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题名番茄LeNHX3基因的生物信息学分析
被引量：6
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作者
范晶
胥成浩
张西玉
刘超
黄明远
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机构
乐山师范学院化学与生命科学学院
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出处
《湖北农业科学》
北大核心
2009年第12期2917-2921,共5页
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基金
四川省教育厅基金项目(08Zb051)
乐山师范学院科研项目(Z0858)
峨眉山生物多样性保护与利用研究所科研项目(08S04)
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文摘
应用生物信息学的方法和工具对番茄LeNHX3蛋白质的理化性质、跨膜区域、疏水性/亲水性、二级结构、结构功能域、功能分类和同源性进行了分析,结果表明,番茄LeNHX3蛋白为疏水性稳定蛋白,包含一个高度保守的具有氨氯吡嗪咪结合位点的LFFIYLLPPI结构功能域,相对分子量为59.4kD,等电点为8.54,可能存在10个跨膜区域,蛋白质二级结构中的主要构成元件是α-螺旋和不规则卷曲;蛋白质同源性分析后,发现番茄LeNHX3蛋白和紫高杯花、矮牵牛花2种植物的Na+/H+反转运蛋白高度同源,序列相似性为90%。
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关键词
番茄
LeNhX3基因
na+/h+反转运蛋白
生物信息学
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Keywords
tomato（Lycopersicon esculentum）
LeNhX3 gene
^^ na^＋/h^＋ anti-transporter
bioinformatics
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分类号
S641.2
[农业科学—蔬菜学]
Q343.1
[农业科学—园艺学]
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