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计算机辅助药物设计中用于建模的计算方法研究进展 被引量：10
1
作者 陈安进 石杰 《中国海洋大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期407-411,共5页
通过检索国内外相关领域的大量研究文献,并结合作者的研究经验,综述了计算机辅助药物设计中计算方法的发展及其应用的最新进展,并对计算方法的选用原则进行了探讨,以期为从事CADD工作者合理选择建模计算方法提供有价值的参考。
关键词 计算机辅助药物设计(CADD) 定量构效关系(qsar) 计算方法
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胺类捕收剂在石英表面吸附的定量构效关系 被引量：3
2
作者 王本英 徐新阳 +1 位作者 段浩 陈熙 《东北大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第1期131-136,共6页
为深入研究胺类阳离子捕收剂在石英表面吸附能与其结构之间的关系,基于遗传算法构建了20种胺类捕收剂在石英表面吸附能与其结构参数之间的定量构效关系模型,得到了模型的相关系数R^2=0.969,调整系数R^2 ad=0.964,交叉验证系数R^2 cv=0.9... 为深入研究胺类阳离子捕收剂在石英表面吸附能与其结构之间的关系,基于遗传算法构建了20种胺类捕收剂在石英表面吸附能与其结构参数之间的定量构效关系模型,得到了模型的相关系数R^2=0.969,调整系数R^2 ad=0.964,交叉验证系数R^2 cv=0.955,显著值F=168.429,表明模型预测结果与模拟计算值拟合较好.四种未参与建模的阳离子捕收剂对所构建模型外部检验结果误差不超过5%,证明模型具有较好的预测性,能够较好预测胺类捕收剂在石英表面的吸附能. 展开更多
关键词 定量构效关系 石英 胺类捕收剂 吸附能 结构参数
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含氮杂环化合物理化性质和生物活性的QSPR/QSAR分析 被引量：9
3
作者 陈艳 岳玮 王彬 《武汉大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期52-56,共5页
在分子拓扑理论的基础上,计算了含氮杂环化合物的3类拓扑指数:分子连接性指数、形状指数和分子电性距离矢量.利用多元线性回归的方法建立了含氮杂环化合物的疏水性参数(lgP)和对淡水纤毛虫毒性(-lgc)的QSPR/QSAR(定量结构-性质/活性相关... 在分子拓扑理论的基础上,计算了含氮杂环化合物的3类拓扑指数:分子连接性指数、形状指数和分子电性距离矢量.利用多元线性回归的方法建立了含氮杂环化合物的疏水性参数(lgP)和对淡水纤毛虫毒性(-lgc)的QSPR/QSAR(定量结构-性质/活性相关)模型,相关系数分别为0.998 1和0.980 6.模型经Jackknife法和逐一剔除法(LOO)交互检验证明具有良好的稳健性和预测能力,为了进一步提高相关系数0.980 6模型的相关性,以模型中的3个参数为人工神经网络输入层,设定3∶3∶1的网络结构,构建人工神经网络(BP)算法模型,相关系数R提升为0.993 3.该模型能很好地预测含氮杂环化合物的理化性质和生物活性. 展开更多
关键词 含氮杂环化合物 拓扑指数 疏水性参数 生物毒性 QSPR qsar(定量结构一性质 活性相关)
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益智酮A与姜黄色素的抗氧化性与其构效的关系 被引量：3
4
作者 刘红 郭祀远 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第12期934-935,共2页
运用分子力学和量子化学计算的方法,研究益智酮A与其类似物姜黄色素抗氧化性的构效关系。从电荷、键长和生成热之差分析益智酮A与姜黄色素的抗氧化性,结果表明益智酮A的姜黄色素因具有相同的结构而具有类似的抗氧化性,但因所带的电荷和... 运用分子力学和量子化学计算的方法,研究益智酮A与其类似物姜黄色素抗氧化性的构效关系。从电荷、键长和生成热之差分析益智酮A与姜黄色素的抗氧化性,结果表明益智酮A的姜黄色素因具有相同的结构而具有类似的抗氧化性,但因所带的电荷和生成热之差不同而存在抗氧化性强弱的差异。 展开更多
关键词 益智 抗氧化 构效
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化合物毒性及三维结构参数的定量构效关系研究 被引量：1
5
作者 郭亦然 张燕玲 +1 位作者 艾路 乔延江 《现代生物医学进展》 CAS 2006年第4期22-24,共3页
目的:建立小分子化合物毒性的三维定量构效关系模型,探索化合物毒性数据和三维结构参数之间关系的方法。方法:利用比较分子力场分析方法(CoMFA),建立了一组对发光菌有急性毒性的小分子的三维定量构效模型。结果:模型的交叉验证相关系数q... 目的:建立小分子化合物毒性的三维定量构效关系模型,探索化合物毒性数据和三维结构参数之间关系的方法。方法:利用比较分子力场分析方法(CoMFA),建立了一组对发光菌有急性毒性的小分子的三维定量构效模型。结果:模型的交叉验证相关系数q2=0.731,非交叉验证相关系数r2=0.973,标准偏差SE=0.122,F=70.910。结论:该模型具有较好的预测能力,表明在甲基的邻对位减小取代基体积或电负性可以降低化合物毒性。 展开更多
关键词 化合物毒性 三维构效关系 比较力场分析方法
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