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广西武宣濠江流域普通野生稻居群遗传多样性及保护研究
被引量:
28
1
作者
盖红梅
陈成斌
+4 位作者
沈法富
张万霞
任民
王玉薇
杨庆文
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
2005年第2期156-162,共7页
选用平均分布于水稻基因组的2 4对SSR引物,对沿河分布最长的广西武宣濠江流域的12个普通野生稻居群343份材料的遗传结构进行研究。结果表明:(1)该地普通野生稻遗传多样性丰富。2 4个位点共检测到2 0 6个等位变异,平均等位变异数A =8 70 ...
选用平均分布于水稻基因组的2 4对SSR引物,对沿河分布最长的广西武宣濠江流域的12个普通野生稻居群343份材料的遗传结构进行研究。结果表明:(1)该地普通野生稻遗传多样性丰富。2 4个位点共检测到2 0 6个等位变异,平均等位变异数A =8 70 83,有效等位变异数Ae =3 7117;(2 )该地普通野生稻居群具有较高的遗传分化和一定频率的基因流。群体遗传分化系数Gst=0 2 6 5 9,基因流Nm =0 6 90 1,表明2 6 5 9%的遗传变异存在于居群间;(3)SSR标记使普通野生稻居群中一些稀有等位变异得以显现。2 0 6个等位变异中,6 5个等位变异仅出现在1个或2个居群中,且频率较低,其中12个等位变异只出现在居群B中;(4)通过聚类分析和主坐标分析(PCO) ,下游居群A和B遗传关系较近,中游居群C比较独特,单独成为一类,中游居群D、E、F和G遗传关系较近,中游居群H、I和J及上游居群K和L遗传关系较近。根据上述分析结果,建议对濠江下游和中游具有代表性的居群(即居群B、D和H)的普通野生稻进行重点保护。
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关键词
普通野生稻
微卫星
遗传多样性
主坐标分析
原生境保护
保护研究
居群
流域
广西
遗传分化系数
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职称材料
人类群体遗传结构的图论主坐标分析方法
被引量:
6
2
作者
薛付忠
王洁贞
+1 位作者
张娜
胡平
《山东大学学报(医学版)》
CAS
北大核心
2006年第2期109-113,121,共6页
目的:提出基因频率矩阵的图论主坐标分析方法,探讨该法在人类群体遗传结构研究中的应用。方法:从分析基因频率矩阵的结构特征入手,将主坐标分析与图论中的最小生成树有机结合,构建人类群体遗传结构的图论主坐标模型,并以中国26个汉族人...
目的:提出基因频率矩阵的图论主坐标分析方法,探讨该法在人类群体遗传结构研究中的应用。方法:从分析基因频率矩阵的结构特征入手,将主坐标分析与图论中的最小生成树有机结合,构建人类群体遗传结构的图论主坐标模型,并以中国26个汉族人群HLA-A位点遗传结构分析为例,验证图论主坐标分析的科学性和适用性。结果:图论主坐标分析的基本步骤可概括为:①对中心化基因频率矩阵进行主坐标分析;②按图论原理求过m维空间n个点的最小生成树;③利用求“颈”法分割最小生成树;④将最小生成树整合到二维主坐标散点图中构建图论主坐标分类图。根据此步骤,对中国26个汉族人群HLA-A位点遗传结构进行了图论主坐标分析,分析结果符合中华民族源与流的客观规律。结论:图论主坐标分类图既可显示各群体的遗传结构特性,又可利用最小生成树的连接关系揭示各群体间的内在联系;图论主坐标分析是分析人类群体遗传结构的一种理想方法。
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关键词
遗传学
群体
图论主坐标分析
基因频率
组织相容性抗原
人
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职称材料
基因型与环境互作研究的新进展
被引量:
69
3
作者
黄英姿
毛盛贤
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
1992年第2期116-125,共10页
研究基因型-环境互作是进行遗传分析、品种评价的一个重要环节。Freeman(1973)、Hill(1975)和 Westcott(1986)对用于这一领域的研究方法进行了总结回顾。本文将系统地阐述其中研究非线性基因型-环境互作的方法的基本理论及运用思想。包...
研究基因型-环境互作是进行遗传分析、品种评价的一个重要环节。Freeman(1973)、Hill(1975)和 Westcott(1986)对用于这一领域的研究方法进行了总结回顾。本文将系统地阐述其中研究非线性基因型-环境互作的方法的基本理论及运用思想。包括非线性回归分析、聚类分析、主分量分析、偶图法、多维标度法和主坐标分析及对应分析。
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关键词
基因型
环境互作
聚类分析
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职称材料
题名
广西武宣濠江流域普通野生稻居群遗传多样性及保护研究
被引量:
28
1
作者
盖红梅
陈成斌
沈法富
张万霞
任民
王玉薇
杨庆文
机构
山东农业大学农学院
中国农业科学院作物品种资源研究所
广西农业科学院水稻所
中国农业科学院作物品种资源研究所
四川农业大学玉米研究所
华中农业大学植物科技学院
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
2005年第2期156-162,共7页
基金
国家财政专项资助
文摘
选用平均分布于水稻基因组的2 4对SSR引物,对沿河分布最长的广西武宣濠江流域的12个普通野生稻居群343份材料的遗传结构进行研究。结果表明:(1)该地普通野生稻遗传多样性丰富。2 4个位点共检测到2 0 6个等位变异,平均等位变异数A =8 70 83,有效等位变异数Ae =3 7117;(2 )该地普通野生稻居群具有较高的遗传分化和一定频率的基因流。群体遗传分化系数Gst=0 2 6 5 9,基因流Nm =0 6 90 1,表明2 6 5 9%的遗传变异存在于居群间;(3)SSR标记使普通野生稻居群中一些稀有等位变异得以显现。2 0 6个等位变异中,6 5个等位变异仅出现在1个或2个居群中,且频率较低,其中12个等位变异只出现在居群B中;(4)通过聚类分析和主坐标分析(PCO) ,下游居群A和B遗传关系较近,中游居群C比较独特,单独成为一类,中游居群D、E、F和G遗传关系较近,中游居群H、I和J及上游居群K和L遗传关系较近。根据上述分析结果,建议对濠江下游和中游具有代表性的居群(即居群B、D和H)的普通野生稻进行重点保护。
关键词
普通野生稻
微卫星
遗传多样性
主坐标分析
原生境保护
保护研究
居群
流域
广西
遗传分化系数
Keywords
Oryza
rufipogon
SSR
Genetic
diversity
principle
coordinates
analysis
In-situ
conservation
分类号
S511.9 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
人类群体遗传结构的图论主坐标分析方法
被引量:
6
2
作者
薛付忠
王洁贞
张娜
胡平
机构
山东大学公共卫生学院流行病学与医学统计学研究所
出处
《山东大学学报(医学版)》
CAS
北大核心
2006年第2期109-113,121,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.30170527)
文摘
目的:提出基因频率矩阵的图论主坐标分析方法,探讨该法在人类群体遗传结构研究中的应用。方法:从分析基因频率矩阵的结构特征入手,将主坐标分析与图论中的最小生成树有机结合,构建人类群体遗传结构的图论主坐标模型,并以中国26个汉族人群HLA-A位点遗传结构分析为例,验证图论主坐标分析的科学性和适用性。结果:图论主坐标分析的基本步骤可概括为:①对中心化基因频率矩阵进行主坐标分析;②按图论原理求过m维空间n个点的最小生成树;③利用求“颈”法分割最小生成树;④将最小生成树整合到二维主坐标散点图中构建图论主坐标分类图。根据此步骤,对中国26个汉族人群HLA-A位点遗传结构进行了图论主坐标分析,分析结果符合中华民族源与流的客观规律。结论:图论主坐标分类图既可显示各群体的遗传结构特性,又可利用最小生成树的连接关系揭示各群体间的内在联系;图论主坐标分析是分析人类群体遗传结构的一种理想方法。
关键词
遗传学
群体
图论主坐标分析
基因频率
组织相容性抗原
人
Keywords
Genetic,
population
Graph
theory
principle
coordinates
analysis
Frequency
Histocompatibility
antigens
Persons
分类号
R195.1 [医药卫生—卫生统计学]
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职称材料
题名
基因型与环境互作研究的新进展
被引量:
69
3
作者
黄英姿
毛盛贤
机构
北京师范大学生物系
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
1992年第2期116-125,共10页
文摘
研究基因型-环境互作是进行遗传分析、品种评价的一个重要环节。Freeman(1973)、Hill(1975)和 Westcott(1986)对用于这一领域的研究方法进行了总结回顾。本文将系统地阐述其中研究非线性基因型-环境互作的方法的基本理论及运用思想。包括非线性回归分析、聚类分析、主分量分析、偶图法、多维标度法和主坐标分析及对应分析。
关键词
基因型
环境互作
聚类分析
Keywords
genotype-environment
interaction
non-linear
regression
alalysis
cluster
analysis
principle
component
analysis
biplot
method
multidimensional
scaling
and
principle
coordin
ate
analysis
correspondence
analysis
分类号
Q348 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
广西武宣濠江流域普通野生稻居群遗传多样性及保护研究
盖红梅
陈成斌
沈法富
张万霞
任民
王玉薇
杨庆文
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
2005
28
下载PDF
职称材料
2
人类群体遗传结构的图论主坐标分析方法
薛付忠
王洁贞
张娜
胡平
《山东大学学报(医学版)》
CAS
北大核心
2006
6
下载PDF
职称材料
3
基因型与环境互作研究的新进展
黄英姿
毛盛贤
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
1992
69
下载PDF
职称材料
已选择
0
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