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簸箕柳AP3同源基因SsMADS的克隆与特性分析 被引量:3
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作者 陈英 关亚丽 +2 位作者 程强 曹友志 黄敏仁 《植物生理学通讯》 CSCD 北大核心 2007年第3期469-475,共7页
用cDNA末端快速扩增(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)方法从簸箕柳雄花序中克隆了一个AP3同源基因的cDNA,长826 bp,包括完整的编码区、5′-UTR和3′-UTR,并将其相应的基因命名为SsMADS。该基因由7个外显子和6个内含子组成,编码... 用cDNA末端快速扩增(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)方法从簸箕柳雄花序中克隆了一个AP3同源基因的cDNA,长826 bp,包括完整的编码区、5′-UTR和3′-UTR,并将其相应的基因命名为SsMADS。该基因由7个外显子和6个内含子组成,编码区长723 bp,编码241个氨基酸,其N-端具有典型的MADS保守结构域。序列分析表明,SsMADS编码的氨基酸序列与毛果杨(Populus trichocarp)AP3同源蛋白有95.7%相似性,与其他几种柳属植物的AP3同源蛋白相似性达96.1%~99.6%。实时定量RT-PCR表明,SsMADS在叶、茎和根中表达量极低,在花序中表达量较高,并且其表达量在花器官的早中期发育阶段逐步提高,说明该基因在簸箕柳花器官的发育中起作用。 展开更多
关键词 簸箕柳 ssmads AP3 实时定量RT-PCR 系统进化树分析
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核盘菌子囊盘cDNA文库的构建、EST序列分析与SsMADS基因的筛选 被引量:1
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作者 刘金亮 郭艳梅 +2 位作者 郑明 张世宏 潘洪玉 《吉林大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期694-698,共5页
以核盘菌子囊盘为材料,应用SMART(Switch Mechanism at 5′end of RNA Transcript)技术,构建了高质量的核盘菌cDNA文库.涂平板测定和酶切反应鉴定表明,原始文库的滴度为4.11×105,重组率达97.3%.通过对文库克隆的序列测定和初步生... 以核盘菌子囊盘为材料,应用SMART(Switch Mechanism at 5′end of RNA Transcript)技术,构建了高质量的核盘菌cDNA文库.涂平板测定和酶切反应鉴定表明,原始文库的滴度为4.11×105,重组率达97.3%.通过对文库克隆的序列测定和初步生物信息学分析,共获得1800条核盘菌有效表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST).同源比对分析表明,844条独立基因代表了242个已知基因,其余602个EST为未知序列.这242个已知基因大致可以分为3类:78个可归属于生物学过程,97个可归属于分子功能,67个可归属于细胞组分.其中,在97个分子功能基因中筛选到1个与MADS-box具有较高同源性的基因(SsMADS),推测可能与核盘菌的有性生殖过程有关. 展开更多
关键词 核盘菌 子囊盘 CDNA文库 EST序列 ssmads基因
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