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定位于鸡选择性清扫区域的SH3RF2基因生物信息学分析
被引量：
4
1
作者
耿立英
王秀秀
+4 位作者
王秋悦
潘素敏
朱文进
张传生
尹春光
《河北科技师范学院学报》
CAS
2012年第4期36-40,共5页
为了解鸡SH3RF2基因的结构与功能,由NCBI数据库获得鸡SH3RF2基因的mRNA和氨基酸序列数据信息,利用NCBI/Blast软件进行序列分析、同源性比对确定鸡SH3RF2基因的3'UTR区序列。在此基础上,利用公共数据库和相关软件对SH3RF2基因的CDS(c...
为了解鸡SH3RF2基因的结构与功能,由NCBI数据库获得鸡SH3RF2基因的mRNA和氨基酸序列数据信息,利用NCBI/Blast软件进行序列分析、同源性比对确定鸡SH3RF2基因的3'UTR区序列。在此基础上,利用公共数据库和相关软件对SH3RF2基因的CDS(coding sequence)区和其3'UTR(untranslated region)区进行了MicroRNA靶标的预测分析,进一步利用生物信息学相关数据库对其蛋白理化性质和一级结构进行分析,模拟了其二级结构和空间结构并构建了SH3RF2蛋白的系统进化树。
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关键词
鸡
sh
3
rf
2基因
生物信息学
下载PDF
职称材料
鸡SH3RF2插入/缺失等位基因在中国地方鸡种中频率分布研究
被引量：
1
2
作者
赵妤娟
张代喜
+2 位作者
陈余
贾亚雄
曲鲁江
《中国家禽》
北大核心
2012年第6期33-36,共4页
中国地方鸡种资源丰富,风味较优,但存在生长速度慢、饲料效率低等缺点,因此为了加速我国地方鸡种和肉鸡品种的遗传改良,分子标记技术得到了广泛应用。已知SH3RF2基因的插入/缺失突变与肉鸡生长和体重密切相关,因此本试验对分布在我国各...
中国地方鸡种资源丰富,风味较优,但存在生长速度慢、饲料效率低等缺点,因此为了加速我国地方鸡种和肉鸡品种的遗传改良,分子标记技术得到了广泛应用。已知SH3RF2基因的插入/缺失突变与肉鸡生长和体重密切相关,因此本试验对分布在我国各地的15个地方鸡品种进行了SH3RF2基因的等位基因频率检测,以确定SH3RF2基因在我国地方鸡种中的等位基因分布情况,继而将SH3RF2基因用于鸡生长性状的选择的分子育种标记。研究结果发现所检测地方鸡种和肉鸡品种均是非缺失的纯合子,没有发现缺失的等位基因。要利用SH3RF2基因对中国地方鸡种进行选择,可能需要通过杂交等手段将缺失型等位基因导入我国地方鸡种的群体之中。
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关键词
地方鸡种
分子标记
sh
3
rf
2基因
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职称材料
题名
定位于鸡选择性清扫区域的SH3RF2基因生物信息学分析
被引量：
4
1
作者
耿立英
王秀秀
王秋悦
潘素敏
朱文进
张传生
尹春光
机构
河北科技师范学院
济宁学院
出处
《河北科技师范学院学报》
CAS
2012年第4期36-40,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(项目编号:31001003)
文摘
为了解鸡SH3RF2基因的结构与功能,由NCBI数据库获得鸡SH3RF2基因的mRNA和氨基酸序列数据信息,利用NCBI/Blast软件进行序列分析、同源性比对确定鸡SH3RF2基因的3'UTR区序列。在此基础上,利用公共数据库和相关软件对SH3RF2基因的CDS(coding sequence)区和其3'UTR(untranslated region)区进行了MicroRNA靶标的预测分析,进一步利用生物信息学相关数据库对其蛋白理化性质和一级结构进行分析,模拟了其二级结构和空间结构并构建了SH3RF2蛋白的系统进化树。
关键词
鸡
sh
3
rf
2基因
生物信息学
Keywords
chicken
sh
3
rf
2
bioinformatics
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
鸡SH3RF2插入/缺失等位基因在中国地方鸡种中频率分布研究
被引量：
1
2
作者
赵妤娟
张代喜
陈余
贾亚雄
曲鲁江
机构
中国农业大学动物科技学院
北京市畜牧兽医总站
出处
《中国家禽》
北大核心
2012年第6期33-36,共4页
基金
"十二五"国家科技支撑计划课题(2011BAD28B03)
现代农业产业技术体系北京市创新团队
+1 种基金
长江学者和创新团队发展计划(IRT0945)
863课题(2011AA10030)
文摘
中国地方鸡种资源丰富,风味较优,但存在生长速度慢、饲料效率低等缺点,因此为了加速我国地方鸡种和肉鸡品种的遗传改良,分子标记技术得到了广泛应用。已知SH3RF2基因的插入/缺失突变与肉鸡生长和体重密切相关,因此本试验对分布在我国各地的15个地方鸡品种进行了SH3RF2基因的等位基因频率检测,以确定SH3RF2基因在我国地方鸡种中的等位基因分布情况,继而将SH3RF2基因用于鸡生长性状的选择的分子育种标记。研究结果发现所检测地方鸡种和肉鸡品种均是非缺失的纯合子,没有发现缺失的等位基因。要利用SH3RF2基因对中国地方鸡种进行选择,可能需要通过杂交等手段将缺失型等位基因导入我国地方鸡种的群体之中。
关键词
地方鸡种
分子标记
sh
3
rf
2基因
Keywords
Chinese indigenous chicken breeds
molecular markers
sh
3
rf
2 gene
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
定位于鸡选择性清扫区域的SH3RF2基因生物信息学分析
耿立英
王秀秀
王秋悦
潘素敏
朱文进
张传生
尹春光
《河北科技师范学院学报》
CAS
2012
4
下载PDF
职称材料
2
鸡SH3RF2插入/缺失等位基因在中国地方鸡种中频率分布研究
赵妤娟
张代喜
陈余
贾亚雄
曲鲁江
《中国家禽》
北大核心
2012
1
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