期刊文献+
共找到182篇文章
< 1 2 10 >
每页显示 20 50 100
乙型脑炎病毒TaqMan PCR检测方法的建立及初步应用 被引量:22
1
作者 刘卫滨 付士红 +6 位作者 宋宏 王环宇 曹玉玺 何英 王俊文 王力华 梁国栋 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第8期656-662,共7页
目的利用TaqMan PCR技术,建立乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)实时荧光PCR检测方法,初步应用于蚊虫媒介的JEV监测。方法根据GenBank发表的JEV全基因组序列资料分析结果,在其NS5基因区段设计JEV特异的引物与探针;优化Mg2... 目的利用TaqMan PCR技术,建立乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)实时荧光PCR检测方法,初步应用于蚊虫媒介的JEV监测。方法根据GenBank发表的JEV全基因组序列资料分析结果,在其NS5基因区段设计JEV特异的引物与探针;优化Mg2+浓度和引物浓度比例,并利用11株JEV和7株相关病毒株考核检测体系的保守性、特异性、灵敏性和稳定性;利用体外转录的病毒RNA和定量的病毒样品,建立相应的定量分析模型;初步应用于蚊虫媒介的监测与检测分析。结果Mg2+优化浓度为5mmolL,上下游引物浓度比例为4∶1,引物探针具有良好的保守性和特异性,灵敏度为10PFUml,稳定性分析表明,同一样品Ct值的重复检测5次,变异系数均小于5%;绘制两种标准曲线,构建了JEV基因拷贝数、病毒滴度为分析指标的定量分析模型,检测蚊虫标本结果显示,TaqMan PCR方法较病毒分离法敏感、快捷、简便。结论本研究建立了一种灵敏、特异、简便易行的JEVTaqMan PCR检测方法,为蚊虫媒介检测奠定了基础,为乙型脑炎的预防控制和脑炎相关疾病的诊断与鉴别诊断提供了一种技术手段。 展开更多
关键词 乙型脑炎病毒 taqman pcr 定量 pcr检测方法 初步应用 ENCEPHALITIS MG^2+ 稳定性分析 定量分析
原文传递
狂犬病毒TaqMan PCR检测方法的建立 被引量:10
2
作者 张强 唐青 +2 位作者 刘卫滨 李浩 梁国栋 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期889-893,共5页
目的建立检测狂犬病毒(RV)核蛋白(N)基因片段的TaqMan PCR检测方法。方法针对RV N基因保守区域设计特异性引物与探针;优化检测体系中引物与探针的浓度;以体外转录的RV完整的N基因RNA作为定量分析模型;考核检测体系灵敏性、特异性、稳定... 目的建立检测狂犬病毒(RV)核蛋白(N)基因片段的TaqMan PCR检测方法。方法针对RV N基因保守区域设计特异性引物与探针;优化检测体系中引物与探针的浓度;以体外转录的RV完整的N基因RNA作为定量分析模型;考核检测体系灵敏性、特异性、稳定性;初步用于RV的检测。结果引物和探针具有良好的特异性,使用浓度分别为0.6μmol/L和0.2μmol/L,可检测到2700个RNA拷贝数,较传统RT-PCR检测方法敏感性提高了10倍;同一样品Ct值重复检测5次,变异系数均<5%,表明检测体系具有较好的稳定性;通过所建立的检测体系,绘制了以模板拷贝数为分析指标的RV定量检测标准曲线,对实验室内保存毒株的检测结果显示TaqMan PCR检测比普通PCR检测更快捷、敏感。结论所建立的RV TaqMan PCR可以用于RV的实验室检测,并且比普通PCR检测方法更灵敏、特异。 展开更多
关键词 狂犬病毒 taqman pcr检测 定量
原文传递
应用TaqMan荧光定量PCR快速检测鹿血中副结核分枝杆菌 被引量:9
3
作者 王春雨 杨莉 +5 位作者 刘金华 宋占昀 周亮 王海军 王振国 王全凯 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期208-210,共3页
为建立快速检测鹿血中副结核分枝杆菌(Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis,MAP)的荧光定量PCR方法,本研究根据GenBank中登录的MAPf57基因序列设计并合成引物及探针,并检测该方法的特异性和敏感性。试验结果显示,该方法具有良... 为建立快速检测鹿血中副结核分枝杆菌(Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis,MAP)的荧光定量PCR方法,本研究根据GenBank中登录的MAPf57基因序列设计并合成引物及探针,并检测该方法的特异性和敏感性。试验结果显示,该方法具有良好的特异性,对MAP的检测灵敏度可以达到单个菌细胞。对长春地区采集的549份血清样品进行检测,结果显示阳性血清101份,阳性率达到18.4%。本研究结果表明,荧光定量PCR用于动物性产品MAP的检测具有快速、准确的特点。 展开更多
关键词 副结核病 克罗恩病 taqman pcr 血液 检测
下载PDF
副溶血性弧菌LUX^TM荧光PCR快速检测方法的建立 被引量:5
4
作者 许如苏 陈茹 +2 位作者 林彩华 杨梓坚 陈冠武 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期1075-1079,共5页
根据LUXTM荧光PCR技术原理,针对副溶血性弧菌toxR基因的保守序列,设计了特异的LUXTM荧光标记引物,通过优化反应条件与参数,建立了可快速检测副溶血性弧菌的LUXTM荧光PCR方法。结果显示,该方法高度敏感,对纯菌的检测低限达到每个反应体系... 根据LUXTM荧光PCR技术原理,针对副溶血性弧菌toxR基因的保守序列,设计了特异的LUXTM荧光标记引物,通过优化反应条件与参数,建立了可快速检测副溶血性弧菌的LUXTM荧光PCR方法。结果显示,该方法高度敏感,对纯菌的检测低限达到每个反应体系7个菌(CFU),经6 h增菌培养后检测,对样品的检测低限(CFU)达到100/25 g;特异性强,对副溶血性弧菌2株标准菌株和10株参考菌株的检验均呈阳性,而对霍乱弧菌等28株非目标菌的检测均呈阴性;重复性好,定量检测的批内和批间变异系数均小于1%。应用此方法检测水产样品103份,检出阳性样品6份,与TaqMan荧光PCR和SN标准的检测结果完全一致。用此方法可在8 h内完成对样品中副溶血性弧菌的检测,其检测的快速性、敏感性和特异性与TaqMan荧光PCR技术相当,但检测成本更低。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 LUX^TM荧光pcr taqman荧光pcr
下载PDF
TaqMan PCR检测乙型脑炎病毒方法的建立及应用 被引量:6
5
作者 阳帆 刘建军 +3 位作者 何建凡 杨洪 张海龙 冼慧霞 《中国卫生检验杂志》 CAS 2008年第10期1962-1964,共3页
目的:利用TaqMan PCR技术,建立乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)实时荧光PCR检测方法,探讨其用于临床诊断的可行性。方法:根据GenBank发表的JEV全基因组序列资料分析结果,在其3′端非编码区(UTR)设计JEV特异的引物与探针... 目的:利用TaqMan PCR技术,建立乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)实时荧光PCR检测方法,探讨其用于临床诊断的可行性。方法:根据GenBank发表的JEV全基因组序列资料分析结果,在其3′端非编码区(UTR)设计JEV特异的引物与探针,验证检测体系的特异性、灵敏性和稳定性,并用于临床乙脑病人样本的检测。结果:引物、探针具有良好的特异性,用该TaqMan PCR法检测JEV减毒株SA14-14-2灵敏度可达1 TCID50/ml。稳定性分析表明,同一样本重复检测5次,Ct值变异系数均小于5%。在此基础上,实时荧光PCR检测了10份临床上确诊为乙脑患者的标本(特异性IgM阳性),6份阳性,阳性率为60%。在7份特异性IgM阴性、临床上疑似乙脑的患者中,2份TaqMan PCR结果为阳性,阳性率为28.6%。此方法从RNA提取到检测结果仅需1.5 h。结论:本研究建立了一种灵敏、特异、简便易行的JEV TaqMan PCR检测方法,为乙型脑炎的鉴别诊断提供了一种技术手段。 展开更多
关键词 乙型脑炎病毒 实时荧光pcr
下载PDF
建立检测产气肠杆菌的TaqMan荧光定量PCR和普通PCR方法 被引量:2
6
作者 王怡倩 叶长芸 《疾病监测》 CAS 2016年第2期153-158,共6页
目的建立敏感、特异的普通聚合酶链反应(PCR)方法和Taq Man荧光定量PCR方法对产气肠杆菌进行快速检测。方法以产气肠杆菌组氨酸脱氢酶基因(hdc)为靶基因设计引物以及Taq Man FAM探针,建立对产气肠杆菌进行检测的普通PCR方法和Taq Ma... 目的建立敏感、特异的普通聚合酶链反应(PCR)方法和Taq Man荧光定量PCR方法对产气肠杆菌进行快速检测。方法以产气肠杆菌组氨酸脱氢酶基因(hdc)为靶基因设计引物以及Taq Man FAM探针,建立对产气肠杆菌进行检测的普通PCR方法和Taq Man荧光定量PCR方法,并评价该方法的特异性、灵敏性和稳定性。结果普通PCR和Taq Man荧光定量PCR方法均能对产气肠杆菌进行特异检测;普通PCR方法对质粒标准品和粪便模拟标本的检测下限分别为100 copies/μl和1.0×105cfu/g,Taq Man荧光定量PCR方法对质粒标准品和粪便模拟标本的检测下限分别为33copies/μl和1.0×104cfu/g;Taq Man荧光定量PCR方法对质粒标准品和粪便模拟标本检测的扩增曲线良好;在稳定性评价试验中,普通PCR方法的重复性良好,Taq Man荧光定量PCR方法对质粒标准品检测Ct值的组内差异为0.15%~0.98%,组间差异为0.55%~1.63%。结论本研究建立的检测产气肠杆菌的普通PCR方法和Taq Man荧光PCR方法特异性好、灵敏度高,能够用于产气肠杆菌的快速检测。 展开更多
关键词 产气肠杆菌 普通pcr taqman荧光定量pcr
原文传递
输卵管性不孕患者输卵管黏膜CT DNA定量表达 被引量:4
7
作者 李琳 余妙真 +2 位作者 张帝开 杨冬梓 邝健全 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 2004年第11期100-102,共3页
目的探讨沙眼衣原体(CT)DNA在输卵管性不孕患者输卵管黏膜定量表达的特点。方法采用荧光定量PCR检测43例输卵管性不孕患者和26例非输卵管疾病患者的宫颈分泌物和输卵管黏膜CTDNA。结果病例组宫颈和输卵管CTDNA阳性率分别为25.6%、33.3%... 目的探讨沙眼衣原体(CT)DNA在输卵管性不孕患者输卵管黏膜定量表达的特点。方法采用荧光定量PCR检测43例输卵管性不孕患者和26例非输卵管疾病患者的宫颈分泌物和输卵管黏膜CTDNA。结果病例组宫颈和输卵管CTDNA阳性率分别为25.6%、33.3%,明显高于对照组(P<0.05)。病例组宫颈和输卵管CTDNA的定量值高于对照组(P<0.05)。宫颈分泌物、输卵管黏膜CTDNA定量表达与输卵管阻塞程度和盆腔黏连程度均未见相关性(P<0.05)。结论CT感染与输卵管性不孕症密切相关,对输卵管性不孕患者进行生殖道CT检测具有较重要的临床意义。 展开更多
关键词 输卵管性疾病 女性 不孕症 沙眼衣原体 荧光定量pcr
下载PDF
使用Taqman PCR技术建立人类血小板抗原-1~5、15分型体系 被引量:1
8
作者 沈彤 赵玉林 +1 位作者 刘熔增 刘达庄 《中国输血杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期936-938,共3页
目的了解上海地区单采血小板献血人群HPA-1~5、15多态性分布,分析评估新的分型技术。方法利用TaqMan PCR技术对500份上海地区单采血小板供者标本进行HPA-1~5、15抗原系统等位基因分型,并随机抽取100份标本使用PCR-SSP技术进行比对。结... 目的了解上海地区单采血小板献血人群HPA-1~5、15多态性分布,分析评估新的分型技术。方法利用TaqMan PCR技术对500份上海地区单采血小板供者标本进行HPA-1~5、15抗原系统等位基因分型,并随机抽取100份标本使用PCR-SSP技术进行比对。结果 HPA各等位基因频率分别为HPA-1a:0.999,HPA-1b:0.001,HPA-2a:0.953,HPA-2b:0.047,HPA-3a:0.582,HPA-3b:0.418,HPA-4a:0.999,HPA-4b:0.001,HPA-5a:0.988,HPA-5b:0.012,HPA-15a:0.524,HPA-15b:0.476;有1份标本HPA-5等位基因与SSP检测结果产生差异。结论上海地区HPA各等位基因频率与国内各地区人群分布无明显差异,与中国汉族人群HPA分布情况基本吻合,实验数据经验证符合Hardy-Weinberg平衡定律,实验结果准确可靠;HPA-5差异经测序验证判断可能由PCR-SSP非特异扩增所致;TaqMan技术在HPA抗原系统分型应用中特异性高,反应时间短,具有良好的应用前景,是现有技术方法的一种重要补充。 展开更多
关键词 HPA taqman pcr 基因频率 多态性
下载PDF
金属硫蛋白基因多态性与昆明地区汉族2型糖尿病的相关性研究 被引量:1
9
作者 颜穗珺 郭伟昌 +5 位作者 周晓伟 李佳丽 乐小婧 董雪娥 宋滇平 李会芳 《中国糖尿病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期529-533,共5页
目的 探讨金属硫蛋白(MT)1A基因rs8052394多态性与昆明地区汉族T2DM的相关性。方法 采用Taqman实时荧光定量PCR技术对257例T2DM患者(T2DM组)和108名健康对照(NC)组MT1A基因型进行检测。结果 T2DM组MT1A基因rs8052394A/A基因型频率及... 目的 探讨金属硫蛋白(MT)1A基因rs8052394多态性与昆明地区汉族T2DM的相关性。方法 采用Taqman实时荧光定量PCR技术对257例T2DM患者(T2DM组)和108名健康对照(NC)组MT1A基因型进行检测。结果 T2DM组MT1A基因rs8052394A/A基因型频率及A等位基因频率高于NC组(χ~2=20.519、29.213,P<0.01)。Logistic回归分析显示,MT1A rs8052394A/A基因型携带者相对于A/G和G/G基因型携带者患T2DM的危险性增加。结论 昆明地区汉族人群MT1A基因rs8052394多态性可能与T2DM的发生有关,A等位基因可能增加T2DM的发病风险。 展开更多
关键词 金属硫蛋白1A基因 多态性 糖尿病 2型 taqman实时荧光定量pcr
原文传递
Taqman PCR检测人博卡病毒的阳性率 被引量:1
10
作者 邓幼平 刘颖娟 +4 位作者 王笑臣 张一卉 刘媛媛 杨占秋 赵东赤 《海南医学院学报》 CAS 2014年第3期289-292,共4页
目的:建立核酸特异、快速、敏感的Taqman探针实时定量PCR检测方法筛选疑似人博卡病毒(HBoV)感染者鼻咽拭子临床样本中的阳性样本。方法:比对编码HBoV-sh9的基因序列,选取保守区序列设计引物和探针,建立Taqman PCR检测人博卡病毒的阳性... 目的:建立核酸特异、快速、敏感的Taqman探针实时定量PCR检测方法筛选疑似人博卡病毒(HBoV)感染者鼻咽拭子临床样本中的阳性样本。方法:比对编码HBoV-sh9的基因序列,选取保守区序列设计引物和探针,建立Taqman PCR检测人博卡病毒的阳性率的方法,进行特异性实验,检测214例临床样本。结果:所建立的Taqman PCR方法可以用于检测人博卡病毒的阳性率,对所收集得到的214例急性上呼吸道感染者的咽拭子标本进行检测,结果显示,荧光定量PCR检测出8例阳性,其阳性率为3.74%。结论:建立了HBoV TaqMan探针实时定量PCR检测方法,可以快速灵敏的检测出阳性人博卡病毒,为临床治疗提供快速可靠的诊断依据。 展开更多
关键词 Faqman pcr 人博卡病毒 阳性率
下载PDF
沙门菌常见O抗原和H抗原荧光PCR检测方法评估
11
作者 曹阳 韩营营 +2 位作者 李杰 阚飙 闫梅英 《生物技术通讯》 CAS 2017年第2期84-89,共6页
目的:评估沙门菌常见A^F血清群O抗原和H抗原荧光PCR检测方法对不同血清型沙门菌的检测效果。方法:选用不同血清型沙门菌制备模板,运用沙门菌O抗原A^F群及不同H抗原荧光PCR检测试剂盒对这些菌株进行扩增检测,分别计算不同血清型检测结果... 目的:评估沙门菌常见A^F血清群O抗原和H抗原荧光PCR检测方法对不同血清型沙门菌的检测效果。方法:选用不同血清型沙门菌制备模板,运用沙门菌O抗原A^F群及不同H抗原荧光PCR检测试剂盒对这些菌株进行扩增检测,分别计算不同血清型检测结果的灵敏度、特异度、检测下限、假阳性率、假阴性率、Kappa值等指标并进行分析。结果:对7种不同沙门菌O抗原的检测灵敏度为85.71%~100.00%,特异度为66.67%~100.00%;对7种不同沙门菌H抗原的检测,H1,5及Hi-l的灵敏度不高,分别为35.71%及57.14%,但特异度均较高(87.50%~100.00%);经Fisher精确检验,除H1,5阳性检测的P>0.05(P=0.162),其余为P<0.05;C1、C2、D1、E、F血清群及H抗原1,6、1,7、g,s,t、g,m的检测结果与血清凝集结果的一致性较高(Kappa值均大于0.75),而H1,5及Hi-l的检测结果与血清凝集结果的一致性很差(Kappa值分别为0.302及0.492);试剂盒对不同O/H抗原核酸检测扩增效率较好,最低检出限为7~137608拷贝/反应。结论:除H1,5抗原外,该荧光PCR检测试剂盒对沙门菌O/H抗原不同血清型的检测效果较好,优于传统血清凝集方法,可显著提高血清型鉴定时效,有利于疾病或暴发的早期发现。 展开更多
关键词 沙门菌 血清型 O抗原 H抗原 荧光pcr
下载PDF
阪崎肠杆菌实时荧光双重TaqMan PCR快速检测体系的建立 被引量:10
12
作者 孟双 李娟 +2 位作者 王艳 白雪梅 叶长芸 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期857-860,共4页
目的建立针对阪崎肠杆菌的高灵敏、高特异的实时荧光双重TaqMan聚合酶链式反应(PCR)快速检测体系。方法根据阪崎肠杆菌基因组16SrRNA~23SrRNA的内部转录间隔区(ITS)基因和外膜蛋白A(OmpA)基因的特异性序列设计引物及TaqMan探针,利用高... 目的建立针对阪崎肠杆菌的高灵敏、高特异的实时荧光双重TaqMan聚合酶链式反应(PCR)快速检测体系。方法根据阪崎肠杆菌基因组16SrRNA~23SrRNA的内部转录间隔区(ITS)基因和外膜蛋白A(OmpA)基因的特异性序列设计引物及TaqMan探针,利用高通量实时荧光PCR检测平台探讨该检测体系的灵敏度;用50种其他肠道致病菌及院内感染中常见的致病菌评价该检测体系的特异性。结果实时荧光双重TaqMan PCR快速检测体系对阪崎肠杆菌重组质粒的检测灵敏度为1×102拷贝/反应体系;对阪崎肠杆菌基因组的检测灵敏度为4×10-1pg/反应体系;该检测体系在检测50种其他肠道致病菌及院内感染中常见的致病菌时未出现特异性扩增,整个反应在2h内完成。结论本研究建立的实时荧光双重TaqMan PCR检测体系可作为阪崎肠杆菌灵敏、特异、快速的检测方法,并同时检测阪崎肠杆菌的致病力。 展开更多
关键词 阪崎肠杆菌 实时荧光taqman pcr 外膜蛋白A 内部转录间隔区
下载PDF
嗜水气单胞菌实时荧光三重TaqMan PCR快速检测体系的建立 被引量:9
13
作者 孟双 白雪梅 +1 位作者 王艳 叶长芸 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期217-222,共6页
目的建立针对嗜水气单胞菌的高灵敏、高特异的实时荧光三重TaqMan聚合酶链式反应(PCR)快速检测体系。方法根据嗜水气单胞菌的16SrDNA、气溶素基因(aerA)和丝氨酸蛋白酶基因(ahp)的特异性序列设计引物及TaqMan探针,利用高通量实时荧光PC... 目的建立针对嗜水气单胞菌的高灵敏、高特异的实时荧光三重TaqMan聚合酶链式反应(PCR)快速检测体系。方法根据嗜水气单胞菌的16SrDNA、气溶素基因(aerA)和丝氨酸蛋白酶基因(ahp)的特异性序列设计引物及TaqMan探针,利用高通量实时荧光PCR检测平台探讨该检测体系的灵敏度;用29种其他肠道致病菌及院内感染中常见的致病菌评价该检测体系的特异性。结果实时荧光三重TaqMan PCR快速检测体系对嗜水气单胞菌重组质粒的检测灵敏度为1×102拷贝/反应体系;对嗜水气单胞菌基因组的检测灵敏度为5×10-2pg/反应体系;该体系的特异性引物探针在检测29种其他肠道致病菌及院内感染中常见的致病菌时未出现假阳性,整个反应在2h内完成。结论本研究建立的实时荧光三重TaqManPCR检测体系可作为嗜水气单胞菌灵敏、特异、快速的检测方法,并同时评价嗜水气单胞菌的致病潜力。 展开更多
关键词 嗜水气单胞菌 实时荧光taqman pcr 气溶素基因 丝氨酸蛋白酶基因
下载PDF
区别伪狂犬病病毒野毒株和gE-疫苗株的gE-MGB-TaqMan PCR方法的建立 被引量:7
14
作者 陈世界 李璟 +1 位作者 张焕容 郭万柱 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第7期550-554,568,共6页
本实验通过设计针对伪狂犬病病毒gE基因的引物和MGB(Minor groove binder oligodeoxynucleotide conjugate,MGB-ODN)TaqMan探针,结合ABI PE7700荧光定量PCR仪器系统,建立了一种能区别伪狂犬病病毒野毒株和gE-疫苗株的快速检测方法gE-M... 本实验通过设计针对伪狂犬病病毒gE基因的引物和MGB(Minor groove binder oligodeoxynucleotide conjugate,MGB-ODN)TaqMan探针,结合ABI PE7700荧光定量PCR仪器系统,建立了一种能区别伪狂犬病病毒野毒株和gE-疫苗株的快速检测方法gE-MGB-TaqMan PCR.实验表明,该方法可检测出最低43拷贝的gE基因和104倍稀释的伪狂犬病病毒Fa株DNA,与微量血清中和结合MTT比色法相比,灵敏度和特异性一致,检测时间仅为后者的1/10,操作比后者更为简单.特异性和重复性试验表明:gE-MGB-TaqMan PCR特异性和重复性好.该方法以闭管的模式操作,减少了各步骤污染的可能性,整个检测少于3 h. 展开更多
关键词 伪狂犬病病毒 gE gE-MGB—taqman pcr
下载PDF
TaqMan探针法与尿素呼气试验法检测胃镜活检标本 幽门螺旋杆菌的比较 被引量:7
15
作者 沈和德 褚明亮 +1 位作者 易韦 杨文秀 《临床与病理杂志》 2017年第3期473-477,共5页
目的:通过比较幽门螺旋杆菌(Helicobacter pylori,Hp)感染的两种检测方法,探讨TaqMan探针法在诊断幽门螺旋杆菌感染中的价值。方法:抽取70例有完整病例资料的胃镜活检标本,进行Hp分型、鉴定检测,并将实验结果与临床的碳14尿素呼气试验... 目的:通过比较幽门螺旋杆菌(Helicobacter pylori,Hp)感染的两种检测方法,探讨TaqMan探针法在诊断幽门螺旋杆菌感染中的价值。方法:抽取70例有完整病例资料的胃镜活检标本,进行Hp分型、鉴定检测,并将实验结果与临床的碳14尿素呼气试验和病理结果进行相关性分析。结果:Hp感染的两种检测方法 (TaqMan探针法和呼气实验法)一致性程度尚可(Kappa=0.550),两种方法检测的阳性率都随病理炎症程度的加重而增加,而呼气实验法检测Hp的阳性率更高(P<0.05)。但TaqMan探针法可以将Hp进行不同毒力类型的鉴定,且TaqMan探针法可区分Hp的阳性强度(1+,2+,3+),其与病理的炎症程度有较好的相关性(γ=0.564,P<0.05)。结论:TaqMan探针法可以定性地鉴定Hp,与呼气实验法有较好的一致性。TaqMan探针法可进一步定量Hp的阳性强度,更好地反映临床的病理炎症程度。 展开更多
关键词 幽门螺旋杆菌 taqman探针法 尿素呼气试验法
下载PDF
以主要流行EV71 VP1基因高度保守区为靶点的TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:4
16
作者 胡晓星 彭杰 +3 位作者 冯悦 刘丽 张阿梅 夏雪山 《生命科学研究》 CAS CSCD 2016年第3期189-195,共7页
在我国,肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)C4型是引起手足口病的主要流行基因型。为建立EV71C4型TaqMan荧光定量PCR检测方法,在C4型EV71VP1基因的高保守区,设计合成引物和TaqMan探针,将包含此目的区段的基因片段克隆到pcDNA3.1载体中,... 在我国,肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)C4型是引起手足口病的主要流行基因型。为建立EV71C4型TaqMan荧光定量PCR检测方法,在C4型EV71VP1基因的高保守区,设计合成引物和TaqMan探针,将包含此目的区段的基因片段克隆到pcDNA3.1载体中,通过体外转录获得标准品,并以梯度稀释的标准品为模板建立工作曲线,进而在优化反应条件的基础上建立TaqMan荧光实时定量PCR检测方法。实验中,所设计引物、探针的高度保守性保证了C4型EV71的高效扩增。经反应条件优化,引物和探针的最佳工作浓度分别为300 nmol/L和200 nmol/L,在1×10~301×10~3拷贝数检测范围内具有良好的线性关系(R^2=1),灵敏度可达到10~2 copies/μL。通过对该方法进行检验发现,批间和组间重复实验的变异系数均小于0.5%,且该方法对柯萨奇A16(coxsackievirus A16,CA16)柯萨奇B1(coxsackievirus B1,CB1)人轮状病毒(human rotavirus,HRV)单纯疱疹病毒2型(herpes Simplex virus type 2,HSV-2)均无交叉反应,对6份EV71阳性样本检出率为100%。以上数据表明,文中建立的TaqMan荧光定量PCR方法可为我国主要流行C4型EV71感染的快速诊断及疾病监控提供有效途径。 展开更多
关键词 肠道病毒71型 VP1基因 高保守区 taqman探针 荧光定量pcr 检测
下载PDF
阪崎肠杆菌实时荧光TaqMan PCR检测方法的研究 被引量:4
17
作者 孟双 李娟 +2 位作者 白雪梅 王艳 叶长芸 《疾病监测》 CAS 2011年第9期746-748,752,共4页
目的建立阪崎肠杆菌的TaqMan PCR检测方法。方法将阪崎肠杆菌的菌悬液连续10倍稀释后与健康人新鲜粪便混匀,制备成1.2×100~1.2×108 cfu/ml梯度浓度的粪便模拟标本并提取DNA,用以评价阪崎肠杆菌实时荧光TaqMan PCR法对临床模... 目的建立阪崎肠杆菌的TaqMan PCR检测方法。方法将阪崎肠杆菌的菌悬液连续10倍稀释后与健康人新鲜粪便混匀,制备成1.2×100~1.2×108 cfu/ml梯度浓度的粪便模拟标本并提取DNA,用以评价阪崎肠杆菌实时荧光TaqMan PCR法对临床模拟标本检测的灵敏度、特异性和稳定性。结果实时荧光TaqMan PCR法对阪崎肠杆菌粪便模拟标本的检测灵敏度为1.2×103 cfu/ml;其线性检测范围为:1.2×103~1.2×108 cfu/ml;在稳定性评价中,对含菌量为1.2×108、1.2×106和1.2×104 cfu/ml的粪便模拟标本进行实时荧光TaqMan PCR法重复检测10次,结果显示扩增反应Ct值的变异系数(CV)为0.65%~1.47%;在特异性评价中,除了阳性对照其余样本均未见特异性扩增曲线。结论本研究建立了阪崎肠杆菌实时荧光TaqMan PCR法。 展开更多
关键词 阪崎肠杆菌 实时荧光taqman pcr 外膜蛋白A
原文传递
类志贺邻单胞菌实时荧光TaqMan PCR快速检测体系的建立 被引量:3
18
作者 孟双 王艳 +3 位作者 白雪梅 纪少博 李爱华 叶长芸 《疾病监测》 CAS 2011年第11期906-910,共5页
目的建立针对类志贺邻单胞菌的高灵敏、高特异的实时荧光TaqMan聚合酶链式反应(PCR)快速检测体系。方法根据类志贺邻单胞菌23S rRNA基因的一段特异性序列设计引物及TaqMan探针,利用实时荧光PCR检测平台探讨该检测体系的灵敏度;用30种其... 目的建立针对类志贺邻单胞菌的高灵敏、高特异的实时荧光TaqMan聚合酶链式反应(PCR)快速检测体系。方法根据类志贺邻单胞菌23S rRNA基因的一段特异性序列设计引物及TaqMan探针,利用实时荧光PCR检测平台探讨该检测体系的灵敏度;用30种其他肠道致病菌及院内感染中常见的致病菌评价该检测体系的特异性。结果实时荧光TaqMan PCR快速检测体系对类志贺邻单胞菌重组质粒的检测灵敏度为1×102拷贝/反应体系;对类志贺邻单胞菌基因组的检测灵敏度为3×10-2pg/反应体系;该检测体系在检测30种其他肠道致病菌及院内感染中常见的致病菌时未出现特异性扩增,整个反应在2 h内完成。结论本研究建立的实时荧光TaqMan PCR检测体系可作为类志贺邻单胞菌灵敏、特异、快速的检测方法。 展开更多
关键词 类志贺邻单胞菌 实时荧光taqman pcr 23S RRNA
原文传递
塞内卡病毒Taqman实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用 被引量:2
19
作者 陈鑫 莫红芳 +4 位作者 刘文强 李祥敏 陈焕春 金梅林 钱平 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期2293-2297,共5页
根据对GenBank中2015-2017年登录的18株国内塞内卡病毒(SVV)基因组序列比对分析结果,设计合成1对针对SVV 5’UTR区域的特异性引物和Taqman探针,通过优化荧光定量PCR反应条件,建立一种定量检测SVV的Taqman实时荧光定量PCR检测方法。该方... 根据对GenBank中2015-2017年登录的18株国内塞内卡病毒(SVV)基因组序列比对分析结果,设计合成1对针对SVV 5’UTR区域的特异性引物和Taqman探针,通过优化荧光定量PCR反应条件,建立一种定量检测SVV的Taqman实时荧光定量PCR检测方法。该方法定量检测范围在10~109 copies/μL,检测下限为10copies/μL,比常规PCR检测灵敏度高约1000倍,同时检测口蹄疫病毒(FMDV)、猪水疱病病毒(SVDV)、猪水疱疹病毒(VSV)、圆环病毒(PCV)、猪伪狂犬病病毒(PRV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)均为阴性,特异性良好;对50份疑似病料同时进行荧光定量PCR检测和常规PCR检测,结果显示荧光定量PCR阳性检测率(38%)高于常规PCR阳性检测率(25%),证实本试验建立的SVV Taqman实时荧光定量PCR检测方法可实现对SVV的临床诊断和定量分析。 展开更多
关键词 塞内卡病毒(SVV) 猪特发性水疱病 taqman荧光定量pcr
原文传递
弗氏枸橼酸杆菌TaqMan实时荧光定量-聚合酶链反应检测方法的建立 被引量:1
20
作者 金东 王艺婷 +2 位作者 白雪梅 叶长芸 刘丽云 《疾病监测》 CAS 2013年第6期451-455,共5页
目的建立针对弗氏枸橼酸杆菌的TaqMan实时荧光定量-聚合酶链反应(real time-PCR)检测方法。方法针对弗氏枸橼酸杆菌的特有序列设计引物和TaqMan探针,扩增目的基因建立标准曲线,确定检测方法的灵敏度;对20种其他肠道致病菌及院内感染中... 目的建立针对弗氏枸橼酸杆菌的TaqMan实时荧光定量-聚合酶链反应(real time-PCR)检测方法。方法针对弗氏枸橼酸杆菌的特有序列设计引物和TaqMan探针,扩增目的基因建立标准曲线,确定检测方法的灵敏度;对20种其他肠道致病菌及院内感染中常见的致病菌进行检测,评价该检测方法的特异性;使用牛奶模拟标本评价方法在实际检测工作中应用性。结果 TaqMan real time-PCR检测方法对弗氏枸橼酸杆菌重组质粒的检测灵敏度为1.0×101拷贝/反应体系;该检测方法在检测30种其他肠道致病菌及院内感染中常见的致病菌时未出现特异性扩增。该检测方法对牛奶模拟样本中弗氏枸橼酸杆菌检测下限为1.0×102cfu/ml的菌量;通过对1.0×107、1.0×105和1.0×103三个浓度质粒标准品的重复检测,确定本方法的组内变异系数为1.90%~3.91%;组间变异系数为1.52%~1.69%。结论本研究建立的TaqMan real time-PCR检测方法可作为检测弗氏枸橼酸杆菌灵敏、特异、快速的方法。 展开更多
关键词 弗氏枸橼酸杆菌 taqman实时荧光定量-聚合酶链反应 tct基因
原文传递
上一页 1 2 10 下一页 到第
使用帮助 返回顶部