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中国北方几种主要森林群落表土花粉组合特征研究 被引量:61
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作者 许清海 李月丛 +1 位作者 阳小兰 郑振华 《第四纪研究》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期585-597,共13页
中国北方68个不同森林群落表土花粉研究表明,东部森林区森林群落中乔木花粉百分比多数大于30%,草本花粉百分比小于50%;草原区河谷林和低山林带乔木花粉百分比低于30%,草本植物花粉高于50%。松、云冷杉林和桦木林花粉组合中的优势成分也... 中国北方68个不同森林群落表土花粉研究表明,东部森林区森林群落中乔木花粉百分比多数大于30%,草本花粉百分比小于50%;草原区河谷林和低山林带乔木花粉百分比低于30%,草本植物花粉高于50%。松、云冷杉林和桦木林花粉组合中的优势成分也是群落中的优势植物;落叶松林中蒿花粉含量最高,其次为松、落叶松;山杨林中松、桦是最主要花粉类型;栎、胡桃、鹅耳枥及青檀林中,除建群种外,松是最主要的乔木花粉类型,中华卷柏也较多;阔叶杂木林与油松阔叶混交林花粉组成相似,松、桦、中华卷柏是最主要的花粉类型。降趋对应分析、主坐标分析和聚类分析研究表明云冷杉、落叶松和桦林花粉组合及所代表的生境具有一定的相似性,为最耐寒喜湿类型;沙枣、榆树疏林和草原区人工杨树林花粉组合及所代表的生境为最喜干旱类型;山杨林较桦木林略喜暖干,栎林、鹅耳枥林和青檀林较山杨林更喜暖干,胡桃楸林为所有森林类型中最喜暖类型,但喜湿性低于桦木林高于栎林。森林区松蒿比(P/A)大于0.1,草原区松蒿比小于0.1。松林、油松阔叶混交林和阔叶杂木林以高松蒿比、高蕨类与草本比值(F/H)和低蒿藜比(A/C)为特征,云冷杉、落叶松和桦林以低松蒿比、低蕨类与草本比值和高蒿藜比为特征,栎、胡桃、鹅耳枥、杨、青檀等阔叶林以高松蒿比、高蒿藜比和低蕨类与草本比值,可与落叶阔叶杂木林、油松阔叶混交林、松林、桦林和针叶林区分开。但这些比值的可操作性,有待进一步研究。 展开更多
关键词 中国北方 森林群落 花粉组合 降趋对应分析(DCA) 聚类分析(CLA) 松蒿比 蒿藜比 蕨类 与草本比值
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贵州地方水稻品种的SSR遗传多样性分析 被引量:28
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作者 马琳 余显权 赵福胜 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期237-243,共7页
利用21对SSR引物对74份贵州"禾"水稻品种及6份国际上常用的典型籼稻和粳稻品种进行遗传多样性研究。共检测到92个等位基因,每个位点的等位基因数变幅为2~9个,平均4.381个;平均Shannon信息指数为0.935,变幅为0.2793~1.8732;期望杂合... 利用21对SSR引物对74份贵州"禾"水稻品种及6份国际上常用的典型籼稻和粳稻品种进行遗传多样性研究。共检测到92个等位基因,每个位点的等位基因数变幅为2~9个,平均4.381个;平均Shannon信息指数为0.935,变幅为0.2793~1.8732;期望杂合度为0.5145,范围在0.0988~0.8313;品种间遗传相似系数为0.64~0.98。UPGMA聚类分析表明,在相似系数为0.682处可将"禾"品种分为4大类,大部分材料被聚类到典型粳稻的附近,品种间的亲缘关系与地理来源关系不大;主坐标分析结果与UPGMA聚类结果基本吻合。SSR检测结果表明,贵州省水稻地方品种——"禾"的多样性程度较低,且大多数属于粳稻。 展开更多
关键词 水稻 地方品种 微卫星标记 遗传多样性 主坐标分析
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冬瓜和节瓜种质资源遗传多样性的RAPD分析 被引量:23
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作者 宋世威 李珍 +2 位作者 刘厚诚 孙光闻 陈日远 《中国蔬菜》 北大核心 2010年第22期47-53,共7页
采用RAPD分子标记技术对41份冬瓜和节瓜种质资源进行遗传多样性分析。从455条随机引物中筛选出23条能产生稳定多态性扩增谱带的引物用于RAPD分析,共产生143条扩增谱带,其中多态性谱带81条,多态性检测率为56.6%,表明冬瓜和节瓜种质资源... 采用RAPD分子标记技术对41份冬瓜和节瓜种质资源进行遗传多样性分析。从455条随机引物中筛选出23条能产生稳定多态性扩增谱带的引物用于RAPD分析,共产生143条扩增谱带,其中多态性谱带81条,多态性检测率为56.6%,表明冬瓜和节瓜种质资源在分子水平上具有丰富的遗传多样性。用NTSYSpc软件处理RAPD数据,41份材料间的遗传相似系数在0.60~0.99之间。聚类分析结果可将供试材料分为6大类群9个亚类,主坐标分析可将供试材料分为6大类群10个亚类。两种分类方法的结果基本一致。 展开更多
关键词 冬瓜 节瓜 RAPD 聚类分析 主坐标分析
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青花菜种质资源遗传多样性的SSR分析 被引量:16
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作者 张志仙 何道根 +2 位作者 朱长志 檀国印 高旭 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第2期228-235,共8页
采用SSR分子标记技术,从50对引物中筛选出14对条带清晰、稳定性好的多态性引物分析了28份青花菜种质资源的遗传多样性。结果表明,14对引物在28份材料中共扩增出94条条带,多肽信息量为0.20~0.91。供试的28份材料的遗传相似系数为0.585 1~... 采用SSR分子标记技术,从50对引物中筛选出14对条带清晰、稳定性好的多态性引物分析了28份青花菜种质资源的遗传多样性。结果表明,14对引物在28份材料中共扩增出94条条带,多肽信息量为0.20~0.91。供试的28份材料的遗传相似系数为0.585 1~0.904 3,平均遗传相似系数为0.728 9。其中TN12和TN14亲缘关系最近(相似系数为0.904 3),TN503和TN597亲缘关系最远(相似系数为0.585 1)。聚类分析表明,在遗传相似系数0.688处,28份青花菜材料可分为2大类。第一大类(Ⅰ)包括TN501、TN526等26份材料,第二类(Ⅱ)由TN539和TN597两个材料组成。同时,从主成分分析二维图结果来看,28份材料分成4个组,第一组由TN539和TN597构成,第二组由TN55、TN591等6个材料组成,第三组由TN671等6个材料组成,第四组由14份材料组成。两种分类方法都得出TN539和TN597与其他26份材料亲缘关系较远的结果。结果表明,这28份青花菜种质资源总体遗传多样性较低,但部分材料存在较大遗传差异,为供试材料的利用和杂交亲本选配提供了参考。 展开更多
关键词 青花菜 SSR 聚类分析 主成分分析 遗传多样性
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利用SSR分子标记分析云南陆稻品种遗传多样性 被引量:14
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作者 徐建欣 王云月 +3 位作者 姚春 刘云霞 汤淼 陆明兴 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期155-164,共10页
利用24对SSR引物对云南131个陆稻品种进行遗传多样性分析。共检测到195个等位基因。每个位点的等位基因数平均为8.125个,范围在5(RM55)~13(RM218、RM241)之间;平均表观杂合度为0.0014,平均期望杂合度为0.6545;平均Shannon-Weaver指数(I... 利用24对SSR引物对云南131个陆稻品种进行遗传多样性分析。共检测到195个等位基因。每个位点的等位基因数平均为8.125个,范围在5(RM55)~13(RM218、RM241)之间;平均表观杂合度为0.0014,平均期望杂合度为0.6545;平均Shannon-Weaver指数(I)为1.381;Nei基因多样性指数(H)平均为0.6543,变幅为0.2073(RM235)~0.8689(RM218)。不同地区间陆稻种质资源遗传多样性比较分析表明,滇西南和滇南地区存在丰富的遗传变异,是云南陆稻品种遗传多样性的分布中心。藏缅语族和孟-高棉语族所种植的陆稻品种遗传多样性最丰富。AMOVA分析表明陆稻的遗传变异主要存在于地区内品种间(82%),只有3%遗传变异存在于地区间,品种内的遗传变异占15%。聚类分析显示Nei遗传相似系数为0.22时,云南陆稻品种分为籼粳两个类群,主坐标分析与UPGMA聚类结果基本吻合,并将类群Ⅳ的4个偏籼品种从粳稻类群中重新划归到籼稻类群中,校正了UPGMA聚类的误差,但是不能区分地理组。 展开更多
关键词 陆稻 遗传多样性 简单重复序列 主坐标分析
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杜鹃花种质资源遗传多样性的SRAP分析 被引量:15
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作者 肖政 苏家乐 +3 位作者 刘晓青 李畅 何丽斯 陈尚平 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第2期442-447,共6页
采用SRAP分子标记分析了30个杜鹃花物种的遗传多样性。20对引物共检测到306个位点,平均每对引物扩增出15.3个位点,多态位点百分率为100%。物种水平的Nei’s基因多样性指数(H)为0.352,Shannon’s信息指数(I)为0.525,相似系数在0.543至0.... 采用SRAP分子标记分析了30个杜鹃花物种的遗传多样性。20对引物共检测到306个位点,平均每对引物扩增出15.3个位点,多态位点百分率为100%。物种水平的Nei’s基因多样性指数(H)为0.352,Shannon’s信息指数(I)为0.525,相似系数在0.543至0.761之间,表明参试的30份杜鹃花材料具有较高的遗传多样性。主坐标分析(PCA)结果和UPGMA法构建的系统树显示,30份杜鹃花材料可分为5类,其中云锦杜鹃和光枝杜鹃、井岗山杜鹃和皱叶杜鹃、迎红杜鹃和兴安杜鹃、露珠杜鹃和大果杜鹃分别聚为一组,结果与基于表型特征的分类基本一致,表明SRAP标记具有较准确的鉴别能力,是进行杜鹃花属植物遗传多样性分析的有效分子标记。 展开更多
关键词 杜鹃花属 序列相关扩增多态性 遗传多样性 主坐标分析
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大蒜资源鳞茎产量构成性状评价与种质分类研究 被引量:13
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作者 王海平 李锡香 +3 位作者 沈镝 宋江萍 邱杨 Philipp W.Simon 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2011年第S1期153-162,共10页
对无性繁殖蔬菜资源圃保存的192份大蒜种质的8个鳞茎产量构成数量性状(鳞茎高、鳞茎直径、鳞茎重、鳞芽高、鳞芽背宽、鳞芽数、鳞茎盘厚、鳞茎盘直径)进行了观测、统计分析和分类研究。结果表明:8个数量性状均存在较大变异;依据频次分布... 对无性繁殖蔬菜资源圃保存的192份大蒜种质的8个鳞茎产量构成数量性状(鳞茎高、鳞茎直径、鳞茎重、鳞芽高、鳞芽背宽、鳞芽数、鳞茎盘厚、鳞茎盘直径)进行了观测、统计分析和分类研究。结果表明:8个数量性状均存在较大变异;依据频次分布和5级分组的惯例,提出了各个性状相应的分级标准;相关分析表明,鳞茎单产与除鳞芽背宽之外的其他7个性状显著相关,其中与鳞茎重和鳞茎直径相关系数最大,相关系数分别为0.983 77和0.726 9;主成分分析表明,与产量相关的前3个主成分累积贡献率达74.84%,在第一主成分的特征向量中,以鳞茎重最大、鳞茎直径次之,再次是鳞茎高和鳞芽数;不同种质鳞茎产量差异显著,结合主坐标分析结果,可将参试资源分为高、较高、中、较低、低、极低6个产量级别,并筛选到单产在15 t/hm2以上的资源3份。 展开更多
关键词 大蒜 产量数量性状 主成分分析 相关分析 主坐标分析
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新疆枸杞种质资源遗传多样性的SRAP分析 被引量:6
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作者 查美琴 赵玉玲 +3 位作者 李疆 朱瑜 罗淑萍 胡月 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期681-687,共7页
利用SRAP分子标记技术对新疆枸杞种质资源遗传多样性及亲缘关系进行研究,为新疆枸杞种质资源分类和杂交育种提供理论依据。结果显示:(1)筛选出的12对SRAP引物共扩增出310个位点,其中多态性位点264个,多态性比率平均为84.61%,引物多... 利用SRAP分子标记技术对新疆枸杞种质资源遗传多样性及亲缘关系进行研究,为新疆枸杞种质资源分类和杂交育种提供理论依据。结果显示:(1)筛选出的12对SRAP引物共扩增出310个位点,其中多态性位点264个,多态性比率平均为84.61%,引物多态性信息含量(PIC)变化范围为0.76~0.93,平均为0.83;观测等位基因(Na)、有效等位基因数(Ne)、Neis基因多样性指数(H)、Shannon信息指数(I)平均值分别为1.846 1、1.386 9、0.228 0和0.352 0。(2)聚类分析表明,供试材料间的遗传相似系数为0.590 3~0.903 2,在遗传相似性系数为0.70和0.76时,可将30份样品分别分为2大类和5个亚类;主坐标分析结果和聚类结果基本一致。研究表明,新疆枸杞种质资源遗传多样性较丰富,且野生种与栽培品种(系)间的遗传差异较大,表现出较远的亲缘关系,而栽培品种(系)间的遗传差异相对较小,表现出较近的亲缘关系。 展开更多
关键词 枸杞 相关序列扩增多态性(SRAP) 聚类分析 主坐标分析 遗传多样性
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38个石榴品种的RAPD遗传关系分析 被引量:5
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作者 马丽 马耀华 +3 位作者 郝兆祥 侯乐峰 明东风 郑珂 《北方园艺》 CAS 北大核心 2014年第9期101-105,共5页
以山东省枣庄市峄城区中国石榴种质资源圃内38个石榴品种为试材,用20条RAPD引物对其进行扩增,根据扩增结果进行UPGMA聚类分析和主坐标分析,研究了38份材料的亲缘关系。结果表明:20条RAPD引物在38份材料中共产生146个位点,多态性位... 以山东省枣庄市峄城区中国石榴种质资源圃内38个石榴品种为试材,用20条RAPD引物对其进行扩增,根据扩增结果进行UPGMA聚类分析和主坐标分析,研究了38份材料的亲缘关系。结果表明:20条RAPD引物在38份材料中共产生146个位点,多态性位点为109,多态性比率为74.6%;38个品种间遗传相似系数变化范围为0.45~1.00;在相似系数为0.58处,将38个品种可以分为四大类,得出品种间的亲缘关系与形态学和地理分布没有明显相关性;38份材料可以分为两大类,主坐标分析结果与UPGMA的聚类结果存在一定差异。 展开更多
关键词 石榴种质资源 RAPD 遗传关系 主坐标分析
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太行山北段地区荆条灌丛和三裂绣线菊灌丛群落谱系结构 被引量:3
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作者 董雷 王静 +3 位作者 刘永刚 赵志平 米湘成 郭柯 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期21-31,共11页
灌丛是太行山地区最重要的生态系统类型之一,灌丛群落生物多样性的维持及其生态系统服务功能对京津冀地区的生态安全具有重要作用。本研究选择太行山最具代表性的两种灌木群落——荆条(Vitex negundo var. heterophylla)灌丛和三裂绣线... 灌丛是太行山地区最重要的生态系统类型之一,灌丛群落生物多样性的维持及其生态系统服务功能对京津冀地区的生态安全具有重要作用。本研究选择太行山最具代表性的两种灌木群落——荆条(Vitex negundo var. heterophylla)灌丛和三裂绣线菊(Spiraea trilobata)灌丛为研究对象,利用净亲缘关系指数(net relatedness index,NRI)和多元回归等方法探究了两种灌丛群落构建机制的异同及主要的环境影响因子,同时还利用谱系结构主坐标分析(principal coordinates of phylogenetic structure,PCPS)对决定群落谱系结构的关键系统发育节点进行了探究。结果表明:两种灌丛群落内灌木植物的物种多样性没有显著差异,但谱系结构差异显著。三裂绣线菊群落表现出显著的谱系发散趋势,而荆条群落谱系聚集程度高于三裂绣线菊群落,但未表现出显著的谱系结构。三裂绣线菊灌丛群落构建的驱动机制是生态位分化,荆条灌丛中生境过滤作用有所增加,与生态位分化共同驱动其群落构建过程。与干旱胁迫相关的生境过滤因素增加是荆条灌丛群落谱系聚集程度增加的重要原因。PCPS二维排序结果表明:荆条灌丛群落谱系趋向聚集与其群落内缺乏蔷薇目、壳斗目等亲缘关系较远的类群有关,而三裂绣线菊灌丛群落内物种则包含较多的演化分支。总体而言,环境过滤不是决定太行山地区灌丛群落构建的主要驱动因素,但水分条件仍然是影响区域群落谱系结构的重要因素。 展开更多
关键词 群落构建 生态位分化 生境过滤 主坐标分析 水分限制
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苏子种质资源的遗传多样性分析 被引量:2
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作者 王姣梅 汪磊 +5 位作者 谭美莲 汪魏 王玲 尹紫艳 严兴初 王力军 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2021年第6期2048-2056,共9页
为明确苏子种质资源亲缘关系,本研究以收集的44份苏子种质资源为材料,采用SSR、AFLP和SRAP分子标记对其进行遗传多样性和聚类分析。结果表明,SSR、SRAP和AFLP引物的平均多态性分别为63.6%、85.2%和92.6%,44份种质间的遗传相似系数为0.71... 为明确苏子种质资源亲缘关系,本研究以收集的44份苏子种质资源为材料,采用SSR、AFLP和SRAP分子标记对其进行遗传多样性和聚类分析。结果表明,SSR、SRAP和AFLP引物的平均多态性分别为63.6%、85.2%和92.6%,44份种质间的遗传相似系数为0.717~0.967(平均为0.864);在遗传相似系数0.762处,44份苏子材料可分为2大类,黄陵苏子和玉泉苏子聚为第Ⅰ类,其余42份材料聚为第Ⅱ类;在相似系数0.84处,可将第二类分为4个亚类。从主成分分析二维图结果来看,44份材料分成5个组,黄陵苏子和玉泉苏子为一组,与其它几组距离较远。本研究结果说明这些苏子种质之间遗传多样性较低,但部分材料间存在较大遗传差异,其中黄陵苏子和玉泉苏子与其他42份材料亲缘关系较远。本研究综合采用了3种标记进行苏子遗传多样性的评价,可为优异种质的创新利用提供理论参考,也为后续大规模的评价鉴定提供依据。 展开更多
关键词 苏子(Perilla frutescens) 种质资源 聚类分析 主成分分析 遗传多样性
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蓖麻种质遗传多样性的SRAP分析 被引量:2
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作者 谭美莲 严明芳 +2 位作者 汪磊 王力军 严兴初 《内蒙古民族大学学报(自然科学版)》 2012年第5期533-540,共8页
蓖麻(Ricinus communis L.)是一种重要的工业油源作物,具有多种经济价值.为了解蓖麻的遗传多样性,本研究对50份蓖麻种质的遗传多样性进行SRAP分析.结果表明50份种质之间多态性低,其多态条带比率、平均基因多样性和每对引物的多态性带,... 蓖麻(Ricinus communis L.)是一种重要的工业油源作物,具有多种经济价值.为了解蓖麻的遗传多样性,本研究对50份蓖麻种质的遗传多样性进行SRAP分析.结果表明50份种质之间多态性低,其多态条带比率、平均基因多样性和每对引物的多态性带,分别为29.97%、0.0904和5.41,遗传相似系数介于0.6469至0.9739之间,香农指数为0.1379;华北种质群比其它种质群的遗传变异相对丰富,而华南种质群的各种质则紧密地聚在一起.采用不加权算术平均组对法(UPGMA)将50份种质分为三大类群,与二维主成分分析(PCA)的结果相一致,一些来自相同地区的种质紧密聚在一起,表现出一定的地域性;7个种质群分别聚为两大类群. 展开更多
关键词 蓖麻 聚类分析 遗传多样性 种质 主成分分析 SRAP
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辽宁老秃顶子保护区种子植物区系及与其他山地的关系 被引量:2
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作者 季长波 刘卓 《辽东学院学报(自然科学版)》 CAS 2016年第1期21-26,共6页
通过外业调查,利用植物区系谱、聚类模型、排序分析和最小生成树等方法,对辽宁老秃顶子植物区系地理组成及与其他山地植物区系的相似性进行了定量分析,揭示了多山地植物区系的分布特点及相似关系。结果表明:辽宁老秃顶子自然保护区植物... 通过外业调查,利用植物区系谱、聚类模型、排序分析和最小生成树等方法,对辽宁老秃顶子植物区系地理组成及与其他山地植物区系的相似性进行了定量分析,揭示了多山地植物区系的分布特点及相似关系。结果表明:辽宁老秃顶子自然保护区植物种类组成丰富,共有野生维管植物120科432属1 066种。被子植物占物种总数量的97.64%,其中双子叶植物占82.31%;植物属的地理成分丰富多样,以温带性质为主,共有282属,占总属数的81.97%,处于中国-日本森林植物亚区从暖温带-温带过度范围内,认为植物区系总体划归于华北植物区系平原山地亚地区较为合理。17个南北代表山地植物区系可以划分为4个集合,老秃顶子种子植物属的分布区类型与凤凰山、仙人洞、医巫闾山和东灵山有着较大的相似关系,反映了纬度等包含的水热因子可能是影响植物地理分布的重要因素。 展开更多
关键词 植物区系 相似关系 主坐标分析 老秃顶子 辽宁
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古全浊声母今读的聚类分析和主坐标分析 被引量:1
14
作者 项梦冰 《云南民族大学学报(哲学社会科学版)》 CSSCI 北大核心 2016年第3期114-122,共9页
以26个汉语方言点古全浊声母的今读为样品,用NTSYS进行聚类分析和主坐标分析,并讨论相关的问题。结论是:(1)聚类分析结果不一定能直接作为一种合理的分类方案;(2)古全浊声母演变的特定方式跟大方言之间不存在一对一的关系;(3)汉语方言... 以26个汉语方言点古全浊声母的今读为样品,用NTSYS进行聚类分析和主坐标分析,并讨论相关的问题。结论是:(1)聚类分析结果不一定能直接作为一种合理的分类方案;(2)古全浊声母演变的特定方式跟大方言之间不存在一对一的关系;(3)汉语方言基本特征库建设的困难主要在于转写特征时如何保证足够的专家干预以及设计特征时如何把表面相似现象分开。 展开更多
关键词 汉语方言 古全浊声母的今读 NTSYS 聚类分析 主坐标分析
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富营养化城市湖泊武汉东湖沉积物微生物群体结构及空间变化研究(英文) 被引量:6
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作者 杨江科 程占冰 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期943-955,共13页
【目的】城市湖泊沉积物中的微生物群体是富营养环境生物修复的重要因素。本研究拟对中型富营养化湖泊——武汉东湖沉积物细菌群体结构及空间变化规律进行研究。加深对富营养湖泊微生物群体结构的理解,并为城市湖泊的保护和污染控制提... 【目的】城市湖泊沉积物中的微生物群体是富营养环境生物修复的重要因素。本研究拟对中型富营养化湖泊——武汉东湖沉积物细菌群体结构及空间变化规律进行研究。加深对富营养湖泊微生物群体结构的理解,并为城市湖泊的保护和污染控制提供参考。【方法】采用16S r RNA基因RFLP分析和序列分析技术获得细菌群体系统发育信息。采用PCoA法分析武汉东湖沉积物细菌群体内以及与其它湖泊沉积物细菌群体间的相似性。采用CCA法分析环境因素对细菌群体的影响。【结果】武汉东湖沉积物细菌群体包含13个门和2个未知种群。PCoA分析进一步表明来自东湖3个子湖的细菌群体与其它地域富营养化湖泊的微生物种群结构相似,并区别于重度富营养化子湖庙湖的细菌群体。在庙湖中,我们发现了Thermogymnomonas类古菌的含量显著偏高。CCA分析表明细菌的分布与沉积物中碳、氮和磷元素的含量显著相关。【结论】本研究进一步确证了环境因素对细菌群体组成和分布的调节作用,加深了对富营养水体微生物群体结构的理解,并为城市湖泊的保护和污染控制提供了参考。 展开更多
关键词 富营养湖泊 群体结构 空间变化 PCoA CCA
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BAF中不同高度海绵铁填料表面物种多样性分析 被引量:5
16
作者 万琼 吴仪 +4 位作者 王信 吴英海 魏东洋 贺涛 姜琦 《环境工程技术学报》 CAS 2018年第2期161-168,共8页
主要通过目的片段的聚合酶链式反应(polymeraes chain reaction,PCR)扩增、Illumina高通量测序以及生物信息分析对曝气生物滤池(BAF)反应器中不同高度的海绵铁填料表面微生物丰度和多样性进行分析和研究。结果表明:Ctrl(原水样)以及反... 主要通过目的片段的聚合酶链式反应(polymeraes chain reaction,PCR)扩增、Illumina高通量测序以及生物信息分析对曝气生物滤池(BAF)反应器中不同高度的海绵铁填料表面微生物丰度和多样性进行分析和研究。结果表明:Ctrl(原水样)以及反应器中优势种群均以变形菌门(Proteobacteria)为主,拟杆菌(Bacteroidetes)次之;等级丰度分布(Rank-Abundance)曲线中Ctrl物种数量为1 193,DO1(BAF上部水样)为2 389,DO2(BAF中部水样)为2 211,DO3(BAF下部水样)为1 890,DO1的丰度和生物多样性最高,随着DO浓度的降低(或填料空间位置的下降),微生物群落丰度和多样性均逐渐下降;Chao1指数比观察到的物种(observed species)指数对物种的丰度更加敏感,测得的OTUs(operational taxonomic units)数均高出400;DO1和DO2的物种均匀度较高,DO3和Ctrl的优势菌群所占比例很高,均匀度较低。通过PCo A(principal co-ordinates analysis)可以观察到DO1和DO2的物种组成最为相似。 展开更多
关键词 海绵铁 物种多样性 高通量测序 OTUs聚类 Chao1指数 Shannon指数 等级丰度分布 PCoA
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西南地区普通小麦1BL/1RS易位系的DArT分子标记鉴定 被引量:2
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作者 张立异 王伟 +4 位作者 刘冬成 孙家柱 阳文龙 何庆才 张爱民 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期832-838,共7页
为了准确了解小麦品系中1BL/1RS易位系的存在,利用7 000多个DArT分子标记(Diversityarrays technology,多样性微阵列技术)对87个普通小麦品系进行扫描,总共获得1 750个稳定的多样性的分子标记(P>80)。这些标记的多态性信息含量指数(P... 为了准确了解小麦品系中1BL/1RS易位系的存在,利用7 000多个DArT分子标记(Diversityarrays technology,多样性微阵列技术)对87个普通小麦品系进行扫描,总共获得1 750个稳定的多样性的分子标记(P>80)。这些标记的多态性信息含量指数(PIC)的范围是0.03~0.5,平均值为0.35(P>80)。根据DArT标记的可整合性,利用1B染色体上的DArT数据进行主坐标分析(Principal-Coordinates Analysis,PCoA),可以把实验材料划分为两个群,并且确定一个群是由1BL/1RS易位系组成,另一个群由非1BL/1RS易位系组成。同时,利用非加权组平均法(Unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA)进行聚类分析,调查了材料之间的遗传关系,结果显示,实验材料同样聚集为两个群,一个群由1BL/1RS易位系组成,包含两个亚群;另一个群由非易位系组成,包含六个亚群。研究证实,DArT标记不仅可以调查小麦全基因组的遗传多样性,而且利用它的可整合性能够准确鉴定研究材料中的1BL/1RS易位系。 展开更多
关键词 普通小麦 DArT(Diversity ARRAY Technology)标记 1BL/1RS易位系 主坐标分析(PCoA principal-coordinates analysis)
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样本量不一致时的β多样性计算 被引量:1
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作者 邹怡 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期790-797,共8页
度量样方间物种组成的差异,即β多样性,是生态学研究中的常用手段。在开展生态学研究的过程中,不同样方获取的样本量通常不同。使用物种稀疏曲线可以计算不同样本量的α多样性,但常用的β多样性指数的计算却没有考虑样本量的差异。本文... 度量样方间物种组成的差异,即β多样性,是生态学研究中的常用手段。在开展生态学研究的过程中,不同样方获取的样本量通常不同。使用物种稀疏曲线可以计算不同样本量的α多样性,但常用的β多样性指数的计算却没有考虑样本量的差异。本文主要介绍了从稀疏曲线演化而来的可以计算不同样本量的β多样性指数——预期共享物种数(expected species shared,ESS)及其标准化后的指数,其中详细介绍了弦标准化的预期共享物种数(chord-normalized expected species shared,CNESS)。利用真实采集的数据集,本文演示了在不同样本参数m下,CNESS经过主坐标分析(principalcoordinatesanalysis,PCo A)的二维排序结果,并比较了样本量变化后,CNESS与基于多度的Chao-Jaccard相异性指数之间的差异。模拟结果表明,CNESS指数与Chao-Jaccard指数的PCoA结果具有相关性,该相关性不随m值的变化而变化。CNESS指数较Chao-Jaccard指数具有更多优势,通过调节样本参数m,CNESS的结果可以分析优势种或者稀有种的物种组成差异,同时CNESS指数对样本量不敏感。ESS系列相异指数是基于物种多度的计算,适用于样本量不一致时的β多样性研究,建议在开展昆虫等无脊椎动物的生态学研究中使用此指数。为了更加准确地获得样方之间的物种组成差异,在数据分析的过程中应选取不同大小的m值计算CNESS。然而,由于样本量小于特定m值的样方会在计算中被剔除,因此,在实际的取样工作中,每个样方都应该尽量采集到足够多的个体,才能保证在m值足够大的时候也不丢失样方信息。 展开更多
关键词 beta多样性 CNESS 主坐标分析(PCoA) 相异矩阵 昆虫 群落生态学
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北京市延庆采砂迹地型湿地植被群落分类与演替分析
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作者 赵欣胜 崔丽娟 +3 位作者 李伟 张曼胤 王义飞 李胜男 《生态科学》 CSCD 2011年第5期518-524,共7页
采用TWISPAN分析方法,对北京市延庆采矿迹地湿地40个样地51种植物进行了分类排序,将群落类型划分为7个类型,即茵陈蒿-狗尾草-黄花蒿群落、野艾蒿-茵陈蒿-尖叶胡枝子-狗尾草群落、野艾蒿-茵陈蒿-狗尾草-野大豆-苣荬菜群落、狗尾草-苍耳-... 采用TWISPAN分析方法,对北京市延庆采矿迹地湿地40个样地51种植物进行了分类排序,将群落类型划分为7个类型,即茵陈蒿-狗尾草-黄花蒿群落、野艾蒿-茵陈蒿-尖叶胡枝子-狗尾草群落、野艾蒿-茵陈蒿-狗尾草-野大豆-苣荬菜群落、狗尾草-苍耳-黄香草木犀-虎尾草群落、狼拔草-野艾蒿-旋覆花-大籽蒿-芦苇群落、香蒲-芦苇-茭白-野大豆-鬼针草群落和竹节灯心草-褐穗莎草-稗群落;同时运用双变量主坐标分析(DPCoA)对51种植物进行了排序分析,研究结果显示研究区存在两种演替规律,即由喜湿旱生耐淹水植物演替为喜旱旱生植物和由湿地挺水植物向湿生植物演替两种类型。对于采砂基地型湿地植被恢复不仅恢复土壤营养条件,调控湿地水分条件也是十分关键的。研究结论将为采砂迹地型湿地恢复提供科学支持。 展开更多
关键词 植物群落 双变量主坐标分析 群落演替 湿地
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栽培萝卜种质亲缘关系的AFLP分析 被引量:26
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作者 孔秋生 李锡香 +2 位作者 向长萍 邱杨 沈镝 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期1017-1023,共7页
利用筛选出的8对引物对56份来源于不同国家和地区的栽培萝卜种质的亲缘关系进行了AFLP分析,共扩增出327条带,其中多态性带128条,多态性位点百分率39.1%,显示出栽培萝卜种质之间存在着较丰富的遗传多样性。系统聚类分析将供试材料分为5类... 利用筛选出的8对引物对56份来源于不同国家和地区的栽培萝卜种质的亲缘关系进行了AFLP分析,共扩增出327条带,其中多态性带128条,多态性位点百分率39.1%,显示出栽培萝卜种质之间存在着较丰富的遗传多样性。系统聚类分析将供试材料分为5类9组,主坐标分析将其分为4类7组,2种分类方法所获结果基本一致。基于分子标记的分类与种质的表型基本吻合。 展开更多
关键词 萝卜 种质资源 亲缘关系 AFLP 聚类分析 主坐标分析
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