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丝氨酸羟甲基转移酶基因C1420T多态性与食管鳞癌、贲门腺癌易感性的关系 被引量:9
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作者 王益民 郭炜 +6 位作者 张秀凤 李琰 王娜 葛晖 魏丽珍 温登瑰 张健慧 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第3期281-286,共6页
背景与目的:丝氨酸羟甲基转移酶(serinehydroxymethyltransferase,SHMT)是叶酸代谢过程中的关键酶,它通过为嘌呤、胸苷酸、蛋氨酸等重要物质的合成提供一碳单位来影响基因的甲基化和DNA的合成过程,与肿瘤的发生、发展关系密切。本研究... 背景与目的:丝氨酸羟甲基转移酶(serinehydroxymethyltransferase,SHMT)是叶酸代谢过程中的关键酶,它通过为嘌呤、胸苷酸、蛋氨酸等重要物质的合成提供一碳单位来影响基因的甲基化和DNA的合成过程,与肿瘤的发生、发展关系密切。本研究旨在探讨河北省食管癌高发人群SHMT1C1420T单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)与食管鳞状细胞癌(esophagealsquamouscellcarcinoma,ESCC)和贲门腺癌(gastriccardiacadenocarcinoma,GCA)易感性的关系。方法:采用双相引物-聚合酶链反应(polymerasechainreaction-withconfrontingtwo-pairprimers,PCR-CTPP)方法,检测584例ESCC患者、467例GCA患者和540名健康对照者的SHMT1C1420TSNP的基因型,并用非条件Logistic回归模型分析多态性与食管鳞癌和贲门腺癌发病风险的关系。结果:上消化道肿瘤(uppergastrointestinalcancers,UGIC)家族史可显著增加高发区人群食管鳞癌和贲门癌的发病风险,经性别、年龄、吸烟校正后的OR值分别为2.89(95%CI=2.23~3.73)和1.68(95%CI=1.28~2.23)。ESCC组和GCA组C/T基因型频率(分别为12.0%和10.9%)明显低于健康对照组(16.5%)(P值分别<0.05和0.01)。与C/C基因型相比,携带C/T基因型的个体ESCC、GCA的发病风险显著降低,经性别、年龄、吸烟、家族史校正后的OR值分别为0.70(95%CI=0.50~0.98)0.55(95%CI=0.38~0.81)。分层分析显示,与C/C基因型相比,C/T基因型可以显著降低非吸烟个体ESCC和GCA的发病风险,经性别、年龄、家族史校正后的OR值分别为0.54(95%CI=0.33~0.90),0.56(95%CI=0.33~0.95)。另外,虽然C/T基因型可显著降低UGIC家族史阳性和阴性个体贲门腺癌的发病风险[校正OR值分别为0.46(95%CI=0.24~0.90)和0.62(95%CI=0.38~0.99)],该基因型仅可降低UGIC家族史阳性个体ESCC的发病风险(校正OR值为0.51,95%CI=0.29~0.89)。结论:SHMT1C/T基因型可以显著降低中国河北省高发区ESCC、GCA的发病风险。 展开更多
关键词 食管肿瘤/病因学 贲门肿瘤/病因学 丝氨酸羟甲基转移酶 多态性 肿瘤易感性
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glyA基因及其编码的丝氨酸羟甲基转移酶 被引量:7
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作者 刘万红 刘爱福 《氨基酸和生物资源》 CAS 2001年第2期13-16,21,共5页
glyA基因广泛存在于生物体中 ,其编码的丝氨酸羟甲基转移酶 (serinehydroxymethyltransferase,SHMT)催化丝氨酸和甘氨酸之间的相互转化 ,转化反应产生的 5,1 0 亚甲基四氢叶酸 (M THF)提供细胞新陈代谢—碳单位 ,此反应在细胞新陈代谢... glyA基因广泛存在于生物体中 ,其编码的丝氨酸羟甲基转移酶 (serinehydroxymethyltransferase,SHMT)催化丝氨酸和甘氨酸之间的相互转化 ,转化反应产生的 5,1 0 亚甲基四氢叶酸 (M THF)提供细胞新陈代谢—碳单位 ,此反应在细胞新陈代谢中处于重要地位。因此 ,研究 glyA基因及其编码的丝氨酸羟甲基转移酶具有重要的意义。介绍了 glyA基因的克隆、序列分析、调控组分和丝氨酸羟甲基转移酶的部分性质。 展开更多
关键词 glyA基因 丝氨酸羟甲基转移酶 调控序列
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Characterization and molecular cloning of a serine hydroxymethyltransferase 1(OsSHM_1) in rice 被引量:3
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作者 Dekai Wang Heqin Liu +3 位作者 Sujuan Li Guowei Zhai Jianfeng Shao Yuezhi Tao 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2015年第9期745-756,共12页
Serine hydroxymethyltransferase (SHMT) is important for one carbon metabolism and photorespiration in higher plants for its participation in plant growth and development, and resistance to biotic and abiotic stresses.... Serine hydroxymethyltransferase (SHMT) is important for one carbon metabolism and photorespiration in higher plants for its participation in plant growth and development, and resistance to biotic and abiotic stresses. A rice serine hydroxymethyltransferase gene, OsSHM1, an ortholog of Arabidopsis SHM1, was isolated using map-based cloning. The osshm1 mutant had chlorotic lesions and a considerably smaller, lethal phenotype under natural ambient CO<sub>2</sub> concentrations, but could be restored to wild type with normal growth under elevated CO<sub>2</sub> levels (0.5% CO<sub>2</sub>), showing a typical photorespiratory phenotype. The data from antioxidant enzymes activity measurement suggested that osshm1 was subjected to significant oxidative stress. Also, OsSHM1 was expressed in all organs tested (root, culm, leaf, and young panicle) but predominantly in leaves. OsSHM1 protein is localized to the mitochondria. Our study suggested that molecular function of the OsSHM1 gene is conserved in rice and Arabidopsis. 展开更多
关键词 GENE molecular cloning reactive oxygen species RICE serine hydroxymethyltransferase
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1株产丝氨酸羟甲基转移酶菌株的分离鉴定及其培养条件优化 被引量:3
4
作者 马立周 李江华 +4 位作者 房峻 宁健飞 蔡立明 曹钰 陆健 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期18-23,共6页
从甲醇污染土壤中分离得到1株能在含2%甲醇的培养基上生长且产丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)的菌株,ML206,酶活达到0.030 U/mL。将ML206菌株的16S rDNA序列(No.EF612770)和GenBank数据库中已报道的16S rDNA序列进行Blast比对和系统发育分析... 从甲醇污染土壤中分离得到1株能在含2%甲醇的培养基上生长且产丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)的菌株,ML206,酶活达到0.030 U/mL。将ML206菌株的16S rDNA序列(No.EF612770)和GenBank数据库中已报道的16S rDNA序列进行Blast比对和系统发育分析,结合形态学和生理生化鉴定结果,确定ML206为嗜胺甲基杆菌(M.aniovorans)。经过对产酶条件的优化确定最佳氮源、碳源及培养件为:(NH_4)_2 HPO_4 0.8%,CH_3OH 2%,pH 7.0,温度30℃;采用分批的方式添加甲醇,培养时间由72 h缩短至48 h,节省了33%的培养时间。在优化的培养条件基础上进行实验,菌体浓度比原来提高了50%,SHMT活力提高了20%。经过对该菌的各种特性的研究确定了其为1株良好的产SHMT的新型出发菌。 展开更多
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶 系统发育分析 嗜胺甲基杆菌 条件优化
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丝氨酸代谢对肾癌细胞增殖和迁移能力的影响
5
作者 张明慧 邓渟之 +2 位作者 邵珠峰 毛子俊 杨阳 《滨州医学院学报》 2023年第5期321-326,共6页
目的明确丝氨酸代谢对肾癌细胞增殖和迁移能力的影响,探索丝氨酸羟甲基转移酶1(SHMT1)在肾癌中表达水平和肾癌患者预后的关系。方法通过对肾癌细胞给予丝氨酸过量处理,利用CCK8实验检测丝氨酸对肾癌细胞增殖能力的影响,细胞周期实验检... 目的明确丝氨酸代谢对肾癌细胞增殖和迁移能力的影响,探索丝氨酸羟甲基转移酶1(SHMT1)在肾癌中表达水平和肾癌患者预后的关系。方法通过对肾癌细胞给予丝氨酸过量处理,利用CCK8实验检测丝氨酸对肾癌细胞增殖能力的影响,细胞周期实验检测对细胞周期进程的影响,划痕实验检测对迁移能力的影响。通过TCGA数据库分析SHMT1在肾癌组织中表达水平及其与肾癌患者生存率的关系,并且利用WebGestalt在线分析工具对靶基因进行GO分析和KEGG信号通路富集。结果给予肾癌细胞丝氨酸过量处理可促进肾癌细胞的增殖能力,并且增强769-P及Caki-1细胞的迁移能力。给予肾癌细胞丝氨酸过量处理后,加速了肾癌细胞向G0/G1期的转换。通过TCGA数据库分析发现SHMT1在肾癌组织低表达,且病理分期越高,表达水平越低,并且SHMT1与肾癌患者临床不良预后相关。KEGG富集分析发现SHMT1主要参与调控mTOR信号传导途径、Ras信号传导途径及钙信号传导等途径。结论丝氨酸过量处理可促进肾癌细胞的增殖能力和迁移能力,控制患者饮食中丝氨酸摄入量可能成为改善肾癌患者进展的一种新的重要策略。SHMT1在肾癌组织低表达且与肾癌患者临床不良预后相关,提示SHMT1可作为评价肾癌患者预后的一种新的生物标记物。 展开更多
关键词 肾癌 丝氨酸代谢 丝氨酸羟甲基转移酶
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拟南芥丝氨酸羟甲基转移酶(AtSHMT)的原核表达与酶活测定 被引量:2
6
作者 江晶晶 张春义 姜凌 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期14-20,共7页
从拟南芥叶片中克隆了定位于线粒体的拟南芥丝氨酸羟甲基转移酶基因(At SHM1),将其插入到p ET-26b(+)表达载体,并在大肠杆菌中成功表达。优化表达条件之后,获得可溶性At SHMT蛋白。用亲和色谱法成功分离纯化该蛋白,计算得到该酶酶学常... 从拟南芥叶片中克隆了定位于线粒体的拟南芥丝氨酸羟甲基转移酶基因(At SHM1),将其插入到p ET-26b(+)表达载体,并在大肠杆菌中成功表达。优化表达条件之后,获得可溶性At SHMT蛋白。用亲和色谱法成功分离纯化该蛋白,计算得到该酶酶学常数Km和Kmax分别为121μmol和21.8μmol/L·min。利用该酶催化DL-3-苯基丝氨酸裂解的产物苯甲醛在279 nm波长处有强烈吸收的性质,测定反应产物的吸光值,根据苯甲醛标准曲线测得At SHMT酶活,由此建立了一种测定真核生物丝氨酸羟甲基转移酶酶活的一种简便、快速、安全的方法。 展开更多
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶 亲和色谱 酶活测定
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丝氨酸羟甲基转移酶基因的功能表达及其活性鉴定 被引量:2
7
作者 刘万红 刘爱福 +1 位作者 李文鑫 王君英 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期5-8,共4页
从大肠杆菌染色体DNA中成功克隆到丝氨酸羟甲基转移酶基因 ,并将其插入表达载体 pET15b中 ,在大肠杆菌中得到了高表达。
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶 基因克隆 原核表达 活性鉴定 L-丝氨酸
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敲除ptsG基因及共表达透明颤菌血红蛋白提高大肠杆菌SHMT产量 被引量:1
8
作者 韩琴 徐新星 +4 位作者 王儒昕 李鑫 闫达中 吴菁 刘军 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第2期119-125,共7页
利用Red同源重组技术敲除大肠杆菌BL21(DE3)的ptsG基因,得到ptsG基因缺失菌株BL21(DE3)ΔptsG。构建重组质粒,得到表达大肠杆菌丝氨酸羟甲基转移酶(serine hydroxymethyltransferase,SHMT)工程菌株BL21(DE3)/pET-glyA、BL21(DE3)ΔptsG/... 利用Red同源重组技术敲除大肠杆菌BL21(DE3)的ptsG基因,得到ptsG基因缺失菌株BL21(DE3)ΔptsG。构建重组质粒,得到表达大肠杆菌丝氨酸羟甲基转移酶(serine hydroxymethyltransferase,SHMT)工程菌株BL21(DE3)/pET-glyA、BL21(DE3)ΔptsG/pET-glyA,及共表达SHMT和透明颤菌血红蛋白(Vitreoscilla hemoglobin,VHb)工程菌株BL21(DE3)ΔptsG/pET-SV。在LB培养基中,BL21(DE3)ΔptsG/pET-glyA菌株与BL21(DE3)/pET-glyA菌株生长情况没有明显差异,BL21(DE3)ΔptsG/pET-SV菌株稳定期的OD 600 nm值比BL21(DE3)ΔptsG/pET-glyA菌株提高了21.3%,在LBG培养基中,稳定期BL21(DE3)ΔptsG/pET-glyA菌株OD600 nm值比BL21(DE3)/pET-glyA菌株提高了19.4%,BL21(DE3)ΔptsG/pET-SV菌株OD600 nm值比BL21(DE3)ΔptsG/pET-glyA菌株提高了21.5%。在LBG培养基中,经过异丙基-β-D-硫代半乳糖苷诱导,与对照菌株BL21(DE3)/pET-28a相比较,两种单表达工程菌株产SHMT活力分别是其6.4倍和7.7倍,共表达工程菌株产SHMT活力是其9.6倍。实验结果表明,敲除ptsG基因能够增加大肠杆菌在含葡萄糖培养基中的生长量及SHMT表达量,共表达VHb能进一步提高菌株生长量和SHMT产量。 展开更多
关键词 RED同源重组 丝氨酸羟甲基转移酶 透明颤菌血红蛋白 ptsG基因 共表达
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一株高产丝氨酸羟甲基转移酶基因工程菌的构建及发酵产酶条件优化 被引量:1
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作者 喻放 左振宇 +1 位作者 杨忠华 周卫 《武汉科技大学学报》 CAS 2013年第3期219-224,共6页
以E.coli AB90054基因组中DNA为模板,采用PCR方法扩增得到glyA基因,将该基因克隆到表达载体pET28a(+)中,转化表达菌株BL21(DE3)后筛选阳性重组子,并对筛选所得高表达基因工程菌G16进行培养条件和表达条件的优化。结果表明,当培养条件为3... 以E.coli AB90054基因组中DNA为模板,采用PCR方法扩增得到glyA基因,将该基因克隆到表达载体pET28a(+)中,转化表达菌株BL21(DE3)后筛选阳性重组子,并对筛选所得高表达基因工程菌G16进行培养条件和表达条件的优化。结果表明,当培养条件为38℃、pH为7.0、转速为150r/min时,基因工程菌的生长速度和菌液浓度最佳;当表达条件的诱导温度为30℃、诱导剂浓度为0.5mmol/L、诱导时间为5h时,基因工程菌诱导目的蛋白表达效果最好。通过SDS-PAGE分析和酶活测定后发现,在优化条件下基因工程菌G16发酵产丝氨酸羟甲基转移酶能力占菌体总蛋白的60%左右,且蛋白活性正常。 展开更多
关键词 glyA基因 丝氨酸羟甲基转移酶 基因工程 发酵产酶
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植物丝氨酸羟甲基转移酶基因研究进展 被引量:11
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作者 马莉 陈丽梅 《生物技术通报》 CAS CSCD 2008年第2期15-19,共5页
丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)是一个含有磷酸吡哆醛(PLP)的四聚体的蛋白质,在亚甲基四氢叶酸(CH2-THF)存在时催化丝氨酸和四氢叶酸生成甘氨酸和N5,N10-亚甲基四氢叶酸的可逆反应。SHMT在高等植物的一碳代谢和光呼吸中起着非常重要的作用,... 丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)是一个含有磷酸吡哆醛(PLP)的四聚体的蛋白质,在亚甲基四氢叶酸(CH2-THF)存在时催化丝氨酸和四氢叶酸生成甘氨酸和N5,N10-亚甲基四氢叶酸的可逆反应。SHMT在高等植物的一碳代谢和光呼吸中起着非常重要的作用,最近随着植物SHMT纯化技术的进步和重要模式植物基因组测序的完工,使很多植物SHMT基因被克隆出来,并对它们的结构和功能及表达调控进行研究。 展开更多
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶 基因克隆 光呼吸 基因表达调控
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SHMT1多态性与ALL儿童HD-MTX不良反应的关系 被引量:6
11
作者 丁慧 岳丽杰 +4 位作者 于洁 谢偲 杨春兰 任艳飞 刘畅 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期162-165,共4页
研究丝氨酸羟甲基转移酶1(serine hydroxymethyltransferase 1,SHMT 1)基因多态性与急性淋巴细胞白血病(acute lymphocytic leukemia,ALL)儿童大剂量甲氨蝶呤(high-dosemethotrexate,HD-MTX )不良反应的相关性。方法:本研究... 研究丝氨酸羟甲基转移酶1(serine hydroxymethyltransferase 1,SHMT 1)基因多态性与急性淋巴细胞白血病(acute lymphocytic leukemia,ALL)儿童大剂量甲氨蝶呤(high-dosemethotrexate,HD-MTX )不良反应的相关性。方法:本研究以51例接受HD-MTX 化疗的ALL 患儿为研究对象,统计分析其应用HD-MTX 后产生的临床表现;提取mRNA 后逆转录为cDNA ,利用变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis ,DGGE)结合DNA测序检测SHMT 1 多态性(rs 1979277、rs 3783、rs 1979276、rs 12952556),并分析其与HD-MTX 不良反应的关系。结果:接受HD-MTX 化疗的ALL 患儿产生的严重不良反应主要表现为中性粒细胞减少和肝功能损害。rs 3783(C〉G )、rs 1979276(C〉T)、rs 12952556(A〉G )及rs 1979277(C〉T)的基因型分布情况相同,rs 1979277 多态性与中性粒细胞减少的发生风险无关(P〉0.05),但其CT及TT基因型可以降低肝功能损害的发生风险(CT:OR= 0.129,95%CI:0.020~0.817,P=0.03;TT:OR= 0.103,95%CI:0.017~0.620,P=0.013)。 结论:rs 1979277、rs 3783、rs 1979276 及rs 12952556的联合作用与中性粒细胞减少的发生无关,但它们之中一个或多个位点可能降低肝功能损害的发生。 展开更多
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶1 多态性 急性淋巴细胞白血病 甲氨蝶呤 不良反应
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SHMT2结合并上调SQSTM1促进结肠癌细胞增殖 被引量:2
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作者 陈前智 沈娜 李雪芹 《医药导报》 CAS 北大核心 2023年第6期814-818,共5页
目的探索SHMT2调控结肠癌细胞增殖的分子机制。方法通过免疫组化染色及生物信息分析来验证SHMT2在结肠癌组织中的表达和作用,通过细胞克隆形成实验检测SHMT2对结肠癌细胞增殖能力的影响,利用免疫共沉淀法、质粒转染、蛋白印迹实验等验证... 目的探索SHMT2调控结肠癌细胞增殖的分子机制。方法通过免疫组化染色及生物信息分析来验证SHMT2在结肠癌组织中的表达和作用,通过细胞克隆形成实验检测SHMT2对结肠癌细胞增殖能力的影响,利用免疫共沉淀法、质粒转染、蛋白印迹实验等验证SHMT2在结肠癌中的作用机制。结果免疫组化染色揭示SHMT2蛋白在结肠癌肿瘤组织中显著高表达,通过生信分析发现SHMT2 mRNA水平与结肠癌的不良预后相关,在细胞实验中发现SHMT2低表达或者SHMT2抑制剂可显著抑制结肠癌细胞增殖,其作用机制可能是SHMT2通过与SQSTM1结合并上调其蛋白水平来促进结肠癌细胞增殖。结论该研究发现SHMT2-SQSTM1信号轴对结肠癌细胞增殖的关键调控作用,为结肠癌相关分子机制研究提供了新的线索和方向。 展开更多
关键词 结肠癌 丝氨酸羟甲基转移酶2(SHMT2) SHMT2抑制剂 SQSTM1 增殖
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燕麦生物碱A通过调控丝氨酸羟甲基转移酶2重塑丝氨酸代谢抑制结肠癌生长 被引量:2
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作者 付荣 王珏 +1 位作者 王海龙 杨鹏 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期715-723,共9页
流行病学研究表明,燕麦类全谷食品可有效降低结肠癌的发病风险。丝氨酸/甘氨酸代谢途径对于维持肿瘤生长十分重要,能为肿瘤细胞核苷酸等生物大分子的合成提供底物,并保障肿瘤细胞免受氧化损伤。我们的前期研究表明,燕麦生物碱A(avenanth... 流行病学研究表明,燕麦类全谷食品可有效降低结肠癌的发病风险。丝氨酸/甘氨酸代谢途径对于维持肿瘤生长十分重要,能为肿瘤细胞核苷酸等生物大分子的合成提供底物,并保障肿瘤细胞免受氧化损伤。我们的前期研究表明,燕麦生物碱A(avenanthramide A,AVN A)具有抑制小鼠原位结肠癌生长的作用。本研究通过对氧化偶氮甲烷/葡聚糖硫酸钠(azoxymethane/dextran sulphate sulfate,AOM/DSS)小鼠结肠癌模型进行血液代谢组学研究,发现AVN A处理后,丝氨酸/甘氨酸代谢途径的变化最为显著(P<0.01)。丝氨酸、甘氨酸饥饿条件下,AVN A对结肠癌的杀伤效果显著增强(P<0.05),表明AVN A靶向丝氨酸代谢从而发挥抗结肠癌作用。随后,对丝氨酸代谢关键酶SHMT1、SHMT2、PHGDH、PSAT1及PSPH的mRNA及蛋白质表达水平进行检测,发现AVN A明显抑制SHMT2的表达(P<0.01或P<0.001)。过表达SHMT2后,由AVN A介导的对结肠癌细胞的生长、增殖、GSH/GSSG以及NADPH/NADP+的抑制作用均被逆转。综上所述,AVN A通过下调SHMT2的表达,阻遏丝氨酸/甘氨酸代谢途径,从而发挥抑制结肠癌进展的作用。本研究为燕麦生物碱的深度利用及结肠癌的营养干预提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 燕麦生物碱A 丝氨酸羟甲基转移酶2 丝氨酸代谢 结肠癌
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SIRT5通过去琥珀酰化SHMT2促进肿瘤细胞增殖 被引量:3
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作者 沈潮 李超群 +2 位作者 魏珍 陈昕媛 余巍 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期32-39,共8页
一碳代谢通路中多种代谢酶与肿瘤的发生、发展都有密切关系,它们都可以作为肿瘤治疗的潜在靶点.丝氨酸羟甲基转移酶2(SHMT2)作为其中的关键代谢酶之一,对于肿瘤细胞的生长增殖具有非常重要的意义.然而SHMT2参与调解肿瘤细胞代谢的具体... 一碳代谢通路中多种代谢酶与肿瘤的发生、发展都有密切关系,它们都可以作为肿瘤治疗的潜在靶点.丝氨酸羟甲基转移酶2(SHMT2)作为其中的关键代谢酶之一,对于肿瘤细胞的生长增殖具有非常重要的意义.然而SHMT2参与调解肿瘤细胞代谢的具体作用机制目前尚不明确.本研究发现SIRT5能去琥珀酰化SHMT2,提升其酶活,并鉴定到第181位赖氨酸是SHMT2的主要琥珀酰化位点.同时,本文还发现高浓度的甲氨蝶呤(MTX)能通过抑制SIRT5的表达,提升SHMT2琥珀酰化水平,达到抑制肿瘤细胞增殖的目的,这也为通过抑制SIRT5阻断肿瘤生长提供了新的理论支撑. 展开更多
关键词 一碳代谢 丝氨酸羟甲基转移酶2 SIRT5 甲氨蝶呤 琥珀酰化
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GlyA基因的克隆及检验 被引量:2
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作者 蔡宇 吴梧桐 史燕东 《药物生物技术》 CAS CSCD 1995年第1期1-4,共4页
用PCR法从大肠杆菌中调出长1.9kb的DNA片断,插入质粒pT77,核酸电泳和DNA测序分析结果证明该片段是GlyA目的基因。
关键词 GLYA 丝氨酸羟甲基转移酶 SHMT PCR
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大肠杆菌丝氨酸羟甲基转移酶基因(glyA)的克隆和表达 被引量:1
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作者 沈天翔 那淑敏 +2 位作者 喻国策 谢家仪 贾盘兴 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 1997年第6期423-428,共6页
利用插入失活及营养缺陷型互补法将大肠杆菌K12 13kb的glyA基因克隆到质粒pBR329中。将重组质粒酶切,亚克隆,确定2.6kb PstI-EcoRI亚克隆片段带有完整的glyA基因。共获得12株glyA基因重组菌,对重组质粒进行了酶切鉴定。不同重组菌丝氨... 利用插入失活及营养缺陷型互补法将大肠杆菌K12 13kb的glyA基因克隆到质粒pBR329中。将重组质粒酶切,亚克隆,确定2.6kb PstI-EcoRI亚克隆片段带有完整的glyA基因。共获得12株glyA基因重组菌,对重组质粒进行了酶切鉴定。不同重组菌丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)活性及其酶表达量均不相同。受体菌未检测到丝氨酸的产生。重组菌株JM109(pSM13)、K12(pSM13)、K12(pSM14)和K12(pSM15)SHMT酶表达量分别占全菌可溶性蛋白的15.7%、15.4%、11.8%和9.48%。 展开更多
关键词 大肠杆菌 丝氨酸 羟甲基转移酶 glyA基因 克隆
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丝氨酸羟甲基转移酶2在胃癌组织中的表达及其对预后的影响 被引量:1
17
作者 单义明 刘东东 叶延伟 《肿瘤基础与临床》 2023年第3期200-205,共6页
目的探讨丝氨酸羟甲基转移酶2(SHMT2)在胃癌组织中的表达及其与临床病理特征和预后之间的关系,为胃癌诊断和预后预测提供新的生物标志物。方法使用免疫组化法检测SHMT2在胃癌、癌旁正常组织中的表达,并通过GEPIA数据库进行验证。利用胃... 目的探讨丝氨酸羟甲基转移酶2(SHMT2)在胃癌组织中的表达及其与临床病理特征和预后之间的关系,为胃癌诊断和预后预测提供新的生物标志物。方法使用免疫组化法检测SHMT2在胃癌、癌旁正常组织中的表达,并通过GEPIA数据库进行验证。利用胃癌组织芯片评估SHMT2与临床病理特征之间的关系。Kaplan-Meier生存分析和生信数据库比较和验证SHMT2高表达组和低表达组患者的生存差异,Cox回归分析不同因素对患者预后的影响。结果SHMT2在胃癌组织和癌旁正常组织中高表达率分别为65.96%和48.84%,差异有统计学意义(χ^(2)=5.396,P=0.020)。SHMT2表达水平与淋巴结转移(χ^(2)=12.214,P<0.001)、血管神经侵犯(χ^(2)=3.884,P=0.049)、临床分期(χ^(2)=13.455,P<0.001)有关。SHMT2高表达和低表达组生存曲线差异有统计学意义(χ^(2)=8.248,P=0.004),SHMT2高表达组总生存期较低表达组短。Cox回归分析显示淋巴结转移和血管神经侵犯是患者预后的独立危险因素(HR=3.704,P=0.002;HR=1.865,P=0.021)。结论SHMT2在胃癌组织中高表达,且与患者较差的总生存期相关,对判断患者预后具有一定意义。 展开更多
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶2 胃癌 预后
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斑马鱼丝氨酸羟甲基转移酶1基因的生物信息学和表达分析 被引量:1
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作者 陈炳宇 何兴 +2 位作者 夏佳敏 邹蓉 黄四洲 《成都医学院学报》 CAS 2021年第6期681-687,共7页
目的探索斑马鱼丝氨酸羟甲基转移酶1(shmt1)基因的生物学结构和基因表达模式。方法利用生物信息学方法对斑马鱼shmt1的基因结构、物种间同源性、物种间进化、蛋白质二级结构和三级结构等进行分析和预测,并用整胚原位杂交技术探究斑马鱼s... 目的探索斑马鱼丝氨酸羟甲基转移酶1(shmt1)基因的生物学结构和基因表达模式。方法利用生物信息学方法对斑马鱼shmt1的基因结构、物种间同源性、物种间进化、蛋白质二级结构和三级结构等进行分析和预测,并用整胚原位杂交技术探究斑马鱼shmt1在重要器官及胚胎早期发育中的表达。结果斑马鱼shmt1位于3号染色体(ZDB-GENE-040426-1558)上,全长15 142 bp,能编码481个氨基酸,属于天冬氨酸转氨酶(AAT)超家族,其二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,且斑马鱼shmt1蛋白与其他哺乳动物同源物在进化上高度保守。反转录定量PCR(RT-PCR)结果显示,斑马鱼shmt1不仅在胚胎发育的各个时期表达,而且也在成年鱼的肾脏、心脏和性腺中高表达。原位杂交结果显示,shmt1除了在卵黄多核层、鼻翼板中脑区、视顶盖和视泡等处集中表达,还在肝脏特异性表达。结论 shmt1作为一碳代谢叶酸循环中的重要蛋白,在斑马鱼发育早期的胚胎卵黄多核层、鼻翼板中脑区、视顶盖和视泡、肝脏特异性表达。该研究为今后以斑马鱼为模型动物探究shmt1基因在器官发育中的功能研究奠定基础。 展开更多
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶1 斑马鱼 肝脏 代谢
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丝氨酸代谢在脐带血红系细胞增殖过程中的作用研究
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作者 李基晟 陈琳 +8 位作者 张博文 习佳飞 姜佳楠 范增 吕洋 何丽娟 乔海晅 裴雪涛 李艳华 《军事医学》 CAS 2021年第9期660-666,共7页
目的通过探索氨基酸代谢对红系细胞体外扩增的影响,为提高脐带血红系细胞体外扩增的效率以制备大量的红系细胞奠定基础。方法高效液相色谱法(HPLC)测定脐血单个核细胞(MNC)中造血细胞向红系细胞分化及增殖过程中培养基内氨基酸的消耗情... 目的通过探索氨基酸代谢对红系细胞体外扩增的影响,为提高脐带血红系细胞体外扩增的效率以制备大量的红系细胞奠定基础。方法高效液相色谱法(HPLC)测定脐血单个核细胞(MNC)中造血细胞向红系细胞分化及增殖过程中培养基内氨基酸的消耗情况,筛选出消耗多的氨基酸;进一步选择人脐带血来源的红系祖细胞系(HUDEP-2)作为研究对象,对其培养体系进行特定氨基酸的缺乏与补加,通过细胞计数、EdU掺入实验结合流式细胞术等方法分析特定氨基酸在红系细胞扩增过程中的作用;向红系培养体系中添加特定氨基酸代谢的抑制剂,进一步评价该氨基酸代谢在红系细胞扩增过程中的作用。结果HPLC法检测发现,红系细胞定向分化及增殖过程中丝氨酸的消耗最为显著。在缺乏丝氨酸的培养体系中,红系祖细胞系HUDEP-2的增殖与存活受到明显抑制,但丝氨酸的缺乏并不影响HUDEP-2细胞表面红系细胞特征蛋白的表达。向红系培养基中添加丝氨酸分解代谢的关键酶抑制剂——丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)抑制剂SHIN1后,发现SHIN1明显抑制HUDEP-2的增殖与存活。结论丝氨酸是维持红系细胞增殖能力的关键氨基酸,其分解代谢产生的一碳单位可能是红系细胞增殖所必需的,该结果为体外进一步提高脐带血红系细胞的扩增效率提供了实验依据。 展开更多
关键词 HUDEP-2 氨基酸 丝氨酸 红系分化 丝氨酸羟甲基转移酶抑制剂
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SHMT1基因启动子甲基化与缺血性卒中相关 被引量:1
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作者 胡景岑 李链 +4 位作者 王淑瑜 许磊 杨德伦 韩丽媛 许国栋 《基础医学与临床》 CSCD 2020年第4期451-455,共5页
目的探究丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT1)基因甲基化与缺血性卒中的关系。方法采用甲基化特异性实时定量PCR测定290名健康对照组和141例缺血性卒中病例组(卒中组)的SHMT1甲基化水平。结果卒中组SHMT1甲基化水平为24.87%(16.97~35.46)高于对... 目的探究丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT1)基因甲基化与缺血性卒中的关系。方法采用甲基化特异性实时定量PCR测定290名健康对照组和141例缺血性卒中病例组(卒中组)的SHMT1甲基化水平。结果卒中组SHMT1甲基化水平为24.87%(16.97~35.46)高于对照组的6.58%(2.43~15.14)(P<0.05)。在调整相关危险因素后,SHMT1甲基化是卒中的危险因素(OR=1.051,95%CI=1.034~1.068)。受试者工作特征曲线下面积为0.804,95%CI=0.760~0.849(P<0.01)。在对照组发现尿酸与SHMT1甲基化相关(rs=0.17,P<0.01),在卒中组发现三酰甘油与SHMT1甲基化相关(rs=0.18,P<0.05)。SHMT1甲基化表达与mRNA的表达呈负相关(r=-0.472,P<0.01)。结论缺血性卒中患者中SHMT1基因启动子呈高甲基化状态,SHMT1低表达,且SHMT1高甲基化是卒中的危险因素。 展开更多
关键词 缺血性卒中 丝氨酸羟甲基转移酶1 DNA启动子 甲基化
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