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NRAMP1基因3′UTR多态现象与汉族结核病易感性的研究 被引量:24
1
作者 段鸿飞 周新华 +4 位作者 马玙 李传友 陈效友 高微微 郑素华 《中华结核和呼吸杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期286-289,共4页
目的 研究人类自然抵抗相关巨噬细胞蛋白 (NRAMP1)基因 3′UTR多态现象与汉族结核病易感性的关系。方法 选取汉族活动性结核病患者 14 7例 ,正常对照 14 5人 ,用聚合酶链反应 限制性片断长度多态性 (PCR RFLP)的方法对NRAMP1基因 3′... 目的 研究人类自然抵抗相关巨噬细胞蛋白 (NRAMP1)基因 3′UTR多态现象与汉族结核病易感性的关系。方法 选取汉族活动性结核病患者 14 7例 ,正常对照 14 5人 ,用聚合酶链反应 限制性片断长度多态性 (PCR RFLP)的方法对NRAMP1基因 3′UTR进行基因分型 ,根据基因型对样本分组 ,经统计学处理 ,研究 3′UTR多态现象与结核病易感性的关系。结果 在活动性结核病患者中 3′UTRTGTG/TGTG基因型 95例 (6 4 6 % ) ,TGTG/TGTG缺失基因型 5 0例 (34 0 % ) ,TGTG缺失 /TGTG缺失基因型 2例 (1 4 % ) ;正常对照TGTG/TGTG基因型则为 115例 (79 3% ) ,TGTG/TGTG缺失基因型 2 9例 (2 0 .0 % ) ,TGTG缺失 /TGTG缺失基因型 1例 (0 7% )。正常对照组TGTG/TGTG基因型明显高于结核病患者 (χ2 =7 79;P <0 0 1)。研究发现TGTG的等位基因频率为 0 85 ,TGTG缺失的等位基因频率为 0 15。结论 NRAMP1基因 3′UTR多态现象与结核病易感性相关 ,汉族 3′UTRTGTG缺失等位基因频率明显高于白种人 ,可部分解释汉族比白种人更易患结核病。 展开更多
关键词 结核病 易感性 nrampl基因3’UTR多态现象 汉族 研究
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猪Nramp1基因多态性与免疫功能的相关性 被引量:20
2
作者 吴宏梅 王立贤 +1 位作者 程笃学 马小军 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期215-220,共6页
【目的】探讨Nramp1基因第6内含子多态在大白猪和松辽黑猪(是由杜洛克、长白猪和民猪合成)中的分布及其与猪免疫抗病的关系。【方法】采用PCR-RFLP法对165头大白猪和109头松辽黑猪Nramp1基因第6内含子多态性与免疫功能(中性粒细胞还原... 【目的】探讨Nramp1基因第6内含子多态在大白猪和松辽黑猪(是由杜洛克、长白猪和民猪合成)中的分布及其与猪免疫抗病的关系。【方法】采用PCR-RFLP法对165头大白猪和109头松辽黑猪Nramp1基因第6内含子多态性与免疫功能(中性粒细胞还原力和单核细胞细胞毒百分率)的相关性进行了研究。【结果】两个品种在该位点均存在多态性,品种间、合并基因型间免疫功能差异不大,但同一品种内不同基因型间差异显著;大白猪BB基因型个体的单核细胞细胞毒百分率显著高于AB基因型个体(P<0.05),BB基因型个体的中性粒细胞NBT还原力值极显著高于AB基因型个体(P<0.01),而在松辽黑猪中则是AB基因型个体的中性粒细胞NBT还原力值显著高于BB基因型个体(P<0.05);从断奶到出栏的死亡率分析显示大白猪BB基因型个体死亡率明显低于AB基因型个体,松辽黑猪则是AB基因型个体的死亡率明显低于BB基因型个体。【结论】品种内不同Nramp1基因型与免疫功能间存在着显著相关,Nramp1基因可作为抗病力性状的一个主要候选基因。 展开更多
关键词 nramp1基因 PCR-RFLP 免疫功能
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中国汉族人群结核易感相关基因多态性研究 被引量:15
3
作者 邵凌云 翁心华 +2 位作者 胡忠义 靳安佳 张文宏 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期302-305,共4页
目的通过病例对照研究明确结核感染与NRAMP1基因多态性的关系。方法选择127例活动性肺结核患者,均为汉族,平均年龄52.5岁,另选与民族匹配的58例健康对照者。对上述入选者通过聚合酶链反应限制性片段长度多态性(PCRRFLP)分析对NRAMP1基... 目的通过病例对照研究明确结核感染与NRAMP1基因多态性的关系。方法选择127例活动性肺结核患者,均为汉族,平均年龄52.5岁,另选与民族匹配的58例健康对照者。对上述入选者通过聚合酶链反应限制性片段长度多态性(PCRRFLP)分析对NRAMP1基因多态性——内含子4(INT4)、D543N进行检测。结果两种NRAMP1基因多态性均与痰涂片阳性的结核显著相关。在结核患者中INT4与D543N的杂合子形式为对结核易感的多态性。NRAMP1的不同基因多态性的协同作用导致了对结核的易感性。结论NRAMP1基因多态性可以影响中国汉族人群对结核的易感性。 展开更多
关键词 中国 汉族人群 结核易感相关基因 多态性 聚合酶链反应
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东亚人群NRAMP1基因多态性与结核易感性的Meta分析 被引量:10
4
作者 李洪涛 张天托 +2 位作者 黄勤欢 吕波 黄瑾 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期428-432,共5页
目的应用Meta分析探讨东亚人群NRAMP1基因3个多态性位点与结核易感性的关系。方法应用主题词和关键词“NRAMP1”、“SLC11A1”、“tuberculosis”和“结核”,检索1995年1 月至2005年5月Medline、Ovid及CBM disc数据库发表的有关文献,并... 目的应用Meta分析探讨东亚人群NRAMP1基因3个多态性位点与结核易感性的关系。方法应用主题词和关键词“NRAMP1”、“SLC11A1”、“tuberculosis”和“结核”,检索1995年1 月至2005年5月Medline、Ovid及CBM disc数据库发表的有关文献,并辅以文献追溯的方法。结果结核病组和对照组3’UTR、D543N和INT4位点的多态现象同最常见纯合子基因型频率比值比 (OR)的合并OR值分别为1.68(95%CI:1.31-2.16,P<0.001);1.78(95%CI:1.38-2.30,P< 0.001);1.56(95%CI:0.72-3.35,P=0.26)。Egger线性回归分析提示3’UTR和D543N基因型相关文献没有发表偏倚,INT4基因型相关文献有一定的出版偏倚。结论东亚人群NRAMP1基因3’ UTR和D543N多态性位点与结核易感性相关;INT4多态性位点与结核易感性无统计学意义。 展开更多
关键词 结核 多态现象(遗传学) 基因 nramp1 META分析 人种群
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藏猪NRAMP1基因的定量表达研究 被引量:8
5
作者 应三成 张义正 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期697-701,共5页
采用半定量和定量PCR方法对藏猪的NRAMP1基因在脾脏等10个组织中的表达进行了研究.结果显示,该基因在所研究藏猪的组织中均得以表达,无组织表达特异性;定量PCR的结果证实该基因在不同组织中的表达量有很大的差异,其中,在脾脏中表达量最... 采用半定量和定量PCR方法对藏猪的NRAMP1基因在脾脏等10个组织中的表达进行了研究.结果显示,该基因在所研究藏猪的组织中均得以表达,无组织表达特异性;定量PCR的结果证实该基因在不同组织中的表达量有很大的差异,其中,在脾脏中表达量最高,在肝脏中表达量最低,两者之间相差77倍,10个组织的平均表达量为3233拷贝/μg cDNA;NRAMP1基因在10个组织表达丰度从高到低的顺序为:脾脏、大脑、肺脏、回肠、肾脏、颌下淋巴结、结肠、心脏、肌肉和肝脏. 展开更多
关键词 藏猪 nramp1基因 表达 实时PCR
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香猪NRAMP1基因多态性与仔猪腹泻的研究 被引量:8
6
作者 刘艳冬 许厚强 +2 位作者 稽辛勤 张勇 陈祥 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第4期125-127,共3页
天然抗性巨噬蛋白1(natural resistance associated macrophage protein 1,NRAMP1)基因是与人、鼠的一些病原微生物(如分支杆菌中的沙门氏伤寒菌等)的易感性和抗性有关的重要候选基因。本研究利用PCR-RFLP技术,分析了香猪的NRAMP1基因第... 天然抗性巨噬蛋白1(natural resistance associated macrophage protein 1,NRAMP1)基因是与人、鼠的一些病原微生物(如分支杆菌中的沙门氏伤寒菌等)的易感性和抗性有关的重要候选基因。本研究利用PCR-RFLP技术,分析了香猪的NRAMP1基因第6内含子的NdeⅠ酶切位点的多态性;观测记录哺乳仔猪的腹泻情况,结果发现,NRAMP1基因的第6内含子的NdeⅠ酶切位点在各品种猪表现出丰富的多态性,该酶切位点的基因频率和基因型频率在各猪种中分布趋于一致,香猪不同品系基因型与腹泻指数统计分析结果显示,Ⅰ系、Ⅱ系差异不显著,11世代显著高于10世代。 展开更多
关键词 香猪 nramp1基因 PCR-RFLP 遗传多态性 腹泻
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合作猪Nramp1基因第六内含子多态性分析 被引量:8
7
作者 李娟娟 马小军 +2 位作者 王立贤 张小丽 李小飞 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期10-13,24,共5页
采用PCR-SSCP方法检测了135头合作猪Nramp1基因第六内含子的多态性.结果表明:序列比对分析发现10个新的核苷酸多态位点,其中,转换7个,颠换2个,插入1个;试验群体发现5个基因型,即AA、AB、BB、CC、AC,其中B等位基因为优势等位基因,AB基因... 采用PCR-SSCP方法检测了135头合作猪Nramp1基因第六内含子的多态性.结果表明:序列比对分析发现10个新的核苷酸多态位点,其中,转换7个,颠换2个,插入1个;试验群体发现5个基因型,即AA、AB、BB、CC、AC,其中B等位基因为优势等位基因,AB基因型为优势基因型;经χ2适合性检验,该群体处于Hardy-Wein-berg平衡状态(P>0.05);Nramp1基因遗传多态指数中,杂合度为0.617 4,多态信息含量为0.537 3,有效等位基因数为2.613 7. 展开更多
关键词 合作猪 nramp1基因 PCR-SSCP 多态性
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新疆维吾尔族人群结核病易感基因的多态性分析 被引量:7
8
作者 王喜 任丽君 +2 位作者 吴芳 章乐 张万江 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第15期1839-1845,共7页
目的探讨人类自然抵抗相关巨噬细胞蛋白(NRAMP1)基因和维生素D受体(VDR)基因与新疆维吾尔族人群结核病易感性的关联。方法采用病例对照研究方法,选取224例新疆维吾尔族活动性肺结核患者为病例组,225例新疆维吾尔族健康人为对照组,应用... 目的探讨人类自然抵抗相关巨噬细胞蛋白(NRAMP1)基因和维生素D受体(VDR)基因与新疆维吾尔族人群结核病易感性的关联。方法采用病例对照研究方法,选取224例新疆维吾尔族活动性肺结核患者为病例组,225例新疆维吾尔族健康人为对照组,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测VDR基因VDR-TaqI T/C、FokI C/T位点和NRAMPI基因3'-UTR多态性位点基因型,采用χ2检验分析3个位点多态性与新疆维吾尔族结核病易感性的关联。结果①新疆维吾尔族病例组中,NRAMP1基因的3’-UTR位点TGTG/TGTG基因型159例(71.0%),TGTG/del基因型56例(25.0%),TGTGdel/del基因型9例(4.0%);正常对照TGTG/TGTG基因型则为185例(82.2%),TGTG/del基因型36例(16.0%),TGT-Gdel/del基因型4例(1.8%)。TGTG/del基因型携带者患结核病的危险性是TGTG/TGTG基因型携带者的1.810倍。TGTGdel等位基因组间分布差异有显著性(P<0.05)。②在病例组中FF、Ff与ff 3种基因型分别为81例(36.2%)、127例(56.7%)、16例(7.1%);对照组的相应基因型为91例(40.4%)、120例(53.3%)、14例(6.2%)。FokI位点FF、Ff和ff基因型组间分布差异无显著性;等位基因F和f组间分布差异无显著性(P>0.05)。病例组中TT、Tt、tt 3种基因型分别为154例(68.8%)、66例(29.5%)、4例(1.8%);对照组的相应基因型则为170例(75.6%)、50例(22.2%)、5例(2.2%)。TaqI位点TT、Tt和tt基因型组间分布差异无显著性(P>0.05),等位基因T和t组间分布差异无显著性(P>0.05)。D'=0.017,r 2=0.00,两位点不存在连锁不平衡。结论①TGTG/del基因型可能是新疆维吾尔族人群结核病易感基因型;TGTG缺失等位基因可能是新疆维吾尔族人群结核病易感基因。②VDR基因FokI与TaqI位点多态性与新疆维吾尔族人群结核病易感性无关联,FokI和TaqI两位点间不存在连锁不平衡。 展开更多
关键词 结核病 nramp1基因 VDR基因 维吾尔族1
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新疆哈萨克族人群结核病易感基因的病例对照研究 被引量:6
9
作者 王喜 杨跃进 +2 位作者 吴芳 章乐 张万江 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期206-211,共6页
目的研究自然抗性相关巨噬细胞蛋白1(NRAMPl)基因3′端非编码区(3′UTR)和维生素D受体(VDR)基因FokI、TaqI位点多态性与新疆哈萨克族人群结核病易感性的关联;分析NRAMPl基因和VDR基因交互作用对新疆哈萨克族人群结核病易感性的影响。方... 目的研究自然抗性相关巨噬细胞蛋白1(NRAMPl)基因3′端非编码区(3′UTR)和维生素D受体(VDR)基因FokI、TaqI位点多态性与新疆哈萨克族人群结核病易感性的关联;分析NRAMPl基因和VDR基因交互作用对新疆哈萨克族人群结核病易感性的影响。方法采用病例对照研究方法,选取新疆哈萨克族活动性肺结核病患者213例,同地区同种族健康者211例。用聚合酶链反应-限制性片断长度多态性(PCR-RFLP)分析方法对NRAMP1基因3′UTR、VDR基因FokI和TaqI多态性位点基因分型,采用2χ检验分析3个位点多态性与新疆哈萨克族结核病易感性的关系,相乘模型分析NRAMPl基因和VDR基因交互作用。结果 1.NRAMPl基因3′UTR位点在病例组和对照组中TGTG/TGTG、TGTG/del和TGT-Gdel/del基因型频率分别为64.8%、29.6%、5.6%和79.1%、19.5%、1.4%。TGTGdel等位基因组间分布差异有统计学意义(χ2=13.737,P<0.01)。2.VDR基因FokI位点在病例组和在对照组中FF、Ff和ff基因型频率分别为33.8%、45.1%、21.1%和47.9%、41.7%、10.4%。f等位基因频率组间分布差异有统计学意义(χ2=13.868,P<0.01);TaqI位点TT、Tt和tt基因型组间分布差异无统计学意义;等位基因T和t组间分布差异无统计学意义(2χ=1.267,P>0.05);D'=0.477,r2=0.01,两位点不存在连锁不平衡。3.NRAMP1基因和VDR基因存在正交互作用,ORint=1.62。结论 1.TGTG/del和TGTGdel/del基因型、TGTG缺失等位基因可能是新疆哈萨克族人群结核病易感基因。2.VDR基因中FokI多态性与新疆哈萨克族结核病易感性有关联,等位基因f可能是新疆哈萨克族结核病易感基因。3.NRAMP1和VDR基因间交互作用可能增加新疆哈萨克族人群结核病的发病风险。 展开更多
关键词 结核病 nramp1基因 VDR基因 哈萨克族
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野交杂种猪NRAMP1基因的定量表达 被引量:6
10
作者 陈赫书 刘娣 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期75-78,共4页
采用Real time PCR方法对野交杂种猪的NRAMP1基因进行了研究。结果表明,在大脑、肺脏、淋巴结、白细胞和脾脏组织出现强的扩增,在肝脏、回肠、肾脏、肌肉、心脏出现弱的扩增。Real time PCR的结果证实该基因在不同组织中的表达量都有差... 采用Real time PCR方法对野交杂种猪的NRAMP1基因进行了研究。结果表明,在大脑、肺脏、淋巴结、白细胞和脾脏组织出现强的扩增,在肝脏、回肠、肾脏、肌肉、心脏出现弱的扩增。Real time PCR的结果证实该基因在不同组织中的表达量都有差异,其中在肾脏中表达的最高,在肝脏中表达最低,两者间相差71倍,从高到低依次是脾脏、大脑、肺脏、回肠、肾脏、淋巴结、结肠、心脏、肌肉和肝脏。 展开更多
关键词 野交杂种猪 nramp1基因 定量PCR
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NRAMP1基因3’UTR多态性与新疆维吾尔族人群结核病易感性的相关性研究 被引量:6
11
作者 孟宪杰 吴放涛 +6 位作者 闫东 王霞 李春柱 吴芳 王萍 吴江东 张万江 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期420-423,共4页
目的研究人类自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1(NRAMP1)基因3’UTR多态性与新疆维吾尔族人群结核病易感性的相关性。方法选取新疆维吾尔族人群活动性结核病患者224例,正常对照225例,用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方... 目的研究人类自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1(NRAMP1)基因3’UTR多态性与新疆维吾尔族人群结核病易感性的相关性。方法选取新疆维吾尔族人群活动性结核病患者224例,正常对照225例,用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法对NRAMP1基因3’UTR进行基因分型,根据基因型对样本分组,经统计学处理,研究NRAMP1基因3’UTR多态性与结核病易感性的相关性。结果在新疆维吾尔族人群活动性结核病患者中3’UTR TGTG/TGTG基因型159例(71.1%),TGTG/TGTG缺失基因型56例(24.9%),TGTG缺失/TGTG缺失基因型9例(4.0%);正常对照TGTG/TGTG基因型则为185例(82.2%),TGTG/TGTG缺失基因型36例(16.0%),TGTG缺失/TGTG缺失基因型4例(1.8%)。正常对照组TGTG/TGTG基因型频率明显高于结核患者(χ^2=7.94,P〈0.01)。研究发现TGTG的等位基因频率为0.87,TGTG缺失的等位基因频率为0.13。结论在新疆维吾尔族人群中NRAMP1基因3’UTR多态性与结核病易感性有明显相关性。 展开更多
关键词 多态性 nramp1基因 疾病易感性 结核病
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3个外种猪Nramp1基因多态性研究 被引量:5
12
作者 杨军 陈红颂 +5 位作者 丁山河 王家圣 罗家琴 杨玉莹 彭本英 韩安勤 《长江大学学报(自科版)(中旬)》 CAS 2009年第4期40-43,共4页
采用PCR-RFLP方法,对3个外种猪群Nramp1基因第6内含子序列多态性进行了检测。结果表明,在3个外种猪群中均仅检测到AB和BB2种基因型,其中AB基因型为优势基因型,BB基因型为数极少,未检测到AA基因型。卡方检验结果表明,3个外种猪群该位点... 采用PCR-RFLP方法,对3个外种猪群Nramp1基因第6内含子序列多态性进行了检测。结果表明,在3个外种猪群中均仅检测到AB和BB2种基因型,其中AB基因型为优势基因型,BB基因型为数极少,未检测到AA基因型。卡方检验结果表明,3个外种猪群该位点均处于遗传不平衡状态(P<0.01)。群体中该位点杂合度较高、纯合度较低,具有中度遗传多态性,可在后续的育种方案中实施分化选择和培育,为抗病育种提供遗传素材。 展开更多
关键词 猪(Sus scrofa) nramp1基因 PCR RFLP 多态性
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中国荷斯坦奶牛Nramp1基因多态性与泌乳性状及产奶量的关联性分析 被引量:5
13
作者 张丽 刘丽霞 +2 位作者 陈红 李强子 刘吴鑫 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第3期389-394,共6页
为寻找与乳房炎相关的分子标记,为荷斯坦牛的抗病育种提供理论基础,试验采用PCR-SSCP技术和测序的方法对宁夏农垦303头中国荷斯坦奶牛的Nramp1基因进行了遗传多态性分析,利用一般线性模型分析Nramp1基因c.200C>G突变对泌乳性状及产... 为寻找与乳房炎相关的分子标记,为荷斯坦牛的抗病育种提供理论基础,试验采用PCR-SSCP技术和测序的方法对宁夏农垦303头中国荷斯坦奶牛的Nramp1基因进行了遗传多态性分析,利用一般线性模型分析Nramp1基因c.200C>G突变对泌乳性状及产奶量影响。结果显示,Nramp1基因c.200C>G突变与乳脂率、日产奶量和体细胞评分值存在显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)关联。因此,可以把该位点作为中国荷斯坦奶牛体细胞评分、测定日产奶量和日乳脂率的遗传标记进行进一步研究。 展开更多
关键词 荷斯坦牛 nramp1基因 遗传多态性 泌乳性状 产奶量
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鸡Nramp1基因多态性与部分免疫指标相关性分析 被引量:4
14
作者 胡国顺 常国斌 +5 位作者 王克华 刘艳 陈蓉 栾德琴 龚琳琳 陈国宏 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2011年第15期5-8,共4页
随机选取同期孵化出雏的中国地方鸡种如皋鸡和引进隐性白羽鸡72只和55只,测定部分免疫性状。利用PCR-SSCP技术检测如皋鸡和隐性白羽鸡Nramp1基因第9外显子的多态性,并对不同基因型与免疫性状进行相关分析。结果表明:如皋鸡与隐性白羽鸡... 随机选取同期孵化出雏的中国地方鸡种如皋鸡和引进隐性白羽鸡72只和55只,测定部分免疫性状。利用PCR-SSCP技术检测如皋鸡和隐性白羽鸡Nramp1基因第9外显子的多态性,并对不同基因型与免疫性状进行相关分析。结果表明:如皋鸡与隐性白羽鸡H/L、淋巴细胞转化率和IgM含量均差异显著(P<0.05)。如皋鸡AA型的H/L显著低于BB型和AB型(P<0.05),而AA型的淋巴细胞转化率和IgM含量显著高于BB型(P<0.05)。隐性白羽鸡各基因型对免疫指标的影响与如皋鸡的趋势相同。该研究结果初步显示,如皋鸡的综合免疫性能优于隐性白羽鸡,AA基因型的综合免疫性能优于AB型和BB型。 展开更多
关键词 nramp1基因 单核苷酸多态性 免疫性状
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鸡NRAMP1蛋白序列特征、分子进化与突变分析
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作者 见玉文 王金萍 +4 位作者 宁波 薛振 胡媛媛 王珊珊 王令 《中国家禽》 北大核心 2023年第1期23-31,共9页
为解析鸡天然抗性相关巨噬蛋白1(Natural-resistance-associated macrophage protein 1,NRAMP1)223位Arg突变为Gln对蛋白质结构和理化性质的影响,试验系统分析了鸡NRAMP1蛋白质结构特征,重点比较鸡NRAMP1223位Arg(抗性)和Gln(易感)的蛋... 为解析鸡天然抗性相关巨噬蛋白1(Natural-resistance-associated macrophage protein 1,NRAMP1)223位Arg突变为Gln对蛋白质结构和理化性质的影响,试验系统分析了鸡NRAMP1蛋白质结构特征,重点比较鸡NRAMP1223位Arg(抗性)和Gln(易感)的蛋白质理化性质和结构差异,并分析略阳乌鸡NRAMP1基因该位点的多态性。结果表明,NRAMP1蛋白质保守性较高,鸡和人NRAMP1氨基酸序列相似度达68%,以鸡NRAMP1的第223位氨基酸为参考,其他物种该位点均为碱性氨基酸(Arg、Lys、His);鸡NRAMP1第2454位G突变为A,223位Arg变成Gln,其理化性质和二、三级结构均发生变化,该位点附近的β-转角变为α-螺旋。略阳乌鸡NRAMP1基因该位点的GG基因型频率为67.1%,GA频率30.1%,AA频率2.7%。研究结果证实鸡NRAMP1蛋白质223位突变改变其结构和理化性质,可能与该蛋白抗感染能力相关。 展开更多
关键词 nramp1 基因多态性 抗感染能力 略阳乌鸡
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玉米镉转运基因ZmNramp1的鉴定及对镉胁迫的响应 被引量:4
16
作者 李亚敏 巩宗强 +2 位作者 贾春云 李晓军 刘宛 《生态学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期2016-2023,共8页
NRAMP(natural-resistance-associated macrophage)转运蛋白家族在调控植物吸收、转运重金属镉(Cd)等方面具有重要功能。基于拟南芥、水稻、番茄和山荆子的Nramp1基因的保守序列,设计玉米该基因的兼并引物,克隆测序得到该基因,片段全长3... NRAMP(natural-resistance-associated macrophage)转运蛋白家族在调控植物吸收、转运重金属镉(Cd)等方面具有重要功能。基于拟南芥、水稻、番茄和山荆子的Nramp1基因的保守序列,设计玉米该基因的兼并引物,克隆测序得到该基因,片段全长314 bp,包含10个外显子,编码104个氨基酸,将其命名为ZmNramp1;对比上述已知植物的Nramp1基因及氨基酸序列后发现,它们具有相同的保守结构域,碱基序列高度相似。生物信息学预测Zm NRAMP1蛋白分子量为11.5 kD,理论等电点为6.92,拥有典型的跨膜螺旋区,属跨膜蛋白。RT-PCR(reversal transcript polymerase chain reaction)结果表明:与对照组相比,玉米幼苗在Cd(50、100μmol·L^(-1)CdCl_(2))胁迫24 h后,ZmNramp1基因在根部的表达显著增加,分别增加了57%、83%,在叶片中的表达亦明显上调;玉米幼苗根中ZmNramp1基因表达与Cd含量呈显著正相关;叶片中二者之间亦为显著的正相关关系。ZmNramp1基因可能参与玉米对Cd的吸收、转运过程,为玉米抗重金属育种提供理论依据和基因资源。 展开更多
关键词 玉米 镉转运蛋白 nramp1基因 克隆与表达
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大肠杆菌刺激猪肠上皮细胞后Nramp1基因的表达变化分析 被引量:5
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作者 戴超辉 吴嘉韵 +2 位作者 孙丽 吴圣龙 包文斌 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2017年第6期40-43,共4页
猪天然抗性相关巨噬细胞蛋白基因1(Naturalresistance-associated Marophage Protein 1,Nramp1)作为影响抗病力的重要候选基因之一,在机体的免疫过程中发挥着重要的调控作用。为了在细胞水平上探讨Nramp1基因与引起仔猪腹泻的致病性大... 猪天然抗性相关巨噬细胞蛋白基因1(Naturalresistance-associated Marophage Protein 1,Nramp1)作为影响抗病力的重要候选基因之一,在机体的免疫过程中发挥着重要的调控作用。为了在细胞水平上探讨Nramp1基因与引起仔猪腹泻的致病性大肠杆菌的关系及其在大肠杆菌感染过程中发挥的免疫调控作用,本研究利用F18ab、F18ac和K88ac等3种致病性大肠杆菌刺激体外培养的猪肠上皮细胞IPEC-J2,并利用实时荧光定量PCR检测3种菌体刺激IPEC-J2后Nramp1基因的表达变化情况。结果表明:F18ab、F18ac和K88ac 3种大肠杆菌刺激IPEC-J2后,Nramp1基因的表达均发生极显著(P<0.01)上调,差异倍数分别为10、8、11倍,且F18ab和K88ac 2种菌体刺激后Nramp1基因的表达上调程度均极显著高于F18ac。本研究结果提示,Nramp1基因的表达与大肠杆菌的侵染有很大的相关性,其在大肠杆菌侵袭猪肠道中发挥了重要的免疫调控作用。本研究在细胞水平分析探讨了Nramp1基因的表达与3种致病性大肠杆菌侵袭的关系,为Nramp1基因在大肠杆菌侵染机体的过程中发挥的免疫调控作用研究提供了参考依据。 展开更多
关键词 大肠杆菌 nramp1基因 抗病育种
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宁夏地区荷斯坦牛Nramp1基因多态性分析 被引量:4
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作者 宁素恒 徐军 +4 位作者 马生虎 文亮 李强子 朱国强 张丽 《中国奶牛》 2015年第17期24-27,共4页
天然抗性相关巨噬蛋白(Nramp)和多种细胞内菌体的抗性感染相关联。通过对荷斯坦牛Nramp1基因第11外显子多态性进行PCR-SSCP检测结果显示,该区域存在A、B两种等位基因和AA、BB、AB三种基因型,其中等位基因A的频率为0.2692,等位基因B的频... 天然抗性相关巨噬蛋白(Nramp)和多种细胞内菌体的抗性感染相关联。通过对荷斯坦牛Nramp1基因第11外显子多态性进行PCR-SSCP检测结果显示,该区域存在A、B两种等位基因和AA、BB、AB三种基因型,其中等位基因A的频率为0.2692,等位基因B的频率为0.7308,基因型AA的频率为0.0833,基因型BB的频率为0.5449,B为优势等位基因,基因型BB为优势基因型。经过卡方适合性检验,荷斯坦牛Nramp1基因所测区域处于中度多态,未偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。测序结果表明,引物扩增片段在200bp处发生G→C错义突变,从而导致氨基酸由半胱氨酸(Cys)变为丝氨酸(Ser)。 展开更多
关键词 nramp1基因 基因多态性 PCR-SSCP 荷斯坦牛
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猪Nramp1基因内含子6多态性与仔猪腹泻的相关性 被引量:4
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作者 古少波 杜倩 +3 位作者 舒丹 李志瑕 田晓静 刘丽霞 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第6期882-887,共6页
为了研究猪Nramp1基因内含子6的多态性与仔猪腹泻的相关性,采用PCR-RFLP法对八眉猪和烟台黑猪Nramp1基因内含子6的多态性进行研究。结果表明:两个猪种在该基因内含子6的多态性较低,共检测到两个等位基因(A、B)和两种基因型(AB、BB),八... 为了研究猪Nramp1基因内含子6的多态性与仔猪腹泻的相关性,采用PCR-RFLP法对八眉猪和烟台黑猪Nramp1基因内含子6的多态性进行研究。结果表明:两个猪种在该基因内含子6的多态性较低,共检测到两个等位基因(A、B)和两种基因型(AB、BB),八眉猪多态信息含量(PIC)为0.33,烟台黑猪为0.36。卡方适合性检验显示,两猪种的Nramp1基因内含子6极显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。相关性分析结果表明,八眉猪对腹泻的抵抗能力显著高于烟台黑猪(P<0.05)。性别与Nramp1基因内含子6基因型对仔猪腹泻影响不显著(P>0.05),而性别与基因型的互作对仔猪腹泻有显著影响(P<0.05),在母猪群体中,AB基因型的腹泻评分极显著大于BB基因型(P<0.01);在公猪群体中,AB和BB基因型腹泻评分差异不显著(P>0.05)。 展开更多
关键词 八眉猪 烟台黑猪 nramp1基因 腹泻 多态性
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牦牛Nramp1基因mRNA组织表达谱及其相关miRNAs初步研究 被引量:3
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作者 温东旭 张雷 +7 位作者 索朗斯珠 牛家强 王玉恒 贡嘎 旦巴次仁 席广银 郭敏 徐业芬 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1576-1586,共11页
旨在探究牦牛Nramp1基因mRNA及可能靶定Nramp1的miRNAs组织表达谱。本研究利用RT-PCR技术对牦牛Nramp1基因的mRNA组织表达谱进行分析,同时运用TargentScan和miRBase软件预测牦牛可能靶定Nramp1基因的miRNAs,并利用加PloyA尾法RT-PCR技... 旨在探究牦牛Nramp1基因mRNA及可能靶定Nramp1的miRNAs组织表达谱。本研究利用RT-PCR技术对牦牛Nramp1基因的mRNA组织表达谱进行分析,同时运用TargentScan和miRBase软件预测牦牛可能靶定Nramp1基因的miRNAs,并利用加PloyA尾法RT-PCR技术分析miRNAs在肝、脾、肺、肾、后腿骨骼肌、卵巢、小肠、颌下淋巴结、大肠、肠系淋巴结10种组织中的相对表达量。试验结果显示,Nramp1基因mRNA在所检测的10种组织中均有表达,其中在脾、颌下淋巴结及肺组织中的表达量极显著高于肝、肾、大肠、肠系淋巴结组织(P<0.01),显著高于小肠组织表达量(P<0.05)。预测到可能靶定牦牛Nramp1基因的miRNAs共有201个,从中选择6个进行表达谱分析,发现bta-miR-106a、bta-miR-20b、bta-miR-17-5p在牦牛免疫组织脾、颌下淋巴结、肠系淋巴结中,bta-miR-93、bta-miR-106b、bta-miR-20a在牦牛免疫组织颌下淋巴结、肠系淋巴结中均与Nramp1基因mRNA共表达,但是bta-miR-93、bta-miR-20a、bta-miR-106a、bta-miR-17-5p和bta-miR-20b在颌下淋巴结和肠系淋巴结间的表达量无显著差异(P>0.05),而bta-miR-106a、bta-miR-20b在颌下淋巴结、肠系淋巴结组织中的表达量极显著高于脾组织表达量(P<0.01),bta-miR-106b在颌下淋巴结组织中的表达量极显著高于肠系淋巴结组织表达量(P<0.01)。Nramp1基因mRNA在牦牛体内广泛表达说明其可能具有广泛免疫调节作用;bta-miR-93、bta-miR-20b、bta-miR-106a、bta-miR-106b、bta-miR-20a和bta-miR-17-5p与Nramp1基因mRNA在免疫组织中的共表达表明二者可能具有靶向调控关系参与免疫调控作用,但二者是否存在真实的靶向调控以及其调控机制有待于深入研究。 展开更多
关键词 牦牛 nramp1基因 MIRNA 组织表达谱
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