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U2依赖型mRNA剪接体与肝癌的相关性研究
1
作者
宋伟
朱贝贝
+4 位作者
田瑶
钟荣
田晶
缪小平
王丽
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期634-638,共5页
目的 探讨U2依赖型mRNA剪接复合体相关基因多态性与肝癌的风险关联.方法 采用两阶段病例对照研究,筛查阶段采用Openarray中通量分型技术对U2依赖型mRNA剪接复合体的关键基因(U2AF1、U2AF2、SRSF1、SRSF2、SF3B1、SF3A1、SF1和PRPF40)...
目的 探讨U2依赖型mRNA剪接复合体相关基因多态性与肝癌的风险关联.方法 采用两阶段病例对照研究,筛查阶段采用Openarray中通量分型技术对U2依赖型mRNA剪接复合体的关键基因(U2AF1、U2AF2、SRSF1、SRSF2、SF3B1、SF3A1、SF1和PRPF40)的21个潜在功能标签SNP位点在筛查人群(武汉地区378例新发肝癌病例和461例非肿瘤对照)中进行基因分型;对筛查阶段得到的阳性位点进一步在验证人群(北京地区428例新发肝癌病例和647例非肿瘤对照)中采用TaqMan基因分型技术进行验证.采用加法交互模型分析吸烟/饮酒及遗传因素的交互作用.结果 两阶段人群中均观察到SF3A1基因的rs5994293与肝癌发病风险存在显著关联.合并分析显示,以携带TT基因型者为参照,携带G等位基因者的肝癌发病风险降低30%(OR=0.70,95%CI:0.58 - 0.84,FDR-P=0.000 5);合并阶段在HBsAg阴性者中观察到吸烟合并饮酒和rs5994293 TT基因型之间存在加法交互作用.结论 携带SF3A1 rs5994293 T等位基因可能增加肝癌发生风险,但仍需大样本研究及功能研究的验证。
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关键词
肝癌
u
2
依赖型mRNA剪接复合体
吸烟
饮酒
单核苷酸多态性
原文传递
剪接蛋白U2AF65基因多态性和吸烟交互作用与胰腺癌风险的关联
被引量:
2
2
作者
田晶
朱贝贝
+3 位作者
田瑶
钟荣
缪小平
王丽
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期710-713,共4页
目的:探讨U2小核糖核蛋白体辅助分子U2AF35和U2AF65功能基因多态性及其与吸烟交互作用与胰腺癌风险关联。方法采用两阶段病例对照研究,筛查阶段采用Openarray中通量分型技术对筛选出的U2AF35和U2AF65基因4个潜在功能标签单核苷酸多态...
目的:探讨U2小核糖核蛋白体辅助分子U2AF35和U2AF65功能基因多态性及其与吸烟交互作用与胰腺癌风险关联。方法采用两阶段病例对照研究,筛查阶段采用Openarray中通量分型技术对筛选出的U2AF35和U2AF65基因4个潜在功能标签单核苷酸多态性(SNP)位点在研究对象(武汉地区298例原发胰腺癌病例和525例非肿瘤对照)中进行基因分型;对筛查阶段的阳性位点进一步在验证人群(北京地区413例原发胰腺癌病例和557例非肿瘤对照人群)中采用TaqMan基因分型技术进行验证。并采用加法交互模型分析基因和吸烟交互作用对胰腺癌发生风险的影响。结果筛查阶段U2AF65基因的rs310441和rs310445与胰腺癌发病风险均存在显著关联。对rs310445进行验证后发现,以携带TT基因型者为参照,携带C等位基因者的胰腺癌发病风险增加,合并两阶段人群的OR值为1.31(95%CI:1.07~1.60,P=0.010)。合并人群观察到吸烟和rs310445 C等位基因之间的协同作用可增加胰腺癌的发生风险,协同指数为2.08(95%CI:1.37~2.78)。未发现U2AF35位点多态与胰腺癌发生风险相关。结论 U2AF65 rs310445 C等位基因与吸烟协同作用可能增加胰腺癌发生风险,但仍需大样本研究验证。
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关键词
吸烟
胰腺癌
u
2
小核糖核蛋白体辅助分子
单核苷酸多态性
原文传递
剪接因子U2AF65相关蛋白的研究进展
3
作者
瞿秀华
马清钧
曹诚
《生物技术通讯》
CAS
2010年第6期868-873,共6页
U2核糖核蛋白小体辅助因子(U2AF)65是参与前体mRNA剪接的重要辅助因子,前体RNA生成之初,U1核糖核蛋白小体(snRNP)结合到内含子的5'剪接位点,U2AF65和U2AF35分别结合到多聚嘧啶序列和3'剪接位点,剪接因子1(SF1)结合到分支位点是...
U2核糖核蛋白小体辅助因子(U2AF)65是参与前体mRNA剪接的重要辅助因子,前体RNA生成之初,U1核糖核蛋白小体(snRNP)结合到内含子的5'剪接位点,U2AF65和U2AF35分别结合到多聚嘧啶序列和3'剪接位点,剪接因子1(SF1)结合到分支位点是剪接体形成的第一步。U2AF的存在又辅助U2snRNP代替SF1结合到分支位点,使剪接反应顺利进行。最近几年,发现基因组中存在一些U2AF65的旁系同源基因序列。这些旁系同源基因由祖先基因经连续复制而横向形成,复制出的基因副本经历了各自的进化途径,最终它们在结构和功能上有相似之处,又各有独特之处。我们简要讨论了U2AF65、PUF60、CAPERα和CAPERβ这4种同源蛋白的发现过程、结构特征、自身的多样性、基因的进化和生物学功能。
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关键词
u
2
核糖核蛋白小体辅助因子65
P
u
F60
CAPERα
CAPERβ
pre-mRNA剪接
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职称材料
题名
U2依赖型mRNA剪接体与肝癌的相关性研究
1
作者
宋伟
朱贝贝
田瑶
钟荣
田晶
缪小平
王丽
机构
中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院流行病和卫生统计学系
华中科技大学同济医学院公共卫生学院流行病和卫生统计学系
出处
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期634-638,共5页
基金
教育部博士点基金(20111106120020)
国家科技重大专项(2012ZX10004904,2013ZX10002002006002)
文摘
目的 探讨U2依赖型mRNA剪接复合体相关基因多态性与肝癌的风险关联.方法 采用两阶段病例对照研究,筛查阶段采用Openarray中通量分型技术对U2依赖型mRNA剪接复合体的关键基因(U2AF1、U2AF2、SRSF1、SRSF2、SF3B1、SF3A1、SF1和PRPF40)的21个潜在功能标签SNP位点在筛查人群(武汉地区378例新发肝癌病例和461例非肿瘤对照)中进行基因分型;对筛查阶段得到的阳性位点进一步在验证人群(北京地区428例新发肝癌病例和647例非肿瘤对照)中采用TaqMan基因分型技术进行验证.采用加法交互模型分析吸烟/饮酒及遗传因素的交互作用.结果 两阶段人群中均观察到SF3A1基因的rs5994293与肝癌发病风险存在显著关联.合并分析显示,以携带TT基因型者为参照,携带G等位基因者的肝癌发病风险降低30%(OR=0.70,95%CI:0.58 - 0.84,FDR-P=0.000 5);合并阶段在HBsAg阴性者中观察到吸烟合并饮酒和rs5994293 TT基因型之间存在加法交互作用.结论 携带SF3A1 rs5994293 T等位基因可能增加肝癌发生风险,但仍需大样本研究及功能研究的验证。
关键词
肝癌
u
2
依赖型mRNA剪接复合体
吸烟
饮酒
单核苷酸多态性
Keywords
Hepatocell
u
lar
cancer
u
2
small
nuclear
ribonucleoproteins
Smoking
Drinking
Single
n
u
cleotide
polymorphism
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
剪接蛋白U2AF65基因多态性和吸烟交互作用与胰腺癌风险的关联
被引量:
2
2
作者
田晶
朱贝贝
田瑶
钟荣
缪小平
王丽
机构
中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院流行病学和卫生统计学系
华中科技大学同济医学院公共卫生学院流行病和卫生统计学系
出处
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期710-713,共4页
基金
国家自然科学基金(81041079)
文摘
目的:探讨U2小核糖核蛋白体辅助分子U2AF35和U2AF65功能基因多态性及其与吸烟交互作用与胰腺癌风险关联。方法采用两阶段病例对照研究,筛查阶段采用Openarray中通量分型技术对筛选出的U2AF35和U2AF65基因4个潜在功能标签单核苷酸多态性(SNP)位点在研究对象(武汉地区298例原发胰腺癌病例和525例非肿瘤对照)中进行基因分型;对筛查阶段的阳性位点进一步在验证人群(北京地区413例原发胰腺癌病例和557例非肿瘤对照人群)中采用TaqMan基因分型技术进行验证。并采用加法交互模型分析基因和吸烟交互作用对胰腺癌发生风险的影响。结果筛查阶段U2AF65基因的rs310441和rs310445与胰腺癌发病风险均存在显著关联。对rs310445进行验证后发现,以携带TT基因型者为参照,携带C等位基因者的胰腺癌发病风险增加,合并两阶段人群的OR值为1.31(95%CI:1.07~1.60,P=0.010)。合并人群观察到吸烟和rs310445 C等位基因之间的协同作用可增加胰腺癌的发生风险,协同指数为2.08(95%CI:1.37~2.78)。未发现U2AF35位点多态与胰腺癌发生风险相关。结论 U2AF65 rs310445 C等位基因与吸烟协同作用可能增加胰腺癌发生风险,但仍需大样本研究验证。
关键词
吸烟
胰腺癌
u
2
小核糖核蛋白体辅助分子
单核苷酸多态性
Keywords
Smoking
Pancreatic
cancer
u
2
small
nuclear
ribonucleoprotein
a
u
xiliary
factor
Single
n
u
cleotide
polymorphism
分类号
R735.9 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
剪接因子U2AF65相关蛋白的研究进展
3
作者
瞿秀华
马清钧
曹诚
机构
军事医学科学院生物工程研究所
出处
《生物技术通讯》
CAS
2010年第6期868-873,共6页
文摘
U2核糖核蛋白小体辅助因子(U2AF)65是参与前体mRNA剪接的重要辅助因子,前体RNA生成之初,U1核糖核蛋白小体(snRNP)结合到内含子的5'剪接位点,U2AF65和U2AF35分别结合到多聚嘧啶序列和3'剪接位点,剪接因子1(SF1)结合到分支位点是剪接体形成的第一步。U2AF的存在又辅助U2snRNP代替SF1结合到分支位点,使剪接反应顺利进行。最近几年,发现基因组中存在一些U2AF65的旁系同源基因序列。这些旁系同源基因由祖先基因经连续复制而横向形成,复制出的基因副本经历了各自的进化途径,最终它们在结构和功能上有相似之处,又各有独特之处。我们简要讨论了U2AF65、PUF60、CAPERα和CAPERβ这4种同源蛋白的发现过程、结构特征、自身的多样性、基因的进化和生物学功能。
关键词
u
2
核糖核蛋白小体辅助因子65
P
u
F60
CAPERα
CAPERβ
pre-mRNA剪接
Keywords
u
2
small
nuclear
ribonucleoprotein
a
u
xiliary
factor
65kD
P
u
F60
CAPERα
CAPERβ
pre-mRNA
splicing
分类号
Q52 [生物学—生物化学]
Q75
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
U2依赖型mRNA剪接体与肝癌的相关性研究
宋伟
朱贝贝
田瑶
钟荣
田晶
缪小平
王丽
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015
0
原文传递
2
剪接蛋白U2AF65基因多态性和吸烟交互作用与胰腺癌风险的关联
田晶
朱贝贝
田瑶
钟荣
缪小平
王丽
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014
2
原文传递
3
剪接因子U2AF65相关蛋白的研究进展
瞿秀华
马清钧
曹诚
《生物技术通讯》
CAS
2010
0
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