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The 150 most important questions in cancer research and clinical oncology series:questions 50-56 被引量:5
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作者 Chinese Journal of Cancer 《Chinese Journal of Cancer》 SCIE CAS CSCD 2017年第8期335-338,共4页
Since the beginning of 2017, Chinese Journal of Cancer has published a series of important questions in cancer research and clinical oncology, which sparkle diverse thoughts, interesting communications, and potential ... Since the beginning of 2017, Chinese Journal of Cancer has published a series of important questions in cancer research and clinical oncology, which sparkle diverse thoughts, interesting communications, and potential collaborations among researchers all over the world. In this article, seven more questions are presented as followed. Question50. When tumor cells spread from primary site to distant sites, are they required to be "trained" or "armed" in the bone marrow niche prior to colonizing soft tissues? Question 51. Are there tipping points during cancer progression which can be identified for manipulation? Question 52. Can we replace molecular biomarkers by network biomarkers?Question 53. Are conventional inhibitors of key cellular processes such as cell proliferation and differentiation more effective than targeted chemotherapeutics that antagonize the downstream cell signaling network via cell-surface receptors such as epidermal growth factor receptor(EGFR), vascular endothelial growth factor receptor(VEGFR) and c-Met, or intracellular receptors such as androgen receptor(AR) and estrogen receptor(ER), by drugs like erlotinib,sunitinib and cabozantinib, or enzalutamide and tomoxifen? Question 54. How can we robustly identify the candidate causal event of somatic genome alteration(SGA) by using computational approach? Question 55. How can we systematically reveal the immune evasion mechanism exploited by each tumor and utilize such information to guide targeted therapy to restore immune sensitivity? Question 56. Can the nasopharyngeal carcinoma(NPC) patients with sarcomatoid carcinoma(SC) subtype benefit from more specific targeted therapy? 展开更多
关键词 Bone marrow niche TIPPING point during cancer progression network biomarkers Targeted CHEMOTHERAPEUTICS SOMATIC genome alteration Immune EVASION mechanism SARCOMATOID carcinoma
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基于个性化网络标志物的药物推荐方法研究 被引量:2
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作者 刘文斌 吴倩 +3 位作者 杜玉改 方刚 石晓龙 许鹏 《电子与信息学报》 EI CSCD 北大核心 2020年第6期1340-1347,共8页
基于个性化标志物的药物推荐研究,有助于实现个性化用药及推动精准医疗的发展。该文利用基因表达谱数据及蛋白质网络信息,基于基因2维高斯分布方法筛选出个性化网络标志物。进而综合考虑靶基因的重要性和药物的副作用,提出了一种计算药... 基于个性化标志物的药物推荐研究,有助于实现个性化用药及推动精准医疗的发展。该文利用基因表达谱数据及蛋白质网络信息,基于基因2维高斯分布方法筛选出个性化网络标志物。进而综合考虑靶基因的重要性和药物的副作用,提出了一种计算药物对个性化标志物影响权重的方法。将该方法应用于肺腺癌、肾透明细胞癌和子宫内膜癌数据集,通过启发式搜索方法,得到每个疾病样本重要药物推荐列表。结果表明,推荐的药物列表在同种癌症不同样本中既存在一致性,也表现出很大的差异性,如药物种类及药物排序差异,这说明个性化药物在疾病治疗中的重要性及必要性。通过从药物数据库中搜索药物组合对疾病治疗的影响作用表明,该文方法筛选得到的许多药物组合对具体疾病治疗具有积极影响,这进一步证明该文基于个性化网络标志物的药物推荐方法的准确性。该文的研究将有效促进精准化医疗的发展。 展开更多
关键词 精准医疗 个性化标志物 网络标志物 药物推荐
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网络生物标志物、交互网络和动态网络生物标志物在呼吸系统疾病中的研究进展 被引量:1
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作者 王坚 吴晓丹 +2 位作者 陈罗南 金美玲 王向东 《转化医学研究(电子版)》 2014年第3期40-47,共8页
疾病特异性的生物标志物是在疾病发生发展或者治疗过程中出现功能性改变的物质,而在疾病特异性的生物标志物研究过程中,定义和确认交互网络和网络生物标志物日趋重要。本文将分别概述网络生物标志物、交互网络和动态网络生物标志物(dyna... 疾病特异性的生物标志物是在疾病发生发展或者治疗过程中出现功能性改变的物质,而在疾病特异性的生物标志物研究过程中,定义和确认交互网络和网络生物标志物日趋重要。本文将分别概述网络生物标志物、交互网络和动态网络生物标志物(dynamical network biomarkers,DNB)的定义、意义、相关研究以及潜在的应用前景。疾病特异性交互网络、网络生物标志物或动态网络生物标志物有助于理解疾病发生的分子机制、风险评估、疾病分类和监测以及评估治疗反应和毒性。基于蛋白的动态网络生物标志物能为区分患者健康状态和疾病前状态提供更多的信息,这有助于疾病的早期诊断。而临床生物信息学是定义和确认疾病特异性的生物标志物最主要的方法。 展开更多
关键词 网络生物标志物 动态网络生物标志物 肺癌 诊断 预后
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基于临界慢化理论的中医“未病”状态识别建模研究初探
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作者 王诗尧 石康乐 +2 位作者 雷聪 杨方燕 孟庆刚 《北京中医药大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期312-319,共8页
中医“未病”理论关注从健康到疾病动态、连续的演化特点,重视从健康到疾病复杂、渐变演化过程中的早期辨识和干预。从系统整体性、演化性角度来看,“未病”理论和复杂性科学具有相同本质的健康观和疾病观——将机体视为连续、动态变化... 中医“未病”理论关注从健康到疾病动态、连续的演化特点,重视从健康到疾病复杂、渐变演化过程中的早期辨识和干预。从系统整体性、演化性角度来看,“未病”理论和复杂性科学具有相同本质的健康观和疾病观——将机体视为连续、动态变化的复杂系统,呈现“稳态-失稳态-相变-另一稳态”的非线性特点。本文从复杂性科学非线性动力学视角,运用临界慢化理论阐释中医未病-已病演化规律的科学内涵,并基于该理论及其发展产生的动态网络生物标志物方法,结合中医四诊合参的宏观体征及包含转录组学和微生物组学的微观特征,提出融合宏观、微观多层级信息,构建具有中医诊疗特点的“未病”临界状态识别模型,为复杂疾病早期预警提供新视角和新方法。 展开更多
关键词 未病 中医 临界慢化 复杂系统 模型框架 动态网络生物标志物
原文传递
复杂生物系统临界状态的识别与预警
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作者 刘锐 杨茜然 《中山大学学报(自然科学版)(中英文)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期275-290,共16页
很多生物系统的动态发展过程中都存在状态的临界迁移现象,例如复杂疾病,在离临界状态较远时,病情不明显;而到达临界状态后,病情有可能在很短的时间内从稳定期突然恶化而成为重病期.如何基于高维生物医学数据,找到可用于识别生物系统状... 很多生物系统的动态发展过程中都存在状态的临界迁移现象,例如复杂疾病,在离临界状态较远时,病情不明显;而到达临界状态后,病情有可能在很短的时间内从稳定期突然恶化而成为重病期.如何基于高维生物医学数据,找到可用于识别生物系统状态改变临界期的标记物,对包括疾病的早期预警等课题具有重要意义.围绕生物系统临界状态识别与预警这一课题,本文主要综述了动态网络生物标志物(DNB)方法,及针对不同的数据条件所发展的一系列适用的改进方法及其应用. 展开更多
关键词 状态迁移 临界状态 动态网络生物标志物(DNB) 早期预警信号
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基于三维景观动态网络生物标志物识别乳腺癌细胞分化的临界状态 被引量:2
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作者 赵宏倩 高洁 《生物医学工程学杂志》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第2期304-310,共7页
乳腺癌是近年来女性发病率和死亡率最高的恶性肿瘤,是一种影响人类健康的复杂疾病。研究表明,动态网络生物标志物(DNB)可以有效识别乳腺癌等复杂疾病由正常状态转变为疾病状态的临界状态。然而,传统的DNB方法需要用到同一疾病状态下多... 乳腺癌是近年来女性发病率和死亡率最高的恶性肿瘤,是一种影响人类健康的复杂疾病。研究表明,动态网络生物标志物(DNB)可以有效识别乳腺癌等复杂疾病由正常状态转变为疾病状态的临界状态。然而,传统的DNB方法需要用到同一疾病状态下多个样本的数据,这通常在临床诊断中是无法实现的。本文定量分析了人类乳腺癌细胞系(MCF-7)的时间序列数据,基于三维景观动态网络生物标志物(L-DNB)方法,找到时间序列中单个样本的DNB模块,然后构建综合指标检测乳腺癌细胞分化过程中的早期预警信号,从而确定其临界状态。本文研究结果对于乳腺癌的防治和早期诊断或具有重要意义,期待本文研究能够为乳腺癌的相关研究提供参考。 展开更多
关键词 乳腺癌 三维景观动态网络生物标志物 临界状态 早期预警
原文传递
基于个体时序列差异网络探测疾病恶化的预警信号
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作者 关小玲 《应用数学进展》 2019年第1期160-169,共10页
前疾病状态是疾病状态的一个临界期,处于这个状态的患者,只要经过合理有效的治疗,就可以回到正常状态。所以,探测前疾病状态对于医疗工作者以及病人来说有着极其重要的意义。本文开发了一种算法,基于个体单样本建立个体时序列差异网络,... 前疾病状态是疾病状态的一个临界期,处于这个状态的患者,只要经过合理有效的治疗,就可以回到正常状态。所以,探测前疾病状态对于医疗工作者以及病人来说有着极其重要的意义。本文开发了一种算法,基于个体单样本建立个体时序列差异网络,并根据所建立的个体时序列差异网络,可以有效地探测疾病恶化的信号。该方法的有效性得到了数值模拟和两个真实数据的检验。 展开更多
关键词 个体单样本 时序列差异网络 动态网络生物标志物 复合变量 临界点
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