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向日葵黑茎病菌的快速分子检测 被引量：14
1
作者 宋娜 陈卫民 +1 位作者 杨家荣 胡小平 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期630-638,共9页
从新疆采集的向日葵黑茎病罹病植株的茎秆、叶片和花盘共分离获得20个真菌分离物。经致病性测定,证明分离物XJ011和XJ111是引起该病害的病原物。采用ITS通用引物ITS1/ITS4对XJ011和XJ111菌株的rDNA-ITS区进行PCR扩增和测序,并结合形态... 从新疆采集的向日葵黑茎病罹病植株的茎秆、叶片和花盘共分离获得20个真菌分离物。经致病性测定,证明分离物XJ011和XJ111是引起该病害的病原物。采用ITS通用引物ITS1/ITS4对XJ011和XJ111菌株的rDNA-ITS区进行PCR扩增和测序,并结合形态学特征,将该菌鉴定为麦氏茎点霉Phoma macdonaldii。同时,在rDNA-ITS的多态性丰富区域设计了一对特异性引物320FOR/320REV,建立了P.macdonaldii病菌的快速分子检测体系,能特异性检测出向日葵黑茎病菌,灵敏度可达到1fg。 展开更多
关键词 致病性 特异性引物 rDNA-ITS区 向日葵
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烟草青枯菌特异性引物筛选及其应用 被引量：7
2
作者 杨姣弟 陈武 +1 位作者 王运生 肖启明 《中国农学通报》 CSCD 2012年第10期254-258,共5页
为解决快速诊断烟田土壤中是否含有烟草青枯菌这一问题,基于已公布的5个青枯菌基因组全基因组比对结果,设计9对青枯菌特异性引物,筛选并验证得到3对引物能对青枯菌进行特异性扩增。应用筛选得到的引物能对土壤中烟草青枯菌进行特异性检... 为解决快速诊断烟田土壤中是否含有烟草青枯菌这一问题,基于已公布的5个青枯菌基因组全基因组比对结果,设计9对青枯菌特异性引物,筛选并验证得到3对引物能对青枯菌进行特异性扩增。应用筛选得到的引物能对土壤中烟草青枯菌进行特异性检测,初步认为本方法对土壤青枯菌最低检出率为2×106/g,为土壤中快速检测烟草青枯菌提供了快速、准确诊断的新方法。 展开更多
关键词 烟草青枯菌 特异性引物 土壤 分子检测
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PCR检测沙门菌hilA基因的方法研究 被引量：7
3
作者 张敬平 凌霞 +3 位作者 陈悦 倪培华 吴家林 肖勇 《中国卫生检验杂志》 CAS 2008年第12期2608-2609,2708,共3页
目的:利用PCR技术,建立特异性引物PCR快速检测沙门菌的方法。方法:设计沙门菌h ilA基因的特异性引物,优化PCR反应条件,对沙门菌和非沙门菌进行特异性引物的PCR扩增,鉴定沙门菌。结果:所检测沙门菌株和模拟样品均出现特异性扩增条带,结... 目的:利用PCR技术,建立特异性引物PCR快速检测沙门菌的方法。方法:设计沙门菌h ilA基因的特异性引物,优化PCR反应条件,对沙门菌和非沙门菌进行特异性引物的PCR扩增,鉴定沙门菌。结果:所检测沙门菌株和模拟样品均出现特异性扩增条带,结果与实际相符。结论:该方法具有简单、迅速、特异性好和敏感性高的特点。 展开更多
关键词 PCR技术 特异性 引物 沙门菌
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橡胶树褐根病菌的分子检测 被引量：4
4
作者 梁艳琼 吴伟怀 +5 位作者 李锐 郑肖兰 郑金龙 习金根 贺春萍 易克贤 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2016年第3期576-581,共6页
利用褐根病菌的一对特异性引物G1F/G1R,对不同来源橡胶树褐根病菌菌株的r DNA-ITS区进行PCR扩增,对发病组织进行分子检测,并构建橡胶树褐根病菌系统发育树。结果表明:10株不同来源橡胶树褐根病菌菌株DNA均能扩增出一条653 bp的特异性片... 利用褐根病菌的一对特异性引物G1F/G1R,对不同来源橡胶树褐根病菌菌株的r DNA-ITS区进行PCR扩增,对发病组织进行分子检测,并构建橡胶树褐根病菌系统发育树。结果表明:10株不同来源橡胶树褐根病菌菌株DNA均能扩增出一条653 bp的特异性片段,而橡胶树红根病菌、紫根病菌、臭根病菌、白根病菌和清水对照均无扩增条带。发病组织检测结果表明,该引物能特异性检测到橡胶树褐根病菌的存在。引物对基因组DNA检测灵敏度为100 ag/μL。基于r DNA-ITS系统发育分析结果表明,供试菌株与Gen Bank中的菌株KF233592、KM079591聚在同一分支上,其亲缘关系最近,均属于Phellinus noxius。 展开更多
关键词 橡胶树 褐根病菌 特异性引物 分子检测
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新疆4种林木腐烂病菌PCR快速检测技术研究 被引量：1
5
作者 郭开发 姚兆群 +2 位作者 吴彩兰 向本春 赵思峰 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1843-1849,共7页
【目的】建立新疆林木腐烂病菌的快速PCR检测方法,为新疆林木腐烂病的早期测报和防治提供技术依据。【方法】针对新疆林木腐烂病菌主要种苹果黑腐皮壳(Valsa mali),污黑腐皮壳(Valsa.sordida),Leucostoma niveum和Valsa.malicola的r DNA... 【目的】建立新疆林木腐烂病菌的快速PCR检测方法,为新疆林木腐烂病的早期测报和防治提供技术依据。【方法】针对新疆林木腐烂病菌主要种苹果黑腐皮壳(Valsa mali),污黑腐皮壳(Valsa.sordida),Leucostoma niveum和Valsa.malicola的r DNA-ITS特异性区段设计属专化型引物和种特异性引物。【结果】属专化型引物VF/VR可以从腐烂病菌中扩增一条424 bp的条带,检测灵敏度为10 pg/m L;设计的4对种特异性引物分别可对4种腐烂病菌V.mali,V.sordida,L.niveum,V.malicola检测到263 bp、423 bp、307 bp、308 bp的条带,检测灵敏度均为10 pg/m L。【结论】采用腐烂病菌Valsa的r DNA-ITS特异性区段设计的引物及PCR方法,可用于新疆林木腐烂病的快速分子检测。 展开更多
关键词 林木 腐烂病菌 r DNA-ITS PCR检测 特异性引物
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封闭循环养殖系统中β变形菌亚纲氨氧化细菌的引物特异性 被引量：1
6
作者 裴芳芳 朱鹏 +2 位作者 闵航 陆开宏 叶央芳 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期1342-1350,共9页
【目的】为探讨4对不同的引物对封闭循环养殖系统生物膜中β变形菌亚纲氨氧化细菌(β-AOB)的特异性差异。【方法】采用16S rDNA文库克隆技术对β-AOB的多样性进行了分析。【结果】以引物CTO189f/CTO654r扩增构建的文库中所含β-AOB比例... 【目的】为探讨4对不同的引物对封闭循环养殖系统生物膜中β变形菌亚纲氨氧化细菌(β-AOB)的特异性差异。【方法】采用16S rDNA文库克隆技术对β-AOB的多样性进行了分析。【结果】以引物CTO189f/CTO654r扩增构建的文库中所含β-AOB比例最高,可达67.3%。不同封闭循环养殖系统的生物膜对引物的扩增效率有明显的影响,其中以养殖尼罗罗非鱼的封闭循环养殖系统生物膜为DNA来源的,引物均有较高的扩增效率。【结论】针对封闭循环养殖系统生物膜中的β-AOB,特异性最高的是CTO189f/CTO654r引物。 展开更多
关键词 β亚纲氨氧化细菌 16S RDNA 克隆文库 引物特异性
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