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Expression of germ cell nuclear factor in mouse germ cells and sperm during postnatal period 被引量:11
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作者 ChenXu Zong-YaoZhou +1 位作者 Qiang-SuGuo Yi-FeiWang 《Asian Journal of Andrology》 SCIE CAS CSCD 2004年第3期217-222,共6页
Aim: To assess the spatial and temporal expression of germ cell nuclear factor (GCNF) in male mouse germ cells during postnatal development and in sperm before and after capacitation. Methods: The indirect immun-ofluo... Aim: To assess the spatial and temporal expression of germ cell nuclear factor (GCNF) in male mouse germ cells during postnatal development and in sperm before and after capacitation. Methods: The indirect immun-ofluorescence method with anti-GCNF antiserum was used to investigate the GCNF expression in mice at day 8, 10, 14, 17, 20, 28, 35, 70, and 420 after birth and in sperm before and after capacitation. Results: With the proceeding of spermatogenesis, GCNF was first detected in the nuclei of spermatogonia and a few early stage primary sperma-tocytes at day 8, which was increased gradually at day 10 to 14 inclusive. From day 17 to day 20, the GCNF was concentrated in round spermatids, while both spermatogonia and early stage primary spermatocytes became GCNF negative. From day 28 until day 420, strong GCNF expression was shown in round spermatids and pachytene spermatocytes, while spermatogonia, early primary spermatocytes and elongating spermatids were all GCNF negative. In addition, it was also found that GCNF was localized on the acrosomal cap region of spermatozoa and there was a big change in GCNF expression during capacitation, from 98 % GCNF positive before capacitation to about 20 % positive following capacitation. The localization of GCNF in caput and cauda spermatozoa was similar. Conclusion: GCNF may play important roles in spermatogenesis, capacitation and fertilization. 展开更多
关键词 germ cell nuclear factor SPERM spatial expression temporal expression MOUSE
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中文文本时间信息获取及语义计算 被引量:10
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作者 徐永东 徐志明 +1 位作者 王晓龙 刘远超 《哈尔滨工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第3期438-442,共5页
为了解决中文文本中时间信息的形式表达、抽取及时间语义计算等一系列问题,提出了一种可以适用于多种自然语言处理任务的时间信息处理系统,通过对汉语句子时间要素的分析以及时间词语构成形式的研究,采用一种时间表达式的概念,将承载时... 为了解决中文文本中时间信息的形式表达、抽取及时间语义计算等一系列问题,提出了一种可以适用于多种自然语言处理任务的时间信息处理系统,通过对汉语句子时间要素的分析以及时间词语构成形式的研究,采用一种时间表达式的概念,将承载时间信息的短语按照功能的不同分解成若干容易识别,语义单一的“小”的成分,并在此基础上给出基于规则的时间信息抽取、理解及时间语义的计算方法. 展开更多
关键词 时间表达式 时间信息抽取 时间语义计算
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中文文本中时间信息抽取及规范化方法 被引量:9
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作者 宋国民 张三强 +1 位作者 贾奋励 姜松言 《测绘科学技术学报》 北大核心 2019年第5期538-544,共7页
时间信息抽取和规范化表达在时空泛在信息处理、关联、聚合和内容服务中具有重要作用。设计并实现了一种基于规则的时间信息抽取和规范化表达的方法。首先,结合中文文本中时间信息描述的特点,定义了基本时间单元和派生时间单元,并由时... 时间信息抽取和规范化表达在时空泛在信息处理、关联、聚合和内容服务中具有重要作用。设计并实现了一种基于规则的时间信息抽取和规范化表达的方法。首先,结合中文文本中时间信息描述的特点,定义了基本时间单元和派生时间单元,并由时间单元组合形成不同的时间表达式;然后,构建了时间词汇词典和时间表达式抽取的正则表达式模板;最后,设计了时间推理和计算的方法,实现了时间信息的规范化表达。基于中文文本语料进行了时间信息抽取测试。实验结果表明,本文方法具有较好的时间信息抽取效果。 展开更多
关键词 中文文本 时间 信息抽取 规范化 时间表达式 正则表达式 时间推理
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马氏珠母贝Dmrt5基因的克隆及时序表达模式分析 被引量:9
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作者 于非非 桂建芳 +2 位作者 周莉 王梅芳 余祥勇 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期844-850,共7页
Dmrt(Double sex and Mab-3 related transcription factor)基因是一类含有高度保守的DM(Double sex and Mab-3)结构域的基因家族,该基因家族的很多成员都参与了性别决定和分化过程的调控。目前已研究了很多物种的Dmrt基因,但对于具有... Dmrt(Double sex and Mab-3 related transcription factor)基因是一类含有高度保守的DM(Double sex and Mab-3)结构域的基因家族,该基因家族的很多成员都参与了性别决定和分化过程的调控。目前已研究了很多物种的Dmrt基因,但对于具有重要进化地位和经济价值的贝类,却鲜见相关报道。Dmrt5作为Dmrt基因家族的重要成员,是否也参与了动物的性别决定与分化的调控,至今为止没有定论。采用RACE-PCR技术,从马氏珠母贝(Pinctadamatensii,Dunker)精巢的SMARTcDNA中克隆了Dmrt5基因的全长cDNA序列。同源性比对显示,pmDmrt5编码的氨基酸序列与海胆、线虫、青鳉、斑马鱼、爪蟾和小鼠的Dmrt5基因的一致性分别为17.2%、26.7%、24.8%、18.7%、20.8%和15.8%。虽然各个物种间同源性并不高,但他们的DM结构域是高度保守的。RT-PCR结果表明,pmDm-rt5基因在雄性性腺中的表达量显著高于鳃、外套膜、闭壳肌、消化盲囊和雌性性腺;在早期雄性性腺、成熟期雄性性腺中的表达量显著高于性腺发育其他时期。这意味着pmDmrt5基因可能参与了马氏珠母贝性别发育的调控。 展开更多
关键词 马氏珠母贝 Dmrt5 性别发育 时序表达模式
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心肌细胞肥大过程中心脏发育相关转录因子及下游心脏肥大标志基因的时序性表达规律研究 被引量:11
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作者 罗漫 吴晓云 +2 位作者 郑敏 刘玲娟 田杰 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期394-401,共8页
目的观察在心肌细胞肥大过程中心脏发育相关转录因子及下游心脏肥大标志基因时序性表达规律,为心肌肥大机制研究提供线索。方法用异丙肾上腺素(ISO)干预心肌细胞,用CCK-8、细胞计数仪、免疫组化分别检测细胞存活率、细胞直径及表面积,用... 目的观察在心肌细胞肥大过程中心脏发育相关转录因子及下游心脏肥大标志基因时序性表达规律,为心肌肥大机制研究提供线索。方法用异丙肾上腺素(ISO)干预心肌细胞,用CCK-8、细胞计数仪、免疫组化分别检测细胞存活率、细胞直径及表面积,用RT-PCR、Western blotting分别检测相关基因mRNA及蛋白表达水平。结果用ISO成功构建心肌细胞肥大模型。ISO干预后,GATA结合蛋白4(GATA4)、肌细胞增强因子2C(MEF2C)、GATA5、脑钠肽(BNP)、心房利钠因子(ANP)于24h开始升高,P300、α-肌球蛋白重链(α-MHC)、T-框蛋白5(TBX5)于12h开始升高,血清应答因子(SRF)、β-MHC mRNA于6h开始升高(P<0.05);其中GATA4、α-MHC、β-MHC、SRF、P300 mRNA表达呈先升后降的趋势,至干预72h GATA4、SRF、α-MHC、β-MHC、P300 mRNA表达仍高于正常(P<0.05),而MEF2C降至正常(P>0.05);GATA5、TBX5、ANP、BNP mRNA表达与对照组相比持续升高(P<0.05),而NKX2.5 mRNA(P>0.05)无明显变化。ISO干预48h后,GATA4蛋白表达水平升高,HEY2蛋白表达水平降低(P<0.05)。结论在心肌细胞肥大过程中,MEF2C的时序表达规律与心脏发育过程相似,而GATA4、GATA5、SRF、TBX5的时序性表达规律与心脏发育过程不完全一致,提示其在心肌细胞肥大由代偿转为失代偿过程中的重要作用。同时GATA4、MEF2C、SRF与乙酰化酶P300的时序性表达规律相似,提示在心肌细胞肥大过程中其时序性表达可能受P300调控。 展开更多
关键词 心肌细胞肥大 心脏发育相关转录因子 心脏肥大标志基因 时序性表达
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食源性金黄色葡萄球菌肠毒素基因的分布与时序性表达 被引量:11
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作者 杨静 杨军 +3 位作者 黄继超 何玮玲 张驰 黄明 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第19期4057-4066,共10页
【目的】研究食源性金黄色葡萄球菌各血清型肠毒素基因的分布,并进一步分析其时序性表达规律。【方法】针对51株各类食品中分离的金黄色葡萄球菌菌株,应用PCR技术对11种葡萄球菌肠毒素进行基因分型;提取细菌总RNA,以ftsZ和ropB作为内标... 【目的】研究食源性金黄色葡萄球菌各血清型肠毒素基因的分布,并进一步分析其时序性表达规律。【方法】针对51株各类食品中分离的金黄色葡萄球菌菌株,应用PCR技术对11种葡萄球菌肠毒素进行基因分型;提取细菌总RNA,以ftsZ和ropB作为内标基因,使用反转录荧光定量PCR研究各肠毒素基因在细菌生长周期中的表达水平变化。【结果】除see、ses和set外,其余8种肠毒素基因在51株食源性金黄色葡萄球菌菌株中均有检出,且sei和seg的检出率最高(27.45%)。各肠毒素基因在mRNA水平的时序性表达规律基本一致,均在对数后期达到峰值,随后快速下降。以内标基因为参照,同一菌株中不同肠毒素基因的相对表达量以及不同菌株中同一肠毒素基因的相对表达量均差异较大。【结论】本文系统研究了肠毒素基因在食源性金黄色葡萄球菌中的分布,并探究了肠毒素基因的时序性表达规律,对金黄色葡萄球菌毒力机制研究与食品质量安全控制具有参考意义。 展开更多
关键词 食源性金黄色葡萄球菌 肠毒素 基因分型 时序性表达 荧光定量实时PCR
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难治性颞叶癫癇患者脑内KCNJ4基因表达的研究 被引量:9
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作者 吴洵昳 洪震 +2 位作者 高翔 朱国行 吕传真 《中华神经科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期242-245,共4页
目的观察内向整流钾离子通道亚单位基因KCNJ4mRNA及其编码的蛋白产物Kir2·3在难治性颞叶癫患者和急性脑外伤患者脑内的表达差异,从分子水平探讨难治性颞叶癫可能的发病机制。方法12例难治性颞叶癫患者手术切除的颞叶组织,10... 目的观察内向整流钾离子通道亚单位基因KCNJ4mRNA及其编码的蛋白产物Kir2·3在难治性颞叶癫患者和急性脑外伤患者脑内的表达差异,从分子水平探讨难治性颞叶癫可能的发病机制。方法12例难治性颞叶癫患者手术切除的颞叶组织,10例急性脑外伤患者相应部位颞叶组织,利用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)与蛋白印迹检测(Western-blot)方法检测两组间KCNJ4mRNA(KCNJ4mRNA/β-actin)与Kir2·3通道蛋白(Kir2·3/β-actin)的表达。结果难治性颞叶癫患者与脑外伤患者比较,颞叶组织KCNJ4mRNA(0·438±0·178)及Kir2·3通道蛋白(0·063)的表达水平均降低,差异有统计学意义(P<0·05)。结论KCNJ4mRNA表达水平的下调及其编码产物Kir2·3通道蛋白表达水平的下降,可能是难治性颞叶癫发生发展的重要的分子学基础之一。 展开更多
关键词 癫癎 颞叶 钾通道 内向整流 基因表达
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中文时间表达式及类型识别 被引量:9
8
作者 李君婵 谭红叶 王风娥 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2012年第S3期191-194,211,共5页
目前,时间信息识别在信息抽取、问答系统、摘要生成、话题跟踪和检测等领域中有着广泛应用,同时也是自然语言处理的重要研究任务之一。针对TempEval-2会议评测任务中的时间表达式识别和类型识别任务:1)句内时间表达式识别,2)时间表达式... 目前,时间信息识别在信息抽取、问答系统、摘要生成、话题跟踪和检测等领域中有着广泛应用,同时也是自然语言处理的重要研究任务之一。针对TempEval-2会议评测任务中的时间表达式识别和类型识别任务:1)句内时间表达式识别,2)时间表达式类型识别,分别提出了基于词性构建时间单元规则库的识别方法以及基于最大熵的类型识别方法。实验对象为中文,结果显示时间表达式识别的准确率为85.16%,时间表达式类型识别的准确率为93.02%。 展开更多
关键词 时间表达式 规则 时间表达式类型 最大熵 自然语言处理
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关于时间透视的研究 被引量:8
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作者 吕厚超 黄希庭 《西南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1999年第3期351-356,共6页
对时间透视的概念作了概述,介绍了测量时间透视的两种方法类型及一些具体的相关方法技术,简要总结了时间透视研究中的两大争议点。
关键词 时间透视 目标测量法 年龄差异 时间心理学
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基于规则的中文文本时间表达式识别和规范化方法 被引量:8
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作者 马雷雷 李宏伟 +2 位作者 魏勇 梁汝鹏 龚竞 《信息工程大学学报》 2017年第5期560-565,共6页
时间信息是事件的基本要素之一,时间信息识别在信息处理中处于基础地位。提出了一种基于规则的时间表达式识别和规范化方法。首先对中文文本时间表达式进行分类,基于正则表达式制定规则,利用模式匹配方法识别时间表达式;然后介绍了基准... 时间信息是事件的基本要素之一,时间信息识别在信息处理中处于基础地位。提出了一种基于规则的时间表达式识别和规范化方法。首先对中文文本时间表达式进行分类,基于正则表达式制定规则,利用模式匹配方法识别时间表达式;然后介绍了基准时间的确定方法,基于推理思想详细分析了时间表达式的规范化过程;最后通过实验进行了测试与分析,结果表明文章的方法具有较高的准确率、召回率和F值。 展开更多
关键词 时间表达式 中文文本 规则 正则表达式 识别 规范化 推理
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牛PLIN1基因CDS区扩增及时序表达 被引量:8
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作者 雷召雄 魏大为 +2 位作者 汪书哲 杨梦丽 马云 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1472-1478,共7页
PLIN1(Perilipin1)基因是调控脂类代谢的“分子开关”,其编码的脂滴包被蛋白是脂滴表面含量最丰富的蛋白,在脂肪沉积中起关键作用。采用RT-PCR方法扩增牛PLIN1基因编码区序列,利用组织块法和消化法分离培养牛前体脂肪细胞,进一步利用qPC... PLIN1(Perilipin1)基因是调控脂类代谢的“分子开关”,其编码的脂滴包被蛋白是脂滴表面含量最丰富的蛋白,在脂肪沉积中起关键作用。采用RT-PCR方法扩增牛PLIN1基因编码区序列,利用组织块法和消化法分离培养牛前体脂肪细胞,进一步利用qPCR技术检测PLIN1在牛皮下前体脂肪细胞诱导分化过程中(0、2、4、6、10 d)mRNA的相对表达水平。结果表明,牛PLIN1基因CDS区长为1551 bp,共编码517个氨基酸;细胞时序表达结果显示,诱导分化的第0天PLIN1不表达,随着分化时间的推移,其表达量呈上升趋势,与分化的第2天相比,在第6天和第10天表达量上升最快,PPARγ在分化的第0天有少量表达,表达趋势与PLIN1一致,在第6天和第10天显著升高。表明PLIN1在牛脂肪组织生成过程中起重要作用,在前体脂肪细胞分化阶段依赖于PPARγ的表达而表达。 展开更多
关键词 PLIN1 基因克隆 时序表达
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金黄色葡萄球菌新型肠毒素sek基因在3株食品分离菌株中的表达 被引量:7
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作者 王琼 唐俊妮 +3 位作者 汤承 陈娟 刘骥 蔡自建 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第13期140-146,共7页
目的:肠毒素sek基因在临床分离的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌菌株中较为流行,研究新型肠毒素sek基因的时序性表达可为食物中毒预防和疾病控制补充新的基础数据。方法:本研究针对实验室保存的食源性金黄色葡萄球菌菌株进行21种肠毒素基... 目的:肠毒素sek基因在临床分离的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌菌株中较为流行,研究新型肠毒素sek基因的时序性表达可为食物中毒预防和疾病控制补充新的基础数据。方法:本研究针对实验室保存的食源性金黄色葡萄球菌菌株进行21种肠毒素基因检测,筛选出3株含sek基因的菌株SA005、SA008和SAB0,针对3株菌株进行生长曲线测定,随后在培养不同时间段收集菌体提取RNA,利用实时荧光定量聚合酶链式反应(real time-polymerase chain reaction,real time-PCR)检测肠毒素sek基因在12~120 h的相对表达水平。结果:基因检测结果显示,菌株SA005含有16S、nuc、mec A、seb、sec、sek、sex基因,SA008含有16S、nuc、mec A、sea、sek、sex基因,SAB0含有16S、nuc、sek、sex基因。3株菌株在胰酪胨大豆肉汤培养基中的生长曲线趋势较相似,18 h左右出现折点,之后细菌进入生长稳定期。3株菌株的sek基因在12~120 h全程表达,SA005的sek基因在48 h时相对表达量最高,在84 h相对表达量最低;SA008在24 h时的相对表达量最高,在48 h相对表达量最低,在60~120 h表达量相对比较稳定;SAB0在12~120 h之间相对表达量呈现抛物线趋势,在60 h和72 h的表达量相对较高且差异不显著(P〉0.05)。结论:3株菌株sek表达水平存在明显差异,相同菌株sek基因不同时间点表达也存在差异性,菌株基因背景的影响可能是造成sek基因表达差异性的关键。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 新型肠毒素 sek基因 实时荧光定量聚合酶链式反应 时序性表达
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Temporal control of the Aux/IAA genes BnIAA32 and BnIAA34 mediates Brassica napus dual shade responses 被引量:1
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作者 Yafei Li Yiyi Guo +5 位作者 Yue Cao Pengguo Xia Dongqing Xu Ning Sun Lixi Jiang Jie Dong 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2024年第5期928-942,共15页
Precise responses to changes in light quality are crucial for plant growth and development.For example,hypocotyls of shade-avoiding plants typically elongate under shade conditions.Although this typical shade-avoidanc... Precise responses to changes in light quality are crucial for plant growth and development.For example,hypocotyls of shade-avoiding plants typically elongate under shade conditions.Although this typical shade-avoidance response(TSR)has been studied in Arabidopsis(Arabidopsis thaliana),the molecular mechanisms underlying shade tolerance are poorly understood.Here we report that B.napus(Brassica napus)seedlings exhibit dual shade responses.In addition to the TSR,B.napus seedlings also display an atypical shade response(ASR),with shorter hypocotyls upon perception of early-shade cues.Genome-wide selective sweep analysis indicated that ASR is associated with light and auxin signaling.Moreover,genetic studies demonstrated that phytochrome A(BnphyA)promotes ASR,whereas BnphyB inhibits it.During ASR,YUCCA8 expression is activated by early-shade cues,leading to increased auxin biosynthesis.This inhibits hypocotyl elongation,as young B.napus seedlings are highly sensitive to auxin.Notably,two non-canonical AUXIN/INDOLE-3-ACETIC ACID(Aux/IAA)repressor genes,BnIAA32 and BnIAA34,are expressed during this early stage.BnIAA32 and BnIAA34 inhibit hypocotyl elongation under shade conditions,and mutations in BnIAA32 and BnIAA34 suppress ASR.Collectively,our study demonstrates that the temporal expression of BnIAA32 and BnIAA34 determines the behavior of B.napus seedlings following shade-induced auxin biosynthesis. 展开更多
关键词 Brassica napus high-density planting IAA32/34 light signal transduction shade response temporal gene expression
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饲粮半胱氨酸水平对獭兔生产性能、氮代谢、毛皮品质及KAP6.1基因时序表达的影响 被引量:7
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作者 常馨月 张恩平 +1 位作者 陈玉林 曾洁 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期764-769,共6页
本研究旨在研究饲粮半胱氨酸水平对獭兔生产性能、氮代谢及毛皮品质和KAP6.1基因时序表达的影响。选取120只90日龄健康獭兔随机分为4组(每组30个重复,每个重复1只兔),对照组饲喂基础日粮,试验组饲喂基础饲粮中添加0.25%、0.35%、0.45%... 本研究旨在研究饲粮半胱氨酸水平对獭兔生产性能、氮代谢及毛皮品质和KAP6.1基因时序表达的影响。选取120只90日龄健康獭兔随机分为4组(每组30个重复,每个重复1只兔),对照组饲喂基础日粮,试验组饲喂基础饲粮中添加0.25%、0.35%、0.45%水平的半胱氨酸的试验饲粮,预饲期7d,正式期40d。结果,饲粮半胱氨酸水平0.25%、0.45%组末重显著高于0%、0.35%组(P<0.05)。饲粮半胱氨酸水平0.35%、45%组采食量(P<0.05)显著高于0%、0.25%组,对平均日增重、料重比无显著影响(P>0.05);半胱氨酸0.35%组食入氮、可消化氮极显著高于其他组(P<0.01),0.45%组的沉积氮显著高于对照组(P<0.05),对粪氮、尿氮、表观消化率、氮利用率、氮生物效价均无显著影响(P>0.05);饲粮半胱氨酸水平0.45%组处理40d皮张面积显著大于其余各组(P<0.05)。饲粮半胱氨酸水平0.45%、0.35%组处理30d被毛密度显著高于0%、0.25%水平组(P<0.05),对皮张厚度无显著性影响(P>0.05);饲粮半胱氨酸水平0.45%处理20d,KAP6.1基因在软骨、皮肤中表达量均显著高于其他组(P<0.05),而对处理10、30、40dKAP6.1基因在软骨、皮肤中表达量无显著影响(P>0.05)。综上所述,獭兔饲粮中半胱氨酸适宜添加量为0.45%,且110~120日龄使用效果最佳。 展开更多
关键词 獭兔 半胱氨酸 生产性能 氮代谢 KAP6 1 时序表达
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灰飞虱保幼激素结合蛋白基因的克隆及表达动态 被引量:7
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作者 贺秀婷 张亚楠 +2 位作者 李飞 李国清 董双林 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期59-64,共6页
克隆了灰飞虱的1个保幼激素结合蛋白(JHBP)基因,命名为LstrJHBP(GenBank登录号:JF728808)。该基因全长1 514 bp,开放阅读框编码289个氨基酸,5'和3'UTR区分别为124和522 bp,预测的相对分子质量为32 599,等电点5.47。综合信号肽... 克隆了灰飞虱的1个保幼激素结合蛋白(JHBP)基因,命名为LstrJHBP(GenBank登录号:JF728808)。该基因全长1 514 bp,开放阅读框编码289个氨基酸,5'和3'UTR区分别为124和522 bp,预测的相对分子质量为32 599,等电点5.47。综合信号肽预测、氨基酸序列比对及聚类分析结果,推测LstrJHBP是一个细胞质JHBP。qRT-PCR测定表明,LstrJHBP在灰飞虱若虫5个龄期及雌雄成虫均有表达,但4龄若虫期显著高于其他龄期,雌雄成虫间没有显著差异。研究结果为进一步明确灰飞虱的发育及变态调控机制奠定了基础。 展开更多
关键词 灰飞虱 保幼激素结合蛋白 基因克隆 表达动态 QRT-PCR
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基于词干提取的维吾尔语事件类时间短语识别 被引量:6
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作者 邹岳琳 吐尔根.依布拉音 +2 位作者 麦热哈巴.艾力 艾山.吾买尔 帕力旦.吐尔逊 《计算机工程与设计》 CSCD 北大核心 2014年第2期625-630,共6页
针对维吾尔语事件类时间短语没有明显时间词特征词而引起的识别困难和边界定位不准确等问题,提出了一种统计结合词干提取的针对黏着性语言的事件类时间短语的识别方法。根据维吾尔语典型的黏着性语言形态特点,对时间短语构成进行分析和... 针对维吾尔语事件类时间短语没有明显时间词特征词而引起的识别困难和边界定位不准确等问题,提出了一种统计结合词干提取的针对黏着性语言的事件类时间短语的识别方法。根据维吾尔语典型的黏着性语言形态特点,对时间短语构成进行分析和分类,采用机器学习的方法将难于识别的事件类隐性时间短语识别问题转换为基于统计方法的序列标注;通过对维吾尔语事件类时间要素分析及维吾尔语构词的研究,引入黏着语特有的词干特征,选定实验特征集合,对比分析不同的特征集合的自动识别准确率的平均值。实验结果表明,该方法对维吾尔语事件类时间短语识别的F-值达到85.37%。这一结果对其它黏着性语言的研究具有参考意义。 展开更多
关键词 自然语言处理 时间短语 条件随机场 黏着语 事件类时间 特征选择 词干提取
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贵州黑山羊ADD1基因克隆、生物信息学及组织表达规律研究
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作者 杨洋 袁超 +1 位作者 龙勇 肖文 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第2期43-49,59,共8页
为了分析贵州黑山羊ADD1基因编码区序列(coding sequence, CDS)信息及在组织中的表达规律,试验克隆了贵州黑山羊ADD1基因CDS并进行了生物信息学分析,同时分析了该基因在12月龄贵州黑山羊心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、皮下脂肪、背最... 为了分析贵州黑山羊ADD1基因编码区序列(coding sequence, CDS)信息及在组织中的表达规律,试验克隆了贵州黑山羊ADD1基因CDS并进行了生物信息学分析,同时分析了该基因在12月龄贵州黑山羊心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、皮下脂肪、背最长肌和腿肌组织中的表达规律,以及在1,3,6,9,12月龄贵州黑山羊皮下脂肪、背最长肌和腿肌组织中的表达时序情况。结果表明:贵州黑山羊ADD1基因CDS大小为2 304 bp,编码767个氨基酸,与山羊ADD1基因序列相似性较高,与禽类的相似性较低;ADD1蛋白中的主要氨基酸为丝氨酸(Ser)、脯氨酸(Pro)、谷氨酸(Glu)和亮氨酸(Leu),含量分别为9.0%、8.7%、8.5%、8.2%,分子质量为84.05 ku,分子式为C_(3682)H_(5840)N_(1036)S_(24),理论等电点为5.74,为不稳定蛋白和亲水蛋白,主要定位在细胞核中,与ADD蛋白家族(ADD2和ADD3)、加帽蛋白(capping actin protein, CAPG)、肌侵蛋白(myotrophin, MTPN)、X盒结合蛋白1(X-box binding protein 1,XBP1)、固醇调节元件结合蛋白1(sterol-regulatory element-binding protein 1,SREBP1)等蛋白存在相互作用,二级结构和三级结构中主要含有α螺旋和无规则卷曲;ADD1基因在12月龄贵州黑山羊心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、皮下脂肪、背最长肌和腿肌组织中均有表达,皮下脂肪中的表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01),其次在心脏、背最长肌、肝脏和腿肌中表达量较高,在脾脏中表达量最低。ADD1基因在1,3月龄贵州黑山羊脂肪、背最长肌和腿肌组织中的表达量均较低。在脂肪组织中6月龄时最高,极显著高于其他月龄(P<0.01);3月龄时最低,极显著低于其他月龄(P<0.01)。在背最长肌中9,12月龄较高,二者差异不显著(P>0.05),但均极显著高于其他月龄(P<0.01);6月龄表达量最低,与1月龄差异不显著(P>0.05),但二者均极显著低于其他月龄(P<0.01)。在腿肌中9月龄时最高,极显著高于其他月龄(P<0.01); 展开更多
关键词 贵州黑山羊 ADD1基因 生物信息学分析 组织表达 背最长肌 腿肌 时序表达
原文传递
藏鸡FTO基因表达的时空特性及与肌内脂肪含量的相关分析 被引量:6
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作者 林森 林亚秋 +2 位作者 朱江江 徐亚欧 王永 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期1191-1201,共11页
旨在获得藏鸡FTO基因序列,并分析其生物学特性,阐明其组织及时序表达规律,同时揭示该基因在不同发育阶段肌肉组织中的表达水平与肌内脂肪含量的关系。选取1~210日龄健康藏鸡为试验材料,采集心、肝、脾、肺、肾、胸肌、腿肌和皮下脂肪组... 旨在获得藏鸡FTO基因序列,并分析其生物学特性,阐明其组织及时序表达规律,同时揭示该基因在不同发育阶段肌肉组织中的表达水平与肌内脂肪含量的关系。选取1~210日龄健康藏鸡为试验材料,采集心、肝、脾、肺、肾、胸肌、腿肌和皮下脂肪组织样品,提取组织总RNA,利用RT-PCR方法克隆FTO基因序列,同时利用实时荧光定量PCR检测其在各组织及不同发育阶段的mRNA表达丰度,并将其表达量与肌内脂肪含量进行相关分析。结果表明,获得藏鸡FTO的基因序列长1 585bp(GenBank登陆号:KY366175),其中CDS为1 524bp,5′UTR 35bp和3′UTR 26bp,编码507个氨基酸,具有一个N端结构域和一个C端结构域。藏鸡与原鸡FTO氨基酸相比发生了6个氨基酸突变。FTO基因在藏鸡的各个组织中广泛表达,在脾组织中的表达水平极显著高于其他组织(P<0.01),在脂肪组织和肺组织也存在较高水平的表达。时序表达谱显示,FTO基因在藏鸡胸肌和腿肌具有不同的表达模式,在胸肌中的表达水平随生长日龄的增加呈逐渐下降的趋势,而在腿肌中的表达水平随生长日龄的增加呈先上升后下降的趋势。藏鸡在不同发育阶段,不同肌肉组织中FTO基因表达水平与IMF含量具有不同程度的相关性,其中FTO基因表达水平与藏鸡胸肌IMF含量呈负相关,并且在母鸡中的相关性达到显著水平(P<0.05)。而公鸡FTO基因表达水平与腿肌IMF含量呈正相关(在119~210日龄阶段r=0.601,P<0.05),母鸡则相反。研究结果提示,FTO基因可能在藏鸡生长发育过程中对肌内脂肪沉积起重要调控作用,本试验结果将为藏鸡FTO基因的结构和功能的进一步研究奠定基础。 展开更多
关键词 藏鸡 FTO基因 组织表达 时序表达 肌内脂肪含量
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基于词典特征优化和依存关系的中文时间表达式识别 被引量:4
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作者 高源 席耀一 +1 位作者 李弼程 李苏奕 《信息工程大学学报》 2016年第4期490-495,共6页
提出一种基于词典特征优化和依存关系的时间表达式识别方法。首先针对中文文本时间表达式边界定位不准确及长距离依赖的问题,优化了传统时间词典特征,将时间词典分为时间词词典和时间单位词典;其次针对传统基于机器学习的时间表达式识... 提出一种基于词典特征优化和依存关系的时间表达式识别方法。首先针对中文文本时间表达式边界定位不准确及长距离依赖的问题,优化了传统时间词典特征,将时间词典分为时间词词典和时间单位词典;其次针对传统基于机器学习的时间表达式识别方法忽视时间表达式本身结构特点的问题,在优化后的词典特征的基础上提取依存特征,挖掘时间表达式的结构信息;最后综合时间表达式的基本特征、词典特征和依存特征,在条件随机场模型上完成时间表达式识别。在中文语料上进行实验,时间表达式识别达到较好效果。 展开更多
关键词 时间表达式 时间表达式识别 时间词典 条件随机场 依存句法分析
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The temporal-spatial expression and functional analysis of three gustatory receptor genes in Solenopsis invicta using sweet and bitter compounds
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作者 Muhammad Irfan Waris Yanyuan Lei +4 位作者 Guojun Qi Ziying Guan Abdul Rashied Jie Chen Lihua Lyu 《Insect Science》 SCIE CAS CSCD 2024年第2期448-468,共21页
The insect gustatory system participates in identifying potential food sources and avoiding toxic compounds.During this process,gustatory receptors(GRs)recognize feeding stimulant and deterrent compounds.However,the G... The insect gustatory system participates in identifying potential food sources and avoiding toxic compounds.During this process,gustatory receptors(GRs)recognize feeding stimulant and deterrent compounds.However,the GRs involved in recognizing stimulant and deterrent compounds in the red imported fire ant,Solenopsis invicta,remain unknown.Therefore,we conducted a study on the genes SinvGR1,SinvGR32b,and SinvGR28a to investigate the roles of GRs in detecting feeding stimulant and deterrent compounds.In this current study,we found that sucrose and fructose are feeding stimulants and the bitter compound quinine is a feeding deterrent.The fire ant workers showed significant behavior changes to avoid the bitter taste in feeding stimulant compounds.Reverse transcription quantitative real-time polymerase chain reaction results from developmental stages showed that the SinvGR1,SinvGR32b,and SinvGR28a genes were highly expressed in fire ant workers.Tissue-specific expression profiles indicated that SinvGR1,SinvGR32b,and SinvGR28a were specifically expressed in the antennae and foreleg tarsi of workers,whereas SinvGR32b gene transcripts were also highly accumulated in the male antennae.Furthermore,the silencing of SinvGRI or SinvGR32b alone and the co-silencing of both genes disrupted worker stimulation and feeding on sucrose and fructose.The results also showed that SinvGR28a is required for avoiding quinine,as workers with knockdown of the SinvGR28a gene failed to avoid and fed on quinine.This study first identified stimulant and deterrent compounds of fire ant workers and then the GRs involved in the taste recognition of these compounds.This study could provide potential target gustatory genes for the control of the fire ant. 展开更多
关键词 behavioral responses feeding assays gustatory receptors RNA interference Solenopsis invicta temporal-spatial expression
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