目的:运用现代网络药理学和分子对接技术对四藤一仙汤治疗糖尿病周围神经病变的潜在有效成分进行筛选,同时推测这些成分的作用靶点,以深入研究其作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库(TCMSP)和国家中医药百科全书数据库(ETCM)筛选...目的:运用现代网络药理学和分子对接技术对四藤一仙汤治疗糖尿病周围神经病变的潜在有效成分进行筛选,同时推测这些成分的作用靶点,以深入研究其作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库(TCMSP)和国家中医药百科全书数据库(ETCM)筛选四藤一仙汤中涉及的五味中药信息及潜在的药理作用和靶点信息,通过在人类基因数据库(GeneCards)中搜索与糖尿病周围神经病变疾病相关的靶点信息,然后将其与四藤一仙汤中的成药靶点信息取交集,得到成药-疾病交集靶点。使用STRING平台构建这些交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络,并将蛋白质-蛋白质相互作用网络数据以TSV文件格式导入Cytoscape 3.8.2软件。在Cytoscape 3.8.2软件中,我们将进行关键靶点分析,依据连接度值进行二次建模,进行亮暗颜色分析,从而检测出最关键的核心靶点;此外利用Metascape数据库分析药物-疾病靶点互相作用网络,同时完成对基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)的信息的富集与分析,从而筛选出四藤一仙汤治疗糖尿病周围神经病变的活性物质成分。最后用Autodock软件和Pymol软件对主要活性成分及核心靶点进行分子对接验证和可视化展示。结果:药物和疾病的潜在靶点分别为249个和1324个,它们之间的交集靶点为108个。经过筛选,我们获得了核心靶点,其中包括信号转导因子和转录激活因子(Signal Transducer and Activator of Transcription,STAT)3、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)等。GO功能富集分析显示,四藤一仙汤对细胞生物学过程具有多种影响,包括细胞对氮化合物的反应、对无机物的反应、细胞迁移的正向调节、细胞对脂质的反应、蛋白质磷酸化的正调节、细胞对有机环状化合物的反应、细胞群增殖的负调控、细胞分解代谢过程的调节�展开更多
文摘目的:运用现代网络药理学和分子对接技术对四藤一仙汤治疗糖尿病周围神经病变的潜在有效成分进行筛选,同时推测这些成分的作用靶点,以深入研究其作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库(TCMSP)和国家中医药百科全书数据库(ETCM)筛选四藤一仙汤中涉及的五味中药信息及潜在的药理作用和靶点信息,通过在人类基因数据库(GeneCards)中搜索与糖尿病周围神经病变疾病相关的靶点信息,然后将其与四藤一仙汤中的成药靶点信息取交集,得到成药-疾病交集靶点。使用STRING平台构建这些交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络,并将蛋白质-蛋白质相互作用网络数据以TSV文件格式导入Cytoscape 3.8.2软件。在Cytoscape 3.8.2软件中,我们将进行关键靶点分析,依据连接度值进行二次建模,进行亮暗颜色分析,从而检测出最关键的核心靶点;此外利用Metascape数据库分析药物-疾病靶点互相作用网络,同时完成对基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)的信息的富集与分析,从而筛选出四藤一仙汤治疗糖尿病周围神经病变的活性物质成分。最后用Autodock软件和Pymol软件对主要活性成分及核心靶点进行分子对接验证和可视化展示。结果:药物和疾病的潜在靶点分别为249个和1324个,它们之间的交集靶点为108个。经过筛选,我们获得了核心靶点,其中包括信号转导因子和转录激活因子(Signal Transducer and Activator of Transcription,STAT)3、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)等。GO功能富集分析显示,四藤一仙汤对细胞生物学过程具有多种影响,包括细胞对氮化合物的反应、对无机物的反应、细胞迁移的正向调节、细胞对脂质的反应、蛋白质磷酸化的正调节、细胞对有机环状化合物的反应、细胞群增殖的负调控、细胞分解代谢过程的调节�
