-
题名菠萝杆状DNA病毒的全基因组序列测定及分析
被引量：2
- 1
-
-
作者
吴丽婷
阮小蕾
沈文锦
谭小勇
翟国会
李华平
-
机构
华南农业大学植物病毒研究室
-
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第9期1969-1976,共8页
-
基金
国家公益性行业(农业)科研专项(nyhyzx07-30)
-
文摘
【目的】证明中国湛江地区菠萝上是否存在菠萝杆状DNA病毒(Pineapple bacilliform comosus virus,PBCoV),并获得PBCoV的基因组全序列,分析该病毒与其它Badnavirus病毒分离物间的分子差异。【方法】设计特异引物,通过反向PCR及分段克隆两种方法扩增PBCoV,克隆后测序获得PBCoV基因组全序列,利用不同生物学软件进行序列分析。【结果】PBCoV基因组为环状结构,全长7543bp;含有3个典型的ORFs,推测其编码蛋白的分子量分别为20.4、14.0和217.6kD。其基因组与GenBank登录的PBCoV ORF3部分核苷酸序列同源性87%-97%,其ORF3编码的氨基酸序列与已报道的Badnavirus病毒ORF3氨基酸序列间一致率小于50.8%。Southern blot分析显示该病毒基因组能整合到植物基因组中。【结论】在中国湛江地区菠萝上存在PBCoV,该病毒属于Badnavirus属病毒,与香蕉线条病毒(Banana streak virus)Mys分离物(BSV-Mys)亲缘关系最近。这是PBCoV基因组全序列的首次报道。
-
关键词
菠萝
菠萝杆状DNA病毒
杆状DNA病毒属
全序列
-
Keywords
pineapple
pineapple bacilliform comosus virus
Badnavirus
complete sequence
-
分类号
S436.68
[农业科学—农业昆虫与害虫防治]
-
