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植物病原真菌嗜水小核菌中dsRNA5和dsRNA8的克隆与序列分析
1
作者 陈宇辰 王春兰 +3 位作者 谭欣宇 吴娟 郭珍珍 竺锡武 《Agricultural Science & Technology》 2023年第3期49-53,共5页
为探究水稻嗜水小核菌中发现的病毒与真菌的相互作用以及明确其是否可用于病原真菌的生物防治,采用修改的单引物拉增法(M-SPAT)对嗜水小核菌[HZ11]菌丝体和病毒粒子(VPL)中分离的10条双链RNA(dsRNA)片段的RNA5和RNA8进行克隆,并对这些... 为探究水稻嗜水小核菌中发现的病毒与真菌的相互作用以及明确其是否可用于病原真菌的生物防治,采用修改的单引物拉增法(M-SPAT)对嗜水小核菌[HZ11]菌丝体和病毒粒子(VPL)中分离的10条双链RNA(dsRNA)片段的RNA5和RNA8进行克隆,并对这些克隆产物进行测序和分析。结果表明,dsRNA5的长度为2038 bp,编码RNA依赖RNA聚合酶(RdRp);dsRNA8的长度为1809 bp,编码外壳蛋白(CP);系统进化分析表明,dsRNA5蛋白和dsRNA8蛋白分别与双分病毒科α病毒属的RdRps和CP高度相近,这两条ds RNA的5'-非翻译区(UTR)包含保守序列5'-GAA(G)T-3'、5'-TTTTCTA(/CG)CCTC(/A)GATAT(A)AAATA(CG)GAA-3'和5'-AAACG(A)AA(G)TC(A)TTACCTCT-3';3'-UTR包含保守序列5'-AAAAAAAA-3',5'-AAAAAG(A)AAAAAAAAAAAAC(A)4A-3'和5'-AAA-3'。表明ds RNA5和dsRNA8属于一种新的α病毒的基因组,推定的新病毒被暂命名为嗜水小核菌病毒3(ShV3);嗜水小核菌分离物dsRNA5和dsRNA8分别对应于ShV3的dsRNA1和dsRNA2。 展开更多
关键词 嗜水小核菌 双链RNA 核酸序列 partitiviridae 嗜水小核菌病毒3(ShV3)
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来源于产黄青霉病毒科成员的分离物对梨轮纹病菌生长及其致病力的影响 被引量：3
2
作者 王利华 罗慧 +1 位作者 王国平 王利平 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期1330-1339,共10页
【目的】明确产黄青霉病毒科成员(Botryosphaeria dothidea Chrysovirus 1,BdCV1)对寄主梨轮纹病菌(Botryosphaeria dothidea)菌株生物学性状的影响,证实单独感染BdCV1梨轮纹病菌分离株是弱毒菌株;以期确定BdCV1是否为引起梨轮纹病菌弱... 【目的】明确产黄青霉病毒科成员(Botryosphaeria dothidea Chrysovirus 1,BdCV1)对寄主梨轮纹病菌(Botryosphaeria dothidea)菌株生物学性状的影响,证实单独感染BdCV1梨轮纹病菌分离株是弱毒菌株;以期确定BdCV1是否为引起梨轮纹病菌弱致病力的单一因子。【方法】从前期弱致病力复合感染双分体病毒科成员Bd PV1和BdCV1的梨轮纹病菌LW-1中经多代菌丝分离获得的疑似仅单独感染BdCV1分离株(命名为LW-C)为材料;采用dsRNA检测、RTPCR,鉴定LW-C菌株中仅携带BdCV1。采用菌丝块接种于PDA培养基以及3针针刺法接种梨果实,观察其菌落形态以及发病情况,测定菌落生长速度和致病性,明确LW-C生物学特性。将LW-C对无毒菌株Mock进行水平转染,检测其传染后衍生菌株的dsRNA并测定其生物学特性。【结果】证实了LW-C仅感染BdCV1,具有弱毒特性;水平转染结果明确了BdCV1因子对梨轮纹病菌的菌落形态、生长速度有抑制作用,对寄主有弱致病力。【结论】确认了BdCV1是引起梨轮纹病菌致病力衰退的主要因子,为真菌病毒防治果树轮纹病害提供了新颖的生防材料。 展开更多
关键词 梨轮纹病害 葡萄座腔菌 产黄青霉病毒科 双分体病毒科 真菌病毒 双链RNA 致病力 生物防治
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萝卜中一种新dsRNA的全长cDNA克隆及序列分析
3
作者 李露露 李力强 +2 位作者 乔爱民 陈亮 陈集双 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期1209-1214,共6页
从‘一点红’萝卜（Raphanus sativus-root‘Yidianhong’）叶片中提取dsRNA，应用SPAT方法对各dsRNA条带进行cDNA克隆并测序，除获得先前报道的5条序列（RasR1～RasR5）以外，还得到一条新的全长序列，将其定名为RasR6（EU285027）。... 从‘一点红’萝卜（Raphanus sativus-root‘Yidianhong’）叶片中提取dsRNA，应用SPAT方法对各dsRNA条带进行cDNA克隆并测序，除获得先前报道的5条序列（RasR1～RasR5）以外，还得到一条新的全长序列，将其定名为RasR6（EU285027）。序列分析结果表明：RasR6全长为1778bp，其正义链编码1个由502个氨基酸组成、分子量约为55．1kD的蛋白质。该序列与前人报道的双分病毒科5个病毒序列具有相似性，且它们均编码双分病毒科病毒的外壳蛋白（eapsidprotein，CP）。核苷酸序列比对结果显示：RasR6与同时来源于萝b的RasR1和RasR2的5′UTR序列高度同源，且其3′末端具有polyA结构，而与RasR3、RasR4和RasR5的UTR则没有明显的相似性。因此，推测RasR6与RasR1、RasR2同属于双分病毒RasV1（Raphanus sativus virus 1），可能与RasR2共同编码该病毒的CP或作为RasV1的卫星RNA存在。 展开更多
关键词 萝卜 双链RNA 双分病毒科 RAPHANUS SATIVUS virus 1
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