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Comparative Analysis on Genomes from Oryza alta and Oryza latifolia by C_0t-1 DNA 被引量:1
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作者 WANG De-bin WANG Yang Wu Qi ZHAO Hou-ming LI Gang QIN Rui WANG Chun-tai LIu Hong 《Rice science》 SCIE 2010年第3期185-191,共7页
In order to reveal the origin and evolutionary relationship between two CCDD genome species, Oryza alta and Oryza latifolia, fluorescence in situ hybridization (FISH) was adopted to analyze the genomes of the two sp... In order to reveal the origin and evolutionary relationship between two CCDD genome species, Oryza alta and Oryza latifolia, fluorescence in situ hybridization (FISH) was adopted to analyze the genomes of the two species with C0t-1 DNA from O. alta as a probe. Karyotype was also comparatively analyzed between O. alta and O. latifolia based on their similar band patterns of the hybridization signals. There were a high homology and close relationship between O. alta and O. latifolia, however, the distinction between the hybridization signals was also clear. C0t-1 DNA was proved to be species- and genome type-specific. It is suggested that C0t-1 DNA-FISH could be more efficient to analyze the genomic relationship between different species. According to the comparative analysis of highly and moderately repetitive DNA sequences between the two allotetraploidy species, O. alta and O. latifolia, the possible origin and evolutionary mechanism of allotetraploidy of Oryza were discussed. 展开更多
关键词 oryza alta oryza latifolia fluorescence in situ hybridization chromosomal repeat sequence KARYOTYPE phylogenetic relation
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利用C_0t-1 DNA对高秆野生稻和宽叶野生稻基因组的比较分析 被引量:3
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作者 王德彬 王阳 +3 位作者 赵侯明 李刚 覃瑞 刘虹 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期131-136,共6页
为了揭示同为CCDD基因组类型的高秆野生稻和宽叶野生稻的起源和进化关系,用高秆野生稻C0t-1DNA作为探针,对其自身体细胞染色体与宽叶野生稻体细胞染色体进行荧光原位杂交并对其核型进行同源性聚类和比较分析。杂交结果显示宽叶野生稻和... 为了揭示同为CCDD基因组类型的高秆野生稻和宽叶野生稻的起源和进化关系,用高秆野生稻C0t-1DNA作为探针,对其自身体细胞染色体与宽叶野生稻体细胞染色体进行荧光原位杂交并对其核型进行同源性聚类和比较分析。杂交结果显示宽叶野生稻和高秆野生稻同源性非常高,说明它们的亲缘关系十分接近,但区别也非常明显,两者的杂交信号存在显著不同。C0t-1DNA具有很强的种特异性和依赖基因组型的特异性,利用它进行荧光原位杂交能够更有效地研究物种基因组间的关系,为物种的划分和鉴定提供依据。另外,通过对高秆野生稻和宽叶野生稻两个异源四倍体基因组的中高度重复序列的比较分析,探讨了稻属异源四倍体可能的起源与进化机制。 展开更多
关键词 高秆野生稻 宽叶野生稻 染色体重复序列 荧光原位杂交 核型 基因组 亲缘关系
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利用45S rDNA探针对宽叶野生稻和高秆野生稻基因组的FISH分析
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作者 周会 蓝伟侦 +2 位作者 覃瑞 刘虹 李刚 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期1-7,共7页
利用45S rDNA作为探针,通过荧光原位杂交(FISH)技术对同样含有CCDD基因组的高秆野生稻(Oryza alta)和宽叶野生稻(O.latifolia)进行rDNA的荧光原位杂交定位分析和核型分析。结果显示:宽叶野生稻中45S rDNA信号分布于多条染色体上... 利用45S rDNA作为探针,通过荧光原位杂交(FISH)技术对同样含有CCDD基因组的高秆野生稻(Oryza alta)和宽叶野生稻(O.latifolia)进行rDNA的荧光原位杂交定位分析和核型分析。结果显示:宽叶野生稻中45S rDNA信号分布于多条染色体上,位点数目为10-16;高秆野生稻中有6个信号点,分布于3对同源染色体上,其中2对信号位点位于染色体短臂,1对位于染色体长臂。研究结果表明,高秆野生稻45S rDNA在基因组中位点数目稳定,宽叶野生稻中45S rDNA位点数在不同个体中呈现一定的动态变化,显示这2种野生稻基因组存在一定差异;核型分析结果也表明二者基因组存在较大的差异。由此推测,高秆野生稻分化较早而趋向稳定,宽叶野生稻可能形成较晚,还处于进化过程之中。鉴于二者在基因组结构上的明显差异和进化上的不平衡性,建议把这2种野生稻划分为不同野生稻种,可能会更加符合二者的进化特性。同时,讨论了45S rDNA在染色体中分布特点与机制。 展开更多
关键词 45S RDNA 荧光原位杂交 高秆野生稻 宽叶野生稻
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利用栽培稻C_0t-1 DNA和基因组DNA比较分析宽叶野生稻基因组
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作者 吴绮 覃瑞 +1 位作者 李刚 刘虹 《武汉植物学研究》 CSCD 北大核心 2010年第6期654-659,共6页
利用AA染色体组栽培稻的中高度重复序列C0t-1 DNA和基因组DNA作为探针,通过荧光原位杂交技术对宽叶野生稻(Oryza latifolia)(CCDD染色体组)进行了比较基因组分析。结果显示,在宽叶野生稻染色体上,C0t-1 DNA的杂交信号没有基因组DNA的杂... 利用AA染色体组栽培稻的中高度重复序列C0t-1 DNA和基因组DNA作为探针,通过荧光原位杂交技术对宽叶野生稻(Oryza latifolia)(CCDD染色体组)进行了比较基因组分析。结果显示,在宽叶野生稻染色体上,C0t-1 DNA的杂交信号没有基因组DNA的杂交信号明显;杂交信号主要分布在着丝粒、近着丝粒及端粒区域;随着洗脱严谨度的不同,杂交信号呈现出较高的种特异性。本研究以不同洗脱严谨度下的荧光原位杂交结果为依据,对宽叶野生稻进行的核型分析,可进一步提高稻属染色体识别的准确性。 展开更多
关键词 C0t-1DNA 基因组DNA 荧光原位杂交 洗脱严谨度 宽叶野生稻
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