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用离散量的方法识别蛋白质的超二级结构
被引量：
16
1
作者
胡秀珍
李前忠
《生物物理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第6期424-428,共5页
用离散量的方法,对2208个分辨率在2.5I以上的高精度的蛋白质结构中四类超二级结构进行了识别。从蛋白质一级序列出发,以氨基酸(20种氨基酸加一个空位)和其紧邻关联共同为参数,当序列模式固定长取8个氨基酸残基时,对“822”序列模式3交...
用离散量的方法,对2208个分辨率在2.5I以上的高精度的蛋白质结构中四类超二级结构进行了识别。从蛋白质一级序列出发,以氨基酸(20种氨基酸加一个空位)和其紧邻关联共同为参数,当序列模式固定长取8个氨基酸残基时,对“822”序列模式3交叉检验的平均预测精度达到78.1%,jack-knife检验的平均预测精度达到76.7%;当序列模式固定长取10个氨基酸残基时,对“1041”序列模式3交叉检验的平均预测精度达到83.1%,jack-knife检验的平均预测精度达到79.8%。
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关键词
离散量
离散增量
蛋白质超二级结构
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职称材料
题名
用离散量的方法识别蛋白质的超二级结构
被引量：
16
1
作者
胡秀珍
李前忠
机构
内蒙古大学理工学院物理系
出处
《生物物理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第6期424-428,共5页
基金
国家自然科学基金项目(30560039)~~
文摘
用离散量的方法,对2208个分辨率在2.5I以上的高精度的蛋白质结构中四类超二级结构进行了识别。从蛋白质一级序列出发,以氨基酸(20种氨基酸加一个空位)和其紧邻关联共同为参数,当序列模式固定长取8个氨基酸残基时,对“822”序列模式3交叉检验的平均预测精度达到78.1%,jack-knife检验的平均预测精度达到76.7%;当序列模式固定长取10个氨基酸残基时,对“1041”序列模式3交叉检验的平均预测精度达到83.1%,jack-knife检验的平均预测精度达到79.8%。
关键词
离散量
离散增量
蛋白质超二级结构
Keywords
Measure
of
diversity
Increment
of
diversity
super
-
secondary
structure
of
proteins
分类号
Q61 [生物学—生物物理学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
用离散量的方法识别蛋白质的超二级结构
胡秀珍
李前忠
《生物物理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006
16
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