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采用RAPD和ISSR标记探讨中国疣粒野生稻的遗传多样性 被引量:280
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作者 钱韦 葛颂 洪德元 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2000年第7期741-750,共10页
用随机扩增多态DNA (RAPD)和inter_简单重复序列 (ISSR)标记对分别来自中国海南和云南 2 0个居群的疣粒野生稻 (Oryzagranulata (NeesetArn .exWatt.) )混合样品 ,以及海南 (M5 )和云南 (M2 7) 2个居群各 2 0个植株的遗传多样性进行了... 用随机扩增多态DNA (RAPD)和inter_简单重复序列 (ISSR)标记对分别来自中国海南和云南 2 0个居群的疣粒野生稻 (Oryzagranulata (NeesetArn .exWatt.) )混合样品 ,以及海南 (M5 )和云南 (M2 7) 2个居群各 2 0个植株的遗传多样性进行了检测。在混合取样的居群中 ,2 0个RAPD引物和 12个ISSR引物分别扩增出 2 0 9和 12 2条带 ,多态条带比率 (PPB)分别为 6 4.11%和 72 .95 %。对于分单株取样的居群 ,在M5中 ,两种标记分别扩增出 146和 95条带 ,PPB值分别为 2 1.48%和 34 .78%。在居群M2 7中 ,则分别扩增出 15 1(PPB =17.2 2 % )和 94(PPB =19.15 % )条带。结果表明 ,中国的疣粒野生稻在物种水平的遗传多样性较低 ,其遗传变异主要存在于海南和云南两地之间 ,而在居群内的遗传多样性水平很低。基于Jaccard遗传相似性系数的UPGMA聚类和基于多态条带表型的主成分分析 (PCA)都将中国的疣粒野生稻分为来自海南和云南两类 ,两地间该物种的平均遗传相似性分别为 0 .5 96(RAPD)和 0 .5 11(ISSR) ,其间产生了相当程度的遗传分化。对比RAPD和ISSR在PCR反应中的稳定性和检测变异的能力表明 ,对于实验条件的稳定性而言ISSR优于RAPD ,且总的来说ISSR能检测到比RAPD更多的遗传变异。Mantel检测表明 ,在物种水平 。 展开更多
关键词 疣粒野生稻 rapd ISSR 遗传多样性 保护生物学
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遗传多样性概述 被引量:115
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作者 沈浩 刘登义 《生物学杂志》 CAS CSCD 2001年第3期5-7,4,共4页
遗传多样性作为生物多样性的重要组成部分 ,是物种多样性、生态系统多样性和景观多样性的基础。随着研究方法和实验技术的发展 ,遗传多样性研究从形态学水平、细胞学 (染色体 )水平、生理生化水平逐渐发展到分子水平。形态标记、细胞学... 遗传多样性作为生物多样性的重要组成部分 ,是物种多样性、生态系统多样性和景观多样性的基础。随着研究方法和实验技术的发展 ,遗传多样性研究从形态学水平、细胞学 (染色体 )水平、生理生化水平逐渐发展到分子水平。形态标记、细胞学标记、等位酶分析、DNA多态性分析等方法 ,为我们研究遗传多样性提供了有效的工具。特别是DNA多态性分析是一种更为直接而有效的方法。 展开更多
关键词 遗传多样性 遗传变异 等位酶分析 PCR rapd
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几种濒危植物及其近缘类群总DNA的提取与鉴定 被引量:192
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作者 邹喻苹 汪小全 +2 位作者 雷一丁 裴颜龙 张志宪 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1994年第7期528-533,共6页
用低pH 介质,高盐沉淀蛋白质方法成功地从银杉(Cathaya argyrophylla Chun etKuang)、矮牡丹(Paeonia suffruticosa var. spontanea)、南川升麻(Cim ici... 用低pH 介质,高盐沉淀蛋白质方法成功地从银杉(Cathaya argyrophylla Chun etKuang)、矮牡丹(Paeonia suffruticosa var. spontanea)、南川升麻(Cim icifuga nanchuanensisHsiao)、裂叶沙参(Adenophora lobophylla)的同属种泡沙参(A. potaninii)等植物中提取和部分纯化了细胞总DNA,并对其产率、质量和纯度作了鉴定。此方法的关键是用了一个低pH提取介质,它能有效防止组织破碎及沉淀大量材料时的电离化作用及酚化合物的进一步氧化。所得DNA 不需经氯化铯梯度离心或柱层析,直接可用于限制性片断长度多态性(RFLP)及随机扩增的DNA多态性(RAPD)等分子水平的遗传标记。为检测濒危植物的遗传多样性提供了一套迅速。 展开更多
关键词 总DNA 提取 DNA 濒危植物
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银杉遗传多样性的RAPD分析 被引量:129
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作者 汪小全 邹喻苹 +2 位作者 张大明 洪德元 刘正宇 《中国科学(C辑)》 CSCD 1996年第5期436-441,共6页
用随机扩增多态 DNA(RAPD)标记方法对银杉(Chthaya argyrophylla)75个个体(采自湖南和四川)进行了遗传多样性检测. 21个 10 mer -的寡核苷酸引物共检测106个位点,其中多态位点34个,占32%.相对于其它裸子植物,银杉的遗传变异水平偏低.... 用随机扩增多态 DNA(RAPD)标记方法对银杉(Chthaya argyrophylla)75个个体(采自湖南和四川)进行了遗传多样性检测. 21个 10 mer -的寡核苷酸引物共检测106个位点,其中多态位点34个,占32%.相对于其它裸子植物,银杉的遗传变异水平偏低.湖南居群和四川居群的多态位点百分率分别为 18%和 25%,两居群间的遗传变异量占总变异量的 7. 99%,这一数值高于裸子植物居群间遗传差异的平均值(6.8%).同时,发现遗传变异水平的高低与生境的复杂程度有一定的相关性.由于点突变和随机遗传漂变,银杉的部分亚居群间有较强烈的分化,亚居群间的遗传差异最高可达 16. 23%.此外,提出了度量遗传多样性水平的分化指数概念及其计算方法,并指出低水平的遗传多样性可能是银杉濒危的原因之一. 展开更多
关键词 银杉 随机扩增多态 DNA 遗传多样性 rapd
原文传递
设施黄瓜连作和轮作中土壤微生物群落多样性的变化及其与产量品质的关系 被引量:189
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作者 吴凤芝 王学征 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期2274-2280,共7页
【目的】研究设施黄瓜连作和轮作中,土壤微生物多样性的变化及其对产量品质的影响。【方法】利用RAPD技术研究了设施黄瓜连作和轮作对土壤微生物群落DNA序列多样性及产量品质的影响。【结果】连作黄瓜2年和7年的土壤微生物群落多样性指... 【目的】研究设施黄瓜连作和轮作中,土壤微生物多样性的变化及其对产量品质的影响。【方法】利用RAPD技术研究了设施黄瓜连作和轮作对土壤微生物群落DNA序列多样性及产量品质的影响。【结果】连作黄瓜2年和7年的土壤微生物群落多样性指数、丰富度及其均匀度指数均随着黄瓜种植年限的增加而降低,黄瓜产量显著下降。而对于15、18和21年3种轮作种植的土壤,尽管其种植年限较长,但其微生物群落DNA序列多样性及均匀度均高于7年黄瓜连作的土壤,而且黄瓜VC含量均高于连作土壤。【结论】设施栽培条件下,轮作有利于土壤微生物群落的多样性和稳定性的提高,有利于土壤生态环境的改善和黄瓜产量品质的形成。 展开更多
关键词 rapd 多样性指数 均匀度指数 产量 品质
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随机扩增多态DNA影响因素的研究 被引量:101
6
作者 陈永久 张亚平 《Zoological Research》 CAS CSCD 1997年第2期221-227,共7页
随机扩增多态DNA(RAPD)分析受诸多因素的影响,我们发现不同厂家制造的PCR扩增仪,不同厂家出品的TaqDNA聚合酶和PCR缓冲液,RAPD反应体系中的引物浓度,Mg2+浓度,dNTP浓度,BSA(牛血清白蛋白)... 随机扩增多态DNA(RAPD)分析受诸多因素的影响,我们发现不同厂家制造的PCR扩增仪,不同厂家出品的TaqDNA聚合酶和PCR缓冲液,RAPD反应体系中的引物浓度,Mg2+浓度,dNTP浓度,BSA(牛血清白蛋白)和明胶,以及模板DNA的量等均可能对RAPD结果有不同程度的影响。为了使RAPD结果在不同实验室间具有重复性和可比性,提高RAPD数据的科学价值,我们建议在RAPD分析过程和文章写作中应规范化。方法部分,除一般写明的引物浓度、TaqDNA聚合酶单位数、dNTP浓度、每一次PCR反应的循环条件和循环数等外,还应注明PCR仪的制造厂家及型号、TaqDNA聚合酶生产厂家、PCR缓冲液的成分、Mg2+浓度。 展开更多
关键词 DNA 检测 rapd 影响因素
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提取植物和微生物DNA的SDS-CTAB改进法 被引量:113
7
作者 刘小勇 田素忠 +1 位作者 秦国夫 沈瑞祥 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1997年第3期100-103,共4页
该文介绍了一种简便快速地提取植物和微生物细胞总DNA的方法,该法是对提取真菌DNA的SDSCTAB法进行改进而成,经过修改后的SDSCTAB法可在数小时内高效地提取细胞总DNA.制备物经琼脂糖凝胶电泳检测到大于2... 该文介绍了一种简便快速地提取植物和微生物细胞总DNA的方法,该法是对提取真菌DNA的SDSCTAB法进行改进而成,经过修改后的SDSCTAB法可在数小时内高效地提取细胞总DNA.制备物经琼脂糖凝胶电泳检测到大于20kb的DNA主带,基本无DNA碎带;不用RNase处理,就已经无RNA的干扰.OD260/280值显示产物纯度较高。 展开更多
关键词 植物 微生物 DNA提取 SDS CTAB
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与西瓜野生种质抗枯萎病基因连锁的RAPD标记 被引量:94
8
作者 许勇 欧阳新星 +3 位作者 张海英 康国斌 王永健 陈杭 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1999年第9期952-955,共4页
运用RAPD技术,采用混合分组分析(bulkedsegregantanalysis,BSA)方法进行了西瓜(Citrulluslanatus(Thunb.)Mansfeldvar. citroides) 野生种质PI2... 运用RAPD技术,采用混合分组分析(bulkedsegregantanalysis,BSA)方法进行了西瓜(Citrulluslanatus(Thunb.)Mansfeldvar. citroides) 野生种质PI296341 抗枯萎病基因连锁的分子标记研究。研究结果表明:西瓜野生种质P1296341 抗枯萎病生理小种1 的抗性由单显性基因控制,RAPD标记OPPOL/700 与其抗病基因连锁,其遗传距离为30 cM(centimorgan)。这为进行抗病分子标记辅助选择,以及最终定位与克隆其抗病基因打下了良好基础。 展开更多
关键词 西瓜 抗枯萎病 rapd
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RAPD分析──鉴定柑桔体细胞杂种的快速方法 被引量:82
9
作者 肖顺元 黄舒 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1995年第4期40-42,共3页
本文利用改进的DNA提取方法,从Volkamer柠檬CitrusvolkamerianaTen.andPasq.)和酸橙(C.aurantiumL.)及其原生质体杂种植株的叶片中抽提总DNA,进行RAPD(Rando... 本文利用改进的DNA提取方法,从Volkamer柠檬CitrusvolkamerianaTen.andPasq.)和酸橙(C.aurantiumL.)及其原生质体杂种植株的叶片中抽提总DNA,进行RAPD(RandomAmplifiedPolymorphicDNA)分析。结果表明:在随机选取的15种引物中,有10种可单独或与其它引物一道鉴定这一组合的体细胞杂种。与形态学性状观察、同工酶及DNA杂交分析等方法比较,RAPD分析是一种可在试管苗期即可直接、准确、快速鉴定柑桔体细胞杂种的方法。 展开更多
关键词 柑桔 rapd 体细胞杂种
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确证冬虫夏草无性型的分子生物学证据I.中国被毛孢与冬虫夏草之间的关系 被引量:107
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作者 李增智 黄勃 +1 位作者 李春如 樊美珍 《菌物系统》 CSCD 北大核心 2000年第1期60-64,共5页
从青海的冬虫夏草子实体上分离出中国被毛孢[Cordyceps sinensis(Berk.)Sacc.],并利用RAPD-PCR技术,筛选出8种引物,获得了冬虫夏草和中国被毛抱相应的基因组DNA指纹图谱,两者相似率高... 从青海的冬虫夏草子实体上分离出中国被毛孢[Cordyceps sinensis(Berk.)Sacc.],并利用RAPD-PCR技术,筛选出8种引物,获得了冬虫夏草和中国被毛抱相应的基因组DNA指纹图谱,两者相似率高达96%,从而表明冬虫夏草的无性型为中国被毛孢。 展开更多
关键词 冬虫夏草 中国被毛孢 rapd 无性型
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分子生物学技术在昆虫系统学研究中的应用 被引量:79
11
作者 成新跃 周红章 张广学 《动物分类学报》 CSCD 2000年第2期121-133,共13页
分子生物学技术应用于昆虫系统学研究 ,是 80年代末新兴起来的 ,近几年来发展相当迅速。为了把握这个研究方向 ,并促进这个研究领域的发展 ,作者从研究方法、研究内容、研究对象等方面着手 ,对近 10年来分子生物学技术应用于昆虫系统学... 分子生物学技术应用于昆虫系统学研究 ,是 80年代末新兴起来的 ,近几年来发展相当迅速。为了把握这个研究方向 ,并促进这个研究领域的发展 ,作者从研究方法、研究内容、研究对象等方面着手 ,对近 10年来分子生物学技术应用于昆虫系统学中的研究进展进行了概括和总结。介绍了DNA序列测定、RFLP、分子杂交技术、RAPD、SSCP及DSCP等几种主要方法及其应用情况 ,并从种及种下阶元的分类鉴定、种上阶元的系统发育分析、分子进化、种群遗传变异及进化研究等方面总结了已有的研究成果 。 展开更多
关键词 分子生物学技术 昆虫系统学 RFLP rapd 系统树
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中国白菜RAPD分子遗传图谱的构建 被引量:53
12
作者 张鲁刚 王鸣 +1 位作者 陈杭 刘玲 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2000年第5期485-489,共5页
以芜菁 (BrassicacampestrisL .ssp .rapiferaMetzg)和结球白菜 (B .campestrisL .ssp .pekinensis (Lour.)Olsson )杂交的F2 群体为试材 ,采用RAPD标记 ,用 84个 10核苷酸随机引物 ,构建了白菜的RAPD遗传图谱。该图谱覆盖基因组的 16 3... 以芜菁 (BrassicacampestrisL .ssp .rapiferaMetzg)和结球白菜 (B .campestrisL .ssp .pekinensis (Lour.)Olsson )杂交的F2 群体为试材 ,采用RAPD标记 ,用 84个 10核苷酸随机引物 ,构建了白菜的RAPD遗传图谱。该图谱覆盖基因组的 16 32 .4cM (centiMorgan) ,标记间的平均间隔为 16 .5cM。其中最长的连锁群为 2 6 7.5cM ,最短的连锁群为6 2 .2cM。该图谱的大小及连锁群的分布与细胞学资料比较一致。 展开更多
关键词 rapd 分子遗传图 白菜 多态性
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利用SSR、ISSR和RAPD技术构建苜蓿基因组DNA指纹图谱 被引量:97
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作者 魏臻武 《草业学报》 CSCD 2004年第3期62-67,共6页
在建立可靠的苜蓿基因组DNA提取分离和PCR扩增技术体系的基础上,筛选具有稳定多态性位点的RAPD、SSR和ISSR引物,建立苜蓿基因组DNA的SSR、ISSR和RAPD分子标记技术体系,并利用分子标记检测苜蓿品种(系)的DNA分子标记多态性,构建苜蓿品种... 在建立可靠的苜蓿基因组DNA提取分离和PCR扩增技术体系的基础上,筛选具有稳定多态性位点的RAPD、SSR和ISSR引物,建立苜蓿基因组DNA的SSR、ISSR和RAPD分子标记技术体系,并利用分子标记检测苜蓿品种(系)的DNA分子标记多态性,构建苜蓿品种的DNA指纹图谱。筛选出36个RAPD引物,8个SSR引物和12个ISSR随机引物,通过PCR扩增在55个国内外苜蓿品种(系)中获得了182个RAPD多态性位点和丰富的SSR和ISSR多态性位点,构建了55个苜蓿品种(系)的SSR、ISSR和RAPD指纹图谱。结果表明,不同苜蓿品种(系)的SSR多态性有较大差异;苜蓿品种ISSR指纹图谱多态性丰富,稳定性比RAPD强;可以通过2~3个引物鉴别我国主要苜蓿品种和引进品种,SSR和ISSR指纹图谱可以更好地用于苜蓿品种鉴定和遗传多样性分析。 展开更多
关键词 苜蓿 分子标记 DNA指纹图谱 SSR ISSR rapd
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RAPD标记构建水稻分子连锁图 被引量:62
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作者 陈洪 朱立煌 +1 位作者 徐吉臣 陈美玲 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1995年第9期677-684,共8页
利用随机扩增多态性DNA(RAPD),在一个水稻(Oryza sativa L.)的双单倍体(DH)群体中发展分子标记,仅用52 个RAPD标记建成了一个水稻RAPD分子连锁图。该图覆盖基因组的总长度为898.4 cM ... 利用随机扩增多态性DNA(RAPD),在一个水稻(Oryza sativa L.)的双单倍体(DH)群体中发展分子标记,仅用52 个RAPD标记建成了一个水稻RAPD分子连锁图。该图覆盖基因组的总长度为898.4 cM (centim organ),标记间的平均间距为17.3 cM。 展开更多
关键词 水稻 随机扩增多态性 DNA 分子连锁图 rapd
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用微卫星多态性和RAPD分析广东地方鸡种的群体遗传变异 被引量:67
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作者 张细权 吕雪梅 +3 位作者 杨玉华 刘敬顺 杨关福 吴显华 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1998年第2期112-119,共8页
用5个座位的微卫星标记和70个10碱基引物得出的RAPD,研究分析了惠阳胡须鸡、杏花鸡和清远麻鸡3个广东地方鸡种和培育品种粤黄鸡的群体遗传变异及相互间的关系,并讨论了微卫星多态性和RAPD这两种标记在应用于群体遗传变... 用5个座位的微卫星标记和70个10碱基引物得出的RAPD,研究分析了惠阳胡须鸡、杏花鸡和清远麻鸡3个广东地方鸡种和培育品种粤黄鸡的群体遗传变异及相互间的关系,并讨论了微卫星多态性和RAPD这两种标记在应用于群体遗传变异及亲缘关系等方面分析的意义。微卫星多态性分析结果说明,样本采自保种群的惠阳胡须鸡和杏花鸡以及经长期封闭选育的粤黄鸡的杂合度均较低,而在起源地采样的清远麻鸡杂合度较高,但总的说来这几个鸡种的杂合度仍然是较低的。RAPD分析结果说明,4个鸡种群体间变异较小,但在惠阳胡须鸡发现具有品种特异性的RAPD图带。微卫星多态性和RAPD分析都说明4个鸡种的亲缘关系较近。由于微卫星标记多态性程度高且等显性遗传,因而通过它计算杂合度可以较好地反映群体内的变异;RAPD则在反映群体间的区别甚至某一群体的特征时可提供明确而直接的信息。 展开更多
关键词 微卫星多态性 rapd 地方鸡种 群体遗传变异
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西瓜抗枯萎病育种分子标记辅助选择的研究 被引量:78
16
作者 许勇 张海英 +2 位作者 康国斌 王永健 陈杭 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2000年第2期151-157,共7页
将西瓜野生种质PI296341抗枯萎病生理小种1的抗性基因连锁的RAPD标记OPP01/700进行克隆、测序,Southern杂交证明此标记为1个单拷贝,并转化为SCAR标记,简化了SCAR扩增产物的检测技术。上述技... 将西瓜野生种质PI296341抗枯萎病生理小种1的抗性基因连锁的RAPD标记OPP01/700进行克隆、测序,Southern杂交证明此标记为1个单拷贝,并转化为SCAR标记,简化了SCAR扩增产物的检测技术。上述技术在抗病转育后代选择中得到了很好的应用,初步建立了西瓜抗枯萎病育种分子标记辅助选择技术系统。 展开更多
关键词 西瓜 枯萎病 rapd SCAR 抗病育种
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运用RAPD对核桃属种间亲缘关系的研究 被引量:70
17
作者 吴燕民 裴东 +1 位作者 奚声珂 李嘉瑞 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期17-22,共6页
用随机扩增多态性DNA (RAPD)技术对核桃属内 9个种及近缘属的 2个种进行基因组DNA多态性分析 ,共选用 2 0个 10bp随机引物扩增出 311个DNA片段 ,其中铁核桃J .sigillata、甘肃枫杨P .macroptera显示出自身特征性标记 ,利用这些片段进行... 用随机扩增多态性DNA (RAPD)技术对核桃属内 9个种及近缘属的 2个种进行基因组DNA多态性分析 ,共选用 2 0个 10bp随机引物扩增出 311个DNA片段 ,其中铁核桃J .sigillata、甘肃枫杨P .macroptera显示出自身特征性标记 ,利用这些片段进行种间遗传关系分析 ,根据UPGMA方法构建聚类树状图。研究结果表明 :铁核桃为核桃属中一个独立种 ;核桃属内组间和种间亲缘关系与经典分类学的结果完全一致 ;RAPD对核桃属与近缘属的分析结果有待进一步研究证实。 展开更多
关键词 核桃属 rapd 亲缘关系 分类 种质资源 开发利用
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利用RAPD和ISSR分子标记分析地黄种质遗传多样性 被引量:71
18
作者 周延清 景建洲 +2 位作者 李振勇 张宝华 贾敬芬 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期922-928,共7页
用RAPD与ISSR技术对地黄的 8个品种和 2个脱毒品系进行了种质遗传多样性分析。分别从 80条RAPD引物和 4 4条ISSR引物中筛选出适合地黄种质分析的 17条RAPD引物和 10条ISSR引物用于RAPD和ISSR分析。 17条RAPD引物共扩增出 177条带 ,多态... 用RAPD与ISSR技术对地黄的 8个品种和 2个脱毒品系进行了种质遗传多样性分析。分别从 80条RAPD引物和 4 4条ISSR引物中筛选出适合地黄种质分析的 17条RAPD引物和 10条ISSR引物用于RAPD和ISSR分析。 17条RAPD引物共扩增出 177条带 ,多态性位点数为 10 9;多态性位点比率为 6 1 5 8% ;平均多样性指数 (I)为0 3135 ;每个位点的有效等位基因数 (Ne)是 1 36 4 1;10条ISSR引物共扩增出 110条带 .多态性位点数为 79;多态性位点比率为 71 5 8% ;平均多样性指数 (I)为 0 35 77;每个位点的有效等位基因数 (Ne)是 1 4 0 37。基于扩增条带数据库建立了各自的Jaccard遗传相关系数矩阵 ,构建了相似的分子树状图 ,将 10个供试材料分为 2类 :一类群含组培 85 5、大田 85 5、组培 930 2、大田 930 2、金状元和金白 6个材料 ;另一类群含北京 1号、大红袍、地黄 910 4和野生地黄 4个材料。两种分子标记的分析结果呈极显著正相关 (r=0 6 4 9)。结果表明 ,RAPD与ISSR标记适合于地黄种质遗传多样性分析 。 展开更多
关键词 地黄 rapd ISSR 种质遗传多样性 DNA分子标记
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矮牡丹与紫斑牡丹RAPD分析初报 被引量:68
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作者 裴颜龙 邹喻苹 +3 位作者 尹蓁 汪小全 张志宪 洪德元 《植物分类学报》 CSCD 1995年第4期350-356,共7页
用10个任意序列的寡核苷酸片段作为引物,将采自陕西、山西、甘肃等地矮牡丹与紫斑牡丹基因 组DNA,在毛细管气浴式PCR热循环仪上随机扩增。在对所有引物扩增条件严格标准化的条件下,这些引物可产生清楚的、可重复的与扩增产物相应的琼脂... 用10个任意序列的寡核苷酸片段作为引物,将采自陕西、山西、甘肃等地矮牡丹与紫斑牡丹基因 组DNA,在毛细管气浴式PCR热循环仪上随机扩增。在对所有引物扩增条件严格标准化的条件下,这些引物可产生清楚的、可重复的与扩增产物相应的琼脂糖凝胶电泳区带。这10个有效扩增的引物在矮牡丹平均每一个体中扩增出71条带,其中多态的带16条(22.5%);在紫斑牡丹平均每一个体中扩增出76条带,其中多态的带21条(27.6%)。对每两个个体,每条多态带进行成对比较,累加后求分子标记差异的平均值。在矮牡丹3个居群间的平均差异是7.9;在紫斑牡丹4个居群间的平均差异是8.7;在矮牡丹与紫斑牡丹2个种间的平均差异是10.3。显然,若用来扩增的植物个体数目和引物数目增加,将会得到更满意的结果。初步结果表明濒危植物矮牡丹与紫斑牡丹种内低水平的DNA多态性。RAPD技术用于检测野生牡丹居群内与居群间的遗传变异是有用的与可行的;用于研究种间的进化和亲缘关系也有潜力。 展开更多
关键词 矮牡丹 紫斑牡丹 rapd 芍药属
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水稻抗白叶枯病基因Xa23的PCR分子标记定位及辅助选择 被引量:82
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作者 潘海军 王春连 +4 位作者 赵开军 章琦 樊颖伦 周少川 朱立煌 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期501-507,共7页
用Xa2 3的近等基因系CBB2 3及其感病轮回亲本JG30构建了包含 2 5 6 2个单株的F2 作图群体。通过分析 5 71个感病单株 ,找到 2个新的与Xa2 3基因连锁的SSR标记RM187和RM2 0 6 ,它们与Xa2 3之间的遗传图距分别为 7 1cM和 1 9cM。通过筛选 ... 用Xa2 3的近等基因系CBB2 3及其感病轮回亲本JG30构建了包含 2 5 6 2个单株的F2 作图群体。通过分析 5 71个感病单株 ,找到 2个新的与Xa2 3基因连锁的SSR标记RM187和RM2 0 6 ,它们与Xa2 3之间的遗传图距分别为 7 1cM和 1 9cM。通过筛选 12 0 0个RAPD引物 ,获得 2个与Xa2 3基因连锁的RAPD标记RpdH5和RpdS1184 ,与Xa2 3之间的遗传图距分别为 7 0cM和 7 6cM。利用丰富占 /CBB2 3、绿油占 /CBB2 3两个实际育种F2 群体 ,结合抗病性人工接种鉴定 ,测算了RpdS1184、RM2 0 6和RpdH5用于分子标记辅助选择 (MAS)的可能性。结果表明 ,对于丰富 2 3群体 ,RpdH5和RpdS1184的MAS准确率分别为 91 0 %和 87 3% ,如果同时使用这两个标记 ,可使MAS的准确率达 99%。对于绿油 2 3群体 ,RpdH5、RpdS1184和RM2 0 6的MAS准确率分别为 77 1%、81 1%和 80 8%。同时使用RpdH5、RpdS1184标记的MAS准确率为 90 3% ;同时使用RpdH5、RM2 0 6的准确率为 91 3% ;同时使用RpdH5、RM2 0 6、RpdS1184标记的准确率为 90 8%。 展开更多
关键词 水稻 抗白叶枯病基因 XA23 PCR分子标记 标记定位 辅助选择 人工接种
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