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深度学习在植物表型研究中的应用现状与展望 被引量:44
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作者 岑海燕 朱月明 +5 位作者 孙大伟 翟莉 万亮 麻志宏 刘子毅 何勇 《农业工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第9期1-16,共16页
精确测量植物表型是深入分析表型-基因-环境互作关系,了解植物生理过程的前提和基础,也是培育良种和提升现代农业生产精准管控的关键。伴随高通量植物表型测量与分析技术的不断发展,以深度学习为代表的人工智能方法在植物表型研究与应... 精确测量植物表型是深入分析表型-基因-环境互作关系,了解植物生理过程的前提和基础,也是培育良种和提升现代农业生产精准管控的关键。伴随高通量植物表型测量与分析技术的不断发展,以深度学习为代表的人工智能方法在植物表型研究与应用中取得了一系列重要进展。为系统阐述相关研究最新成果和热点问题,该研究首先概述了植物表型与深度学习方法的背景;随后从植物识别与分类、胁迫分析、产量预测、面向精准育种和精准管理的表型分析等方面综述了深度学习在植物表型交叉研究的进展;最后提出了未来深度学习和植物表型交叉融合研究与应用中亟需解决的问题,并展望了植物表型研究智能化的发展前景。 展开更多
关键词 植物 表型 管理 深度学习 识别与分类 作物育种
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棉花黄萎病菌T-DNA插入突变体表型特征和侧翼序列分析 被引量:34
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作者 徐荣旗 汪佳妮 +1 位作者 陈捷胤 戴小枫 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期489-496,共8页
【目的】为鉴定棉花黄萎病菌随机插入突变体的表型特征,构建黄萎病菌遗传转化和功能基因研究的技术平台。【方法】采用农杆菌介导的T-DNA插入和高效TAIL-PCR方法。【结果】获得了2628个棉花黄萎病菌VD991的T-DNA随机插入的突变体和15个... 【目的】为鉴定棉花黄萎病菌随机插入突变体的表型特征,构建黄萎病菌遗传转化和功能基因研究的技术平台。【方法】采用农杆菌介导的T-DNA插入和高效TAIL-PCR方法。【结果】获得了2628个棉花黄萎病菌VD991的T-DNA随机插入的突变体和15个突变体插入位点的侧翼序列。部分突变体的表型特征和插入位点侧翼序列分析表明,①突变体的菌落形态分为菌丝型、菌核型和中间型3类,菌核型约占7.3%;②在摇瓶培养条件下,突变体产孢高峰在接种后第5—6天,菌核型突变体的产孢能力普遍高于菌丝型;③棉花黄萎病菌VD991可以产生胞外蛋白酶、淀粉酶、纤维素酶和果胶酶。筛选获得蛋白酶分泌缺失的突变体3个,淀粉酶分泌缺失的突变体1个,果胶酶分泌降低的突变体6个;④菌核型突变体的致病力普遍高于野生型。获得了6个致病力减弱的突变体;⑤突变体侧翼序列与同种的大丽轮枝菌菌株VDLs.17基因组的序列一致性在95%—100%之间,与不同种的黑白轮枝菌VaMs.102序列的一致性为87%—94%。【结论】农杆菌介导的T-DNA随机插入可用于棉花黄萎病菌突变体的构建,突变体微菌核的产生与其产孢能力、致病性存在相关关系。美国大丽轮枝菌菌株VDLs.17基因组可用作黄萎病菌VD991功能基因研究的参考序列。 展开更多
关键词 黄萎病菌 T-DNA插入 表型鉴定 侧翼序列分析
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应用动物行为学与动物福利 被引量:25
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作者 包军 《家畜生态》 1997年第2期38-44,共7页
应用动物行为学与动物福利包军(东北农业大学动物科学系哈尔滨150030)1介绍“动物科学的新领域一动物福利学说”一文(包军,1996)阐述了动物康乐与动物福利的关系。由于康乐反应了动物与环境之间的协调状态,它必然与动... 应用动物行为学与动物福利包军(东北农业大学动物科学系哈尔滨150030)1介绍“动物科学的新领域一动物福利学说”一文(包军,1996)阐述了动物康乐与动物福利的关系。由于康乐反应了动物与环境之间的协调状态,它必然与动物的感受(feelings)有关,... 展开更多
关键词 行为学 动物福利
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辽宁地区水稻资源抗稻瘟病基因的检测分析 被引量:21
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作者 王丽丽 赵家铭 +2 位作者 马作斌 郑文静 马殿荣 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期325-339,共15页
为了明确辽宁地区水稻资源中抗稻瘟病基因的分布情况及抗病效应,选取辽宁地区水稻资源176份,鉴定了抗稻瘟病基因pi21、Pi36、Pi37、Pita、Pid2、Pid3、Pi5及Pib在这些材料中的分布情况,并接种鉴定了这些材料对稻瘟病的抗性。结果表明:17... 为了明确辽宁地区水稻资源中抗稻瘟病基因的分布情况及抗病效应,选取辽宁地区水稻资源176份,鉴定了抗稻瘟病基因pi21、Pi36、Pi37、Pita、Pid2、Pid3、Pi5及Pib在这些材料中的分布情况,并接种鉴定了这些材料对稻瘟病的抗性。结果表明:176份供试材料中,83份对稻瘟病表现抗病,栽培稻、杂草稻及农家种中抗病品种所占的比率分别为41.48%、1.14%及4.54%。抗稻瘟病基因pi21、Pi36和Pi37在所有参试材料中均未检测到,且分别有74份、49份、47份、52份及89份材料携带Pita、Pid2、Pid3、Pi5及Pib的抗病等位基因。抗病基因绝大部分分布在栽培种中,农家种和杂草稻中分布较少。不含有抗稻瘟病基因和只携带单个抗病基因的材料对稻瘟病的抗性均较差,而抗病基因聚合可不同程度提高材料的抗性。经检测,不含有本试验鉴定的pi21等8个已克隆抗病基因的材料共32份,其中表现抗病的占21.87%;只携带1个抗稻瘟病基因的材料为52份,表现抗病的占17.31%;携带2个抗稻瘟病基因的材料为39份,表现抗病的占69.23%,其中以携带Pita+Pi5的材料最多(14份),且均表现抗病;携带3个抗稻瘟病基因的材料为31份,表现抗病的占77.42%,以携带Pita+Pid3+Pi5的材料抗性最强;携带4个抗稻瘟病基因的水稻材料22份,表现抗病的占72.73%,携带5个抗病基因的水稻材料未检测到。 展开更多
关键词 水稻品种 稻瘟病 表型鉴定 基因型鉴定 基因聚合
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青海省马铃薯黑胫病病原菌的鉴定 被引量:13
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作者 王信 程亮 +2 位作者 王亚艺 高旭升 李松龄 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第8期1369-1375,共7页
为明确引起青海省马铃薯黑胫病的病原菌,从青海省不同地区马铃薯黑胫病病样分离病原菌,研究病原菌的形态学特征、致病性、生理生化特性,并结合16S r RNA序列进行病原学鉴定。结果表明:引起马铃薯黑胫病的5个菌株均为黒腐果胶杆菌(Pectob... 为明确引起青海省马铃薯黑胫病的病原菌,从青海省不同地区马铃薯黑胫病病样分离病原菌,研究病原菌的形态学特征、致病性、生理生化特性,并结合16S r RNA序列进行病原学鉴定。结果表明:引起马铃薯黑胫病的5个菌株均为黒腐果胶杆菌(Pectobacterium atrosepticum),来源不同的菌株接种马铃薯后致病力有差异;其中,3株强致病力菌株主要来自于乐都、湟中和大通,2株中等致病力菌株来自于民和和湟源。综上,黒腐果胶杆菌是引起青海省马铃薯黑胫病的病原菌。 展开更多
关键词 马铃薯 黒腐果胶杆菌 表型鉴定 分子鉴定 致病力
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醋栗番茄Solanum pimpinellifolium遗传多样性分析 被引量:13
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作者 冯晶晶 刘磊 +6 位作者 郑峥 邓学斌 刘希艳 白金瑞 舒金帅 宋燕 李君明 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期611-619,628,共10页
野生种醋栗番茄包含丰富的变异,具有众多优良性状。本研究对从世界不同地区收集的433份醋栗番茄遗传资源进行了表型鉴定及遗传多样性分析。表型鉴定结果表明,在收集的433份醋栗番茄中约有14%为樱桃番茄,370份典型醋栗番茄中约22%的材料... 野生种醋栗番茄包含丰富的变异,具有众多优良性状。本研究对从世界不同地区收集的433份醋栗番茄遗传资源进行了表型鉴定及遗传多样性分析。表型鉴定结果表明,在收集的433份醋栗番茄中约有14%为樱桃番茄,370份典型醋栗番茄中约22%的材料存在不同程度的分离。群体变异分析表明,不同性状间变异系数存在较大差异,其中柱头变异系数最大,为56.716%;花瓣数遗传稳定,变异系数最小,为2.082%;相关分析表明,多个性状间存在显著相关性;利用表型和基因型数据聚类均将醋栗番茄群体划分为两大类群;主成分分析表明,坐果率、单果重、可溶性固形物对变异的贡献率较大。研究结果将为利用醋栗番茄进行栽培种番茄遗传改良奠定一定的基础。 展开更多
关键词 醋栗番茄 表型 鉴定 遗传多样性
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基质辅助激光解析离子-飞行时间质谱仪在快速鉴定凝固酶阴性葡萄球菌中的应用 被引量:8
7
作者 黄声雷 胡必杰 +1 位作者 周春妹 马坚 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期1986-1987,1990,共3页
目的评价基质辅助激光解析离子-飞行时间质谱仪(MALDI-TOF-MS,MS)在临床分离凝固酶阴性葡萄球菌(CNS)快速鉴定中的应用。方法收集复旦大学附属中山医院2012年7月-2013年1月分离自血液的194株CNS;分别使用MS和全自动细菌鉴定系统(细菌鉴... 目的评价基质辅助激光解析离子-飞行时间质谱仪(MALDI-TOF-MS,MS)在临床分离凝固酶阴性葡萄球菌(CNS)快速鉴定中的应用。方法收集复旦大学附属中山医院2012年7月-2013年1月分离自血液的194株CNS;分别使用MS和全自动细菌鉴定系统(细菌鉴定仪)鉴定到种,当两种方法结果不一致时使用16SrRNA测序方法进行确认,比较两种鉴定方法的符合率及准确性,评价MS使用价值。结果 194株CNS中148株两种方法鉴定结果一致,符合率76.3%,以16SrRNA方法为金标准,MS和细菌鉴定仪与16SrRNA的结果假定符合率分别为98.9%和76.3%,两种方法准确性差异有统计学意义(P<0.001)。结论 MS用于鉴定CNS比传统方法快速、准确和价廉。 展开更多
关键词 凝固酶阴性葡萄球菌 基质辅助激光解析离子-飞行时间质谱仪 表型鉴定 快速鉴定
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现代微生物鉴定技术在药品质量控制中的应用研究进展 被引量:7
8
作者 李辉 余萌 +2 位作者 刘立科 马仕洪 绳金房 《中国医药工业杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期312-319,共8页
本文通过比较近年来报道的药品微生物鉴定文献,从表型鉴定和基因型鉴定两方面阐述各种技术的优势和缺陷。结果显示,文献重点研究的种群包括葡萄球菌属、伯克霍尔德菌属、肠杆菌属和芽孢杆菌属等:约65%的研究报道采用2种及以上鉴定技术,... 本文通过比较近年来报道的药品微生物鉴定文献,从表型鉴定和基因型鉴定两方面阐述各种技术的优势和缺陷。结果显示,文献重点研究的种群包括葡萄球菌属、伯克霍尔德菌属、肠杆菌属和芽孢杆菌属等:约65%的研究报道采用2种及以上鉴定技术,表型鉴定中生化鉴定系统VITEK的应用较广泛,基因型鉴定中16S核糖体RNA(16S ribosomal RNA,16SrRNA)核酸测序的应用较广泛:鉴定技术在环境菌库建设方面的应用研究较多。实践中,应针对药品微生物控制和鉴定需求,合理选择不同原理的鉴定技术,形成各自实验室独特的多相鉴定方案,以提高药品质量控制水平。 展开更多
关键词 微生物鉴定 微生物污染 鉴定技术 表型鉴定 基因型鉴定
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籽瓜种质资源表型性状鉴定及遗传多样性分析 被引量:3
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作者 周远航 鲁伟丹 +6 位作者 马小龙 高江龙 樊晓琴 郭建富 陈友强 林明 石书兵 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期119-132,共14页
为探究籽瓜种质资源的多样性,深度挖掘籽瓜优异种质应用潜力,采用相关性、主成分与聚类分析方法对100份籽瓜种质资源的21个农艺性状进行表型鉴定及遗传多样性分析。结果表明:籽瓜种质资源遗传多样性丰富,7个质量性状的多样性指数范围为0... 为探究籽瓜种质资源的多样性,深度挖掘籽瓜优异种质应用潜力,采用相关性、主成分与聚类分析方法对100份籽瓜种质资源的21个农艺性状进行表型鉴定及遗传多样性分析。结果表明:籽瓜种质资源遗传多样性丰富,7个质量性状的多样性指数范围为0.53~1.65,14个数量性状变异系数为10.41%~35.56%,各表型性状间具有遗传相关性。以欧氏距离为遗传距离进行聚类分析,可将100份籽瓜种质资源聚为5大类群,其中第Ⅴ类群具有高产特性,可作为育种亲本材料。主成分分析提取前7个主成分,其成分累计贡献率达到了74.185%,可以作为籽瓜种质资源主要评价指标;籽瓜种质资源的综合得分范围为-2.78~2.86,依据综合得分排序,筛选出了3份优异籽瓜种质资源材料。本研究从多角度系统评价籽瓜种质资源遗传多样性,可为后续籽瓜种质资源高效利用及遗传育种提供科学依据。 展开更多
关键词 籽瓜 种质资源 表型鉴定 遗传多样性 综合评价
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玉米籽粒发育突变体emp35的表型分析与基因定位
10
作者 刘津 汤艳芳 +1 位作者 杜何为 张祖新 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期85-92,共8页
为解析玉米籽粒形成的遗传基础,探究Emp35基因在玉米籽粒发育中的作用,对籽粒缺陷突变体empty pericarp35(emp35)进行表型鉴定、胚乳细胞显微观察、胚乳贮藏物质含量测定及图位克隆。结果显示:突变体籽粒发育缓慢,明显小于同期发育的正... 为解析玉米籽粒形成的遗传基础,探究Emp35基因在玉米籽粒发育中的作用,对籽粒缺陷突变体empty pericarp35(emp35)进行表型鉴定、胚乳细胞显微观察、胚乳贮藏物质含量测定及图位克隆。结果显示:突变体籽粒发育缓慢,明显小于同期发育的正常籽粒,成熟籽粒干瘪呈空皮状;胚乳细胞显微观察发现emp35的胚和胚乳发育严重滞后,胚乳细胞中线粒体结构异常;淀粉和蛋白质积累减少;F_(2)代分离果穗上正常籽粒与发育缺陷籽粒呈3∶1分离,表明籽粒缺陷表型由单个隐性核基因突变所致。采用集团分离分析法(bulked segregant analysis,BSA)将Emp35定位于第8染色体127.90~163.36 Mb区间,在该区间内开发了4个InDel标记,连锁作图将Emp35精细定位于139571117~146176858区间。 展开更多
关键词 玉米(Zea mays L.) 籽粒发育 集团分离分析法 基因定位 表型鉴定
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绵羊和山羊肉用性能表型鉴定研究现状与展望 被引量:2
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作者 李忠慧 刘晨曦 +6 位作者 马为红 邓凯平 陈善元 连正兴 张文广 刘志红 李文蓉 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2023年第7期989-1001,共13页
肉用性能表型特征直接决定了羊肉的产量和品质,肉用相关性状鉴定技术的进步有助于挖掘优异肉羊种质资源,培育优良肉羊品种,促进肉羊遗传改良.目前,肉用性能表型鉴定方法多以人工测量方式为主,存在耗时、费力、低通量等不足.随着机器视... 肉用性能表型特征直接决定了羊肉的产量和品质,肉用相关性状鉴定技术的进步有助于挖掘优异肉羊种质资源,培育优良肉羊品种,促进肉羊遗传改良.目前,肉用性能表型鉴定方法多以人工测量方式为主,存在耗时、费力、低通量等不足.随着机器视觉、光谱成像、人工智能等前沿技术的进步,肉用性能表型鉴定方法已向非接触式自动测量模式转变,逐渐实现了表型高通量精准鉴定.同时,数据信息量大、图像算法处理复杂等问题成为智能表型鉴定方法的重要挑战.本文主要介绍了羊肉用性能表型鉴定内容以及表型鉴定方法现状,以期为合理选用羊肉用性能表型鉴定方法提供参考. 展开更多
关键词 绵羊和山羊 肉用性能 表型鉴定 测量方法
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蔬菜作物盐胁迫响应及耐盐机制研究进展
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作者 陈嵘峰 屠静韵 +1 位作者 许学文 陈学好 《中国蔬菜》 北大核心 2024年第4期23-33,共11页
近年来,由于不合理的灌溉及其他环境因素,土壤盐渍化问题日趋严重,盐胁迫严重影响蔬菜作物生长、发育和产量,限制土地利用。盐胁迫主要改变蔬菜作物的净光合生产率、呼吸作用、细胞膜结构和各类酶活性。本文综述了盐胁迫对蔬菜作物表观... 近年来,由于不合理的灌溉及其他环境因素,土壤盐渍化问题日趋严重,盐胁迫严重影响蔬菜作物生长、发育和产量,限制土地利用。盐胁迫主要改变蔬菜作物的净光合生产率、呼吸作用、细胞膜结构和各类酶活性。本文综述了盐胁迫对蔬菜作物表观形态的改变和植物内部生理生化指标的影响,阐述了蔬菜对盐胁迫的生理响应(包括渗透调节、离子区域化、抗氧化代谢)和分子调控(包括转录因子、离子平衡调控基因、抗氧化基因、小RNA)机制;总结了各类蔬菜耐盐性的鉴定方法;展望了蔬菜作物耐盐性的研究方向。 展开更多
关键词 蔬菜作物 盐胁迫 耐盐机制 表型鉴定
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基于Micro-CT的玉米籽粒显微表型特征研究 被引量:5
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作者 赵欢 王璟璐 +4 位作者 廖生进 张颖 卢宪菊 郭新宇 赵春江 《智慧农业(中英文)》 2021年第1期16-28,共13页
植物显微表型主要是指植物组织、细胞和亚细胞水平的表型信息,是植物表型组学研究的重要组成部分。针对传统籽粒显微性状检测方法效率低、误差大且指标单一等问题,本研究利用Micro-CT扫描技术对5种类型11个品种玉米籽粒开展显微表型精... 植物显微表型主要是指植物组织、细胞和亚细胞水平的表型信息,是植物表型组学研究的重要组成部分。针对传统籽粒显微性状检测方法效率低、误差大且指标单一等问题,本研究利用Micro-CT扫描技术对5种类型11个品种玉米籽粒开展显微表型精准鉴定研究。基于对CT序列图像的处理解析,共获取籽粒、胚、胚乳、空腔、皮下空腔、胚乳空腔和胚空腔的34项显微表型指标。其中,胚乳空腔表面积、籽粒体积、胚乳体积比和胚乳空腔比表面积等4项表型指标在不同类型玉米间差异显著(P-value<0.05)。普通玉米胚乳空腔表面积和籽粒体积显著大于其它类型玉米,高油玉米胚乳空腔比表面积最大,甜玉米胚乳空腔比表面积最小,爆裂玉米胚乳体积比最大。进一步利用34项玉米籽粒表型指标开展差异分析和聚类分析,可将11个不同品种玉米分为四类,其中第一类以普通玉米为主,第二类以爆裂玉米为主,第三类是甜玉米,第四类是高油玉米。结果表明,Micro-CT扫描技术不仅可以实现玉米籽粒显微表型的精准鉴定,还可以为玉米籽粒分类、品种检测等提供技术支撑。 展开更多
关键词 植物表型组学 显微表型 MICRO-CT 玉米籽粒 表型鉴定
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微生态系统工程在生态畜牧业中的应用及其前景 被引量:5
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作者 蒋树威 林雪影 《家畜生态》 1997年第1期29-32,共4页
微生态系统工程在生态畜牧业中的应用及其前景蒋树威,林雪影(福建农业大学350002)(福州市农科所350014)抗生素作为饲料添加剂,对促进动物生长、预防疾病、提高生产效益很有成效。但发现长期应用亚剂量抗生素导致细菌... 微生态系统工程在生态畜牧业中的应用及其前景蒋树威,林雪影(福建农业大学350002)(福州市农科所350014)抗生素作为饲料添加剂,对促进动物生长、预防疾病、提高生产效益很有成效。但发现长期应用亚剂量抗生素导致细菌的耐药性和通过食物链对人类健康和安... 展开更多
关键词 畜牧业 微生态系统工程 应用前景
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东祁连山高寒草地土壤5种镰孢菌的形态鉴定和ITS rDNA分析 被引量:5
15
作者 张俊忠 陈秀蓉 +1 位作者 杨成德 王进明 《草原与草坪》 CAS 2010年第2期33-37,共5页
为确定东祁连山高寒草地土壤中镰孢菌的分类地位,运用稀释平板法对从其中分离的5种镰孢菌,采用形态学和培养特征进行观察描述,同时利用ITS rDNA序列对其系统发育学进行分析,确定分类地位,并分析比较了基于形态学和ITS rDNA序列分析的两... 为确定东祁连山高寒草地土壤中镰孢菌的分类地位,运用稀释平板法对从其中分离的5种镰孢菌,采用形态学和培养特征进行观察描述,同时利用ITS rDNA序列对其系统发育学进行分析,确定分类地位,并分析比较了基于形态学和ITS rDNA序列分析的两种鉴定手段。结果表明,3个菌株为三线镰孢(Fusariumtricinctum),2个菌株为木贼镰孢(F.equiseti),与传统方法相比,ITS rDNA方法有着较高的灵敏度,但对于东祁连山高寒草地土壤镰孢菌的鉴定,只有形态学与分子生物学鉴定相互结合,才能使镰孢菌的鉴定分类更加完善。 展开更多
关键词 东祁连山 高寒草地 土壤镰孢菌 表型鉴定 ITS RDNA序列分析 系统发育
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Enterobacter spp.: A new evidence causing bacterial wilt on mulberry 被引量:3
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作者 PRAPHAT Kawicha 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2010年第2期292-300,共9页
Thirty-six pathogenetic bacterial strains were isolated from wilted mulberry plants in Hangzhou,Zhejiang province of China.The six representative strains were confirmed to be involved in more than one Enterobacter spe... Thirty-six pathogenetic bacterial strains were isolated from wilted mulberry plants in Hangzhou,Zhejiang province of China.The six representative strains were confirmed to be involved in more than one Enterobacter species by common bacteriological test,electron microscope observation,hypersensitive reaction,Koch’s postulates,physiological and biochemical test,biolog,fatty acid methyl esters analysis (FAMEs),enterobacterial repetitive intergenic consensus-PCR (ERIC-PCR),16s rRNA sequences analysis,and comparative analysis with 7 type strains and 3 reference strains.This is the first report on mulberry disease caused by Enterobacter spp.in the world providing new evidence on induction of the plant disease in this genus.The results are not only important in the mulberry disease management but also have significant scientific value for further studies of opportunistic human pathogens and environmental strains in Enterobacter. 展开更多
关键词 MULBERRY ENTEROBACTER WILTING ENTEROBACTER phenotype identification ERIC-PCR 16S rRNA
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miR-148a-3p调控血管生成的体内外表型鉴定
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作者 黄瑾 韩文卿 +1 位作者 李鑫 陈骁俊 《组织工程与重建外科》 CAS 2023年第6期525-529,540,共6页
目的明确miR-148a-3p调控血管生成的表型。方法提取miR-148a基因敲除小鼠的原代组织,结合免疫组织化学染色,探究miR-148a敲除对血管生成的影响;通过miRNA mimic转染,在人脐静脉血管内皮细胞(hUVECs)中过表达miR-148a-3p,结合Matrigel基... 目的明确miR-148a-3p调控血管生成的表型。方法提取miR-148a基因敲除小鼠的原代组织,结合免疫组织化学染色,探究miR-148a敲除对血管生成的影响;通过miRNA mimic转染,在人脐静脉血管内皮细胞(hUVECs)中过表达miR-148a-3p,结合Matrigel基质胶管腔形成实验、细胞迁移实验、荧光定量PCR实验等,从敲除和过表达两方面明晰miR-148a-3p对血管生成的作用。结果与同窝对照相比,miR-148a基因敲除小鼠的骨骼组织存在H型血管分布异常。离体实验得到了相似的趋势,miR-148a敲除胎鼠的跖骨具有明显更强的血管形成能力。通过miR-148a-3p mimic过表达血管内皮细胞中的miR-148a-3p表达水平,发现miR-148a-3p过表达不影响hUVECs的增殖能力,但可通过抑制其迁移能力干扰血管生成,影响伪足形成、管腔形成等过程。结论miR-148a-3p可抑制体内外血管生成,包括细胞出芽、迁移、管腔形成等生物学过程。 展开更多
关键词 miR-148a-3p 血管生成 基因敲除小鼠 表型鉴定 H型血管
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137份云南省地方稻抗白叶枯病多菌系多基因鉴定
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作者 李玉琢 陈玲 +10 位作者 张敦宇 管娟 张云 钟巧芳 殷富有 李馨 杨顺发 王波 程在全 罗琼 肖素勤 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期894-904,共11页
为选育水稻抗性品种和发掘抗白叶枯病基因,以来自中国、日本和菲律宾的9株革兰氏阴性菌黄单胞菌水稻变种Xanthomonas oryzae pv.oryzae菌株为供试菌株评价137份云南省地方稻种质资源对白叶枯病菌的抗性,同时检测供试材料中含14个已克隆... 为选育水稻抗性品种和发掘抗白叶枯病基因,以来自中国、日本和菲律宾的9株革兰氏阴性菌黄单胞菌水稻变种Xanthomonas oryzae pv.oryzae菌株为供试菌株评价137份云南省地方稻种质资源对白叶枯病菌的抗性,同时检测供试材料中含14个已克隆抗白叶枯病基因的情况。结果显示,供试材料中至少对1株黄单胞菌水稻变种菌株有抗性的材料有104份,抗1、2、3、4、5、6、7、8和9株黄单胞菌水稻变种菌株的材料分别有25、19、14、19、11、6、5、2和3份;其中白杂一号、珍白18、麻旱谷、老来红、晋糯、香谷、毫冷薅、齐头蚂蚱谷、九谷和来之不易10份材料抗谱较广。大部分抗性材料携带1~7个白叶枯病抗性基因或其同源基因,未检测到含有Xa7、xa13、Xa21和Xa45(t)基因或其同源基因的材料。供试材料携带的抗性基因数量与抗性水平均呈极显著相关。 展开更多
关键词 云南地方稻 白叶枯病 表型鉴定 基因分析 广谱抗病
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不同板栗品种坚果表型差异分析及稳定性指标筛选
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作者 李彤彤 郭素娟 江锡兵 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2023年第4期99-108,共10页
[目的]通过比较分析不同品种板栗表型性状,筛选出表型差异较大且不易受环境影响的指标,以期为生产实践中板栗品种鉴别及实现精准应用提供参考。[方法]以来自我国不同板栗产区的80个品种,共3200个坚果为试验材料,对其21个表型性状进行差... [目的]通过比较分析不同品种板栗表型性状,筛选出表型差异较大且不易受环境影响的指标,以期为生产实践中板栗品种鉴别及实现精准应用提供参考。[方法]以来自我国不同板栗产区的80个品种,共3200个坚果为试验材料,对其21个表型性状进行差异性、多样性分析;对表型与环境因子相关性进行分析,筛选出变异系数较小的稳定性指标;利用多地栽培的3个品种进行稳定性验证。[结果](1)不同地区板栗表型指标存在显著差异,湖北、江苏、安徽地区品种坚果、底座大小均显著高于其它地区。(2)21个表型指标变异范围为4.05%~42.28%,除去在群体内及群体间存在显著差异的指标,筛选出9个在品种间存在差异且变异系数较小的相对稳定指标,即果形指数、坚果圆度、底座圆度及相关比值指标。(3)相关性分析显示:坚果大小、底座大小相关指标与年平均温度、生长季平均温度、年降水量、生长季降水量均存在极显著正相关,与年日照时数、生长季日照时数均存在极显著负相关。(4)多地栽培的3个品种的9个坚果表型指标变异系数为1.13%~5.99%;方差分析结果显示,底座圆度在区域间差异显著,其余8个指标在区域间及个体间均差异不显著。[结论]不同板栗品种在21个坚果表型指标中具有丰富多样性及显著差异性,其中,果形指数、坚果圆度、底座长宽比、相对底座大小、底座弧长/坚果周长、底座面积/横切面积、底座长/横径、底座宽/厚度等8个坚果表型指标为稳定性指标,可应用于生产实践板栗品种鉴别。 展开更多
关键词 板栗 坚果表型 品种鉴别 稳定性 环境因子
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80株中国大陆新生隐球菌环境株表型和分子特征的初步研究 被引量:4
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作者 林丽娜 谈燕 +2 位作者 朱定衡 赵瑾 陈江汉 《实用皮肤病学杂志》 2013年第2期71-73,共3页
目的了解中国大陆地区新生隐球菌环境株的分布情况,及其表型和基因型特征。方法采用CACA培养基培养1372份来自中国大部分地区私人和公共养鸽场所的鸽粪标本,分离出新生隐球菌,并对其表型和基因型特征进行分析。结果共分离出80株新生隐球... 目的了解中国大陆地区新生隐球菌环境株的分布情况,及其表型和基因型特征。方法采用CACA培养基培养1372份来自中国大部分地区私人和公共养鸽场所的鸽粪标本,分离出新生隐球菌,并对其表型和基因型特征进行分析。结果共分离出80株新生隐球菌,分离阳性率约为5.5%,所有菌株37℃生长良好,有完整荚膜,尿素酶试验阳性。ITS序列分析证实分离出的新生隐球菌均属于血清型A。M13-PCR显示,其基因型为我国及东南亚地区特征性的VNⅠc型,显示了与临床株的高度一致性。结论中国大陆地区的新生隐球菌临床株与环境株显示了高度的同源性,提示对于易感人群,阻断与相应环境的接触可有效预防新生隐球菌的感染。 展开更多
关键词 新生隐球菌 表型 基因型 环境分离 鸽粪
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