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用于“野生小家鼠来源一号染色体替换系”构建的PCR-LDR分型系统 被引量:8
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作者 晁天柱 陈国强 +3 位作者 赵莹 李凯 周宇荀 肖君华 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 2011年第5期372-376,共5页
目的建立用于"野生小家鼠来源一号染色体替换系"构建的PCR-LDR(polymerase chain reactionand ligase detection reaction,PCR-LDR)分型系统。方法采用易于判断的二元性遗传标记单核苷酸多态性位点(single nuclear polymorphi... 目的建立用于"野生小家鼠来源一号染色体替换系"构建的PCR-LDR(polymerase chain reactionand ligase detection reaction,PCR-LDR)分型系统。方法采用易于判断的二元性遗传标记单核苷酸多态性位点(single nuclear polymorphism point,SNP),应用连接酶检测技术(ligase detection reaction,LDR),建立PCR-LDR分型方案。结果三组多重PCR-LDR分型方案适用于覆盖整条一号染色体的29个SNP遗传位标的分型,位点间平均遗传距离在6.25厘摩(centimorgan,cM)。结论实现了后代小鼠快速、高通量的基因分型,可准确检测1号染色体各区段的重组事件。 展开更多
关键词 野生小家鼠来源的一号染色体替换系 pcr-ldr分型系统 重组
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小鼠冷冻胚胎和精子SNP遗传鉴定方法的建立 被引量:3
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作者 徐伟 晁天柱 +2 位作者 刘丽均 李凯 肖君华 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期169-174,共6页
目的建立小鼠冷冻胚胎和精子SNP(single nucleotide polymorphism)分型方法,用于冷冻胚胎和精子快速遗传鉴定方案。方法以中科院上海实验动物中心(国家啮齿类实验动物种子中心上海分中心)提供的小鼠冷冻胚胎和精子为样本,采用全基因组... 目的建立小鼠冷冻胚胎和精子SNP(single nucleotide polymorphism)分型方法,用于冷冻胚胎和精子快速遗传鉴定方案。方法以中科院上海实验动物中心(国家啮齿类实验动物种子中心上海分中心)提供的小鼠冷冻胚胎和精子为样本,采用全基因组扩增技术和PCR-LDR分型技术建立小鼠冷冻物SNP遗传鉴定方法。结果全基因组扩增技术能大幅度增加冷冻胚胎样本的DNA总量;PCR-LDR分型方法适用于小鼠全基因组45个SNPs的分型;分型确定C57BL/6,BALB/c,FVB/NJ等胚胎和精子各10种近交系,SNP位点信息与测序结果一致;小鼠冷冻胚胎个数与SNPs检出个数成正比,当胚胎数达到12以上时SNP检出率100%。结论实现近交系小鼠冷冻胚胎和精子快速SNP基因分型及遗传质量鉴定。 展开更多
关键词 小鼠 冷冻胚胎和精子 全基因组扩增 pcr-ldr分型 SNP遗传鉴定
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Identification of Susceptibility Genes Loci Associated with Type 2 Diabetes 被引量:1
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作者 LIU Lifei LEI Jingjing +7 位作者 LIU Haiyun ZOU Qinjie SUN Yuhua XU Yancheng BI Huimin DENG Fengjiao SHAO Xueling LIU Siyang 《Wuhan University Journal of Natural Sciences》 CAS 2010年第2期171-175,共5页
In this study, we selected 10 susceptible SNPs loci to investigate their contribution to susceptibility to type 2 diabetes in Hart Chinese among Hubei population. We genotyped SNPs rs5219, rs1801282, rs1470579, rs1111... In this study, we selected 10 susceptible SNPs loci to investigate their contribution to susceptibility to type 2 diabetes in Hart Chinese among Hubei population. We genotyped SNPs rs5219, rs1801282, rs1470579, rs1111875, rs1081661, rs7754840, rs4506565, rs13266634, rs4402960, and rs5643981 by using the method of polymerase chain reaction-ligase detection reaction (PCR-LDR). In a case-control study, we have genotyped the 10 candidate susceptibility SNP loci, and here, we reported that the SNP rs5219 in KCNJII was strongly associated with type 2 diabetes in Han Chinese in Hubei China There were significant differences in the TT genotype frequency (OR=1.6, 95%CI 1.1-2.3, p=0.01) and T allele frequency (OR=l.3, 95%C1 1.1-1.6, p-0.03) of SNP rs5219 between cases and controls. The other nine SNP loci did not show significant association with type 2 diabetes in Han Chinese in Hubei. The result suggests that KCNJ11 gene is a susceptibility gene of type 2 diabetes among this population. 展开更多
关键词 type 2 diabetes susceptibility gene single nucleotide polymorphism polymerase chain reaction-ligase detection reaction pcr-ldr
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