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三种鳖线粒体DNA细胞色素b基因序列的比较分析 被引量：20
1
作者 陈合格 刘文彬 +1 位作者 李建中 张轩杰 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期380-385,共6页
对中华鳖、砂鳖和山瑞鳖线粒体DNA细胞色素b基因进行了引物设计、PCR扩增、序列测定和PCR-PFLP(Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism)分析。研究结果表明中华鳖、砂鳖与山瑞鳖线粒体DNACytb基因的序列... 对中华鳖、砂鳖和山瑞鳖线粒体DNA细胞色素b基因进行了引物设计、PCR扩增、序列测定和PCR-PFLP(Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism)分析。研究结果表明中华鳖、砂鳖与山瑞鳖线粒体DNACytb基因的序列全长相同,均为1140bp,其A、C、G、T含量相似,分别为378个(33.2%)、322个(28.2%)1、22个(10.7%)、318个(27.9%)、373个(32.7%)、324个(28.4%)、124个(10.9%)、319个(28.0%)、380个(33.3%)3、30个(28.9%)、127个(11.1%)、303个(26.7%)。同源性及序列差异率分析表明:中华鳖与砂鳖b基因序列的同源性为92.3%,中华鳖、山瑞鳖的为85.0%,砂鳖、山瑞鳖的为84.1%;中华鳖与砂鳖b基因核苷酸序列间的差异率为7.7%,中华鳖、山瑞鳖间的序列差异率为15.0%,砂鳖、山瑞鳖间的序列差异率为15.9%,而中华鳖、砂鳖、山瑞鳖各自个体间的序列差异率分别为2.37%、0.88%和0.18%,种间差异显著。用内切酶酶切分析其扩增产物,结果表明:用内切酶NdeⅠ可准确鉴别砂鳖,而用内切酶BamHⅠ则可准确鉴别山瑞鳖。内切酶NdeⅠ和BamHⅠ的联用分析,可使这三种鳖在分子水平都得到明确的鉴定。从三种鳖线粒体DNACytb基因核苷酸序列的显著差异和酶切位点的变化,可以进一步证明砂鳖是不同于中华鳖的鳖属一新种。 展开更多
关键词 中华鳖 砂鳖 山瑞鳖 细胞色素B pcr-rflp分析 分子鉴定标记
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1996年输入病例Ⅲ型脊髓灰质炎野毒的分子病毒学检测 被引量：17
2
作者 张礼璧 李杰 +5 位作者 原稔 徐闻 郑红 朱宏 郑渡平 方勇 《中国计划免疫》 1997年第5期195-198,共4页
１９９６年３月和４月，我国云南省边境德宏傣族景颇族自治州人民医院收治了２名在缅甸勐古镇发病，来我国求治的急性弛缓性麻痹儿童。云南省卫生防疫站分别从２名病儿的粪便标本中分离到Ⅲ型脊髓灰质炎（脊灰）病毒；国家脊灰实验室经... １９９６年３月和４月，我国云南省边境德宏傣族景颇族自治州人民医院收治了２名在缅甸勐古镇发病，来我国求治的急性弛缓性麻痹儿童。云南省卫生防疫站分别从２名病儿的粪便标本中分离到Ⅲ型脊髓灰质炎（脊灰）病毒；国家脊灰实验室经用ＰＣＲ－ＲＦＬＰ法检测，定为脊灰Ⅲ型野毒株，又经核酸序列测定，与ＳａｂｉｎⅢ型疫苗株有明显差异，但又有别于我国１９９５年新疆分离的Ⅲ型脊灰野毒株的序列。初步判定该２株脊灰Ⅲ型野毒株不属于中国本土的野毒株。 展开更多
关键词 脊髓灰质炎 Ⅲ型野毒株 分离病毒学
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应用PCR－RFLP法作脊灰炎病毒型内分析的研究 被引量：2
3
作者 古绍文 刘巍 +1 位作者 王树声 班华国 《广西科学》 CAS 1994年第4期37-39,共3页
用ＰＣＲ－ＲＦＬＰ法对近年来从麻痹病人分离到的２６株脊灰炎病毒（ＰＶ）作了型内分析研究。１６株ＰＶ１的ＲＦＬＰ图式呈现多样性，毒株的图式可与Ｓａｂｉｎ１型疫苗株完全相同或不同，某些毒株亦可无电泳条带出现。７株ＰＶ２与... 用ＰＣＲ－ＲＦＬＰ法对近年来从麻痹病人分离到的２６株脊灰炎病毒（ＰＶ）作了型内分析研究。１６株ＰＶ１的ＲＦＬＰ图式呈现多样性，毒株的图式可与Ｓａｂｉｎ１型疫苗株完全相同或不同，某些毒株亦可无电泳条带出现。７株ＰＶ２与３株ＰＶ３的ＲＦＬＰ图式则分别与疫苗株Ｓａｂｉｎ２型和３型完全相同。全面分析这些ＲＦＬＰ后，我们认为１６株ＰＶ１为野毒株，而７株ＰＶ２及３株ＰＶ３则可能是疫苗相似株。鉴于近年来广西的麻痹病例仍主要由ＰＶ１所致。故此，加强突击普服ＯＰＶ运动及作好分离毒株的型内分析已成为消灭脊灰炎的关键。 展开更多
关键词 pcr-rflp法 脊髓灰质炎病毒 临床分析
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