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高产紫杉醇菌株的诱变选育及其差异表达基因消减cDNA文库的构建 被引量:8
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作者 赵凯 孙立新 +3 位作者 王旋 李秀凉 王歆 周东坡 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期923-933,共11页
【目的】选育高产紫杉醇菌株,并构建选育到的高产紫杉醇菌株与出发菌株HD1-3差异表达的cDNA消减文库。【方法】分别采用硫酸二乙酯和紫外线与硫酸二乙酯复合诱变处理菌株HD1-3孢子;以选育到的高产紫杉醇菌株为tester,菌株HD1-3为driver... 【目的】选育高产紫杉醇菌株,并构建选育到的高产紫杉醇菌株与出发菌株HD1-3差异表达的cDNA消减文库。【方法】分别采用硫酸二乙酯和紫外线与硫酸二乙酯复合诱变处理菌株HD1-3孢子;以选育到的高产紫杉醇菌株为tester,菌株HD1-3为driver,应用抑制性消减杂交技术构建选育到的高产紫杉醇菌株与菌株HD1-3差异表达的cDNA消减文库。【结果】试验确定的Nodulisporium sylviforme紫杉醇产生菌HD1-3孢子复合诱变的适宜条件为:将106 cfu/mL孢子悬液经过8%硫酸二乙酯处理15 min后,在电磁搅拌下,用紫外灯(30 w,距离30 cm)照射处理45 s,获得了1株遗传性状稳定、高产紫杉醇的突变株——UD14-11,其紫杉醇产量从出发菌株HD1-3的232.73±4.61μg/L提高至312.81±7.51μg/L;构建的文库滴度为1.2×107 cfu/mL,阳性克隆率75.3%,片段大小主要集中在300 bp-1.0 kb。【结论】选育到了1株遗传性状稳定、高产紫杉醇突变株;成功地构建了高产紫杉醇菌株UD14-11与菌株HD1-3差异表达的cDNA消减文库,为寻找、分离微生物生物合成紫杉醇相关基因和利用基因工程或代谢工程手段定向设计改造菌株奠定基础。 展开更多
关键词 紫杉醇 内生真菌 诱变育种 抑制性消减杂交 CDNA文库
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慢性乙型肝炎患者炎症相关差异表达基因cDNA文库的构建和筛选 被引量:4
2
作者 唐翠兰 彭国平 +2 位作者 陈智 朱海红 郑敏 《同济大学学报(医学版)》 CAS 2006年第1期4-8,共5页
目的筛选慢性乙型肝炎(chron ic hepatitis B,CHB)患者与无症状乙型肝炎病毒携带者(asymptom atic HBVcarriers,ASCs)表达差异的基因。方法分离CHB及ASCs的外周血单个核细胞(peripheral b lood mononuc lear cells,PBMC)并提取RNA,SMAR... 目的筛选慢性乙型肝炎(chron ic hepatitis B,CHB)患者与无症状乙型肝炎病毒携带者(asymptom atic HBVcarriers,ASCs)表达差异的基因。方法分离CHB及ASCs的外周血单个核细胞(peripheral b lood mononuc lear cells,PBMC)并提取RNA,SMART技术合成cDNA,采用抑制消减杂交(suppression subtractive hybrid ization,SSH)技术构建差异表达基因cDNA文库,进一步采用dot b lot筛选,得到差异表达的基因。结果经过筛选共获得了22个阳性克隆,通过序列分析,发现它们代表22个基因,在CHB表达增高的基因多是和炎症相关,在ASCs表达增高的基因中,多为新基因。结论成功构建了CHB与ASCs的消减文库并初步分析这些差异表达基因的意义,对于阐明CHB的发病机制及其治疗都有重要意义。 展开更多
关键词 慢性乙型肝炎 无症状乙型肝炎病毒携带者 抑制消减杂交 基因表达
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利用抑制差减杂交筛选稻瘟菌继代接种菌株差异表达基因 被引量:2
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作者 姜华 苏志杰 +7 位作者 张震 王艳丽 王教瑜 柴荣耀 邱海萍 毛雪琴 杜新法 孙国昌 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2012年第1期71-75,共5页
稻瘟菌是重要的水稻病原微生物,通过各种变异机制提高自身对水稻的致病力。通过继代接种可使稻瘟菌发生适应性变异,从而增强致病力。为了解相关适应性变异的分子机制,利用稻瘟菌原始菌株与在水稻上继代接种的第四代菌株构建了抑制消减... 稻瘟菌是重要的水稻病原微生物,通过各种变异机制提高自身对水稻的致病力。通过继代接种可使稻瘟菌发生适应性变异,从而增强致病力。为了解相关适应性变异的分子机制,利用稻瘟菌原始菌株与在水稻上继代接种的第四代菌株构建了抑制消减杂交文库。经过PCR验证及测序分析,共计获得168条EST非冗余序列。拼接后,Unigene的数量为110个。利用不同数据库,进行BLASTX分析,获得了与这些序列推测蛋白相似的功能蛋白,分析蛋白功能注释表明这些蛋白主要与合成和信号传导相关。GO分析表明相关蛋白涉及生命活动的多个方面,但主要集中于细胞生长发育、核酸结合及外界刺激的感知及传导。 展开更多
关键词 稻瘟菌 适应性变异 抑制消减杂交 表达序列标签 致病性
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抑制消减杂交法筛选无症状乙型肝炎病毒携带者差异表达基因 被引量:2
4
作者 唐翠兰 陈智 +3 位作者 羊正纲 周林福 陈峰 彭国平 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期302-303,共2页
乙型肝炎病毒(HBV)携带者中,大多数是婴幼儿期感染,往往终生携带HBV,但正常成人初次感染后大多能清除病毒.除病毒因素外,主要是机体的免疫因素决定感染结局[1].机体对HBV的免疫应答受许多基因的调节,我们推测正是由于在正常人和HBV携... 乙型肝炎病毒(HBV)携带者中,大多数是婴幼儿期感染,往往终生携带HBV,但正常成人初次感染后大多能清除病毒.除病毒因素外,主要是机体的免疫因素决定感染结局[1].机体对HBV的免疫应答受许多基因的调节,我们推测正是由于在正常人和HBV携带者之间存在的免疫相关基因表达的差异才导致了不同的感染结局.本研究旨在探讨HBV携带者与正常人外周血单个核细胞(PBMC)差异表达的基因,有助于阐明HBV携带发生发展机制及设计新的治疗靶标. 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 携带者 肝炎病毒 抑制消减杂交术 基因
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家蚕单性生殖早期胚胎SSH文库的构建及其序列分析 被引量:2
5
作者 王艳敏 夏定国 +3 位作者 张业顺 任晓俊 韦亚东 张国政 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期476-485,共10页
为了探讨家蚕早期胚胎性别决定的分子机制,以非减数分裂孤雌生殖(AMP)和双精雄核发育(BSA)技术获得的家蚕单一性别早期(2-24 h)发育蚕卵为材料,利用抑制消减杂交(SSH)技术构建了正向和反向抑制消减杂交cDNA文库。在正向与反向... 为了探讨家蚕早期胚胎性别决定的分子机制,以非减数分裂孤雌生殖(AMP)和双精雄核发育(BSA)技术获得的家蚕单一性别早期(2-24 h)发育蚕卵为材料,利用抑制消减杂交(SSH)技术构建了正向和反向抑制消减杂交cDNA文库。在正向与反向抑制消减杂交文库中分别随机选择62个和46个克隆测序,分别获得43种和29种cDNA序列,其中25个为新的cDNA序列。生物信息学分析显示,抑制消减杂交文库中与单性生殖有关的高温、低温、辐射等诱导表达基因出现的频次较高。对部分文库序列进行半定量RT-PCR分析表明,这些基因在两种单性生殖早期发育胚胎中存在差异表达。 展开更多
关键词 家蚕 非减数分裂孤雌生殖 双精雄核发育 抑制消减杂交
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利用抑制消减杂交技术分离酱香风味的相关基因 被引量:1
6
作者 朱德丽 谢和 李茂琴 《贵州农业科学》 CAS 2015年第6期103-107,共5页
为了更好地开发利用酱香酒的微生物资源和解释酱香风味的形成机制,以产酱香的枯草芽孢杆菌E20菌株为试验方(tester)、不产酱香的枯草芽孢杆菌10075菌株为驱动方(driver),采用抑制消减杂交技术(suppression subtracted hybridization,SSH... 为了更好地开发利用酱香酒的微生物资源和解释酱香风味的形成机制,以产酱香的枯草芽孢杆菌E20菌株为试验方(tester)、不产酱香的枯草芽孢杆菌10075菌株为驱动方(driver),采用抑制消减杂交技术(suppression subtracted hybridization,SSH)比较其在基因组的差异,对获得的差异片段进行测序及生物信息学分析。结果表明:文库基因测序初步获得77个差异基因片段。获取准确的注释有65个代谢物,平均相似度98%。其中,26个为酶。这些酶与乙偶姻、乙酰乳酸合成酶(alsS)基因、乙酰乳酸脱羧酶(alsD)基因及其相关代谢存在一定的联系,还与美拉德反应相关的反应物存在一定的关系。 展开更多
关键词 枯草芽孢杆菌 抑制消减杂交 酱香相关基因 酱香风味
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内皮细胞内毒素刺激后差异表达基因的筛选
7
作者 梁自文 杨宗城 罗向东 《西北国防医学杂志》 CAS 2002年第3期161-163,共3页
目的 :筛选内皮细胞内毒素刺激后差异表达基因。方法 :提取培养人脐静脉内皮细胞内毒素刺激后mRNA ,反转录合成cDNA ,与对照组间进行抑制消减杂交 ,经菌落原位斑点杂交筛选阳性克隆并进行测序和同源性分析。结果 :内皮细胞内毒素刺激后... 目的 :筛选内皮细胞内毒素刺激后差异表达基因。方法 :提取培养人脐静脉内皮细胞内毒素刺激后mRNA ,反转录合成cDNA ,与对照组间进行抑制消减杂交 ,经菌落原位斑点杂交筛选阳性克隆并进行测序和同源性分析。结果 :内皮细胞内毒素刺激后显示有 18条基因差异表达 ,包括与炎症反应、细胞骨架重构、细胞生长和凋亡以及能量代谢有关的已知基因 ,另有三条为新基因序列。结论 :抑制消减杂交有效地克隆了内皮细胞内毒素刺激后差异表达基因 。 展开更多
关键词 基因表达 内皮细胞 内毒素 抑制消减杂交 菌落原位斑点杂交
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无症状乙型肝炎病毒携带者外周血单个核细胞穿孔素基因表达
8
作者 唐翠兰 周舟 陈智 《郧阳医学院学报》 2006年第4期205-206,213,共3页
目的:检测无症状乙型肝炎病毒携带者(ASCs)与正常对照组消减文库中的差异基因穿孔素(perforin)在相应人群中的表达。方法:分离43例ASCs和41例正常对照者的外周静脉血单个核细胞(PBMC)并提取RNA,做定量RT-PCR检测。结果:穿孔素在HBV携带... 目的:检测无症状乙型肝炎病毒携带者(ASCs)与正常对照组消减文库中的差异基因穿孔素(perforin)在相应人群中的表达。方法:分离43例ASCs和41例正常对照者的外周静脉血单个核细胞(PBMC)并提取RNA,做定量RT-PCR检测。结果:穿孔素在HBV携带者中表达水平是正常对照的3.58倍。结论:穿孔素基因在ASCs高表达,对于阐明ASCs的发病机制有重要意义。 展开更多
关键词 无症状乙型肝炎病毒携带者 抑制消减杂交 定量RT-PCR
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丙型肝炎病毒非结构蛋白NS5A反式激活基因的克隆化研究 被引量:43
9
作者 刘妍 陆荫英 +3 位作者 成军 王建军 李莉 张玲霞 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期40-43,共4页
应用抑制性消减杂交技术构建丙型肝炎病毒非结构蛋白 5A(HCVNS5A)反式激活基因差异表达的cDNA消减文库 ,克隆HCVNS5A蛋白反式激活相关基因。以HCVNS5A表达质粒pcDNA3 1(- ) NS5A转染HepG2细胞 ,以空载体pcDNA3 1(- )为对照 ,制备转染... 应用抑制性消减杂交技术构建丙型肝炎病毒非结构蛋白 5A(HCVNS5A)反式激活基因差异表达的cDNA消减文库 ,克隆HCVNS5A蛋白反式激活相关基因。以HCVNS5A表达质粒pcDNA3 1(- ) NS5A转染HepG2细胞 ,以空载体pcDNA3 1(- )为对照 ,制备转染后的细胞裂解液 ,提取mRNA并逆转录为cDNA ,经RsaI酶切后 ,将实验组cDNA分成两组 ,分别与两种不同的接头衔接 ,再与对照组cDNA进行两次消减杂交及两次抑制性PCR ,将产物与T/A载体连接 ,构建cDNA消减文库 ,并转染大肠杆菌进行文库扩增 ,随机挑选克隆PCR扩增后进行测序及同源性分析。文库扩增后得到 12 1个阳性克隆 ,经菌落PCR分析 ,得到 115个 2 0 0~10 0 0bp的插入片段 ,对其中的 90个片段测序 ,并进行同源性分析 ,显示 31种已知基因编码蛋白和 15种未知功能基因序列 ,包括一些与细胞周期、细胞凋亡、信号传导及肿瘤发生等细胞生长调节密切相关的蛋白编码基因 ,可能是NS5A反式激活靶基因。结果提示 ,成功构建了HCVNS5A反式激活基因差异表达的cDNA消减文库 ,该文库的建立为进一步阐明HCVNS5A反式调节的靶基因及致肝细胞癌发生的分子生物学机制提供了理论依据。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 非结构蛋白NS5A 反式激活 基因 克隆化
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抑制性扣除杂交技术(SSH)及其在基因克隆上的研究进展 被引量:21
10
作者 顾克余 翟虎渠 《生物技术通报》 CAS CSCD 1999年第2期13-16,共4页
抑制性扣除杂交技术是一种基因克隆的新方法,它对研究细胞生殖、发育、分化、癌变、衰老及程序化死亡等生命过程有关基因的差异表达以及相关基因的分子克隆提供了有力的工具,本文简要介绍抑制性扣除杂交技术的主要原理,基本过程、优... 抑制性扣除杂交技术是一种基因克隆的新方法,它对研究细胞生殖、发育、分化、癌变、衰老及程序化死亡等生命过程有关基因的差异表达以及相关基因的分子克隆提供了有力的工具,本文简要介绍抑制性扣除杂交技术的主要原理,基本过程、优越性。 展开更多
关键词 抑制性扣除杂交 基因克隆 应用
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小麦抗白粉病侵染初期的表达序列标签分析 被引量:21
11
作者 骆蒙 孔秀英 +2 位作者 霍纳新 周荣华 贾继增 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第6期525-530,共6页
以抗白粉病品系“百农 32 17×Mardler” BC5F4为材料 ,构建了一个白粉病菌接种初期的抑制消减杂交cDNA文库 ,测序获得 76 0条ESTs。与GenBank序列进行BLASTx分析 ,获功能已知ESTs 2 71条。通过分析抗病相关基因 ,推测G蛋白介导的... 以抗白粉病品系“百农 32 17×Mardler” BC5F4为材料 ,构建了一个白粉病菌接种初期的抑制消减杂交cDNA文库 ,测序获得 76 0条ESTs。与GenBank序列进行BLASTx分析 ,获功能已知ESTs 2 71条。通过分析抗病相关基因 ,推测G蛋白介导的信号传导途径、SA信号传递系统、MAP相关信号传递系统等参与了小麦抗白粉病过程。SAR基因在抗病相关ESTs中的种类与数量最多。数据显示苯丙烷代谢途径、细胞壁结构修饰作用、细胞保卫机制参与了抗病过程。未知功能ESTs与GenBank序列进行BLASTn分析 ,其中许多与病原菌、非病原菌诱导cDNA文库来源的ESTs同源 ;新ESTs占全部ESTs的 16 6 %。 展开更多
关键词 小麦 抗白粉病 侵染初期 表达序列标签 消减抑制杂交 抗病相关EST
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应用SSH技术研究NaHCO_3胁迫下柽柳基因的表达 被引量:22
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作者 杨传平 王玉成 +1 位作者 刘桂丰 姜静 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第9期926-933,共8页
以NaHCO3 胁迫紫杆柽柳 (Tamarixandrossowii)cDNA为试验方 (tester) ,正常生长紫杆柽柳cDNA为驱动方(driver) ,应用SSH技术研究胁迫下柽柳基因的表达。经Northern杂交检测 ,共获得 36个盐胁迫应答基因。Blastx分析表明 ,它们编码的蛋... 以NaHCO3 胁迫紫杆柽柳 (Tamarixandrossowii)cDNA为试验方 (tester) ,正常生长紫杆柽柳cDNA为驱动方(driver) ,应用SSH技术研究胁迫下柽柳基因的表达。经Northern杂交检测 ,共获得 36个盐胁迫应答基因。Blastx分析表明 ,它们编码的蛋白与下列蛋白同源 :抗氧化酶CAT和PRDX ;海藻糖磷酸酶 (trehalosephosphatase) ,该酶与海藻糖合成相关 ;多种调控蛋白 ,例如bZIP转录因子、MADS box蛋白、富含甘氨酸RNA结合蛋白 (glycine richRNA bindingproteins)、CCCH型锌指蛋白、F box蛋白等等 ;早期光诱导蛋白 (earlylight inducedprotein) ,该蛋白可以保护和 /或修复由胁迫引起的植物光合元件 (photosyntheticapparatus)损伤 ;半胱氨酸蛋白酶 (cysteineproteinase)和VPE(vacuolarprocessingenzyme) ,它们在植物细胞的死亡过程中起作用 ;以及脂质转移蛋白前体 (lipidtransferproteinprecursor)、聚合泛素 (polyubiquitin)、查尔酮合成酶、谷胱甘肽转移酶、NADP IDH、盐诱导SI2蛋白、OEE1等蛋白。在获得的 36个基因中 ,3个基因编码的蛋白分别与 3个推定 (putative)的蛋白即HAK2 (K+ transporter)、钙结合蛋白和RNA结合蛋白具有同源性 ;同时 ,发现 6个盐胁迫应答的新序列。 展开更多
关键词 紫杆柽柳 抑制性消减杂交 NAHCO3胁迫
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截短型HBsAg中蛋白反式激活基因的克隆 被引量:26
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作者 刘妍 成军 +7 位作者 张跃新 段惠娟 牟劲松 韩萍 李克 李莉 张玲霞 陈菊梅 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期218-221,共4页
目的 应用抑制性消减杂交技术构建乙型肝炎病毒 (HBV)截短型中蛋白 (MHBst)反式激活基因差异表达的cDNA消减文库 ,克隆HBV截短型中蛋白反式激活相关基因。方法 以HBV截短型中蛋白表达质粒 pcDNA3.1( ) Mt16 7转染HepG2细胞 ,以空载体... 目的 应用抑制性消减杂交技术构建乙型肝炎病毒 (HBV)截短型中蛋白 (MHBst)反式激活基因差异表达的cDNA消减文库 ,克隆HBV截短型中蛋白反式激活相关基因。方法 以HBV截短型中蛋白表达质粒 pcDNA3.1( ) Mt16 7转染HepG2细胞 ,以空载体 pcDNA3.1( )为对照 ;制备转染后的细胞裂解液 ,提取mRNA并逆转录为cDNA ,经RsaI酶切后 ,将实验组cDNA分成两组 ,分别与两种不同的接头衔接 ,再与对照组cDNA进行两次消减杂交及两次抑制性聚合酶链反应 (PCR) ,将产物与T/A载体连接 ,构建cDNA消减文库 ,并转染大肠杆菌进行文库扩增 ,随机挑选克隆PCR扩增后进行测序及同源性分析。结果 成功构建人HBV截短型中蛋白反式激活基因差异表达的cDNA消减文库。文库扩增后得到 94个白色克隆 ,进行菌落PCR分析 ,均得到 2 0 0~ 80 0bp插入片段。挑取 5 0个插入片段测序 ,并通过生物信息学分析获得其全长基因序列 ,结果共获得 2 3种编码基因 ,包括 19种已知基因和 4种未知基因。结论 筛选到的cDNA全长序列 ,包括一些与细胞生长调节、免疫应答及肿瘤发生密切相关的蛋白编码基因 。 展开更多
关键词 蛋白反式激活 乙型肝炎 表面抗原 基因克隆
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抑制性消减杂交构建奶牛乳房炎抗性相关cDNA文库 被引量:20
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作者 曹随忠 李宏滨 +2 位作者 王爱华 赵兴绪 杜立新 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期526-530,共5页
以经产荷斯坦奶牛外周血白细胞为材料,分离Poly(A)+ RNA,反转录合成单链及双链cDNA,经酶切成平均大小为400~600 bp的片段,将患乳房炎奶牛cDNA分成2组,分别与2种不同的接头连接,再与健康奶牛cDNA进行2次消减杂交和2次抑制性PCR扩增,将第... 以经产荷斯坦奶牛外周血白细胞为材料,分离Poly(A)+ RNA,反转录合成单链及双链cDNA,经酶切成平均大小为400~600 bp的片段,将患乳房炎奶牛cDNA分成2组,分别与2种不同的接头连接,再与健康奶牛cDNA进行2次消减杂交和2次抑制性PCR扩增,将第2次PCR产物与pGEM-T载体连接,转化大肠杆菌TOP10感受态细胞进行文库扩增,构建了具有高消减效率的奶牛乳房炎抗性相关cDNA文库.文库扩增后得到610个白色阳性克隆,随机挑选克隆进行PCR鉴定,插入片段主要分布在250~750 bp 之间.文库的成功构建为进一步筛选、克隆与奶牛乳房炎抗性相关的基因奠定了基础,对研究奶牛乳房炎抗性的分子机制以及乳房炎的综合防制具有重要意义. 展开更多
关键词 奶牛乳房炎 CDNA文库 抑制性消减杂交 抗性 相关 构建 pGEM-T载体 荷斯坦奶牛 PCR扩增 PCR产物 感受态细胞 TOP10 PCR鉴定 接头连接 大肠杆菌 阳性克隆 综合防制 分子机制 白细胞 外周血 RNA 反转录 600 610 片段 酶切
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YS型小麦温敏雄性不育系A3017育性相关基因的SSH分析 被引量:15
15
作者 宋国琦 胡银岗 +2 位作者 林凡云 董普辉 何蓓如 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期1301-1308,共8页
以人工气候箱控温条件下YS型小麦温敏不育系A3017的不育幼穗和可育幼穗为材料,分别构建了不育和可育条件下基因特异表达的抑制消减杂交cDNA文库.在两个库中分别随机挑选100个阳性克隆进行测序,经BLAST序列比对分析,共获功能已知的EST 78... 以人工气候箱控温条件下YS型小麦温敏不育系A3017的不育幼穗和可育幼穗为材料,分别构建了不育和可育条件下基因特异表达的抑制消减杂交cDNA文库.在两个库中分别随机挑选100个阳性克隆进行测序,经BLAST序列比对分析,共获功能已知的EST 78条.比较发现,不育条件下与细胞质相关的基因表达数量(63.4%)远高于可育条件下的基因数量(35.1%),参与蛋白质合成、蛋白质修饰/加工/储藏、转运和信号传递过程基因的比例也均高于可育条件下的,而参与能量代谢过程基因的比例则明显偏低.分析认为,在不育和可育条件下的基因表达差异可能是导致温敏雄性不育系育性变化的关键,这为进一步从分子基础上揭示YS型小麦温敏雄性不育系育性转换机制奠定了基础. 展开更多
关键词 小麦 温敏雄性不育系 抑制消减杂交 育性相关基因
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柔嫩艾美耳球虫抗马杜拉霉素、地克珠利虫株特异消减文库的构建 被引量:15
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作者 韩红玉 赵其平 +3 位作者 姜连连 董辉 陈兆国 黄兵 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第8期1712-1716,共5页
以遗传背景一致的柔嫩艾美耳球虫(Eimeria tenella)敏感株孢子化卵囊为驱动组,马杜拉霉素抗药株和地克珠利抗药株孢子化卵囊为试验组,利用抑制消减杂交(SSH)方法,通过两轮杂交和两次PCR分别构建了富含两个抗药株孢子化卵囊与敏感株孢子... 以遗传背景一致的柔嫩艾美耳球虫(Eimeria tenella)敏感株孢子化卵囊为驱动组,马杜拉霉素抗药株和地克珠利抗药株孢子化卵囊为试验组,利用抑制消减杂交(SSH)方法,通过两轮杂交和两次PCR分别构建了富含两个抗药株孢子化卵囊与敏感株孢子化卵囊之间差异表达基因的消减cDNA文库。随机从两个消减文库中分别挑取50个克隆,经PCR鉴定马杜拉霉素抗药株和地克珠利抗药株孢子化卵囊的消减文库重组率分别为96%和98%,差异基因片段大小分布在250bp~1.0kb之间。从每个文库中随机挑取65个阳性克隆经斑点杂交试验,分别选择表达量上调的6个克隆进行序列分析和同源性比较。结果发现,有4个cDNA片段可能是新基因片段,与地克珠利抗药株的产生有关;有3个新的cDNA片段可能与马杜拉霉素抗药株的产生有关。这些结果将为克隆全长cDNA和探索球虫抗药性产生及发展的分子机理奠定了一定的基础。 展开更多
关键词 柔嫩艾美耳球虫 马杜拉霉素 地克珠利 抗药性相关基因 抑制消减杂交 基因克隆 消减文库 构建 孢子化卵囊 cDNA片段
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淡色库蚊对溴氰菊酯抗药性和敏感性相关基因克隆和序列分析 被引量:11
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作者 田海生 朱昌亮 +4 位作者 高晓红 马磊 沈波 李秀兰 吴观陵 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期193-197,共5页
目的 获取淡色库蚊对溴氰菊酯抗药性和敏感性相关基因。 方法 通过正、反向抑制性差减杂交获取对溴氰菊酯抗药性和敏感性淡色库蚊的差异表达基因 ,并以基因芯片和逆 Northern对所获基因进行杂交鉴定。 结果 正、反向抑制性差减杂... 目的 获取淡色库蚊对溴氰菊酯抗药性和敏感性相关基因。 方法 通过正、反向抑制性差减杂交获取对溴氰菊酯抗药性和敏感性淡色库蚊的差异表达基因 ,并以基因芯片和逆 Northern对所获基因进行杂交鉴定。 结果 正、反向抑制性差减杂交各获得 5 2 3和 2 86个克隆 ,经芯片鉴定后在抗性品系高表达的基因分别有15 5个 (2~ 3倍 )和 42个 (3倍以上 ) ,在敏感品系中高表达的基因分别有 15个 (2~ 3倍 )和 9个 (3倍以上 )。对 3倍以上差异表达和特异表达基因进行单向测序 ,根据最高同源性比对结果 ,线粒体 r RNA基因、6 0 S核糖体蛋白基因、40 S核糖体蛋白 S4基因、胰蛋白酶前体基因、糜蛋白酶 A前体基因、视蛋白基因等在抗性品系中高表达 ;而 40 S核糖体蛋白 S2 9基因和肌球蛋白调控轻链 2在敏感品系中高表达 ;另外 ,1,4- α-葡聚糖分支酶和核糖体蛋白 46基因在抗性品系中特异表达。 结论 所获得的 13个差异表达基因和 展开更多
关键词 淡色库蚊 杀虫剂抗性 基因克隆 抑制性差减杂交 基因芯片 逆Northern
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红曲菌cDNA消减文库的构建 被引量:10
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作者 赖卫华 许杨 熊勇华 《菌物系统》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期466-473,共8页
应用抑制性消减杂交技术,构建红曲菌产桔霉素和不产桔霉素差异表达的cDNA消减文库.分别从产桔霉素和不产桔霉素的红曲菌丝体中提取mRNA,依次合成单链和双链cDNA,经酶切成大小为250~750bp的片断,将产桔霉素的cDNA分为两组,分别与两种不... 应用抑制性消减杂交技术,构建红曲菌产桔霉素和不产桔霉素差异表达的cDNA消减文库.分别从产桔霉素和不产桔霉素的红曲菌丝体中提取mRNA,依次合成单链和双链cDNA,经酶切成大小为250~750bp的片断,将产桔霉素的cDNA分为两组,分别与两种不同的接头连接,再与不产桔霉素的红曲菌的cDNA进行两次消减杂交及两次抑制性PCR后,将产物与T/A载体连接构建成功cDNA消减文库,并转染大肠杆菌进行文库扩增,文库扩增后得到283个克隆,经PCR法快速测定,均得到250~750bp的插入片断.所构建的红曲菌cDNA消减文库为进一步筛选红曲菌中与产桔霉素性状相关的基因奠定了基础. 展开更多
关键词 桔霉素 抑制性消减杂交 聚合酶链式反应
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利用抑制性减数杂交技术(SSH)研究IL-10抑制表达的新基因 被引量:12
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作者 韩文玲 李莹 +4 位作者 张颖妹 徐秀珍 宋泉声 狄春辉 马大龙 《中华微生物学和免疫学杂志》 CSCD 北大核心 2000年第2期128-131,共4页
目的 利用抑制性减数杂交 (SSH)技术筛选IL 10抑制表达的新基因。方法 以PHA刺激的U937细胞为tester,以PHA刺激同时IL 10抑制的U937细胞为driver,提取mRNA ,反转录构建cDNA文库 ,利用SSH技术筛选IL 10抑制表达的新基因。结果 通过SS... 目的 利用抑制性减数杂交 (SSH)技术筛选IL 10抑制表达的新基因。方法 以PHA刺激的U937细胞为tester,以PHA刺激同时IL 10抑制的U937细胞为driver,提取mRNA ,反转录构建cDNA文库 ,利用SSH技术筛选IL 10抑制表达的新基因。结果 通过SSH技术 ,发现了 15个可能的IL 10抑制表达的基因 ,其中 6个与GenBank中已公布的表达序列检签 (expressedsequencetag ,EST)片段没有明显同源性 ,为新基因 ,其中之一经EST拼接 ,得到全长cDNA ,为一种新的C C家族趋化因子 ,已被GenBank收录 ,收录号码为AF0 96 985。挑选 4个新基因进行Northernblot分析 ,发现IL 10可抑制其中 3个新基因表达。结论 SSH技术是一种高效的差异基因筛选方法 ,IL 展开更多
关键词 白细胞介素10 U937细胞 抑制性减数杂交
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差异表达基因的分离策略 被引量:4
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作者 刘军 杨金水 《生物工程进展》 CSCD 1999年第6期43-46,37,共5页
生命活动的各个进程伴随着不同基因的选择性开启和关闭。如何有效地分离克隆各种差异表达的基因,成为分子生物学研究的一个努力方向,大量差异基因分离策略因之问世。本文扼要介绍了近年来发展的几种主要分离策略。
关键词 差异表达基因 抑制差减杂交 基因分离
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