛素结合酶E2C(UBE2C)和E2T(UBE2T)与胰腺癌患者预后及免疫细胞浸润的关系。方法检索Oncomine、GEPIA2.0、EMBL-EBI数据库分析两基因在胰腺癌中的表达情况,利用GEPIA、Kaplan-Meierplotter数据库探索两基因的表达与胰腺癌患者预后的相关性。利用Oncomine及cBioPortal数据库筛选共表达基因,使用FunRich软件进行富集分析。利用String数据库和Cytoscape软件综合分析与两基因相互作用的蛋白及调控网络。使用Cytoscape筛选核心(Hub)基因,并利用GEPIA进行预后分析。使用TIMER数据库分析两基因的表达与免疫细胞浸润的相关性。结果UBE2C和UBE2T在胰腺癌中表达上调,高表达两基因的患者总生存期和无病生存期显著缩短(P均<0.05)。两基因的表达与患者的分期、分级、巨噬细胞浸润等有关(P均<0.05)。在胰腺癌中UBE2C与UBE2T的表达显著相关(P<0.05),与两基因共表达的基因主要富集于丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶激活功能;主要参与细胞周期、纺锤体组装过程;主要位于染色体结构中;在细胞周期、Aurora-B信号通路中富集。筛选的10个Hub基因为PBK、CEP55、BIRC5、MELK、CDK1、NUSAP1、TPX2、BUB1、TOP2A和BUB1B,与胰腺癌患者预后相关(P<0.05)。两基因的表达与巨噬细胞浸润呈负相关关系(P<0.05)。结论UBE2C和UBE2T与胰腺癌患者的预后及多种免疫细胞如T细胞、巨噬细胞的浸润有关,可能通过调控细胞周期、DNA复制过程进而调控胰腺癌的进程。 展开更多
关键词 胰腺癌 泛素结合酶e2C 泛素结合酶e2T 预后 免疫细胞
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Ubiquitin-conjugating enzyme E2T knockdown suppresses hepatocellular tumorigenesis via inducing cell cycle arrest and apoptosis 被引量:3
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作者 Jian Guo Mu Wang +1 位作者 Jun-Ping Wang Chang-Xin Wu 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2019年第43期6386-6403,共18页
BACKGROUND Hepatocellular carcinoma(HCC)is now the most common primary liver malignancy worldwide,and multiple risk factors attribute to the occurrence and development of HCC.Recently,increasing studies suggest that u... BACKGROUND Hepatocellular carcinoma(HCC)is now the most common primary liver malignancy worldwide,and multiple risk factors attribute to the occurrence and development of HCC.Recently,increasing studies suggest that ubiquitinconjugating enzyme E2T(UBE2T)serves as a promising prognostic factor in human cancers,although the molecular mechanism of UBE2T in HCC remains unclear.AIM To investigate the clinical relevance and role of UBE2T in HCC development.METHODS UBE2T expression in HCC tissues from the TCGA database and its association with patient survival were analyzed.A lentivirus-mediated strategy was used to knock down UBE2T in HCC cells.qRT-PCR and Western blot assays were performed to check the effect of UBE2T silencing in HCC cells.Cell growth in vitro and in vivo was analyzed by multiparametric high-content screening and the xenograft tumorigenicity assay,respectively.Cell cycle distribution and apoptosis were determined by flow cytometry.The genes regulated by UBE2T were profiled by microarray assay.RESULTS UBE2T was overexpressed in HCC tissues compared with paired and non-paired normal tissues.High expression of UBE2T predicted a poor overall survival in HCC patients.In vitro,lentivirus-mediated UBE2T knockdown significantly reduced the viability of both SMMC-7721 and BEL-7404 cells.In vivo,the xenograft tumorigenesis of SMMC-7721 cells was largely attenuated by UBE2T silencing.The cell cycle was arrested at G1/S phase in SMMC-7721 and BEL-7404 cells with UBE2T knockdown.Furthermore,apoptosis was increased by UBE2T knockdown.At the molecular level,numerous genes were dysregulated after UBE2T silencing,including IL-1B,FOSL1,PTGS2,and BMP6.CONCLUSION UBE2T plays an important role in cell cycle progression,apoptosis,and HCC development. 展开更多
关键词 HePATOCeLLULAR carcinoma ubiquitin-conjugating enzyme e2T Cell cycle APOPTOSIS TUMORIGeNeSIS
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血清hMAM、HER2、UBE2C联合检测对乳腺癌腋窝淋巴结转移的诊断价值
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作者 张江华 王海峰 +1 位作者 张克俭 贾国洪 《中国现代普通外科进展》 CAS 2024年第11期856-860,共5页
目的:探究血清人乳腺珠蛋白(hMAM)、人类表皮生长因子受体2(HER2)、泛素结合酶2C(UBE2C)联合检测对乳腺癌腋窝淋巴结转移的诊断价值。方法:选取2022年3月—2024年3月收治的乳腺癌患者90例,根据病理检查结果是否发生腋窝淋巴结转移分为... 目的:探究血清人乳腺珠蛋白(hMAM)、人类表皮生长因子受体2(HER2)、泛素结合酶2C(UBE2C)联合检测对乳腺癌腋窝淋巴结转移的诊断价值。方法:选取2022年3月—2024年3月收治的乳腺癌患者90例,根据病理检查结果是否发生腋窝淋巴结转移分为转移组(n=40)和非转移组(n=50),收集患者的一般临床资料,多因素Logistic回归分析乳腺癌发生腋窝淋巴结转移的影响因素,绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析hMAM、HER2、UBE2C对乳腺癌腋窝淋巴结转移的诊断价值,Pearson法分析hMAM、HER2、UBE2C与肿瘤标志物血清白蛋白19(CK19)、癌胚抗原(CEA)及三者间相关性。结果:转移组T_(3)+T_(4)期患者及肿瘤直径>3 cm患者占比显著高于非转移组(P<0.05),转移组水平显著高于非转移组(P<0.05);与非转移组相比,转移组血清hMAM、HER2、UBE2C水平均显著升高(P<0.05);CEA、hMAM、HER2、UBE2C水平升高均为影响乳腺癌发生腋窝淋巴结转移的危险因素(P<0.05);ROC曲线结果显示,hMAM、HER2、UBE2C预测乳腺癌发生腋窝淋巴结转移的AUC分别为0.821、0.815、0.819,三者联合的AUC为0.914,显著高于hMAM(Z=2.070,P=0.038)、HER2(Z=2.072,P=0.038)、UBE2C(Z=1.987,P=0.047)单独诊断。hMAM、HER2、UBE2C与肿瘤检测标志物均呈正相关(P<0.05),且三者之间也均互为正相关(P<0.05)。结论:乳腺癌腋窝淋巴结转移患者的血清hMAM、HER2、UBE2C水平升高,三者联合检测对乳腺癌腋窝淋巴结转移具有一定辅助预测价值,可能作为乳腺癌腋窝淋巴结转移潜在的生物标志物。 展开更多
关键词 人乳腺珠蛋白 人类表皮生长因子受体2 泛素结合酶e2C 乳腺肿瘤 腋窝淋巴结转移
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胃癌组织中UBE2S、FASN蛋白的表达及其临床病理意义
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作者 陈元杏 张丽 +1 位作者 张玉荣 刘杲 《分子诊断与治疗杂志》 2024年第10期1932-1935,1939,共5页
目的研究胃癌组织中泛素结合酶E2S(UBE2S)、脂肪酸合成酶(FASN)蛋白的表达及其与临床病理特征、生存预后的相关性。方法对2020年1月至2022年12月期间在恩施土家族苗族自治州中心医院行手术切除治疗的108例胃癌患者进行分析,采用Western ... 目的研究胃癌组织中泛素结合酶E2S(UBE2S)、脂肪酸合成酶(FASN)蛋白的表达及其与临床病理特征、生存预后的相关性。方法对2020年1月至2022年12月期间在恩施土家族苗族自治州中心医院行手术切除治疗的108例胃癌患者进行分析,采用Western blot检测胃癌组织及癌旁组织中UBE2S、FASN的蛋白表达水平。比较不同临床病理特征、生存预后患者胃癌组织中UBE2S、FASN蛋白表达水平的差异,采用ROC曲线分析胃癌组织中UBE2S、FASN蛋白表达水平对患者生存预后的评估价值。结果胃癌组织中UBE2S、FASN的蛋白表达水平高于对应的癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05);TNMⅢ期胃癌组织中UBE2S、FASN蛋白表达水平高于TNMⅠ~Ⅱ期,差异有统计学意义(P<0.05);有脉管癌栓的胃癌组织中UBE2S、FASN的蛋白表达高于无脉管癌栓的胃癌组织,差异有统计学意义(P<0.05);死亡患者的胃癌组织中UBE2S、FASN的蛋白表达高于存活患者,差异有统计学意义(P<0.05);胃癌组织中UBE2S、FASN蛋白表达水平评估患者术后死亡的曲线下面积分别为0.828、0.835(P<0.05)。结论胃癌组织中UBE2S、FASN表达增加且与TNM分期、脉管癌栓、生存预后相关。 展开更多
关键词 胃癌 泛素结合酶e2S 脂肪酸合成酶
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肝细胞癌中UBE2S互作蛋白的筛选及预后模型构建
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作者 王小燕 张豪 +2 位作者 郭泽皓 曹骏 莫之婧 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期168-177,共10页
目的:筛选泛素结合酶E2S (UBE2S)互作蛋白并构建肝细胞癌(HCC)基于UBE2S互作蛋白的预后模型(UIPM),分析UIPM评估HCC患者预后的价值。方法:采用免疫共沉淀(Co-IP)技术筛选与Flag-UBE2S结合的蛋白复合体,经十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶... 目的:筛选泛素结合酶E2S (UBE2S)互作蛋白并构建肝细胞癌(HCC)基于UBE2S互作蛋白的预后模型(UIPM),分析UIPM评估HCC患者预后的价值。方法:采用免疫共沉淀(Co-IP)技术筛选与Flag-UBE2S结合的蛋白复合体,经十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDSPAGE)和Western blotting法验证后,采用液相色谱-质谱联用仪(LC-MS)分析鉴定UBE2S互作蛋白,并对互作蛋白进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。采用R软件survival包筛选癌症基因组图谱(TGGA)中HCC预后相关蛋白与UBE2S互作蛋白取交集,通过LASSO回归分析从交集蛋白中获取关键蛋白构建UIPM,并建立预后模型风险评分公式,按照风险评分的中位值将TGGA中HCC患者分为高风险组和低风险组,通过受试者工作特征曲线(ROC)评估UIPM的预测准确性,并采用国际癌症基因组联盟(ICGC)数据库对UIPM预测准确性进行再次验证。采用单因素和多因素Cox回归分析评估UIPM风险评分是否为HCC的预后独立危险因素,并进一步构建列线图模型。结果:Co-IP联合LC-MS分析得到97个UBE2S互作蛋白。GO功能和KEGG信号通路富集分析,互作蛋白主要与半胱氨酸型内肽酶活性、氧化应激和细胞死亡有密切关联。TCGA筛选出5 163个HCC预后相关蛋白,与UBE2S互作蛋白取交集,获得40个预后相关互作蛋白,LASSO回归分析得到7个关键蛋白,包括UBE2S、热休克蛋白家族A成员8(HSPA8)、异质性胞核核糖核蛋白H1(HNRNPH1)、含TCP1伴侣蛋白亚基3 (CCT3)、真核翻译起始因子2亚基1 (EIF2S1)、活化蛋白C激酶1受体(RACK1)和肌动蛋白相关蛋白2/3复合体亚基4(ARPC4),并构建了UIPM,高和低风险组HCC患者生存率存比较差异有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线,UIPM预测HCC患者1、2和3年UIPM风险评分的ROC曲线下面积(AUC)值均大于0.7,表明预测模型准确度较高。ICGC数据库数据也证实UIPM预测准确度较高。单因� 展开更多
关键词 泛素结合酶e2S 肝细胞癌 免疫共沉淀 液相色谱-质谱联用仪 预后分析
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子痫前期患者血清TFF1、UBE2C水平变化及其对不良妊娠结局的预测效能
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作者 刘琼 翟明月 杨青 《中国实用医刊》 2024年第19期11-14,共4页
目的探讨子痫前期患者血清三叶因子1(TFF1)、泛素偶联酶E2C(UBE2C)水平变化及其对不良妊娠结局的预测效能。方法回顾性抽取2021年5月至2023年5月于南阳市中心医院产检且分娩的子痫前期患者88例,依据子痫前期病情将其分为轻度组(47例)和... 目的探讨子痫前期患者血清三叶因子1(TFF1)、泛素偶联酶E2C(UBE2C)水平变化及其对不良妊娠结局的预测效能。方法回顾性抽取2021年5月至2023年5月于南阳市中心医院产检且分娩的子痫前期患者88例,依据子痫前期病情将其分为轻度组(47例)和重度组(41例),依据妊娠结局情况将其分为不良妊娠组(27例)和良好妊娠组(61例)。另抽取同期孕检的正常妊娠健康孕妇45例为正常组。通过酶联免疫吸附实验检测血清TFF1、UBE2C水平。采用受试者工作特性曲线下面积(AUC)评估TFF1、UBE2C对子痫前期患者不良妊娠结局的预测价值。结果重度组血清TFF1、UBE2C水平高于轻度组和正常组,轻度组血清TFF1、UBE2C水平高于正常组,P均<0.05。不良妊娠组血清TFF1、UBE2C水平高于良好妊娠组(P<0.05)。血清TFF1和UBE2C预测子痫前期患者不良妊娠结局的AUC分别为0.74(95%CI:0.693~0.788)、0.81(95%CI:0.767~0.862),两者联合预测的AUC为0.93(95%CI:0.881~0.976)。结论TFF1、UBE2C在子痫前期疾病患者血清中呈高表达,有望用于预测子痫前期患者不良妊娠结局的发生。 展开更多
关键词 子痫前期 三叶因子1 泛素偶联酶e2C 妊娠结局
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泛素结合酶E2L3通过NF-κB/COX2通路调节颅脑创伤后小胶质细胞介导神经炎症的实验研究
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作者 陈月阳 王景景 +9 位作者 任党利 李泽萌 王淑莹 杨以太 周蓬勃 李伟 邓庭桢 牛翰婕 李锐 孙洪涛 《中华神经外科杂志》 CSCD 北大核心 2024年第9期952-958,共7页
目的探讨泛素结合酶E2L3(UBE2L3)对颅脑创伤(TBI)后小胶质细胞相关神经炎症的作用及其潜在机制。方法采用SD大鼠构建TBI及假手术(Sham)组大鼠模型,通过多肽组学筛选Sham组和TBI组建模3 d时创伤病灶周围皮质脑组织差异表达的肽段,并选取... 目的探讨泛素结合酶E2L3(UBE2L3)对颅脑创伤(TBI)后小胶质细胞相关神经炎症的作用及其潜在机制。方法采用SD大鼠构建TBI及假手术(Sham)组大鼠模型,通过多肽组学筛选Sham组和TBI组建模3 d时创伤病灶周围皮质脑组织差异表达的肽段,并选取下调显著的UBE2L3蛋白作为研究对象;分别通过蛋白免疫印迹法(WB)和实时荧光定量PCR(qPCR)实验验证TBI大鼠脑组织和不同BV2细胞模型中UBE2L3的表达情况。将UBE2L3质粒转染至BV2细胞中并将细胞分为阴性对照组(NC)、UBE2L3过表达组(OE-UBE2L3),采用qPCR和WB实验鉴定UBE2L3基因的过表达情况。构建脂多糖(LPS)诱导的M1型小胶质细胞神经炎症模型,将细胞分为NC组、OE-UBE2L3组、LPS组和LPS-UBE2L3组,分别通过免疫荧光染色和qPCR实验检测UBE2L3过表达对小胶质细胞极化、炎症因子表达的影响;随后通过WB实验分析UBE2L3过表达对NF-κB通路中COX2蛋白和NF-κB p65蛋白磷酸化水平的影响。结果多肽组学质谱分析结果显示,TBI大鼠病灶周围脑皮质组织中UBE2L3蛋白的表达水平较Sham组降低,差异有统计学意义(P=0.046)。WB验证实验显示,在BV2细胞神经炎症模型中,UBE2L3的表达水平在12 h时较0 h时下调,差异有统计学意义(P<0.01);在TBI大鼠脑组织中,UBE2L3的表达水平在TBI后1 d时较Sham组下调(0.804±0.056对比1.394±0.263),在7 d时(0.558±0.024)表达趋于平缓,差异均有统计学意义(均P<0.01)。WB鉴定实验显示成功构建UBE2L3过表达细胞模型,OE-UBE2L3组UBE2L3表达水平较NC组升高(0.908±0.052对比0.362±0.080),差异有统计学意义(P<0.01)。qPCR实验显示,LPS组白细胞介素1β(IL-1β)、白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)表达水平较NC组均升高,而LPS-UBE2L3组IL-1β、IL-6、TNF-α表达水平较LPS组均下调,差异均有统计学意义(均P<0.01)。免疫荧光实验显示,LPS组小胶质细胞M1型标准物诱导性一氧化氮合酶(iNOS)的表达水平较NC 展开更多
关键词 脑损伤 创伤性 小神经胶质细胞 炎症 极化 泛素化结合酶e2L3 大鼠
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泛素链的形成机理 被引量:1
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作者 王亚楠 赵博 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2021年第5期515-528,共14页
泛素化是真核细胞中重要的蛋白质翻译后修饰过程,通过靶向蛋白质降解或其他信号途径参与多种细胞功能.底物蛋白的多聚泛素化修饰是一个持续的过程,其中不仅涉及复杂泛素系统相关酶的参与,而且存在更为复杂的结构上相互作用与泛素链组装... 泛素化是真核细胞中重要的蛋白质翻译后修饰过程,通过靶向蛋白质降解或其他信号途径参与多种细胞功能.底物蛋白的多聚泛素化修饰是一个持续的过程,其中不仅涉及复杂泛素系统相关酶的参与,而且存在更为复杂的结构上相互作用与泛素链组装机理.不同的泛素链修饰决定了底物蛋白下游的不同命运,泛素结合酶E2在泛素链形成中的重要作用受到越来越多的关注.对泛素链形成机理的深入研究与认识有利于发现与泛素系统相关的疾病靶点和利用泛素化调控方法进行治疗.本综述总结了E2和E3如何决定不同泛素链形成的机制和相关的结构信息,以及两种不同的泛素链组装机制. 展开更多
关键词 泛素链 泛素结合酶e2 泛素连接酶e3 泛素链特异性 泛素链组装
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