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ITO法和判别函数法在同胞关系鉴定中的应用 被引量:52
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作者 陆惠玲 周科伟 +2 位作者 吕德坚 姚亚楠 章雅清 《法医学杂志》 CAS CSCD 2009年第2期118-122,共5页
目的探讨ITO法和判别函数法在全同胞、半同胞关系鉴定中的应用价值。方法根据500对全同胞、50对半同胞及500对无关个体的15个STR基因座(PowerPlexTM16体系)的分型结果,采用ITO法分别计算全同胞关系指数(FSI)、半同胞关系指数(HSI)及其比... 目的探讨ITO法和判别函数法在全同胞、半同胞关系鉴定中的应用价值。方法根据500对全同胞、50对半同胞及500对无关个体的15个STR基因座(PowerPlexTM16体系)的分型结果,采用ITO法分别计算全同胞关系指数(FSI)、半同胞关系指数(HSI)及其比值(FSI∶HSI)。比较三组配对个体的等位基因匹配情况,计算分型结果全不同的基因座数(x0)、半相同的基因座数(x1)和完全相同的基因座数(x2),利用SPSS13.0分析软件建立全同胞、半同胞和无关个体的判别函数。结果(1)以FSI≥19、FSI<1作为全同胞与无关个体的判别标准,交互准确率为96.4%;以HSI≥19、HSI<1作为半同胞与无关个体的判别标准,交互准确率为85.3%;以FSI∶HSI≥1、FSI∶HSI<1作为全同胞与半同胞的判别标准,交互准确率为87.5%。(2)分别建立了全同胞-半同胞-无关个体、全同胞-无关个体、半同胞-无关个体、全同胞-半同胞4组判别函数,判别函数交互准确率为84.4%~97.7%,其中同胞-无关个体判别准确率最高。结论ITO法与判别函数法在全同胞、半同胞鉴定中均具有较高的应用价值。 展开更多
关键词 法医遗传学 同胞关系 短串联重复序列 判别分析 ITO法
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中国Y-STR数据库建设相关问题探讨 被引量:30
2
作者 葛建业 严江伟 +3 位作者 谢群 孙宏钰 周怀谷 李斌 《法医学杂志》 CAS CSCD 2013年第3期212-215,221,共5页
Y染色体是男性所特有的父系遗传染色体,Y染色体上的STR基因座已经大量应用于实际案件。本文总结了Y-STR的特性以及选择适合中国人群的Y-STR基因座所需要考虑的问题,展望了Y-STR在家系排查、亲缘搜索、来源人群推断、混合样本检验、亲缘... Y染色体是男性所特有的父系遗传染色体,Y染色体上的STR基因座已经大量应用于实际案件。本文总结了Y-STR的特性以及选择适合中国人群的Y-STR基因座所需要考虑的问题,展望了Y-STR在家系排查、亲缘搜索、来源人群推断、混合样本检验、亲缘关系鉴定等方面的应用前景,并探讨了Y-STR试剂盒研发、验证,Y-STR突变率,搜索软件等方面的问题,提出了相应的建议。 展开更多
关键词 法医遗传学 Y染色体 综述[文献类型] 短串联重复序列 DNA数据库
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应用常染色体STR基因座共有等位基因数判别全同胞关系 被引量:30
3
作者 赵书民 李成涛 +3 位作者 张素华 李莉 林源 阙庭志 《法医学杂志》 CAS CSCD 2009年第4期267-270,共4页
目的建立基于常染色体STR基因座共有等位基因数的全同胞关系判别标准。方法根据280对全同胞及2003对无关个体Identifiler系统15个STR基因座的分型结果,对15个STR基因座的共有等位基因数(S15)和全同胞指数(FSI)进行统计,应用SAS8.2软件... 目的建立基于常染色体STR基因座共有等位基因数的全同胞关系判别标准。方法根据280对全同胞及2003对无关个体Identifiler系统15个STR基因座的分型结果,对15个STR基因座的共有等位基因数(S15)和全同胞指数(FSI)进行统计,应用SAS8.2软件包得出Fisher判别函数并与ITO法结果进行比较。结果全同胞对及无关个体对中共有等位基因数目均符合正态分布。采用Identifiler系统15个STR基因座共有等位基因数进行全同胞关系判别时,判别函数分别为:ZFS=3.26970S15-31.51174和ZUI=1.70058S15-8.52411。用上述判别函数进行全同胞/无关个体关系判别时的平均错判率为0.0298。15个STR基因座共有等位基因数法、CODIS13个STR基因座共有等位基因数法与ITO法判别结果差异无统计学意义。结论应用常染色体STR基因座的共有等位基因数判别全同胞关系简便、可信,易于掌握且不受STR基因座等位基因频率的影响。 展开更多
关键词 法医遗传学 同胞关系 等位基因 短串联重复序列 判别分析 ITO法
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常用STR基因座突变的观察与分析 被引量:27
4
作者 李秋阳 丰伟军 +3 位作者 杨庆恩 朱传红 黄代新 余纯应 《法医学杂志》 CAS CSCD 2005年第2期86-89,共4页
目的观察与分析常用STR基因座突变的特点。方法从1211例确定亲子关系的案例中收集到27个突变基因。用银染法和荧光标记试剂盒复核,并作序列测定证实。结果27个突变基因出现在15个基因座,突变方式符合步移突变模型。男女性别比例8∶1。... 目的观察与分析常用STR基因座突变的特点。方法从1211例确定亲子关系的案例中收集到27个突变基因。用银染法和荧光标记试剂盒复核,并作序列测定证实。结果27个突变基因出现在15个基因座,突变方式符合步移突变模型。男女性别比例8∶1。突变率与父亲年龄正相关。结论突变率与基因座各等位基因均一重复单位个数的几何平均数相关,数值高的突变率较高,亲子鉴定中应谨慎使用。 展开更多
关键词 STR基因座 突变基因 几何平均数 突变率 亲子关系 荧光标记 序列测定 突变模型 突变方式 性别比例 等位基因 父亲年龄 亲子鉴定 试剂盒 银染法 正相关
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雌激素受体α基因PvuⅡ、XbaⅠ、STR多态性与原因不明月经过少的关系 被引量:22
5
作者 袁瑞 乐爱文 +1 位作者 夏恩兰 姚珍薇 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期231-233,共3页
目的探讨西南地区雌激素受体α(estrogen receptorα,ERα)基因多态性与原因不明月经过少的关系。方法选择西南地区100例原因不明月经过少患者为实验组,100例正常月经者作为对照组。应用分子生物学的方法分析PvuⅡ、XbaⅠ限制性片段... 目的探讨西南地区雌激素受体α(estrogen receptorα,ERα)基因多态性与原因不明月经过少的关系。方法选择西南地区100例原因不明月经过少患者为实验组,100例正常月经者作为对照组。应用分子生物学的方法分析PvuⅡ、XbaⅠ限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)。同时对人雌激素受体基因上游的短串联重复序列(short tandem repeat,STR)进行纯化、克隆和序列分析,观察ERα基因多态性基因型在实验组与对照组中的基因型分布。结果P基因型频率实验组为47.5%,对照组为30.5%,OR值1.810(95%CI=1.113-2.765),P=0.012。实验组X基因型频率为20.5%,对照组为32.0%,OR值0.641(95%CI=0.361-0.898),P=0.036;PvuⅡ和XbaⅠ限制性片段长度多态性在两组中均呈多态性分布。病例组TA13等位基因频率高于对照组,差异有显著性(P=0.006),TA15等位基因频率低于对照组,差异有显著性(P=0.033)。结论ERα基因多态性与原因不明月经过少有关,P等位基因可能是其危险因素,X等位基因可能是其保护因素,TA13等位基因可能是其危险因素,TA15等位基因可能是其保护因素。 展开更多
关键词 月经过少 雌激素受体 等位基因 短串联重复序列
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先天性心脏病患者22q11微缺失检测及相关分析 被引量:21
6
作者 许争峰 易龙 +9 位作者 莫绪明 胡娅莉 王东进 朱瑞芳 江永中 吴星 武忠 沈立 张颖 仲晓玲 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期250-255,共6页
目的探讨5个短串联重复(shorttandemrepeat,STR)标记用于检测22q11微缺失的可行性,了解中国汉族未经挑选的先天性心脏畸形患者中22q11微缺失的发生情况。方法选择位于22q11缺失区域的5个STR标记,对163例中国汉族先天性心脏畸形(congenit... 目的探讨5个短串联重复(shorttandemrepeat,STR)标记用于检测22q11微缺失的可行性,了解中国汉族未经挑选的先天性心脏畸形患者中22q11微缺失的发生情况。方法选择位于22q11缺失区域的5个STR标记,对163例中国汉族先天性心脏畸形(congenitalheartdefect,CHD)患者及双亲进行单倍型分析,对检出的阳性病例及部分阴性病例进行荧光原位杂交(fluorescenceinsituhybridization,FISH)验证。结果5个标记均具有较好的信息量,22D41和22D42杂合率分别为0.65和0.52,22D43、22D44和D22S873杂合率均在0.7以上,可用于汉族人群多态性分析;163例先天性心脏畸形患者用STR标记检出12例22q11微缺失,其中9例得到FISH检测证实,2例微小缺失和1例远端缺失FISH检测为阴性;CHD患者22q11微缺失检出率为7.36%,室间隔缺损微缺失检出率为8.18%(9/110),法乐氏四联征检出率为14.3%(3/21),其它类型的CHD未检出缺失。结论5个STR标记可用于汉族人群22q11微缺失的检测,且有快速、成本低的优点;中国汉族CHD患者中存在一定比率的22q11微缺失,尤其是室间隔缺损和法乐氏四联征较为常见。 展开更多
关键词 先天性心脏病 22Q11微缺失 短串联重复
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藏族X染色体10个STR位点的遗传多态性 被引量:16
7
作者 高雅 金天博 +2 位作者 余兵 杜宏 李生斌 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期97-99,共3页
目的研究西藏藏族X染色体上的10个短串联重复序列(DXS7423,DXS8378,DXS6799,DXS7424,DXS7130,DXS7132,DXS6789,DXSl01,DXS6804,DXS7133)的基因及基因型频率分布。方法随机抽取101名西藏藏族无关个体静脉血,提取DNA,PCR扩... 目的研究西藏藏族X染色体上的10个短串联重复序列(DXS7423,DXS8378,DXS6799,DXS7424,DXS7130,DXS7132,DXS6789,DXSl01,DXS6804,DXS7133)的基因及基因型频率分布。方法随机抽取101名西藏藏族无关个体静脉血,提取DNA,PCR扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染检测结果。结果DXS7423,DXS8378,DXS6799,DXS7424,DXS7130,DXS7132,DXS6789,DXS101,DXS6804,DXS7133分别检出5种、5种、5种、9种、7种、7种、11种、9种、5种和4种等位基因;基因频率分别分布在0.0172~0.5610、0.0179~0.5595、0.0122~0.5614、0.0122—0.4024、0.0172—0.4828、0.0116~0.4035、0.0119~0.2857、0.0119-0.3774、0.0351-0.0.3929、0.0116~0.6786之间,此10个位点女性的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡。结论此10个X染色体STR位点有较高的个体识别率,在个体识别和女孩亲权鉴定中有较高应用价值.对疾病相关研究有重要意义。 展开更多
关键词 X染色体 短串联重复序列 遗传多态性 藏族 STR位点
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PowerPlex^(TM)16体系OL等位基因序列分析及命名探讨 被引量:18
8
作者 陆惠玲 台运春 +1 位作者 刘超 李海燕 《法医学杂志》 CAS CSCD 2006年第3期186-189,共4页
目的观察中国汉族人群PowerPlexTM16体系STR基因座分型标准物外等位基因(OL等位基因)的序列组成,探讨其类型及命名。方法应用PowerPlexTM16体系和ABI377或3100遗传分析仪,对10071名中国汉族无关个体的血样DNA进行15个STR基因座的分型,... 目的观察中国汉族人群PowerPlexTM16体系STR基因座分型标准物外等位基因(OL等位基因)的序列组成,探讨其类型及命名。方法应用PowerPlexTM16体系和ABI377或3100遗传分析仪,对10071名中国汉族无关个体的血样DNA进行15个STR基因座的分型,筛选出OL等位基因样本;对该样本进行单基因座扩增、聚丙稀酰胺凝胶电泳、银染显色,获取等位基因条带并再次扩增和测序。结果在11个基因座检见OL等位基因,共32个,频率0.05‰ ̄4.02‰,各基因座OL等位基因数目1 ̄9个不等。按其组成分为四类:(1)重复单位完整重复,但重复次数在ladder范围外;(2)不完整重复;(3)侧翼序列个别碱基的插入或缺失;(4)较大片断的缺失。结论OL等位基因类型不一,既有重复次数的变化,也有侧翼序列或核心序列的变化,现有命名原则尚不能反映其组成类型。 展开更多
关键词 STR基因座 OL等位基因 PowerPlex^TM16体系
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三个短串联重复序列位点的等位基因遗传变异研究 被引量:17
9
作者 庾蕾 李建金 +4 位作者 伍新尧 曹露媚 刘秋玲 曾艳红 区敬华 《中华医学遗传学杂志》 EI CAS CSCD 2002年第4期308-312,共5页
目的 探讨短串联重复序列 (short tandem repeats,STRs)遗传变异的方式及机理。方法用银染方法对 3个 STR位点 (FGA、D12 S391、D11S5 5 4 )共 19个发生突变的家系父、母、子的 DNA样本进行 STR基因分型 ,将需测序的等位基因条带从凝... 目的 探讨短串联重复序列 (short tandem repeats,STRs)遗传变异的方式及机理。方法用银染方法对 3个 STR位点 (FGA、D12 S391、D11S5 5 4 )共 19个发生突变的家系父、母、子的 DNA样本进行 STR基因分型 ,将需测序的等位基因条带从凝胶上切下 ,再进行 PCR扩增 ,产物经纯化作为测序模板 ,采用循环测序法测序。结果  19个家系中有 18个家系子代新产生的等位基因变异表现为一个重复单位的增加或减少 (表现为一个重复单位增加的有 8个家系 ,减少的有 7个家系 ,不确定的有 3个家系 ) ,只有 1个家系表现为 2个重复单位的减少。子代新产生的等位基因来自父亲的有 13个家系 ,来自母亲的有 3个家系 ,不能确定的有 3个家系。来自父与母的比例约为 4∶ 1。 3个 STR位点等位基因突变都出现在长的、连续的四核苷酸重复区 (FGA的“CTTT”区、 D12 S391的“AGAT”区、 D11S5 5 4的“AAAG”区 )。结论FGA、D12 S391和 D11S5 5 4 3个 STR位点的等位基因突变主要表现为一个重复单位的增加或减少占95 % ,其次是两个重复单位的变化 ,没有碱基的插入或缺失。突变主要来自父亲。在这 3个 STR位点中的长的。 展开更多
关键词 等位基因 遗传变异 短串联重复序列 突变 测序 STRS 银染方法
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用分子克隆技术构建D12S391基因座等位基因分型标准物及群体遗传学研究 被引量:13
10
作者 张林 辛军平 +2 位作者 陈国弟 廖淼 李荣华 《中华医学遗传学杂志》 EI CAS CSCD 2002年第1期17-21,共5页
目的 解决长期困扰短串联重复序列 (shorttandem repeat,STR)分型上存在的准确性和标准化问题。方法 先用 PCR扩增出 D12 S391基因座的 9个等位基因片段 ,将其插入 p UC重组质粒中 ,经DNA测序分析证实插入片段的结构及大小 ,用国际标... 目的 解决长期困扰短串联重复序列 (shorttandem repeat,STR)分型上存在的准确性和标准化问题。方法 先用 PCR扩增出 D12 S391基因座的 9个等位基因片段 ,将其插入 p UC重组质粒中 ,经DNA测序分析证实插入片段的结构及大小 ,用国际标准将插入的等位基因片段进行命名 ,最后经转染、扩大培养、扩增及再鉴定后 ,制备出标准的 D12 S391等位基因分型标准物。结果 应用此法制备出大量的D12 S391基因座等位基因分型标准物 ,并将其用于调查该基因座在德国 Mainz地区、日本 Miyazaki地区及中国成都汉族、北京汉族、新疆维吾尔族和甘肃回族 6个群体中的基因型分布频率。 D12 S391基因座在各群体中均有较高的多态性 ,其非父排除概率及个人识别能力分别为 0 .6 0 9~ 0 .786和 0 .940~ 0 .95 2。结论该法制备的 STR基因座等位基因分型标准物在法医科学实践中应用价值极高 ,D12 S391基因座是一个非常适合于群体遗传学研究和法医科学应用的遗传标记。 展开更多
关键词 等位基因分型标准物 短串联重复序列 聚合酶链反应 D12S391基因座 遗传多态性 群体遗传学
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Goldeneye^(TM) DNA身份鉴定系统22NC试剂盒的法医遗传学调查 被引量:16
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作者 林源 阙庭志 +1 位作者 赵珍敏 张素华 《法医学杂志》 CAS CSCD 2015年第4期280-283,共4页
目的调查Goldeneye TM DNA身份鉴定系统22NC试剂盒中所包含的21个常染色体STR基因座在汉族人群中的遗传学数据,并考察该试剂盒的法医学应用价值。方法应用Goldeneye TM DNA身份鉴定系统22NC试剂盒对华东地区500名汉族健康无关个体进行... 目的调查Goldeneye TM DNA身份鉴定系统22NC试剂盒中所包含的21个常染色体STR基因座在汉族人群中的遗传学数据,并考察该试剂盒的法医学应用价值。方法应用Goldeneye TM DNA身份鉴定系统22NC试剂盒对华东地区500名汉族健康无关个体进行常染色体STR基因座分型检测,统计分析21个常染色体STR基因座的频率数据、群体遗传学参数及连锁不平衡状况。结果 21个常染色体STR基因座在华东汉族人群中均符合Hardy-Weinberg平衡,各基因座之间相互独立。DP值均大于0.85,在群体中的CDP值为1-3.616 5×10-26,二联体累积非父排除率为1-2.786 81×10-6,三联体累积非父排除率为1-8.545 82×10-10。结论Goldeneye TM DNA身份鉴定系统22NC试剂盒中所包含的21个常染色体STR基因座在华东汉族人群中具有良好的多态性,联合Goldeneye TM DNA身份鉴定系统20A可以满足双亲皆无的全同胞鉴定要求,为该类案件的解决提供便利的工具。 展开更多
关键词 法医遗传学 多态现象 遗传 短串联重复序列 GoldeneyeTM DNA身份鉴定系统22NC试剂盒
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多重定量荧光PCR在胎儿常见染色体非整倍体快速诊断中的应用 被引量:15
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作者 胡婷 刘洪倩 +7 位作者 朱红梅 王婧 张海霞 祝茜 赖怡 秦利 王和 刘珊玲 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期214-218,共5页
目的探讨多重定量荧光PCR(quantitative fluorescence polymerase chain reaction,QF—PCR)技术在胎儿常见染色体非整倍体异常快速诊断中的应用。方法用QF-PCR技术对我院4649名行羊膜腔穿刺术孕妇的4760份羊水样本21、18、13、X和Y... 目的探讨多重定量荧光PCR(quantitative fluorescence polymerase chain reaction,QF—PCR)技术在胎儿常见染色体非整倍体异常快速诊断中的应用。方法用QF-PCR技术对我院4649名行羊膜腔穿刺术孕妇的4760份羊水样本21、18、13、X和Y染色体数目进行分析,并与染色体核型分析结果进行比较。结果QF-PCR检测成功率为98.4%。QF-PCR检测出21、18、13、x及Y染色体非整倍体48例(2例核型为46,XY,rob(13:21),+21;4例为双胎之一21三体),均与核型分析结果一致,5种常见染色体非整倍体异常分析敏感性和特异性均为100%;检出1例21三体嵌合体及4例性染色体异常的嵌合体(1例核型分析漏诊);QF-PCR漏诊4例性染色体嵌合体;染色体核型分析失败的64例样本,QF—PCR检测均得到结果。QF-PCR检测结果与核型分析符合率为98.3%。结论QF-PCR技术可快速、准确的诊断21、18、13、X及Y染色体非整倍体,并能检出部分嵌合体,作为染色体核型分析的有效补充,在快速产前诊断中具有重要临床实用价值。 展开更多
关键词 定量荧光PCR 产前诊断 短串联重复序列 非整倍体 嵌合体
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宁夏回族人群X染色体10个短串联重复序列位点的遗传多态性调查 被引量:12
13
作者 冯雪 徐平 +2 位作者 托娅 余兵 李生斌 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期346-348,共3页
目的研究宁夏回族群体X染色体上的10个短串联重复序列(DXS101、DXS6789、DXS6799、DXS6804、DXS7130、DXS7132、DXS7133、DXS7423、HPRTB、DXS8378)的基因及基因型频率分布。方法随机抽取100名宁夏回族无关个体静脉血,提取DNA,PCR扩增,... 目的研究宁夏回族群体X染色体上的10个短串联重复序列(DXS101、DXS6789、DXS6799、DXS6804、DXS7130、DXS7132、DXS7133、DXS7423、HPRTB、DXS8378)的基因及基因型频率分布。方法随机抽取100名宁夏回族无关个体静脉血,提取DNA,PCR扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染检测结果。结果DXS101、DXS6789、DXS6799、DXS6804、DXS7130、DXS7132、DXS7133、DXS7423、HPRTB、DXS8378分别检出9、8、4、6、6、6、4、4、5和5种等位基因;分别检出17、22、7、14、14、15、6、7、12和8种基因型;基因频率分别分布在0.0087~0.3130、0.0087~0.2696、0.0348~0.5826、0.0087~0.3044、0.0261~0.4348、0.0261~0.3217、0.0261~0.6783、0.0087~0.4870、0.0261~0.4783、0.0087~0.4870之间;此10个位点女性的基因型频率分布均符合Hardy Weinberg平衡,多态信息量除DXS7133和DXS7423外均大于0.50;女性个体识别率从0.89(DXS7133,DXS7423)至0.99(DXS101,DXS6789,DXS7132)。结论这10个X染色体短串联重复序列位点有较高的个体识别率,在个体识别和女孩亲权鉴定中有较高应用价值,对疾病相关研究有重要意义。 展开更多
关键词 X染色体 短串联重复 遗传多态性
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短串联重复基因座突变率的分析研究 被引量:13
14
作者 李建金 伍祥林 +2 位作者 吕德坚 伍新尧 区敬华 《中国法医学杂志》 CSCD 2000年第B06期10-11,共2页
分析亲子鉴定案例进行中的STR基因座的突变率。采用chelex 100快速抽提DNA,DNA扩增,聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染色法,参照标准品进行DNA分型。在300例已确定亲生关系的案例中,有11例出现STR基因座变异,其中D11S554基因座6例,D19S253基因座... 分析亲子鉴定案例进行中的STR基因座的突变率。采用chelex 100快速抽提DNA,DNA扩增,聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染色法,参照标准品进行DNA分型。在300例已确定亲生关系的案例中,有11例出现STR基因座变异,其中D11S554基因座6例,D19S253基因座2例,SE33、D12S391、D13S631基因座各1例。结果提示:用STR基因座进行亲子鉴定,必须考虑STR基因座突变因素。 展开更多
关键词 短串联重复序列 变异 亲子鉴定
全文增补中
2个新Y-STR基因座的序列分析和在广东汉族群体中的多态性研究 被引量:12
15
作者 黄艳梅 祁英杰 +2 位作者 徐基清 朱运良 伍新尧 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期1355-1360,共6页
分析了Y染色体2个新STR基因座DYS522和DYS527的序列结构及其在151例广东汉族男性无关个体中的遗传多态性。结果显示,DYS522基因座为单拷贝,核心序列gata,观察到重复数目为9-13次。DYS527基因座有双拷贝,每一个拷贝的序列结构有6个稳定... 分析了Y染色体2个新STR基因座DYS522和DYS527的序列结构及其在151例广东汉族男性无关个体中的遗传多态性。结果显示,DYS522基因座为单拷贝,核心序列gata,观察到重复数目为9-13次。DYS527基因座有双拷贝,每一个拷贝的序列结构有6个稳定的重复序列和2个数目变异的重复序列,如(GGAA)3…(GGAA)2…(GGAA)2…(GGAA)3…(GGAA)4…(GGAA)3…(GAAA)m(GGAA)n。在广东汉族男性群体中观察到2个数目变异的核心序列重复总数目(m+n)为18~26次。还发现1个稀有的拷贝“15.3”。在广东汉族男性群体中,2个基因座所组成的单倍型有63种,出现最多的单倍型为11/21-22,频率为0.0728,仅出现1次的单倍型有29种,频率为0.0066。本系统单倍型多样性(HD)为0.9780,个体识别力(DP)达0.9715。在38对父子遗传中未发现DYS522和DYS527基因座发生变异。这2个Y-STR具有种属差异,能够区分“男人”和“非人”雄性动物。因此,DYS522和DYS527基因座具有高度的多态性,适用于法医学实践和人类进化的研究。 展开更多
关键词 DYS522 DYS527 短串联重复序列 遗传多态性 法医学
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荧光定量PCR产前快速诊断唐氏综合征可行性研究 被引量:12
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作者 杨昕 廖灿 +6 位作者 黄以宁 李焱 李东至 潘敏 易翠兴 吴韶清 胡舜妍 《现代妇产科进展》 CSCD 北大核心 2006年第8期599-602,共4页
目的建立快速高效的产前诊断唐氏综合征的分子生物学方法。方法分别在21号染色体上选取7个微卫星重复序列(SmallTandemRepeat,STR)(D21S1433,D21S1442,D21S1444,D21S1411,D21S1412,D21S1413,D21S1414)作为遗传标记,利用荧光定量PCR(QF-P... 目的建立快速高效的产前诊断唐氏综合征的分子生物学方法。方法分别在21号染色体上选取7个微卫星重复序列(SmallTandemRepeat,STR)(D21S1433,D21S1442,D21S1444,D21S1411,D21S1412,D21S1413,D21S1414)作为遗传标记,利用荧光定量PCR(QF-PCR)扩增技术及片段分析技术,对250例羊水标本进行检测,并与羊水标本染色体核型分析结果进行对比。结果250例羊水标本中,核型分析发现24例21三体,2例性染色体数目异常,24例唐氏综合征样本采用QF-PCR全部检出。224例正常羊水标本中,QF-PCR检出阴性标本223例,1例样本呈假阳性,假阳性率为0.4%,24例21三体标本中,七对引物同时检测诊断阳性率为100%。所有试验结果均在24h内得出。结论QF-PCR作为一种快速、准确、高效的分子生物学方法,对诊断唐氏综合征具有重要意义。 展开更多
关键词 荧光定量PCR 微卫星重复序列 唐氏综合征
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20723例亲子鉴定中19个STR基因座的突变分析 被引量:13
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作者 毕洁 畅晶晶 +1 位作者 李妙霞 余纯应 《法医学杂志》 CAS CSCD 2017年第3期263-266,共4页
目的观察并分析肯定亲权关系的案件,探索STR基因座的突变规律。方法采用Goldeneye 20A试剂盒对20723例肯定亲权关系的案件筛选等位基因突变事件,统计各基因座的突变率和突变等位基因的来源、片段大小、突变步数及重复单位的增加或减少情... 目的观察并分析肯定亲权关系的案件,探索STR基因座的突变规律。方法采用Goldeneye 20A试剂盒对20723例肯定亲权关系的案件筛选等位基因突变事件,统计各基因座的突变率和突变等位基因的来源、片段大小、突变步数及重复单位的增加或减少情况,分析突变相关因素的特点。结果 19个STR基因座共发现548例突变,观察到557个突变事件,基因座的突变率为0.07‰~2.23‰。父系突变与母系突变的比例为3.06∶1。突变以一步突变为主,增加与减少重复单位的情况相当;二步以上(含二步)突变更易出现重复单位减少。突变主要发生于中等位基因,重复单位增减比例相当,长等位基因突变中重复单位减少显著多于增加。父系突变出现重复单位增加与减少的比例相当,母系突变重复单位减少较增加多见。结论各基因座的突变率差异具有统计学意义,当出现1~2个基因座不符合遗传规律时,应当加测其他检测系统,并结合突变基因座的信息计算PI值,以进一步明确鉴定意见。 展开更多
关键词 法医遗传学 亲子关系 短串联重复序列 DNA突变分析
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中国人群中15个短串联重复序列位点的突变研究(英文) 被引量:13
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作者 蔡贵庆 陈丽娴 +2 位作者 童大跃 区敬华 伍新尧 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期507-509,共3页
目的对亲子鉴定中常用的PlowerPlex16R系统的15个短关重复序列(short tandemrepeat ,STR)位点的突变现象进行研究。方法在1921例确定亲权的案例中,对PlowerPlex16R系统的15个STR位点的突变现象进行了分析。结果在1921例确定亲权的案例中... 目的对亲子鉴定中常用的PlowerPlex16R系统的15个短关重复序列(short tandemrepeat ,STR)位点的突变现象进行研究。方法在1921例确定亲权的案例中,对PlowerPlex16R系统的15个STR位点的突变现象进行了分析。结果在1921例确定亲权的案例中有70例(3 .644 %)观察到了突变,其中1例是两个位点同时突变(D21S11 and PentaD)、1例是2个子代不同位点发生突变(D7S820 and D16S539)。在3764次减数分裂中,15个STR位点共观察到有72例突变,突变率为0 .128 %±1 .104×10-3。vWA和D21S11的突变率最高(0·292 %) ,TH01和TPOX位点没有发现突变。父源突变是母源突变的5倍。大多数(98 .611 %)突变的等位基因为一步突变,一个重复单位的增加突变与减少突变之比为1 .826∶1。只发现1例多步突变,表现为PentaD位点的等位基因的增加2个重复单位。在PlowerPlex16R系统中,D8S1179、Penta D、D13S317、D16S539、D7S820、D5S818、D3S1358、TH01和TPOX9个位点突变率低,更适用于亲权鉴定。结论STR位点的突变是一个较为常见的现象,常使亲子鉴定中亲权认定变得更加复杂,因此筛选突变率低的稳定STR位点对于亲子鉴定非常重要。 展开更多
关键词 中国 短串联重复序列 基因突变 SIR位点 亲权鉴定
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中国南方汉族群体九个短片段长度Y-STR基因座的遗传多态性及其法医学应用 被引量:13
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作者 邓志辉 李茜 +3 位作者 李大成 王大明 高素青 吴国光 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期470-474,共5页
目的研究中国南方汉族群体中,扩增产物片段长度在180bp以下的9个Y染色体的短串联重复(Y-short tandem repeal,Y-STR)基因座的遗传多态性,并用于法医学鉴定。方法采用PCR复合扩增和基因测序仪荧光检测方法,检测213个无关男性个体... 目的研究中国南方汉族群体中,扩增产物片段长度在180bp以下的9个Y染色体的短串联重复(Y-short tandem repeal,Y-STR)基因座的遗传多态性,并用于法医学鉴定。方法采用PCR复合扩增和基因测序仪荧光检测方法,检测213个无关男性个体,调查南方汉族的9个Y-SIR基因座的等位基因频率和单倍型频率,并对84对真父子和36对非父子的亲子鉴定样本进行检测。结果213个无关男性个体中,DYS426基因座检出3个等位基因,DYS393、DYS460、DYS391和DYS389 Ⅰ基因座均检出了5个等位基因,DYS456基因座检出6个等位基因,H4和DYS388基因座检出7个等位基因,DYS458基因座检出8个等位基因。除DYS426基因座的基因多样性(gene diversity,GD)值(0.1489)较低外,其余8个基因座的GD值介于0.5064~0.9133。9个Y-SIR基因座的单倍型共有178种,其中154种单倍型仅出现1次,单倍型多样性达0.9983。在84对真父子中,未观察到基因座突变。检测36对非父子,有2个Y-STR基因座排除的案例有2例(5.56%);有3个和3个以上的Y-STR基因座可以排除父子关系的案例为33例(91.67%);9个Y-SIR基因座不能排除父子关系的有1例。结论9个Y-SIR基因座具有丰富的遗传多态性,该短片段长度Y-STR基因复合荧光扩增系统可用于法医学个体识别和亲子鉴定。 展开更多
关键词 Y染色体 短串联重复序列 短片段长度 遗传多态性 亲子鉴定
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基于下一代测序的全解析度STR分型研究进展与展望 被引量:12
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作者 王乐 季安全 叶健 《中国法医学杂志》 CSCD 2017年第2期159-163,167,共6页
下一代测序技术具有高通量、高速度、集成化、低成本等显著优势,近年来已在科研和临床诊断领域得到广泛应用,在法医遗传学领域亦具有重要应用前景。当前主流的STR分型方法仅关注序列的长度多态性,然而由于核心重复结构存在差异或扩增区... 下一代测序技术具有高通量、高速度、集成化、低成本等显著优势,近年来已在科研和临床诊断领域得到广泛应用,在法医遗传学领域亦具有重要应用前景。当前主流的STR分型方法仅关注序列的长度多态性,然而由于核心重复结构存在差异或扩增区段内存在SNP,序列长度相等的等位基因可能是具有遗传稳定性的完全不同的等位基因,此类STR序列多态性是个体识别或亲缘关系分析的宝贵资源。基于下一代测序的STR分型在现有数据输出方式基础上,允许进一步关注STR的序列多态性,对STR基因座进行全解析度分型,显著提升STR基因座的个体识别能力。本文以法医STR遗传标记和下一代测序技术为关注焦点,系统综述基于下一代测序的全解析度STR分型领域国际最新研究进展,深入探讨该技术在法医DNA实验室的实际应用潜力和可能面临的挑战,希冀对相关研究和实践提供参考。 展开更多
关键词 法医遗传学 下一代测序 短串联重复序列 序列多态性
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