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中间偃麦草染色体2Ai-2特异PCR新标记的建立和St基因组特异序列的克隆 被引量:15
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作者 张增艳 王丽丽 +1 位作者 辛志勇 林志珊 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第7期627-633,共7页
对中间偃麦草麦、小麦和小麦 中间偃麦草 2Ai 2附加系Z1、Z2、Z6 ,代换系ZD2 8等进行RAPD分析 ,从 32 0个RAPD引物中 ,鉴定出 2Ai 2染色体特异的 2个RAPD标记OPO0 5 6 50 和OPM0 4 1 40 0 。利用这 2个特异RAPD引物OPO0 5和OPM0 4 ,PC... 对中间偃麦草麦、小麦和小麦 中间偃麦草 2Ai 2附加系Z1、Z2、Z6 ,代换系ZD2 8等进行RAPD分析 ,从 32 0个RAPD引物中 ,鉴定出 2Ai 2染色体特异的 2个RAPD标记OPO0 5 6 50 和OPM0 4 1 40 0 。利用这 2个特异RAPD引物OPO0 5和OPM0 4 ,PCR扩增普通小麦CS(ABD)及其近缘植物中间偃麦草 (E1 E2 St)、拟鹅冠草 (St) ,长穗偃麦草 (E)、簇毛麦(V)、黑麦 (R)、大麦 (H)、粗山羊草 (D)等基因组DNA。结果表明 ,OPO0 5 6 50 和OPM0 4 1 40 0 均是 2Ai 2染色体上St基因组区域的特异标记。将上述 2个特异片段分离回收、克隆、测序 ,根据测序结果重新设计、合成特异引物 ,成功地转换RAPD标记为SCAR(sequencecharacterizedamplifiedregion)标记SC O5和SC M4。利用SCAR标记对不同材料进行分析的结果表明 ,凡含有 2Ai 2染色体的抗黄矮病材料及拟鹅冠草均产生一条扩增带 ,不含 2Ai 2染色体的材料 ,包括小麦、长穗偃麦草、簇毛麦、黑麦、大麦、粗山羊草以及含有其他中间偃麦草染色体的附加系 ,均没有扩增产物 ,说明上述 2个SCAR标记是中间偃麦草 2Ai 2染色体的特异性PCR标记 ,且是 2Ai 2染色体上St基因组区域的特异性标记。克隆与鉴定中间偃麦草的 2个SCAR扩增片段TiSCO5和TiSCM4 ,结果表明 。 展开更多
关键词 中间偃麦草 染色体特异性 RAPD标记 SCAR标记 st基因组
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Genetic Relationships Among Five Basic Genomes St, E, A, B and D in Triticeae Revealed by Genomic Southern and in situ Hybridization 被引量:11
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作者 Zhao Liu Dayong Li Xueyong Zhang 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2007年第7期1080-1086,共7页
The St and E are two important basic genomes in the perennial tribe Triticeae (Poaceae). They exist in many perennial species and are very closely related to the A, B and D genomes of bread wheat (Triticum aestivum... The St and E are two important basic genomes in the perennial tribe Triticeae (Poaceae). They exist in many perennial species and are very closely related to the A, B and D genomes of bread wheat (Triticum aestivum L.). Genomic Southern hybridization and genomic in situ hybridization (GISH) were used to analyze the genomic relationships between the two genomes (St and E) and the three basic genomes (A, B and D) of T. aestivum. The semi-quantitative analysis of the Southern hybridization suggested that both St and E genomes are most closely related to the D genome, then the A genome, and relatively distant to the B genome. GISH analysis using St and E genomic DNA as probes further confirmed the conclusion. St and E are the two basic genomes of Thinopyrum ponticum (StStE^eE^bE^x) and Th. intermedium (StE^eE^b), two perennial species successfully used in wheat improvement. Therefore, this paper provides a possible answer as to why most of the spontaneous wheat-Thinopyrum translocations and substitutions usually happen in the D genome, some in the A genome and rarely in the B genome. This would develop further use of alien species for wheat improvement, especially those containing St or E in their genome components. 展开更多
关键词 E genome fluorescent in situ hybridization genomic in situ hybridization perennial Triticeae st genome wheat
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基于叶绿体trnL-F序列对广义披碱草属物种的系统进化研究 被引量:7
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作者 张春 凡星 +3 位作者 沙莉娜 康厚扬 张海琴 周永红 《草业学报》 CSCD 北大核心 2011年第3期162-173,共12页
广义披碱草属包括了披碱草属、鹅观草属、猬草属、裂颖草属和仲彬草属。为深入研究这5个小麦族多年生属的系统地位、母本来源及St染色体组的来源和分化等问题,本研究根据叶绿体DNAtrnL-F序列构建了系统树和网状结构图。结果表明,1)广义... 广义披碱草属包括了披碱草属、鹅观草属、猬草属、裂颖草属和仲彬草属。为深入研究这5个小麦族多年生属的系统地位、母本来源及St染色体组的来源和分化等问题,本研究根据叶绿体DNAtrnL-F序列构建了系统树和网状结构图。结果表明,1)广义披碱草属物种的母本不完全来源于拟鹅观草属的St染色体组,其中黑药仲彬草和梭罗仲彬草的母本染色体组为P染色体组,Hystrix duthiei及长芒猬草的母本染色体组为Ns染色体组;2)系统树中反映了P、W和St染色体组之间具有较近的亲缘关系,它们与H和Ns染色体组的关系较远;3)仲彬草属中黑药仲彬草和梭罗仲彬草与冰草属的二倍体物种聚类在一起,表明黑药仲彬草和梭罗仲彬草与冰草属的关系较近;猬草属中猬草聚在St支中,而H.duthiei和长芒猬草包括在Ns支中,表明它们具有不同的染色体组组成;4)5个不同地理分布的具有St染色体组的拟鹅观草属二倍体物种没有形成一个单系组,表明St染色体组在二倍体物种中存在一定程度的分化;在异源多倍体物种中,其St染色体组的质体序列构成了不同的分支,表明St染色体组在多倍体物种中也具有分化;5)亚洲分布的拟鹅观草属二倍体物种可能参与了大部分欧亚物种的起源,北美分布物种的St染色体组可能来源于北美的拟鹅观草属物种;有些物种在多倍化起源过程中可能发生了重复杂交过程。 展开更多
关键词 广义披碱草属 属间关系 系统进化 st染色体组 母本来源 起源 染色体组分化
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拟鹅观草St基因组ISSR特异标记的建立
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作者 曾子贤 杨足君 +3 位作者 胡利君 刘成 李光蓉 任正隆 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期1533-1540,共8页
以拟鹅观草(Pseudoroegneria spicata)、中间偃麦草(Thinopyrum intermedium)、长穗偃麦草(Th.elonga-tum)、二倍体簇毛麦(Dasypyrum villosum)、澳冰草(Australopyrum retrofractum)等10份小麦族物种为材料,对100条ISSR引物进行分析,... 以拟鹅观草(Pseudoroegneria spicata)、中间偃麦草(Thinopyrum intermedium)、长穗偃麦草(Th.elonga-tum)、二倍体簇毛麦(Dasypyrum villosum)、澳冰草(Australopyrum retrofractum)等10份小麦族物种为材料,对100条ISSR引物进行分析,结果显示引物811可以在拟鹅观草(GenBank登录号为EU368859)和中间偃麦草中扩增出一条长441 bp的特异DNA片段命名为St441,而其它供试物种均未扩出.经序列比对、软件分析结合原位杂交结果认为St441为一类新的低拷贝重复序列.利用ISSR引物811对10份不同居群的中间偃麦草、20份披碱草属物种、4份小麦-偃麦草部分双二倍体、6份小麦-茸毛偃麦草后代和12份小麦对照进行扩增,结果发现除对照小麦外均能扩增出St441;进而对小麦-中间偃麦草两套附加系进行扩增,将St441初步定位于包括第四同源群在内的8条St染色体上.同时,发现只含有整条St染色体和St染色体片段的材料能扩增出St441,而仅有Js染色体的材料未扩增出St441.因此,该标记St441可以作为检测不同背景下St染色质的分子标记. 展开更多
关键词 ISSR 分子标记 st基因组 偃麦草
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