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长双歧杆菌NCC2705葡萄糖与乳糖代谢的比较蛋白质组学
被引量：
4
1
作者
何湘
刘大伟
+6 位作者
孙忠科
王芳
姜铮
赵红庆
陈宣男
黄留玉
袁静
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第11期1451-1458,共8页
【目的】以本实验室前期构建的长双歧杆菌NCC2705菌株蛋白质参考图谱为基础,研究长双歧杆菌发酵乳糖和葡萄糖的比较蛋白质组学。【方法】采用ImageMaster 2D Elite Platnum Version5.0比较分析3倍以上蛋白差异点;利用MALDI-TOF进行差异...
【目的】以本实验室前期构建的长双歧杆菌NCC2705菌株蛋白质参考图谱为基础,研究长双歧杆菌发酵乳糖和葡萄糖的比较蛋白质组学。【方法】采用ImageMaster 2D Elite Platnum Version5.0比较分析3倍以上蛋白差异点;利用MALDI-TOF进行差异蛋白鉴定,每个蛋白质点的肽指纹图谱在长双歧杆菌NCC2705菌株的蛋白质数据库用Mascot进行检索;采用Pro-Q磷酸化试剂进行磷酸化蛋白的染色。【结果】鉴定到31个蛋白表达发生显著变化,在乳糖发酵中14个蛋白上调17个蛋白下调。这些蛋白为亲水性酸性蛋白,它们基因的CAI值均在0.5以上,主要包括糖代谢相关蛋白、应激蛋白、转录和翻译相关蛋白,还有一些未知功能的蛋白。此外,有两个蛋白:转醛缩酶(BL0715,transaldolase,tal)L3蛋白点和丙酮酸激酶(BL0988,pyruvate kinase,pyk)G9蛋白点发生了磷酸化作用。【结论】长双歧杆菌NCC2705在乳糖中生长快于葡萄糖,它们的降解途径是相同的;转醛缩酶和丙酮酸激酶发生了翻译后修饰作用,推测转醛缩酶在43T和47S发生了磷酸化,而丙酮酸激酶在65S发生了磷酸化。
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关键词
比较蛋白质组
乳糖代谢
双向电泳
pro
—
q
diamond
染色
MALDI—TOF
磷酸化蛋白
下载PDF
职称材料
一种磷酸化蛋白质组定性定量分析方法的考察
2
作者
赵丽艳
刘金凤
+5 位作者
蔡芸
钱小红
马守栋
程艳芹
纪松岗
李明春
《热带医学杂志》
CAS
2012年第12期1434-1437,F0004,共5页
目的对用于磷酸化蛋白质的相对定量分析的一种基于双向差示凝胶电泳(2-DDIGE)技术和Pro-Q Diamond荧光染色的方法进行考察。方法采用DIGE技术,从Pro-Q Diamond染色后对Cy2、Cy5荧光强度的影响、Pro-Q Diamond染色过程中采用的试剂对CyDy...
目的对用于磷酸化蛋白质的相对定量分析的一种基于双向差示凝胶电泳(2-DDIGE)技术和Pro-Q Diamond荧光染色的方法进行考察。方法采用DIGE技术,从Pro-Q Diamond染色后对Cy2、Cy5荧光强度的影响、Pro-Q Diamond染色过程中采用的试剂对CyDye标记的蛋白质的影响、去离子水对DIGE扫描结果的影响、CyDye染料扫描的稳定性影响等方面,考察了该方法的有效性和特异性。结果在Pro-Q Diamond染色前对DIGE凝胶进行处理的过程中,有多种因素影响荧光强度变化,以致在进行Pro-Q Diamond染色后,凝胶点的荧光强度变化无法区分是染色造成的灰度值变化还是CyDye染料自身的变化,从而使通过荧光强度变化来定量检测磷酸化蛋白质变得困难。结论不宜采用对同一DIGE凝胶进行Pro-Q Diamond再染色检测磷酸化蛋白质的方法进行比较蛋白质组学的定量分析,为能同时展示出胶上的磷酸化蛋白质和总蛋白质,可通过DIGE实验与Pro-Q Diamond分开运行,再通过DIGE扫描图谱与Pro-Q Diamond染色图谱进行匹配的方法进行改进。
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关键词
比较蛋白质组学
双向差示凝胶电泳
pro
-
q
diamond
荧光染色
磷酸化蛋白质
原文传递
题名
长双歧杆菌NCC2705葡萄糖与乳糖代谢的比较蛋白质组学
被引量：
4
1
作者
何湘
刘大伟
孙忠科
王芳
姜铮
赵红庆
陈宣男
黄留玉
袁静
机构
军事医学科学院疾病预防控制研究所
吉林大学公共卫生学院
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第11期1451-1458,共8页
基金
国家“863计划”(2007AA02Z118)
国家自然科学基金(30771809)~~
文摘
【目的】以本实验室前期构建的长双歧杆菌NCC2705菌株蛋白质参考图谱为基础,研究长双歧杆菌发酵乳糖和葡萄糖的比较蛋白质组学。【方法】采用ImageMaster 2D Elite Platnum Version5.0比较分析3倍以上蛋白差异点;利用MALDI-TOF进行差异蛋白鉴定,每个蛋白质点的肽指纹图谱在长双歧杆菌NCC2705菌株的蛋白质数据库用Mascot进行检索;采用Pro-Q磷酸化试剂进行磷酸化蛋白的染色。【结果】鉴定到31个蛋白表达发生显著变化,在乳糖发酵中14个蛋白上调17个蛋白下调。这些蛋白为亲水性酸性蛋白,它们基因的CAI值均在0.5以上,主要包括糖代谢相关蛋白、应激蛋白、转录和翻译相关蛋白,还有一些未知功能的蛋白。此外,有两个蛋白:转醛缩酶(BL0715,transaldolase,tal)L3蛋白点和丙酮酸激酶(BL0988,pyruvate kinase,pyk)G9蛋白点发生了磷酸化作用。【结论】长双歧杆菌NCC2705在乳糖中生长快于葡萄糖,它们的降解途径是相同的;转醛缩酶和丙酮酸激酶发生了翻译后修饰作用,推测转醛缩酶在43T和47S发生了磷酸化,而丙酮酸激酶在65S发生了磷酸化。
关键词
比较蛋白质组
乳糖代谢
双向电泳
pro
—
q
diamond
染色
MALDI—TOF
磷酸化蛋白
Keywords
Comparative
pro
teome
the
catabolism
of
lactose
2D-PAGE
pro
-
q
diamond
staining
phospho
pro
teins
分类号
Q93 [生物学—微生物学]
下载PDF
职称材料
题名
一种磷酸化蛋白质组定性定量分析方法的考察
2
作者
赵丽艳
刘金凤
蔡芸
钱小红
马守栋
程艳芹
纪松岗
李明春
机构
解放军第
北京蛋白质组研究中心
出处
《热带医学杂志》
CAS
2012年第12期1434-1437,F0004,共5页
基金
国家自然科学基金(81102410)
文摘
目的对用于磷酸化蛋白质的相对定量分析的一种基于双向差示凝胶电泳(2-DDIGE)技术和Pro-Q Diamond荧光染色的方法进行考察。方法采用DIGE技术,从Pro-Q Diamond染色后对Cy2、Cy5荧光强度的影响、Pro-Q Diamond染色过程中采用的试剂对CyDye标记的蛋白质的影响、去离子水对DIGE扫描结果的影响、CyDye染料扫描的稳定性影响等方面,考察了该方法的有效性和特异性。结果在Pro-Q Diamond染色前对DIGE凝胶进行处理的过程中,有多种因素影响荧光强度变化,以致在进行Pro-Q Diamond染色后,凝胶点的荧光强度变化无法区分是染色造成的灰度值变化还是CyDye染料自身的变化,从而使通过荧光强度变化来定量检测磷酸化蛋白质变得困难。结论不宜采用对同一DIGE凝胶进行Pro-Q Diamond再染色检测磷酸化蛋白质的方法进行比较蛋白质组学的定量分析,为能同时展示出胶上的磷酸化蛋白质和总蛋白质,可通过DIGE实验与Pro-Q Diamond分开运行,再通过DIGE扫描图谱与Pro-Q Diamond染色图谱进行匹配的方法进行改进。
关键词
比较蛋白质组学
双向差示凝胶电泳
pro
-
q
diamond
荧光染色
磷酸化蛋白质
Keywords
comparative
pro
teomics
two
dimension
difference
gel
electrophoresis
pro
-
q
diamond
fluorescence
staining
phospho
pro
teins
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
长双歧杆菌NCC2705葡萄糖与乳糖代谢的比较蛋白质组学
何湘
刘大伟
孙忠科
王芳
姜铮
赵红庆
陈宣男
黄留玉
袁静
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
4
下载PDF
职称材料
2
一种磷酸化蛋白质组定性定量分析方法的考察
赵丽艳
刘金凤
蔡芸
钱小红
马守栋
程艳芹
纪松岗
李明春
《热带医学杂志》
CAS
2012
0
原文传递
已选择
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